EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEEUG00000005349 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: AGO1
Alias: EIF2C1|hAGO1
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Erinaceus_europaeus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 53237 bases
Position: chrGeneScaffold_3819:15040-68276
Accession: 3262
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEEUP00000004900	PAZ	PF02170.22	1.8e-10	1	1
ENSEEUP00000004900	Piwi	PF02171.17	6.8e-111	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEEUT00000005383	AGO1-201	2574	-	ENSEEUP00000004900	857 (aa)	-	UPI0000F62E1C

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSEEUG00000005349	AGO1	68	75.393	ENSEEUG00000000745	AGO4	69	75.393
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	60.176	ENSEEUG00000007058	AGO3	93	60.176
ENSEEUG00000005349	AGO1	55	96.429	ENSEEUG00000008564	-	55	96.429

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSG00000092847	AGO1	100	91.560	Homo_sapiens
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.818	ENSAPOG00000024299	ago1	96	88.439	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSAMEG00000000504	AGO1	92	91.614	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEEUG00000005349	AGO1	82	82.621	ENSACIG00000005298	ago1	98	82.621	Amphilophus_citrinellus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.818	ENSAOCG00000017727	ago1	92	88.818	Amphiprion_ocellaris
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.818	ENSAPEG00000004458	ago1	93	88.818	Amphiprion_percula
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.818	ENSATEG00000008523	ago1	92	88.818	Anabas_testudineus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	86.726	ENSAPLG00000010440	AGO1	91	86.726	Anas_platyrhynchos
ENSEEUG00000005349	AGO1	91	91.432	ENSACAG00000029174	AGO1	100	91.432	Anolis_carolinensis
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSANAG00000037711	AGO1	92	91.614	Aotus_nancymaae
ENSEEUG00000005349	AGO1	82	98.853	ENSACLG00000000890	ago1	93	98.853	Astatotilapia_calliptera
ENSEEUG00000005349	AGO1	80	88.921	ENSAMXG00000001917	ago1	98	88.921	Astyanax_mexicanus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.487	ENSBTAG00000012253	AGO1	92	91.487	Bos_taurus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSCJAG00000032023	AGO1	92	91.614	Callithrix_jacchus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSCAFG00000003443	AGO1	92	91.614	Canis_familiaris
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSCAFG00020009251	AGO1	92	99.683	Canis_lupus_dingo
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.105	ENSCHIG00000011848	-	92	90.909	Capra_hircus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSTSYG00000009767	-	92	91.614	Carlito_syrichta
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	71.410	ENSTSYG00000032426	-	99	71.143	Carlito_syrichta
ENSEEUG00000005349	AGO1	66	100.000	ENSCAPG00000010228	AGO1	84	94.080	Cavia_aperea
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSCPOG00000011568	AGO1	92	91.614	Cavia_porcellus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSCCAG00000011823	AGO1	92	91.614	Cebus_capucinus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSCATG00000031521	AGO1	100	91.560	Cercocebus_atys
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSCLAG00000011507	AGO1	92	91.614	Chinchilla_lanigera
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSCSAG00000001091	AGO1	92	91.614	Chlorocebus_sabaeus
ENSEEUG00000005349	AGO1	78	94.574	ENSCHOG00000011591	AGO1	79	94.574	Choloepus_hoffmanni
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.487	ENSCPBG00000018594	AGO1	92	91.487	Chrysemys_picta_bellii
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSCANG00000039798	AGO1	92	91.614	Colobus_angolensis_palliatus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSCGRG00001022708	Ago1	92	91.614	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSCGRG00000010386	Ago1	93	91.614	Cricetulus_griseus_crigri
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	87.157	ENSCSEG00000001051	ago1	93	87.157	Cynoglossus_semilaevis
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.818	ENSCVAG00000018173	ago1	92	88.818	Cyprinodon_variegatus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.945	ENSDARG00000092644	ago1	92	88.945	Danio_rerio
ENSEEUG00000005349	AGO1	91	91.560	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	91.560	Dasypus_novemcinctus
ENSEEUG00000005349	AGO1	83	100.000	ENSDORG00000008494	Ago1	91	100.000	Dipodomys_ordii
ENSEEUG00000005349	AGO1	76	82.335	ENSETEG00000007626	AGO1	90	82.335	Echinops_telfairi
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSEASG00005012086	AGO1	92	91.614	Equus_asinus_asinus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSECAG00000024353	AGO1	92	91.614	Equus_caballus
ENSEEUG00000005349	AGO1	91	88.619	ENSELUG00000016803	ago1	100	88.619	Esox_lucius
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSFCAG00000000746	AGO1	92	91.614	Felis_catus
ENSEEUG00000005349	AGO1	91	83.801	ENSFALG00000000790	AGO1	100	83.801	Ficedula_albicollis
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSFDAG00000017210	AGO1	92	91.614	Fukomys_damarensis
ENSEEUG00000005349	AGO1	87	88.636	ENSFHEG00000017927	ago1	90	88.636	Fundulus_heteroclitus
ENSEEUG00000005349	AGO1	87	86.515	ENSGMOG00000019413	ago1	100	86.515	Gadus_morhua
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.487	ENSGALG00000002249	AGO1	92	91.487	Gallus_gallus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.818	ENSGAFG00000009775	ago1	92	88.818	Gambusia_affinis
ENSEEUG00000005349	AGO1	87	88.415	ENSGACG00000012443	ago1	100	88.415	Gasterosteus_aculeatus
ENSEEUG00000005349	AGO1	91	91.432	ENSGAGG00000012893	-	100	91.432	Gopherus_agassizii
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSGGOG00000003316	AGO1	92	91.614	Gorilla_gorilla
ENSEEUG00000005349	AGO1	82	98.853	ENSHBUG00000010459	ago1	93	98.853	Haplochromis_burtoni
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSHGLG00000011540	AGO1	92	91.614	Heterocephalus_glaber_female
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSHGLG00100005568	AGO1	92	91.614	Heterocephalus_glaber_male
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.818	ENSHCOG00000005708	ago1	93	88.818	Hippocampus_comes
