EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000015953 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 235722 bases
Position: chrFYBX02009993.1:1700176-1935897
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000025884	zf-C2H2	PF00096.26	2.4e-44	1	6
ENSEBUP00000025884	zf-C2H2	PF00096.26	2.4e-44	2	6
ENSEBUP00000025884	zf-C2H2	PF00096.26	2.4e-44	3	6
ENSEBUP00000025884	zf-C2H2	PF00096.26	2.4e-44	4	6
ENSEBUP00000025884	zf-C2H2	PF00096.26	2.4e-44	5	6
ENSEBUP00000025884	zf-C2H2	PF00096.26	2.4e-44	6	6
ENSEBUP00000025878	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-43	1	6
ENSEBUP00000025878	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-43	2	6
ENSEBUP00000025878	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-43	3	6
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ENSEBUP00000025878	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-43	5	6
ENSEBUP00000025878	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-43	6	6
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ENSEBUP00000025884	zf-met	PF12874.7	3.4e-16	2	3
ENSEBUP00000025884	zf-met	PF12874.7	3.4e-16	3	3
ENSEBUP00000025878	zf-met	PF12874.7	1.6e-15	1	3
ENSEBUP00000025878	zf-met	PF12874.7	1.6e-15	2	3
ENSEBUP00000025878	zf-met	PF12874.7	1.6e-15	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000026460	-	4172	-	ENSEBUP00000025884	414 (aa)	-	-
ENSEBUT00000026454	-	4596	-	ENSEBUP00000025878	502 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSEBUG00000015953	-	60	48.538	ENSEBUG00000013126	-	63	48.538
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ENSEBUG00000015953	-	64	47.739	ENSEBUG00000004841	-	83	47.739
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ENSEBUG00000015953	-	55	51.020	ENSEBUG00000007740	-	88	51.020
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ENSEBUG00000015953	-	54	48.663	ENSEBUG00000001308	-	64	50.568
ENSEBUG00000015953	-	54	52.542	ENSEBUG00000002589	-	76	52.542
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ENSEBUG00000015953	-	52	48.500	ENSEBUG00000010794	-	66	48.500
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