EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEEUG00000009479 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: XPO1
Alias: CRM1|emb
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Erinaceus_europaeus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 42389 bases
Position: chrGeneScaffold_8706:4708-47096
Accession: 12825
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEEUP00000008677	CRM1_C	PF08767.11	2.9e-81	1	1
ENSEEUP00000008677	Xpo1	PF08389.12	1.5e-24	1	1
ENSEEUP00000008677	IBN_N	PF03810.19	2.8e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEEUT00000009521	XPO1-201	3216	-	ENSEEUP00000008677	1071 (aa)	-	UPI0000F62798

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	91.667	ENSG00000082898	XPO1	100	99.441	Homo_sapiens
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	93.750	ENSAPOG00000004984	-	92	93.750	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEEUG00000009479	XPO1	80	93.750	ENSAPOG00000002354	xpo1a	91	93.750	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	ENSAMEG00000003460	XPO1	92	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEEUG00000009479	XPO1	80	93.750	ENSACIG00000010259	xpo1a	91	93.750	Amphilophus_citrinellus
ENSEEUG00000009479	XPO1	80	93.750	ENSACIG00000010818	-	91	93.750	Amphilophus_citrinellus
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	93.750	ENSAOCG00000010121	-	92	93.750	Amphiprion_ocellaris
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	93.750	ENSAOCG00000018914	xpo1a	92	93.750	Amphiprion_ocellaris
ENSEEUG00000009479	XPO1	83	93.750	ENSAPEG00000006583	xpo1a	91	93.750	Amphiprion_percula
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	93.750	ENSAPEG00000007038	-	92	93.750	Amphiprion_percula
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	93.750	ENSATEG00000008816	-	92	93.750	Anabas_testudineus
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	91.667	ENSATEG00000020750	xpo1a	92	91.667	Anabas_testudineus
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	ENSAPLG00000004008	XPO1	92	100.000	Anas_platyrhynchos
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	ENSACAG00000002501	XPO1	92	100.000	Anolis_carolinensis
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	91.667	ENSANAG00000020802	XPO1	92	91.667	Aotus_nancymaae
ENSEEUG00000009479	XPO1	80	97.917	ENSACLG00000015669	xpo1a	91	97.917	Astatotilapia_calliptera
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	93.750	ENSACLG00000015192	-	92	93.750	Astatotilapia_calliptera
ENSEEUG00000009479	XPO1	80	91.667	ENSAMXG00000003069	xpo1a	91	91.667	Astyanax_mexicanus
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	93.750	ENSAMXG00000012704	xpo1b	92	93.750	Astyanax_mexicanus
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	ENSBTAG00000013254	XPO1	92	100.000	Bos_taurus
ENSEEUG00000009479	XPO1	91	55.556	WBGene00002078	xpo-1	91	55.556	Caenorhabditis_elegans
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	91.667	ENSCJAG00000008877	XPO1	92	91.667	Callithrix_jacchus
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	ENSCAFG00000003050	XPO1	92	100.000	Canis_familiaris
ENSEEUG00000009479	XPO1	85	100.000	ENSCAFG00020026910	XPO1	91	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	ENSCHIG00000018132	XPO1	92	100.000	Capra_hircus
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	ENSTSYG00000004330	XPO1	92	100.000	Carlito_syrichta
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	ENSCPOG00000034053	XPO1	92	100.000	Cavia_porcellus
ENSEEUG00000009479	XPO1	83	98.795	ENSCCAG00000037445	XPO1	91	98.795	Cebus_capucinus
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	91.667	ENSCATG00000032674	XPO1	92	91.667	Cercocebus_atys
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	ENSCLAG00000012953	XPO1	92	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	91.667	ENSCSAG00000014606	XPO1	92	91.667	Chlorocebus_sabaeus
ENSEEUG00000009479	XPO1	71	94.286	ENSCHOG00000012088	XPO1	71	94.286	Choloepus_hoffmanni
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	ENSCPBG00000026239	XPO1	92	100.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	75.319	ENSCING00000024562	-	92	75.319	Ciona_intestinalis
ENSEEUG00000009479	XPO1	91	75.702	ENSCSAVG00000005965	-	87	81.928	Ciona_savignyi
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	91.667	ENSCANG00000028883	XPO1	92	91.667	Colobus_angolensis_palliatus
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	ENSCGRG00001000263	Xpo1	92	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	ENSCGRG00000001520	Xpo1	92	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSEEUG00000009479	XPO1	80	91.667	ENSCSEG00000001693	XPO1	91	91.667	Cynoglossus_semilaevis
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	93.750	ENSCVAG00000016558	xpo1a	92	93.750	Cyprinodon_variegatus
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	93.750	ENSCVAG00000016788	-	92	93.750	Cyprinodon_variegatus
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	95.833	ENSDARG00000063229	xpo1b	92	95.833	Danio_rerio
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	86.233	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	89.164	Danio_rerio
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	ENSDNOG00000005805	XPO1	92	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSEEUG00000009479	XPO1	88	100.000	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	66.452	FBgn0020497	emb	92	66.452	Drosophila_melanogaster
ENSEEUG00000009479	XPO1	86	100.000	ENSETEG00000018045	XPO1	86	100.000	Echinops_telfairi
ENSEEUG00000009479	XPO1	73	85.179	ENSEBUG00000012580	-	89	85.179	Eptatretus_burgeri
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	ENSEASG00005007223	XPO1	92	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	ENSECAG00000024920	XPO1	92	100.000	Equus_caballus
ENSEEUG00000009479	XPO1	80	93.750	ENSELUG00000012707	xpo1a	91	93.750	Esox_lucius
ENSEEUG00000009479	XPO1	79	93.750	ENSELUG00000014306	-	89	93.750	Esox_lucius
ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	ENSFCAG00000002702	XPO1	92	100.000	Felis_catus
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ENSEEUG00000009479	XPO1	92	93.750	ENSFHEG00000002412	xpo1a	92	93.750	Fundulus_heteroclitus
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ENSEEUG00000009479	XPO1	92	95.833	ENSKMAG00000016218	-	92	95.833	Kryptolebias_marmoratus
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ENSEEUG00000009479	XPO1	92	93.750	ENSLBEG00000005740	-	92	93.750	Labrus_bergylta
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