EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEEUG00000006196 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: PAPOLG
Alias: FLJ12972
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Erinaceus_europaeus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 40318 bases
Position: chrGeneScaffold_2548:34691-75008
Accession: 14982
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEEUP00000005680	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.3e-23	1	2
ENSEEUP00000005680	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.3e-23	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEEUT00000006222	PAPOLG-201	2217	-	ENSEEUP00000005680	738 (aa)	-	UPI0000F638C8

Gene Model

Click here to download ENSEEUG00000006196's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSEEUG00000006196's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.671	ENSG00000115421	PAPOLG	100	83.671	Homo_sapiens
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	63.793	ENSAPOG00000004798	papolg	99	62.973	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	99	84.282	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	100	84.282	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	61.404	ENSACIG00000010546	papolg	99	61.808	Amphilophus_citrinellus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	63.793	ENSAOCG00000010254	papolg	89	64.058	Amphiprion_ocellaris
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	63.793	ENSAPEG00000006944	papolg	89	64.058	Amphiprion_percula
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	64.447	ENSATEG00000009007	papolg	80	74.606	Anabas_testudineus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	99	65.246	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	65.246	Anas_platyrhynchos
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	80	58.979	ENSACAG00000015048	-	99	58.979	Anolis_carolinensis
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.806	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	83.806	Aotus_nancymaae
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	62.141	ENSACLG00000015592	papolg	89	62.663	Astatotilapia_calliptera
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	64.418	ENSAMXG00000004611	papolg	100	64.418	Astyanax_mexicanus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	84.076	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	84.076	Bos_taurus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.941	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	83.941	Callithrix_jacchus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	84.076	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	78.431	Canis_familiaris
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.266	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	83.534	Canis_lupus_dingo
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.941	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	83.941	Capra_hircus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.806	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	83.806	Carlito_syrichta
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	52	74.016	ENSCAPG00000014901	-	100	74.016	Cavia_aperea
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	84.189	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	84.189	Cavia_porcellus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	84.211	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	84.211	Cebus_capucinus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	91	82.727	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	82.727	Cercocebus_atys
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.671	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	83.671	Chinchilla_lanigera
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.941	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	83.941	Chlorocebus_sabaeus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	89	81.184	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	81.184	Choloepus_hoffmanni
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	71	54.699	ENSCING00000024664	-	99	54.699	Ciona_intestinalis
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	66	57.732	ENSCSAVG00000009085	-	97	57.732	Ciona_savignyi
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.806	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	83.806	Colobus_angolensis_palliatus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	99	82.240	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	82.240	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	99	82.240	ENSCGRG00000005552	-	100	82.240	Cricetulus_griseus_crigri
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	62.568	ENSCSEG00000000771	papolg	99	63.243	Cynoglossus_semilaevis
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	60.622	ENSCVAG00000016602	papolg	89	74.349	Cyprinodon_variegatus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	65.125	ENSDARG00000012141	papolg	100	65.125	Danio_rerio
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	80.637	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	80.637	Dasypus_novemcinctus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	58	82.751	ENSDORG00000016228	Papolg	100	82.751	Dipodomys_ordii
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	78.869	ENSETEG00000011815	PAPOLG	99	79.054	Echinops_telfairi
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	60	65.617	ENSEBUG00000004020	papolg	90	65.617	Eptatretus_burgeri
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	63	54.604	ENSEBUG00000005042	-	79	54.604	Eptatretus_burgeri
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	84.480	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	84.480	Equus_asinus_asinus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	84.345	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	84.011	Equus_caballus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	65.747	ENSELUG00000014497	papolg	98	66.183	Esox_lucius
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	84.345	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	84.345	Felis_catus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	99	57.728	ENSFALG00000011079	PAPOLG	97	57.728	Ficedula_albicollis
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.671	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	83.671	Fukomys_damarensis
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	66	57.426	ENSFHEG00000019080	papolg	90	58.103	Fundulus_heteroclitus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	87	73.285	ENSGMOG00000018772	papolg	90	73.285	Gadus_morhua
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	62.850	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	62.850	Gallus_gallus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	62.137	ENSGAFG00000003263	papolg	89	62.254	Gambusia_affinis
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	63.974	ENSGACG00000002718	papolg	100	63.974	Gasterosteus_aculeatus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.806	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	83.806	Gorilla_gorilla
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	62.141	ENSHBUG00000004882	papolg	89	62.663	Haplochromis_burtoni
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	99	83.582	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	100	83.582	Heterocephalus_glaber_female
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.919	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	83.919	Heterocephalus_glaber_male
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	62.633	ENSHCOG00000006782	papolg	89	62.781	Hippocampus_comes
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	64.729	ENSIPUG00000021642	papolg	100	65.013	Ictalurus_punctatus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	84.615	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	84.615	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	58	82.751	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	82.751	Jaculus_jaculus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	62.683	ENSKMAG00000016439	papolg	97	61.134	Kryptolebias_marmoratus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	60.179	ENSLBEG00000023218	papolg	89	60.591	Labrus_bergylta
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	98	61.924	ENSLACG00000009543	PAPOLG	98	61.924	Latimeria_chalumnae
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	66.361	ENSLOCG00000016130	papolg	100	66.361	Lepisosteus_oculatus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	82.075	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	82.075	Loxodonta_africana
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.941	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	83.941	Macaca_fascicularis
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.941	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	83.941	Macaca_mulatta
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	77.480	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	77.480	Macaca_nemestrina
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.806	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	83.806	Mandrillus_leucophaeus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	63.793	ENSMAMG00000010667	papolg	99	62.162	Mastacembelus_armatus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	62.141	ENSMZEG00005018140	papolg	99	62.963	Maylandia_zebra
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	62.115	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	100	62.115	Meleagris_gallopavo
