EuRBPDB

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEEUG00000007058 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: AGO3
Alias: EIF2C3|FLJ12765|hAGO3
Full Name: argonaute 3%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Erinaceus_europaeus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 181075 bases
Position: chrGeneScaffold_3798:653-181727
Accession: 18421
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEEUP00000006464	PAZ	PF02170.22	5.2e-28	1	1
ENSEEUP00000006464	Piwi	PF02171.17	8.1e-71	1	2
ENSEEUP00000006464	Piwi	PF02171.17	8.1e-71	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEEUT00000007079	AGO3-201	2583	-	ENSEEUP00000006464	860 (aa)	-	UPI0000F6411F

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSEEUG00000007058	AGO3	93	60.176	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	60.176
ENSEEUG00000007058	AGO3	59	96.667	ENSEEUG00000008564	-	59	96.667
ENSEEUG00000007058	AGO3	79	80.250	ENSEEUG00000000745	AGO4	79	80.250

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	82.907	ENSG00000126070	AGO3	100	98.438	Homo_sapiens
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	78.201	ENSAPOG00000014494	-	100	78.201	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	80.581	ENSAPOG00000024260	ago3a	100	80.581	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	83.023	ENSAMEG00000000497	AGO3	100	83.023	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEEUG00000007058	AGO3	92	79.772	ENSACIG00000005333	ago3a	100	79.772	Amphilophus_citrinellus
ENSEEUG00000007058	AGO3	92	78.129	ENSACIG00000019272	AGO3	100	78.129	Amphilophus_citrinellus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	80.581	ENSAOCG00000017642	ago3a	100	80.581	Amphiprion_ocellaris
ENSEEUG00000007058	AGO3	54	79.541	ENSAOCG00000022538	-	91	79.541	Amphiprion_ocellaris
ENSEEUG00000007058	AGO3	80	98.529	ENSAOCG00000017051	-	91	98.529	Amphiprion_ocellaris
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	79.931	ENSAPEG00000004375	ago3a	100	79.931	Amphiprion_percula
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	77.855	ENSAPEG00000020249	-	100	77.855	Amphiprion_percula
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	79.931	ENSATEG00000008458	ago3a	100	79.931	Anabas_testudineus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	77.970	ENSATEG00000005160	-	100	77.970	Anabas_testudineus
ENSEEUG00000007058	AGO3	99	82.477	ENSAPLG00000009642	AGO3	99	82.477	Anas_platyrhynchos
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	82.326	ENSACAG00000003385	AGO3	100	82.326	Anolis_carolinensis
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	82.907	ENSANAG00000037735	AGO3	100	82.907	Aotus_nancymaae
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	80.581	ENSACLG00000000963	ago3a	100	80.581	Astatotilapia_calliptera
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	77.855	ENSACLG00000001965	-	100	77.855	Astatotilapia_calliptera
ENSEEUG00000007058	AGO3	92	79.646	ENSAMXG00000002198	ago3a	100	79.646	Astyanax_mexicanus
ENSEEUG00000007058	AGO3	92	78.635	ENSAMXG00000009571	ago3b	100	78.635	Astyanax_mexicanus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	83.023	ENSBTAG00000018324	AGO3	100	83.023	Bos_taurus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	82.907	ENSCJAG00000031580	AGO3	100	82.907	Callithrix_jacchus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	82.907	ENSCAFG00000024682	AGO3	100	82.907	Canis_familiaris
ENSEEUG00000007058	AGO3	99	82.847	ENSCAFG00020009051	AGO3	99	82.847	Canis_lupus_dingo
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	83.023	ENSCHIG00000011536	AGO3	100	83.023	Capra_hircus
ENSEEUG00000007058	AGO3	79	85.125	ENSTSYG00000011897	AGO3	94	85.125	Carlito_syrichta
ENSEEUG00000007058	AGO3	74	100.000	ENSCAPG00000011589	AGO3	88	100.000	Cavia_aperea
ENSEEUG00000007058	AGO3	99	79.415	ENSCPOG00000030524	AGO3	100	79.415	Cavia_porcellus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	82.907	ENSCCAG00000034189	AGO3	100	84.185	Cebus_capucinus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	82.907	ENSCATG00000029748	AGO3	100	84.185	Cercocebus_atys
