EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEEUG00000011128 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Erinaceus_europaeus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 52142 bases
Position: chrGeneScaffold_3530:49122-101263
Accession: 30858
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEEUP00000010179	GTP_EFTU	PF00009.27	1.5e-24	1	1
ENSEEUP00000010179	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	7.3e-13	1	1
ENSEEUP00000010179	EFG_IV	PF03764.18	3.2e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEEUT00000011163	EFTUD2-201	2646	-	ENSEEUP00000010179	881 (aa)	-	UPI0000F635CF

Gene Model

Click here to download ENSEEUG00000011128's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSEEUG00000011128's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSG00000108883	EFTUD2	86	100.000	Homo_sapiens
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSAPOG00000002433	eftud2	83	99.153	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	83	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSACIG00000009096	eftud2	83	99.153	Amphilophus_citrinellus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	88	99.153	ENSAOCG00000023385	eftud2	91	99.153	Amphiprion_ocellaris
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSAPEG00000003321	eftud2	83	99.153	Amphiprion_percula
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSATEG00000000457	eftud2	83	99.153	Anabas_testudineus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	83	100.000	Anas_platyrhynchos
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSACAG00000007637	EFTUD2	83	100.000	Anolis_carolinensis
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSANAG00000025320	EFTUD2	83	100.000	Aotus_nancymaae
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSACLG00000001296	eftud2	83	99.153	Astatotilapia_calliptera
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSAMXG00000000568	eftud2	83	100.000	Astyanax_mexicanus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	83	100.000	Bos_taurus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	91	82.727	WBGene00001166	eftu-2	82	82.727	Caenorhabditis_elegans
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	83	100.000	Callithrix_jacchus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	83	100.000	Canis_familiaris
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	83	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	83	100.000	Capra_hircus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	83	100.000	Carlito_syrichta
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	83	100.000	Cavia_aperea
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	83	100.000	Cavia_porcellus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	83	100.000	Cebus_capucinus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSCATG00000035809	EFTUD2	83	100.000	Cercocebus_atys
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	83	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	83	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	79	100.000	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	77	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	83	100.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	92.373	ENSCING00000009372	-	83	92.373	Ciona_intestinalis
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	92.241	ENSCSAVG00000004985	-	90	91.525	Ciona_savignyi
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSCANG00000026557	EFTUD2	83	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSCGRG00001009904	Eftud2	83	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSCGRG00000003825	Eftud2	83	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSCSEG00000016775	eftud2	83	99.153	Cynoglossus_semilaevis
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSCVAG00000012537	eftud2	83	99.153	Cyprinodon_variegatus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	98.305	ENSDARG00000012261	eftud2	83	98.305	Danio_rerio
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	83	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSDORG00000011566	Eftud2	83	100.000	Dipodomys_ordii
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	89.831	FBgn0039566	CG4849	83	89.831	Drosophila_melanogaster
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	71	99.153	ENSETEG00000005678	EFTUD2	64	99.153	Echinops_telfairi
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	76	94.068	ENSEBUG00000004047	-	86	90.909	Eptatretus_burgeri
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSEASG00005010321	EFTUD2	83	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSECAG00000019363	EFTUD2	77	99.153	Equus_caballus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSELUG00000017169	eftud2	83	100.000	Esox_lucius
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	83	100.000	Felis_catus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSFALG00000007551	EFTUD2	83	100.000	Ficedula_albicollis
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	83	100.000	Fukomys_damarensis
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSFHEG00000013479	eftud2	83	99.153	Fundulus_heteroclitus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSGMOG00000014277	eftud2	83	99.153	Gadus_morhua
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSGALG00000000988	EFTUD2	87	100.000	Gallus_gallus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSGAFG00000002263	eftud2	83	99.153	Gambusia_affinis
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSGACG00000009163	eftud2	83	99.153	Gasterosteus_aculeatus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	83	100.000	Gorilla_gorilla
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSHBUG00000023546	eftud2	83	99.153	Haplochromis_burtoni
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	83	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	83	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSHCOG00000017689	eftud2	83	99.153	Hippocampus_comes
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSIPUG00000023182	Eftud2	83	99.153	Ictalurus_punctatus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	88	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSJJAG00000018268	Eftud2	86	100.000	Jaculus_jaculus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	95.763	ENSKMAG00000021027	eftud2	83	95.763	Kryptolebias_marmoratus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	87	98.630	ENSLBEG00000005875	eftud2	91	89.831	Labrus_bergylta
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	97.458	ENSLACG00000012918	EFTUD2	83	97.458	Latimeria_chalumnae
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSLOCG00000011460	eftud2	83	99.153	Lepisosteus_oculatus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	83	100.000	Loxodonta_africana
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	83	100.000	Macaca_fascicularis
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	83	100.000	Macaca_mulatta
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	83	100.000	Macaca_nemestrina
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	83	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSMAMG00000022190	eftud2	83	99.153	Mastacembelus_armatus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSMZEG00005022885	eftud2	83	99.153	Maylandia_zebra
