EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSECAG00000024920 (Gene tree)
Gene ID: 100051994
Gene Symbol: XPO1
Alias: -
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Equus_caballus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 41281 bases
Position: chr15:40633652-40674932
Accession: 25075
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSECAP00000032194	CRM1_C	PF08767.11	9.2e-135	1	1
ENSECAP00000022526	CRM1_C	PF08767.11	9.8e-135	1	1
ENSECAP00000045147	CRM1_C	PF08767.11	9.8e-135	1	1
ENSECAP00000042863	CRM1_C	PF08767.11	1.1e-134	1	1
ENSECAP00000022526	Xpo1	PF08389.12	5.7e-41	1	1
ENSECAP00000045147	Xpo1	PF08389.12	7.4e-41	1	1
ENSECAP00000042863	Xpo1	PF08389.12	8.2e-41	1	1
ENSECAP00000032194	Xpo1	PF08389.12	6.4e-37	1	1
ENSECAP00000032194	IBN_N	PF03810.19	3e-12	1	1
ENSECAP00000022526	IBN_N	PF03810.19	3.1e-12	1	1
ENSECAP00000042863	IBN_N	PF03810.19	3.6e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSECAT00000031199	-	3905	-	ENSECAP00000045147	1005 (aa)	-	UPI000BAA1F44
ENSECAT00000026941	-	3054	-	ENSECAP00000022526	1005 (aa)	-	F6S8L9
ENSECAT00000030228	-	4186	XM_023619042	ENSECAP00000042863	1071 (aa)	XP_001917538	UPI00004BB74F
ENSECAT00000040886	-	2934	-	ENSECAP00000032194	975 (aa)	-	-
ENSECAT00000034865	-	399	-	ENSECAP00000035535	120 (aa)	-	-

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ecb03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
ecb03013	RNA transport	KEGG
ecb05164	Influenza A	KEGG
ecb05166	Human T-cell leukemia virus 1 infection	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSECAG00000024920	XPO1	100	98.880	ENSG00000082898	XPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSECAG00000024920	XPO1	100	96.359	ENSAPOG00000004984	-	100	96.359	Acanthochromis_polyacanthus
ENSECAG00000024920	XPO1	94	90.532	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	90.532	Acanthochromis_polyacanthus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	99.907	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	99.907	Ailuropoda_melanoleuca
ENSECAG00000024920	XPO1	94	92.872	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.872	Amphilophus_citrinellus
ENSECAG00000024920	XPO1	94	96.702	ENSACIG00000010818	-	100	96.702	Amphilophus_citrinellus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	92.413	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	92.157	Amphiprion_ocellaris
ENSECAG00000024920	XPO1	100	96.359	ENSAOCG00000010121	-	100	96.359	Amphiprion_ocellaris
ENSECAG00000024920	XPO1	97	92.688	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	92.688	Amphiprion_percula
ENSECAG00000024920	XPO1	100	96.359	ENSAPEG00000007038	-	100	96.359	Amphiprion_percula
ENSECAG00000024920	XPO1	100	96.359	ENSATEG00000008816	-	100	96.359	Anabas_testudineus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	92.564	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	91.783	Anabas_testudineus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	99.720	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	99.720	Anas_platyrhynchos
ENSECAG00000024920	XPO1	100	99.533	ENSACAG00000002501	XPO1	100	99.533	Anolis_carolinensis
ENSECAG00000024920	XPO1	100	98.880	ENSANAG00000020802	XPO1	100	98.880	Aotus_nancymaae
ENSECAG00000024920	XPO1	100	96.172	ENSACLG00000015192	-	100	96.172	Astatotilapia_calliptera
ENSECAG00000024920	XPO1	94	93.191	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	93.191	Astatotilapia_calliptera
ENSECAG00000024920	XPO1	100	96.813	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	96.732	Astyanax_mexicanus
ENSECAG00000024920	XPO1	94	94.068	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	94.068	Astyanax_mexicanus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	100.000	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	100.000	Bos_taurus
ENSECAG00000024920	XPO1	99	56.957	WBGene00002078	xpo-1	96	56.957	Caenorhabditis_elegans
ENSECAG00000024920	XPO1	100	98.880	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.880	Callithrix_jacchus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	100.000	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	100.000	Canis_familiaris
ENSECAG00000024920	XPO1	100	100.000	ENSCAFG00020026910	XPO1	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSECAG00000024920	XPO1	100	100.000	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	100.000	Capra_hircus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	100.000	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSECAG00000024920	XPO1	58	95.390	ENSCAPG00000006454	-	100	95.390	Cavia_aperea
ENSECAG00000024920	XPO1	100	98.828	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	98.506	Cavia_porcellus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	79.902	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.963	Cebus_capucinus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	98.828	ENSCATG00000032674	XPO1	100	98.723	Cercocebus_atys
ENSECAG00000024920	XPO1	100	99.720	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	99.720	Chinchilla_lanigera
ENSECAG00000024920	XPO1	100	98.880	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.880	Chlorocebus_sabaeus
ENSECAG00000024920	XPO1	83	100.000	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSECAG00000024920	XPO1	100	99.627	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.627	Chrysemys_picta_bellii
ENSECAG00000024920	XPO1	100	85.432	ENSCING00000024562	-	100	81.285	Ciona_intestinalis
ENSECAG00000024920	XPO1	99	84.219	ENSCSAVG00000005965	-	99	80.299	Ciona_savignyi
ENSECAG00000024920	XPO1	100	94.678	ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.582	Colobus_angolensis_palliatus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	98.693	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.693	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSECAG00000024920	XPO1	100	98.693	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	98.693	Cricetulus_griseus_crigri
ENSECAG00000024920	XPO1	94	95.532	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.532	Cynoglossus_semilaevis
ENSECAG00000024920	XPO1	100	96.265	ENSCVAG00000016788	-	100	96.265	Cyprinodon_variegatus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	92.716	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	91.410	Cyprinodon_variegatus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	97.269	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	97.106	Danio_rerio