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	83.023	ENSCLAG00000013184	AGO3	100	83.023	Chinchilla_lanigera
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	82.907	ENSCSAG00000001092	AGO3	100	82.907	Chlorocebus_sabaeus
ENSEEUG00000007058	AGO3	84	100.000	ENSCHOG00000011621	AGO3	87	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	82.674	ENSCPBG00000018583	AGO3	100	82.674	Chrysemys_picta_bellii
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	82.907	ENSCANG00000033258	AGO3	100	84.185	Colobus_angolensis_palliatus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	82.558	ENSCGRG00001024614	Ago3	100	82.558	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	82.558	ENSCGRG00000010670	Ago3	100	82.558	Cricetulus_griseus_crigri
ENSEEUG00000007058	AGO3	92	72.659	ENSCSEG00000009788	-	100	72.659	Cynoglossus_semilaevis
ENSEEUG00000007058	AGO3	92	79.393	ENSCSEG00000001040	ago3a	100	79.393	Cynoglossus_semilaevis
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	80.233	ENSCVAG00000018224	ago3a	100	80.233	Cyprinodon_variegatus
ENSEEUG00000007058	AGO3	52	76.974	ENSCVAG00000011229	-	98	76.974	Cyprinodon_variegatus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	78.837	ENSDARG00000063079	ago3b	100	78.837	Danio_rerio
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	79.815	ENSDARG00000059888	ago3a	100	79.815	Danio_rerio
ENSEEUG00000007058	AGO3	88	80.739	ENSDNOG00000008106	AGO3	100	80.739	Dasypus_novemcinctus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	82.674	ENSDORG00000009414	Ago3	100	82.674	Dipodomys_ordii
ENSEEUG00000007058	AGO3	85	88.032	ENSETEG00000007639	AGO3	89	88.032	Echinops_telfairi
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	83.023	ENSEASG00005012089	AGO3	100	83.023	Equus_asinus_asinus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	83.023	ENSECAG00000023972	AGO3	100	83.023	Equus_caballus
ENSEEUG00000007058	AGO3	85	93.269	ENSELUG00000001774	-	93	93.269	Esox_lucius
ENSEEUG00000007058	AGO3	92	76.738	ENSELUG00000016755	ago3a	100	76.738	Esox_lucius
ENSEEUG00000007058	AGO3	73	84.185	ENSFCAG00000000747	-	100	84.185	Felis_catus
ENSEEUG00000007058	AGO3	99	82.360	ENSFALG00000000802	AGO3	99	82.360	Ficedula_albicollis
ENSEEUG00000007058	AGO3	99	82.884	ENSFDAG00000012874	AGO3	100	82.884	Fukomys_damarensis
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	77.163	ENSFHEG00000016205	-	100	77.163	Fundulus_heteroclitus
ENSEEUG00000007058	AGO3	97	80.000	ENSGMOG00000013069	-	100	80.000	Gadus_morhua
ENSEEUG00000007058	AGO3	83	96.748	ENSGMOG00000019418	-	89	96.748	Gadus_morhua
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	82.558	ENSGALG00000043711	AGO3	100	82.558	Gallus_gallus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	80.465	ENSGAFG00000009808	ago3a	100	80.465	Gambusia_affinis
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	77.163	ENSGAFG00000015911	-	100	77.163	Gambusia_affinis
ENSEEUG00000007058	AGO3	97	78.563	ENSGACG00000002455	AGO3	100	78.563	Gasterosteus_aculeatus
ENSEEUG00000007058	AGO3	92	79.297	ENSGACG00000012453	ago3a	100	79.297	Gasterosteus_aculeatus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	82.558	ENSGAGG00000012887	AGO3	100	82.558	Gopherus_agassizii
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	82.907	ENSGGOG00000036711	AGO3	100	82.907	Gorilla_gorilla
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	77.855	ENSHBUG00000017794	-	100	77.855	Haplochromis_burtoni
ENSEEUG00000007058	AGO3	89	77.132	ENSHBUG00000010542	ago3a	97	77.132	Haplochromis_burtoni
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	83.023	ENSHGLG00000012538	AGO3	100	83.023	Heterocephalus_glaber_female
ENSEEUG00000007058	AGO3	99	82.353	ENSHGLG00100006043	AGO3	100	82.353	Heterocephalus_glaber_male
ENSEEUG00000007058	AGO3	87	78.121	ENSHCOG00000005674	ago3a	97	78.121	Hippocampus_comes
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	76.701	ENSHCOG00000011851	AGO3	100	76.701	Hippocampus_comes
ENSEEUG00000007058	AGO3	94	89.820	ENSIPUG00000008548	ago3b	92	89.820	Ictalurus_punctatus