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.564	ENSIPUG00000023216	ago1	100	84.547	Ictalurus_punctatus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSSTOG00000010857	AGO1	92	91.614	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSJJAG00000019449	Ago1	92	91.614	Jaculus_jaculus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.818	ENSKMAG00000019464	ago1	92	88.818	Kryptolebias_marmoratus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.818	ENSLBEG00000007694	ago1	97	84.425	Labrus_bergylta
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	85.044	ENSLACG00000017009	AGO1	92	85.044	Latimeria_chalumnae
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	86.150	ENSLOCG00000000504	AGO1	92	86.150	Lepisosteus_oculatus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSLAFG00000010835	AGO1	93	91.614	Loxodonta_africana
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSMFAG00000002846	AGO1	92	91.614	Macaca_fascicularis
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	86.658	ENSMMUG00000006251	AGO1	94	86.272	Macaca_mulatta
ENSEEUG00000005349	AGO1	91	91.560	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	91.560	Macaca_nemestrina
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSMLEG00000038388	AGO1	92	91.614	Mandrillus_leucophaeus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.818	ENSMAMG00000008381	ago1	99	85.756	Mastacembelus_armatus
ENSEEUG00000005349	AGO1	82	98.853	ENSMZEG00005007996	ago1	93	98.853	Maylandia_zebra
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	85.768	ENSMGAG00000003822	AGO1	92	85.768	Meleagris_gallopavo
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSMAUG00000015189	Ago1	92	91.614	Mesocricetus_auratus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSMICG00000016147	AGO1	92	91.614	Microcebus_murinus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.487	ENSMOCG00000000537	Ago1	92	91.487	Microtus_ochrogaster
ENSEEUG00000005349	AGO1	78	88.806	ENSMMOG00000018459	ago1	93	88.806	Mola_mola
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.360	ENSMODG00000023335	AGO1	92	91.360	Monodelphis_domestica
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.691	ENSMALG00000011057	ago1	94	88.437	Monopterus_albus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	92.224	Mus_caroli
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	92.224	Mus_musculus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	92.224	Mus_pahari
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	92.224	Mus_spretus
ENSEEUG00000005349	AGO1	84	90.808	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	90.808	Mustela_putorius_furo
ENSEEUG00000005349	AGO1	54	85.217	ENSMLUG00000009628	AGO1	88	85.217	Myotis_lucifugus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSNGAG00000017448	Ago1	92	91.614	Nannospalax_galili
ENSEEUG00000005349	AGO1	91	88.619	ENSNBRG00000010867	ago1	100	88.619	Neolamprologus_brichardi
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSNLEG00000011181	AGO1	92	91.614	Nomascus_leucogenys
ENSEEUG00000005349	AGO1	84	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSEEUG00000005349	AGO1	84	100.000	ENSOPRG00000012325	AGO1	85	100.000	Ochotona_princeps
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSODEG00000005321	AGO1	92	91.614	Octodon_degus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.691	ENSONIG00000016345	ago1	93	88.691	Oreochromis_niloticus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	85.787	ENSOANG00000002080	AGO1	92	85.787	Ornithorhynchus_anatinus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSOCUG00000023116	AGO1	92	91.614	Oryctolagus_cuniculus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.818	ENSORLG00000014965	ago1	92	88.818	Oryzias_latipes
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.818	ENSORLG00020018253	ago1	92	88.818	Oryzias_latipes_hni
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.818	ENSORLG00015003287	ago1	92	88.818	Oryzias_latipes_hsok
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.818	ENSOMEG00000020528	ago1	92	88.818	Oryzias_melastigma
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSOGAG00000010279	AGO1	92	91.614	Otolemur_garnettii
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.487	ENSOARG00000019591	AGO1	92	91.487	Ovis_aries
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSPPAG00000034838	AGO1	92	91.614	Pan_paniscus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSPPRG00000006475	AGO1	92	91.614	Panthera_pardus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.360	ENSPTIG00000020991	AGO1	92	91.360	Panthera_tigris_altaica
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSPTRG00000000528	AGO1	92	91.614	Pan_troglodytes
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSPANG00000009060	AGO1	92	91.614	Papio_anubis
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	90.621	ENSPSIG00000017482	AGO1	94	90.621	Pelodiscus_sinensis
ENSEEUG00000005349	AGO1	80	88.047	ENSPMGG00000024099	ago1	98	88.047	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSPEMG00000023313	Ago1	92	91.614	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.360	ENSPCIG00000000172	AGO1	92	91.360	Phascolarctos_cinereus
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.818	ENSPFOG00000005867	ago1	92	88.818	Poecilia_formosa
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.818	ENSPLAG00000002824	ago1	99	88.567	Poecilia_latipinna
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.818	ENSPMEG00000001787	ago1	99	88.567	Poecilia_mexicana
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.818	ENSPREG00000006534	ago1	92	88.818	Poecilia_reticulata
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSPPYG00000001551	AGO1	92	91.614	Pongo_abelii
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSPCOG00000022061	AGO1	100	91.560	Propithecus_coquereli
ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	ENSPVAG00000005082	AGO1	92	91.614	Pteropus_vampyrus
ENSEEUG00000005349	AGO1	82	98.853	ENSPNYG00000012586	ago1	93	98.853	Pundamilia_nyererei
ENSEEUG00000005349	AGO1	88	83.533	ENSPNAG00000000597	ago1	94	83.533	Pygocentrus_nattereri
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