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	83	100.000	Meleagris_gallopavo
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSMAUG00000021178	Eftud2	83	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSMICG00000016592	EFTUD2	83	100.000	Microcebus_murinus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSMOCG00000009039	-	83	100.000	Microtus_ochrogaster
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	78	63.821	ENSMOCG00000017653	-	68	63.821	Microtus_ochrogaster
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	88	99.153	ENSMMOG00000020811	eftud2	92	99.153	Mola_mola
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSMODG00000011347	EFTUD2	83	100.000	Monodelphis_domestica
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	88	99.153	ENSMALG00000014501	eftud2	91	99.153	Monopterus_albus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	83	100.000	Mus_caroli
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSMUSG00000020929	Eftud2	83	100.000	Mus_musculus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	83	100.000	Mus_pahari
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	83	100.000	Mus_spretus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	89	98.889	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	75	98.889	Mustela_putorius_furo
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	83	100.000	Myotis_lucifugus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSNGAG00000017834	Eftud2	83	100.000	Nannospalax_galili
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSNBRG00000020081	eftud2	83	99.153	Neolamprologus_brichardi
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	88	100.000	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	80	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	77.858	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	83	77.858	Notamacropus_eugenii
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	81	100.000	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	73	100.000	Ochotona_princeps
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSODEG00000018041	-	83	100.000	Octodon_degus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	83	76.984	ENSODEG00000003385	-	83	76.984	Octodon_degus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSONIG00000000912	eftud2	83	99.153	Oreochromis_niloticus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	83	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSORLG00000003109	eftud2	83	99.153	Oryzias_latipes
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSORLG00020009865	eftud2	83	99.153	Oryzias_latipes_hni
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSORLG00015002611	eftud2	88	99.153	Oryzias_latipes_hsok
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	91	100.000	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	82	100.000	Otolemur_garnettii
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSOARG00000009078	EFTUD2	81	100.000	Ovis_aries
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	83	100.000	Pan_paniscus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	83	100.000	Panthera_pardus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	83	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	83	100.000	Pan_troglodytes
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSPANG00000021284	EFTUD2	83	100.000	Papio_anubis
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	84	100.000	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	81	100.000	Pelodiscus_sinensis
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	79	99.153	ENSPMGG00000007281	eftud2	77	99.153	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSPEMG00000005129	Eftud2	83	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	83	100.000	Phascolarctos_cinereus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSPFOG00000008515	eftud2	83	99.153	Poecilia_formosa
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSPLAG00000010393	eftud2	83	99.153	Poecilia_latipinna
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSPMEG00000005087	eftud2	83	99.153	Poecilia_mexicana
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	83	100.000	Pongo_abelii
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	77.713	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	83	77.713	Procavia_capensis
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	83	100.000	Propithecus_coquereli
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	83	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSPNYG00000012448	eftud2	83	99.153	Pundamilia_nyererei
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSPNAG00000012490	eftud2	84	99.153	Pygocentrus_nattereri
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSRNOG00000002818	Eftud2	83	100.000	Rattus_norvegicus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	83	100.000	Rhinopithecus_bieti
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSRROG00000042925	EFTUD2	83	100.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	78	47.619	YKL173W	SNU114	72	47.619	Saccharomyces_cerevisiae
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	83	100.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	86	100.000	Sarcophilus_harrisii
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSSFOG00015023272	eftud2	83	99.153	Scleropages_formosus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSSMAG00000010174	eftud2	91	99.153	Scophthalmus_maximus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSSDUG00000022675	eftud2	83	99.153	Seriola_dumerili
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSSLDG00000001595	eftud2	83	99.153	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	93.220	ENSSARG00000008664	EFTUD2	83	93.220	Sorex_araneus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	83	100.000	Sphenodon_punctatus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSSPAG00000016235	eftud2	83	99.153	Stegastes_partitus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	83	100.000	Sus_scrofa
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	78	76.623	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	84	76.623	Taeniopygia_guttata
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSTRUG00000016422	eftud2	83	99.153	Takifugu_rubripes
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSTNIG00000005346	eftud2	83	99.153	Tetraodon_nigroviridis
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	83	100.000	Tupaia_belangeri
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	83	100.000	Tursiops_truncatus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	83	100.000	Ursus_americanus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	83	100.000	Ursus_maritimus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	76	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	69	100.000	Vicugna_pacos
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	83	100.000	Vulpes_vulpes
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSXETG00000003394	eftud2	86	99.153	Xenopus_tropicalis
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	81	96.154	ENSXCOG00000017309	eftud2	87	96.154	Xiphophorus_couchianus
ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	ENSXMAG00000008494	eftud2	83	99.153	Xiphophorus_maculatus