EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000016944 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 116538 bases
Position: chrFYBX02010596.1:556163-672700
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000027678	zf-C2H2	PF00096.26	4.2e-38	1	8
ENSEBUP00000027678	zf-C2H2	PF00096.26	4.2e-38	2	8
ENSEBUP00000027678	zf-C2H2	PF00096.26	4.2e-38	3	8
ENSEBUP00000027678	zf-C2H2	PF00096.26	4.2e-38	4	8
ENSEBUP00000027678	zf-C2H2	PF00096.26	4.2e-38	5	8
ENSEBUP00000027678	zf-C2H2	PF00096.26	4.2e-38	6	8
ENSEBUP00000027678	zf-C2H2	PF00096.26	4.2e-38	7	8
ENSEBUP00000027678	zf-C2H2	PF00096.26	4.2e-38	8	8
ENSEBUP00000027678	zf-met	PF12874.7	8.1e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000028254	-	1437	-	ENSEBUP00000027678	478 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSEBUG00000016944's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSEBUG00000016944's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSEBUG00000016944	-	75	46.396	ENSEBUG00000002721	-	63	46.396
ENSEBUG00000016944	-	60	44.898	ENSEBUG00000003128	-	76	44.898
ENSEBUG00000016944	-	59	47.718	ENSEBUG00000015834	-	84	47.718
ENSEBUG00000016944	-	61	47.744	ENSEBUG00000015110	-	61	47.744
ENSEBUG00000016944	-	68	39.865	ENSEBUG00000011562	-	88	39.865
ENSEBUG00000016944	-	59	46.371	ENSEBUG00000007012	-	71	46.371
ENSEBUG00000016944	-	59	47.368	ENSEBUG00000012314	-	76	47.368
ENSEBUG00000016944	-	69	44.643	ENSEBUG00000002075	-	75	44.643
ENSEBUG00000016944	-	69	47.845	ENSEBUG00000008169	-	74	47.845
ENSEBUG00000016944	-	59	37.589	ENSEBUG00000016969	-	76	37.589
ENSEBUG00000016944	-	76	48.443	ENSEBUG00000014050	-	78	49.356
ENSEBUG00000016944	-	82	51.957	ENSEBUG00000007386	-	79	51.957
ENSEBUG00000016944	-	60	48.551	ENSEBUG00000015207	-	61	48.551
ENSEBUG00000016944	-	60	46.734	ENSEBUG00000011123	-	97	46.078
ENSEBUG00000016944	-	62	41.350	ENSEBUG00000011977	-	77	42.935
ENSEBUG00000016944	-	60	46.296	ENSEBUG00000005012	-	59	46.296
ENSEBUG00000016944	-	67	46.643	ENSEBUG00000011331	-	80	46.643
ENSEBUG00000016944	-	51	50.610	ENSEBUG00000000436	-	66	50.610
ENSEBUG00000016944	-	76	48.261	ENSEBUG00000012919	-	73	50.968
ENSEBUG00000016944	-	63	40.146	ENSEBUG00000014717	-	75	40.146
ENSEBUG00000016944	-	69	47.853	ENSEBUG00000017017	-	65	47.407
ENSEBUG00000016944	-	77	47.368	ENSEBUG00000015456	-	92	46.382
ENSEBUG00000016944	-	77	44.298	ENSEBUG00000004597	-	73	44.298
ENSEBUG00000016944	-	69	43.463	ENSEBUG00000000704	-	67	43.463
ENSEBUG00000016944	-	61	46.786	ENSEBUG00000008991	-	81	46.786
ENSEBUG00000016944	-	73	42.662	ENSEBUG00000005258	-	92	42.662
ENSEBUG00000016944	-	79	46.237	ENSEBUG00000006092	-	63	46.237
ENSEBUG00000016944	-	60	48.763	ENSEBUG00000011244	-	79	48.763
ENSEBUG00000016944	-	77	42.090	ENSEBUG00000009666	-	85	42.090
ENSEBUG00000016944	-	58	45.045	ENSEBUG00000012939	-	68	45.045
ENSEBUG00000016944	-	75	46.758	ENSEBUG00000012748	-	80	46.403