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	99	81.831	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	81.831	Mesocricetus_auratus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.941	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	83.941	Microcebus_murinus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	81.757	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	81.757	Microtus_ochrogaster
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	63.926	ENSMMOG00000008020	papolg	99	64.191	Mola_mola
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	99	77.346	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	77.346	Monodelphis_domestica
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	64.037	ENSMALG00000007012	papolg	89	64.037	Monopterus_albus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	82.973	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	100	82.973	Mus_caroli
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	82.703	ENSMUSG00000020273	Papolg	100	82.703	Mus_musculus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.108	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	83.108	Mus_pahari
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	82.568	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	100	82.568	Mus_spretus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	84.211	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	84.211	Mustela_putorius_furo
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	99	83.740	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	100	83.740	Myotis_lucifugus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.919	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	83.919	Nannospalax_galili
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	99	57.652	ENSNBRG00000011943	papolg	99	57.916	Neolamprologus_brichardi
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	58	82.984	ENSNLEG00000009507	-	100	82.984	Nomascus_leucogenys
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	64	99.091	ENSMEUG00000013605	-	69	99.091	Notamacropus_eugenii
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.401	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	83.401	Ochotona_princeps
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	58	78.404	ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	78.404	Octodon_degus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	59.492	ENSONIG00000002985	papolg	100	59.893	Oreochromis_niloticus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	99	76.139	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	76.139	Ornithorhynchus_anatinus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	84.480	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	84.480	Oryctolagus_cuniculus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	62.701	ENSORLG00000001577	papolg	89	63.151	Oryzias_latipes
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	62.968	ENSORLG00020002482	papolg	89	63.284	Oryzias_latipes_hni
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	62.701	ENSORLG00015008836	papolg	89	63.151	Oryzias_latipes_hsok
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	62.667	ENSOMEG00000001406	papolg	89	62.667	Oryzias_melastigma
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	58	79.720	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	79.720	Otolemur_garnettii
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.806	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	83.806	Ovis_aries
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.671	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	83.671	Pan_paniscus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	84.076	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	84.076	Panthera_pardus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.941	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	83.941	Panthera_tigris_altaica
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.671	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	83.671	Pan_troglodytes
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	79.946	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	79.946	Papio_anubis
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	64.171	ENSPKIG00000003313	papolg	100	64.171	Paramormyrops_kingsleyae
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	90	65.037	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	94	65.037	Paramormyrops_kingsleyae
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	98	70.014	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	70.014	Pelodiscus_sinensis
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	99	81.967	ENSPEMG00000008960	-	100	81.967	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	66	54.806	ENSPMAG00000004864	-	96	54.806	Petromyzon_marinus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	82	66.327	ENSPMAG00000002961	papolg	99	47.410	Petromyzon_marinus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	76.903	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	76.903	Phascolarctos_cinereus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	60.784	ENSPFOG00000012909	papolg	99	61.528	Poecilia_formosa
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	61.722	ENSPLAG00000018445	papolg	89	61.761	Poecilia_latipinna
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	60.836	ENSPMEG00000003961	papolg	89	61.629	Poecilia_mexicana
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	75	73.056	ENSPREG00000010358	papolg	89	61.358	Poecilia_reticulata
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.536	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	83.536	Pongo_abelii
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	99	71.973	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	71.973	Procavia_capensis
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	74.595	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	74.595	Propithecus_coquereli
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	89	87.097	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	87.097	Pteropus_vampyrus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	62.838	ENSPNYG00000006729	papolg	99	62.838	Pundamilia_nyererei
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	64.589	ENSPNAG00000015521	papolg	100	64.589	Pygocentrus_nattereri
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	82.297	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	82.297	Rattus_norvegicus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	79.757	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	79.757	Rhinopithecus_bieti
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.806	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	83.806	Rhinopithecus_roxellana
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.941	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	83.941	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	94	77.305	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	77.305	Sarcophilus_harrisii
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	64.238	ENSSFOG00015002383	papolg	100	64.238	Scleropages_formosus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	57.104	ENSSFOG00015011874	papolg	100	57.104	Scleropages_formosus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	75	73.561	ENSSMAG00000015598	papolg	95	60.226	Scophthalmus_maximus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	64.096	ENSSDUG00000000912	papolg	99	62.432	Seriola_dumerili
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	64.096	ENSSLDG00000001217	papolg	99	59.492	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	69.067	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	69.067	Sphenodon_punctatus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	62.046	ENSSPAG00000009004	papolg	99	62.046	Stegastes_partitus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	84.885	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	84.885	Sus_scrofa
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	73	66.234	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	99	66.234	Taeniopygia_guttata
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	62.282	ENSTRUG00000006410	papolg	99	62.282	Takifugu_rubripes
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	58.026	ENSTNIG00000017106	papolg	100	58.026	Tetraodon_nigroviridis
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	99	83.810	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	83.810	Tupaia_belangeri
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	79.622	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	79.622	Tursiops_truncatus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	99	84.584	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	84.584	Ursus_americanus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	99	84.584	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	84.584	Ursus_maritimus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	99	80.680	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	80.680	Vicugna_pacos
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	84.211	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	84.211	Vulpes_vulpes
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	66.313	ENSXETG00000002208	papolg	100	66.313	Xenopus_tropicalis
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	67	74.297	ENSXCOG00000006611	papolg	73	74.297	Xiphophorus_couchianus
ENSEEUG00000006196	PAPOLG	67	71.743	ENSXMAG00000007383	papolg	95	71.743	Xiphophorus_maculatus