ENSEEUG00000007058	AGO3	94	87.524	ENSIPUG00000023241	ago3a	97	87.524	Ictalurus_punctatus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	78.256	ENSSTOG00000025904	AGO3	100	78.256	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	82.907	ENSJJAG00000017436	Ago3	100	82.907	Jaculus_jaculus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	79.931	ENSKMAG00000019534	ago3a	100	79.931	Kryptolebias_marmoratus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	77.449	ENSLBEG00000016073	-	100	77.449	Labrus_bergylta
ENSEEUG00000007058	AGO3	92	79.772	ENSLBEG00000007592	ago3a	100	79.772	Labrus_bergylta
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	83.023	ENSLAFG00000002744	AGO3	100	83.023	Loxodonta_africana
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	82.907	ENSMFAG00000035610	AGO3	100	84.185	Macaca_fascicularis
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	82.907	ENSMMUG00000006252	AGO3	100	82.907	Macaca_mulatta
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	82.907	ENSMNEG00000039518	AGO3	100	84.185	Macaca_nemestrina
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	82.907	ENSMLEG00000027912	AGO3	100	84.185	Mandrillus_leucophaeus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	75.987	ENSMAMG00000008440	ago3a	100	79.899	Mastacembelus_armatus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	77.624	ENSMAMG00000005697	-	100	77.624	Mastacembelus_armatus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	80.581	ENSMZEG00005007949	ago3a	100	80.581	Maylandia_zebra
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	77.970	ENSMZEG00005026243	-	100	77.970	Maylandia_zebra
ENSEEUG00000007058	AGO3	99	82.456	ENSMGAG00000003773	AGO3	99	82.456	Meleagris_gallopavo
ENSEEUG00000007058	AGO3	74	98.165	ENSMAUG00000010128	Ago3	79	98.165	Mesocricetus_auratus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	83.023	ENSMICG00000016158	AGO3	100	83.023	Microcebus_murinus
ENSEEUG00000007058	AGO3	92	87.091	ENSMOCG00000020568	Ago3	93	87.091	Microtus_ochrogaster
ENSEEUG00000007058	AGO3	83	98.058	ENSMMOG00000018446	ago3a	90	98.058	Mola_mola
ENSEEUG00000007058	AGO3	85	93.333	ENSMMOG00000014065	-	94	93.333	Mola_mola
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	82.326	ENSMODG00000017869	AGO3	100	82.326	Monodelphis_domestica
ENSEEUG00000007058	AGO3	98	75.443	ENSMALG00000014658	-	99	75.443	Monopterus_albus
ENSEEUG00000007058	AGO3	91	98.246	ENSMALG00000010895	ago3a	94	98.246	Monopterus_albus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	82.209	MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	82.209	Mus_caroli
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	81.977	ENSMUSG00000028842	Ago3	100	81.977	Mus_musculus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	82.093	MGP_PahariEiJ_G0028808	Ago3	100	82.093	Mus_pahari
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	82.326	MGP_SPRETEiJ_G0027456	Ago3	100	82.326	Mus_spretus
ENSEEUG00000007058	AGO3	73	84.026	ENSMLUG00000009668	AGO3	100	84.026	Myotis_lucifugus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	82.791	ENSNGAG00000012607	Ago3	100	82.791	Nannospalax_galili
ENSEEUG00000007058	AGO3	92	77.876	ENSNBRG00000015687	AGO3	100	77.876	Neolamprologus_brichardi
ENSEEUG00000007058	AGO3	92	70.818	ENSNBRG00000010936	ago3a	100	70.818	Neolamprologus_brichardi
ENSEEUG00000007058	AGO3	99	78.429	ENSNLEG00000027092	AGO3	99	78.429	Nomascus_leucogenys
ENSEEUG00000007058	AGO3	82	86.755	ENSMEUG00000009200	AGO3	86	86.755	Notamacropus_eugenii
ENSEEUG00000007058	AGO3	77	100.000	ENSOPRG00000012344	AGO3	76	100.000	Ochotona_princeps
ENSEEUG00000007058	AGO3	99	82.884	ENSODEG00000005161	AGO3	100	82.884	Octodon_degus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	78.085	ENSONIG00000013760	AGO3	100	78.085	Oreochromis_niloticus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	80.465	ENSONIG00000016349	ago3a	100	80.465	Oreochromis_niloticus
ENSEEUG00000007058	AGO3	98	82.270	ENSOANG00000002078	AGO3	100	82.270	Ornithorhynchus_anatinus
ENSEEUG00000007058	AGO3	100	83.023	ENSOCUG00000006255	AGO3	100	83.023	Oryctolagus_cuniculus
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