ENSEBUG00000016944	-	58	48.772	ENSEBUG00000011479	-	70	48.772
ENSEBUG00000016944	-	61	50.542	ENSEBUG00000011751	-	64	50.357
ENSEBUG00000016944	-	75	47.703	ENSEBUG00000002185	-	82	47.703
ENSEBUG00000016944	-	78	50.526	ENSEBUG00000008852	ZNF845	83	46.185
ENSEBUG00000016944	-	69	51.397	ENSEBUG00000009436	-	91	43.310
ENSEBUG00000016944	-	87	48.973	ENSEBUG00000016878	-	82	48.973
ENSEBUG00000016944	-	81	48.432	ENSEBUG00000003512	-	74	48.432
ENSEBUG00000016944	-	61	48.800	ENSEBUG00000011728	-	73	48.800
ENSEBUG00000016944	-	59	43.386	ENSEBUG00000015837	-	76	43.386
ENSEBUG00000016944	-	69	50.746	ENSEBUG00000008025	-	76	50.746
ENSEBUG00000016944	-	76	49.117	ENSEBUG00000015576	-	84	49.117
ENSEBUG00000016944	-	60	50.725	ENSEBUG00000009208	-	55	50.725
ENSEBUG00000016944	-	60	49.826	ENSEBUG00000012823	-	70	49.826
ENSEBUG00000016944	-	69	43.069	ENSEBUG00000005722	-	90	43.069
ENSEBUG00000016944	-	61	46.241	ENSEBUG00000002291	-	59	46.241
ENSEBUG00000016944	-	58	43.158	ENSEBUG00000002290	-	52	43.158
ENSEBUG00000016944	-	60	49.537	ENSEBUG00000008157	-	97	50.909
ENSEBUG00000016944	-	62	38.732	ENSEBUG00000004301	prdm5	73	38.732
ENSEBUG00000016944	-	76	48.031	ENSEBUG00000013528	-	77	48.031
ENSEBUG00000016944	-	83	46.947	ENSEBUG00000014040	-	75	46.185
ENSEBUG00000016944	-	81	54.067	ENSEBUG00000014284	-	99	50.943
ENSEBUG00000016944	-	79	51.741	ENSEBUG00000014042	-	65	51.741
ENSEBUG00000016944	-	74	50.000	ENSEBUG00000001972	-	70	50.000
ENSEBUG00000016944	-	60	49.638	ENSEBUG00000001569	-	76	49.638
ENSEBUG00000016944	-	62	48.421	ENSEBUG00000006112	-	76	48.421
ENSEBUG00000016944	-	54	47.791	ENSEBUG00000008229	-	52	47.791
ENSEBUG00000016944	-	69	40.394	ENSEBUG00000013221	-	85	37.743
ENSEBUG00000016944	-	61	49.826	ENSEBUG00000008392	-	75	48.763
ENSEBUG00000016944	-	58	37.838	ENSEBUG00000007518	-	64	37.838
ENSEBUG00000016944	-	69	49.261	ENSEBUG00000014677	-	83	49.261
ENSEBUG00000016944	-	77	46.182	ENSEBUG00000011112	-	99	46.182
ENSEBUG00000016944	-	86	50.174	ENSEBUG00000000735	-	98	50.174
ENSEBUG00000016944	-	79	48.638	ENSEBUG00000015522	-	67	48.000
ENSEBUG00000016944	-	59	39.423	ENSEBUG00000003842	-	90	39.423
ENSEBUG00000016944	-	79	44.275	ENSEBUG00000007305	-	89	44.275
ENSEBUG00000016944	-	80	46.454	ENSEBUG00000009909	-	91	46.454
ENSEBUG00000016944	-	63	47.163	ENSEBUG00000000422	-	65	47.163
ENSEBUG00000016944	-	60	39.749	ENSEBUG00000016164	-	69	40.343
ENSEBUG00000016944	-	62	48.718	ENSEBUG00000013573	-	88	48.718
ENSEBUG00000016944	-	62	38.411	ENSEBUG00000013392	-	56	38.411
ENSEBUG00000016944	-	75	45.139	ENSEBUG00000007470	-	92	45.139
ENSEBUG00000016944	-	61	47.586	ENSEBUG00000014768	-	74	47.586
ENSEBUG00000016944	-	87	52.510	ENSEBUG00000004839	-	88	52.510
ENSEBUG00000016944	-	60	46.429	ENSEBUG00000010952	-	70	46.429
ENSEBUG00000016944	-	68	38.832	ENSEBUG00000015073	-	74	43.077