ENSECAG00000024920	XPO1	100	93.371	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	95.511	Danio_rerio
ENSECAG00000024920	XPO1	100	99.907	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	99.907	Dasypus_novemcinctus
ENSECAG00000024920	XPO1	91	99.219	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	96.417	Dipodomys_ordii
ENSECAG00000024920	XPO1	99	75.200	FBgn0020497	emb	99	71.415	Drosophila_melanogaster
ENSECAG00000024920	XPO1	94	98.708	ENSETEG00000018045	XPO1	94	98.708	Echinops_telfairi
ENSECAG00000024920	XPO1	96	79.772	ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	Eptatretus_burgeri
ENSECAG00000024920	XPO1	100	100.000	ENSEASG00005007223	XPO1	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSECAG00000024920	XPO1	92	100.000	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSECAG00000024920	XPO1	93	93.148	ENSELUG00000014306	-	99	93.148	Esox_lucius
ENSECAG00000024920	XPO1	94	95.319	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	95.319	Esox_lucius
ENSECAG00000024920	XPO1	100	100.000	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	100.000	Felis_catus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	99.440	ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.440	Ficedula_albicollis
ENSECAG00000024920	XPO1	100	98.133	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	98.133	Fukomys_damarensis
ENSECAG00000024920	XPO1	100	92.413	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	91.690	Fundulus_heteroclitus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	94.082	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	92.997	Gadus_morhua
ENSECAG00000024920	XPO1	100	95.448	ENSGMOG00000019063	-	96	95.448	Gadus_morhua
ENSECAG00000024920	XPO1	100	99.720	ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.720	Gallus_gallus
ENSECAG00000024920	XPO1	94	92.766	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.766	Gambusia_affinis
ENSECAG00000024920	XPO1	97	96.395	ENSGAFG00000003355	-	98	96.395	Gambusia_affinis
ENSECAG00000024920	XPO1	100	96.078	ENSGACG00000002743	-	100	96.078	Gasterosteus_aculeatus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	91.806	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.690	Gasterosteus_aculeatus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	99.533	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.533	Gopherus_agassizii
ENSECAG00000024920	XPO1	100	98.880	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	98.880	Gorilla_gorilla
ENSECAG00000024920	XPO1	100	96.265	ENSHBUG00000020037	-	100	96.265	Haplochromis_burtoni
ENSECAG00000024920	XPO1	100	92.868	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	92.344	Haplochromis_burtoni
ENSECAG00000024920	XPO1	100	99.627	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	99.627	Heterocephalus_glaber_female
ENSECAG00000024920	XPO1	100	99.627	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	99.627	Heterocephalus_glaber_male
ENSECAG00000024920	XPO1	94	95.532	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	95.532	Hippocampus_comes
ENSECAG00000024920	XPO1	100	96.732	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	96.732	Ictalurus_punctatus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	95.034	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.211	Ictalurus_punctatus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	99.813	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.813	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	99.720	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	99.720	Jaculus_jaculus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	96.127	ENSKMAG00000016218	-	100	95.798	Kryptolebias_marmoratus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	92.564	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	91.597	Kryptolebias_marmoratus
ENSECAG00000024920	XPO1	94	90.254	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	90.254	Labrus_bergylta
ENSECAG00000024920	XPO1	100	96.359	ENSLBEG00000005740	-	100	96.359	Labrus_bergylta
ENSECAG00000024920	XPO1	100	98.047	ENSLACG00000018213	XPO1	93	98.047	Latimeria_chalumnae
ENSECAG00000024920	XPO1	100	97.199	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	97.199	Lepisosteus_oculatus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	99.627	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	99.627	Loxodonta_africana
ENSECAG00000024920	XPO1	100	98.880	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	98.880	Macaca_fascicularis
ENSECAG00000024920	XPO1	100	98.880	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	98.880	Macaca_mulatta
ENSECAG00000024920	XPO1	100	98.880	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	98.880	Macaca_nemestrina
ENSECAG00000024920	XPO1	100	98.828	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	97.023	Mandrillus_leucophaeus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	96.265	ENSMAMG00000010568	-	100	96.265	Mastacembelus_armatus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	92.413	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	92.063	Mastacembelus_armatus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	92.868	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	92.344	Maylandia_zebra
ENSECAG00000024920	XPO1	100	96.172	ENSMZEG00005018158	-	98	96.395	Maylandia_zebra
ENSECAG00000024920	XPO1	74	99.310	ENSMGAG00000001496	-	100	99.449	Meleagris_gallopavo
ENSECAG00000024920	XPO1	100	98.693	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	98.693	Mesocricetus_auratus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	100.000	ENSMICG00000027770	XPO1	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	98.973	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	98.973	Microtus_ochrogaster
ENSECAG00000024920	XPO1	94	92.872	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	92.872	Mola_mola
ENSECAG00000024920	XPO1	93	96.371	ENSMMOG00000008001	-	99	96.371	Mola_mola
ENSECAG00000024920	XPO1	100	98.828	ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.693	Monodelphis_domestica
ENSECAG00000024920	XPO1	94	91.923	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	91.923	Monopterus_albus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	95.903	ENSMALG00000007085	-	100	95.892	Monopterus_albus
ENSECAG00000024920	XPO1	100	99.219	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	99.066	Mus_caroli
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