ENSEBUG00000016944	-	61	48.410	ENSEBUG00000014309	-	72	49.083
ENSEBUG00000016944	-	77	45.517	ENSEBUG00000014597	-	82	45.517
ENSEBUG00000016944	-	59	51.370	ENSEBUG00000001826	-	53	51.370
ENSEBUG00000016944	-	61	50.800	ENSEBUG00000004992	-	57	52.282
ENSEBUG00000016944	-	70	50.685	ENSEBUG00000004999	-	83	50.685
ENSEBUG00000016944	-	60	47.843	ENSEBUG00000010472	-	76	47.843
ENSEBUG00000016944	-	65	47.241	ENSEBUG00000008039	-	70	47.241
ENSEBUG00000016944	-	81	43.966	ENSEBUG00000001329	-	91	44.156
ENSEBUG00000016944	-	84	48.649	ENSEBUG00000012704	-	71	48.649
ENSEBUG00000016944	-	61	51.570	ENSEBUG00000007054	-	51	51.570
ENSEBUG00000016944	-	73	45.620	ENSEBUG00000001525	-	84	45.620
ENSEBUG00000016944	-	76	45.126	ENSEBUG00000007375	-	84	45.126
ENSEBUG00000016944	-	60	48.410	ENSEBUG00000014388	-	83	48.410
ENSEBUG00000016944	-	67	48.872	ENSEBUG00000002146	-	63	48.872
ENSEBUG00000016944	-	85	47.143	ENSEBUG00000006212	-	85	52.101
ENSEBUG00000016944	-	60	48.561	ENSEBUG00000003991	-	87	48.561
ENSEBUG00000016944	-	60	51.748	ENSEBUG00000002960	-	66	51.748
ENSEBUG00000016944	-	77	43.571	ENSEBUG00000012053	-	84	43.396
ENSEBUG00000016944	-	85	48.918	ENSEBUG00000016287	-	76	37.903
ENSEBUG00000016944	-	71	39.884	ENSEBUG00000011582	-	73	39.407
ENSEBUG00000016944	-	69	47.350	ENSEBUG00000011896	-	51	47.350
ENSEBUG00000016944	-	60	44.574	ENSEBUG00000003555	-	71	44.574
ENSEBUG00000016944	-	82	46.918	ENSEBUG00000004026	-	69	46.918
ENSEBUG00000016944	-	58	47.881	ENSEBUG00000014888	-	63	47.881
ENSEBUG00000016944	-	76	44.728	ENSEBUG00000015925	-	82	47.387
ENSEBUG00000016944	-	58	46.748	ENSEBUG00000014665	-	73	47.059
ENSEBUG00000016944	-	69	44.128	ENSEBUG00000014667	-	80	44.128
ENSEBUG00000016944	-	62	44.718	ENSEBUG00000010794	-	79	44.718
ENSEBUG00000016944	-	78	50.523	ENSEBUG00000009291	-	82	50.523
ENSEBUG00000016944	-	86	46.909	ENSEBUG00000005310	ZNF226	85	46.909
ENSEBUG00000016944	-	65	46.875	ENSEBUG00000006249	-	82	46.875
ENSEBUG00000016944	-	60	48.727	ENSEBUG00000005703	-	80	48.727
ENSEBUG00000016944	-	71	37.778	ENSEBUG00000005186	-	88	37.778
ENSEBUG00000016944	-	61	46.008	ENSEBUG00000011764	-	72	46.008
ENSEBUG00000016944	-	83	48.416	ENSEBUG00000004841	-	80	48.416
ENSEBUG00000016944	-	58	47.807	ENSEBUG00000004844	-	53	47.807
ENSEBUG00000016944	-	57	50.224	ENSEBUG00000014659	-	62	50.224
ENSEBUG00000016944	-	58	48.780	ENSEBUG00000009484	-	55	49.490
ENSEBUG00000016944	-	61	42.688	ENSEBUG00000013875	-	82	42.688
ENSEBUG00000016944	-	87	44.606	ENSEBUG00000013683	-	98	46.021
ENSEBUG00000016944	-	59	47.703	ENSEBUG00000010205	-	80	47.980
ENSEBUG00000016944	-	78	40.088	ENSEBUG00000010204	-	92	40.088
ENSEBUG00000016944	-	75	45.211	ENSEBUG00000007308	ZNF845	98	45.211
ENSEBUG00000016944	-	77	49.351	ENSEBUG00000013355	-	74	47.273
ENSEBUG00000016944	-	93	58.590	ENSEBUG00000006811	-	86	58.590
ENSEBUG00000016944	-	69	46.863	ENSEBUG00000007266	-	80	46.863
ENSEBUG00000016944	-	58	51.754	ENSEBUG00000010357	-	58	45.490
ENSEBUG00000016944	-	58	49.761	ENSEBUG00000002371	-	78	49.761
ENSEBUG00000016944	-	74	42.466	ENSEBUG00000010756	-	97	42.466
ENSEBUG00000016944	-	61	48.057	ENSEBUG00000011837	-	60	48.057
ENSEBUG00000016944	-	62	43.885	ENSEBUG00000016857	-	70	43.885
ENSEBUG00000016944	-	74	46.914	ENSEBUG00000002589	-	89	46.914
ENSEBUG00000016944	-	52	43.979	ENSEBUG00000002586	-	50	43.979
ENSEBUG00000016944	-	68	48.980	ENSEBUG00000015953	-	52	48.980
ENSEBUG00000016944	-	60	50.871	ENSEBUG00000014648	-	77	50.871
ENSEBUG00000016944	-	68	45.690	ENSEBUG00000013213	-	77	40.659
ENSEBUG00000016944	-	78	47.826	ENSEBUG00000001943	-	94	47.619
ENSEBUG00000016944	-	62	40.000	ENSEBUG00000006129	-	79	40.000
ENSEBUG00000016944	-	70	47.518	ENSEBUG00000003455	-	75	47.518
ENSEBUG00000016944	-	78	43.825	ENSEBUG00000015993	-	66	43.825
ENSEBUG00000016944	-	60	42.955	ENSEBUG00000012454	-	69	42.955
ENSEBUG00000016944	-	62	48.485	ENSEBUG00000008273	-	82	48.485
ENSEBUG00000016944	-	63	47.273	ENSEBUG00000008272	-	67	47.273
ENSEBUG00000016944	-	77	56.780	ENSEBUG00000006847	-	92	56.780
ENSEBUG00000016944	-	86	50.000	ENSEBUG00000005785	-	73	50.000
ENSEBUG00000016944	-	61	48.606	ENSEBUG00000016362	-	60	48.606
ENSEBUG00000016944	-	80	46.071	ENSEBUG00000003078	-	70	46.071
ENSEBUG00000016944	-	87	47.735	ENSEBUG00000004011	-	91	47.387
ENSEBUG00000016944	-	59	35.463	ENSEBUG00000002606	-	64	35.849
ENSEBUG00000016944	-	58	64.184	ENSEBUG00000009220	-	89	64.184
ENSEBUG00000016944	-	76	45.498	ENSEBUG00000007980	-	63	45.498
ENSEBUG00000016944	-	58	46.099	ENSEBUG00000002032	-	78	46.099
ENSEBUG00000016944	-	62	47.368	ENSEBUG00000003418	-	92	47.368
ENSEBUG00000016944	-	58	47.150	ENSEBUG00000006250	-	70	46.281
ENSEBUG00000016944	-	91	45.149	ENSEBUG00000001219	-	90	45.149
ENSEBUG00000016944	-	78	49.129	ENSEBUG00000002454	-	86	49.129
ENSEBUG00000016944	-	61	43.289	ENSEBUG00000002537	-	89	49.138
ENSEBUG00000016944	-	60	40.678	ENSEBUG00000007931	-	68	39.683
ENSEBUG00000016944	-	63	48.611	ENSEBUG00000012502	-	88	48.611
ENSEBUG00000016944	-	59	44.765	ENSEBUG00000008792	-	94	44.765
ENSEBUG00000016944	-	54	54.310	ENSEBUG00000000642	-	76	54.783
ENSEBUG00000016944	-	79	52.720	ENSEBUG00000003590	-	68	52.720
ENSEBUG00000016944	-	59	56.250	ENSEBUG00000015661	-	73	55.556
ENSEBUG00000016944	-	77	46.188	ENSEBUG00000008185	-	76	40.816
ENSEBUG00000016944	-	84	45.645	ENSEBUG00000013157	-	82	45.645
ENSEBUG00000016944	-	88	51.961	ENSEBUG00000013400	-	91	51.961
ENSEBUG00000016944	-	59	45.000	ENSEBUG00000006987	-	99	45.000
ENSEBUG00000016944	-	58	48.205	ENSEBUG00000001698	-	77	48.571
ENSEBUG00000016944	-	73	46.931	ENSEBUG00000010031	-	71	46.931
ENSEBUG00000016944	-	77	43.885	ENSEBUG00000005146	-	96	43.885
ENSEBUG00000016944	-	59	52.542	ENSEBUG00000008903	-	75	51.309
ENSEBUG00000016944	-	61	41.343	ENSEBUG00000015155	-	75	41.343
ENSEBUG00000016944	-	59	46.983	ENSEBUG00000015159	-	82	45.276
ENSEBUG00000016944	-	62	50.000	ENSEBUG00000008988	ZNF845	85	50.000
ENSEBUG00000016944	-	60	46.753	ENSEBUG00000013126	-	59	46.753
ENSEBUG00000016944	-	69	48.361	ENSEBUG00000006702	-	74	48.361
ENSEBUG00000016944	-	86	55.944	ENSEBUG00000006233	-	70	55.944
ENSEBUG00000016944	-	68	49.215	ENSEBUG00000014730	-	55	49.215
ENSEBUG00000016944	-	86	63.687	ENSEBUG00000009383	-	70	63.687
ENSEBUG00000016944	-	81	49.470	ENSEBUG00000007563	-	71	49.470
ENSEBUG00000016944	-	98	46.465	ENSEBUG00000005131	-	79	49.773
ENSEBUG00000016944	-	76	48.084	ENSEBUG00000007797	-	73	48.084
ENSEBUG00000016944	-	80	49.609	ENSEBUG00000009330	-	61	47.826
ENSEBUG00000016944	-	69	46.713	ENSEBUG00000000554	-	80	46.786
ENSEBUG00000016944	-	61	51.237	ENSEBUG00000005655	-	74	47.692
ENSEBUG00000016944	-	86	47.955	ENSEBUG00000014739	-	85	47.955
ENSEBUG00000016944	-	69	47.569	ENSEBUG00000012628	ZNF845	80	47.569
ENSEBUG00000016944	-	60	46.053	ENSEBUG00000015472	-	60	46.053
ENSEBUG00000016944	-	75	48.667	ENSEBUG00000016688	-	65	36.742
ENSEBUG00000016944	-	65	50.655	ENSEBUG00000005319	-	71	50.655
ENSEBUG00000016944	-	76	49.289	ENSEBUG00000001121	-	79	48.084
ENSEBUG00000016944	-	69	45.525	ENSEBUG00000011694	-	96	45.525
ENSEBUG00000016944	-	89	46.786	ENSEBUG00000006666	-	98	46.786
ENSEBUG00000016944	-	74	47.982	ENSEBUG00000011435	-	70	47.982
ENSEBUG00000016944	-	86	48.449	ENSEBUG00000003954	-	86	48.449
ENSEBUG00000016944	-	73	43.842	ENSEBUG00000003236	-	96	43.750
ENSEBUG00000016944	-	64	51.261	ENSEBUG00000003232	-	58	51.261
ENSEBUG00000016944	-	71	44.578	ENSEBUG00000001741	-	71	44.578
ENSEBUG00000016944	-	85	48.727	ENSEBUG00000016281	-	82	47.479
ENSEBUG00000016944	-	63	43.322	ENSEBUG00000014469	-	77	43.322
ENSEBUG00000016944	-	64	44.565	ENSEBUG00000007740	-	95	44.565
ENSEBUG00000016944	-	69	43.902	ENSEBUG00000003644	-	79	43.902
ENSEBUG00000016944	-	79	43.175	ENSEBUG00000015693	-	79	49.265
ENSEBUG00000016944	-	79	46.875	ENSEBUG00000015403	-	71	46.875
ENSEBUG00000016944	-	60	48.057	ENSEBUG00000008306	-	79	48.057
ENSEBUG00000016944	-	69	47.445	ENSEBUG00000005264	-	61	47.122
ENSEBUG00000016944	-	62	47.826	ENSEBUG00000013622	-	56	47.500
ENSEBUG00000016944	-	59	41.304	ENSEBUG00000003459	-	73	41.304
ENSEBUG00000016944	-	55	47.934	ENSEBUG00000012737	-	76	47.934
ENSEBUG00000016944	-	62	47.569	ENSEBUG00000008107	-	96	47.569
ENSEBUG00000016944	-	61	44.526	ENSEBUG00000016093	-	73	44.526
ENSEBUG00000016944	-	61	46.286	ENSEBUG00000010878	-	50	46.286
ENSEBUG00000016944	-	63	45.455	ENSEBUG00000006080	-	94	45.455
ENSEBUG00000016944	-	67	45.290	ENSEBUG00000007143	-	61	45.565
ENSEBUG00000016944	-	69	46.441	ENSEBUG00000012775	-	68	46.441
ENSEBUG00000016944	-	62	38.909	ENSEBUG00000014704	ZBTB17	87	38.909
ENSEBUG00000016944	-	76	48.085	ENSEBUG00000011065	-	75	48.085