EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEEUG00000015084 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Erinaceus_europaeus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12805 bases
Position: chrGeneScaffold_2736:7841-20645
Accession: 19824
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEEUP00000013764	SYF2	PF08231.12	2.2e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEEUT00000015079	SYF2-201	549	-	ENSEEUP00000013764	183 (aa)	-	UPI0000F61951

Gene Model

Click here to download ENSEEUG00000015084's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSEEUG00000015084's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	80.874	ENSG00000117614	SYF2	75	80.874	Homo_sapiens
ENSEEUG00000015084	SYF2	88	72.671	ENSAPOG00000001174	syf2	71	71.345	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEEUG00000015084	SYF2	96	81.921	ENSAMEG00000010115	-	73	81.921	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEEUG00000015084	SYF2	73	82.836	ENSAMEG00000010134	-	69	82.836	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEEUG00000015084	SYF2	93	67.836	ENSACIG00000023688	syf2	67	68.235	Amphilophus_citrinellus
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	69.399	ENSAOCG00000022046	syf2	74	69.399	Amphiprion_ocellaris
ENSEEUG00000015084	SYF2	93	71.930	ENSAOCG00000010912	syf2	52	71.930	Amphiprion_ocellaris
ENSEEUG00000015084	SYF2	93	71.930	ENSAPEG00000018858	syf2	65	71.930	Amphiprion_percula
ENSEEUG00000015084	SYF2	85	72.436	ENSATEG00000007745	syf2	71	70.175	Anabas_testudineus
ENSEEUG00000015084	SYF2	76	74.820	ENSAPLG00000016435	SYF2	69	74.820	Anas_platyrhynchos
ENSEEUG00000015084	SYF2	78	72.727	ENSACAG00000013653	-	70	72.727	Anolis_carolinensis
ENSEEUG00000015084	SYF2	57	59.048	ENSACAG00000026777	-	57	57.895	Anolis_carolinensis
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	81.421	ENSANAG00000032473	SYF2	75	81.421	Aotus_nancymaae
ENSEEUG00000015084	SYF2	88	69.565	ENSACLG00000019916	syf2	74	66.480	Astatotilapia_calliptera
ENSEEUG00000015084	SYF2	95	66.477	ENSAMXG00000004051	syf2	67	71.250	Astyanax_mexicanus
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	81.522	ENSBTAG00000001651	SYF2	74	82.857	Bos_taurus
ENSEEUG00000015084	SYF2	80	42.953	WBGene00019402	syf-2	74	38.953	Caenorhabditis_elegans
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	80.874	ENSCJAG00000046570	SYF2	75	80.874	Callithrix_jacchus
ENSEEUG00000015084	SYF2	97	69.101	ENSCAFG00000030331	-	71	69.101	Canis_familiaris
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	80.541	ENSCAFG00000012895	-	75	80.541	Canis_familiaris
ENSEEUG00000015084	SYF2	66	68.595	ENSCAFG00020021094	-	50	76.842	Canis_lupus_dingo
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	80.541	ENSCAFG00020021091	-	75	80.541	Canis_lupus_dingo
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	83.152	ENSCHIG00000020874	SYF2	75	83.152	Capra_hircus
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	81.421	ENSTSYG00000005114	SYF2	75	81.421	Carlito_syrichta
ENSEEUG00000015084	SYF2	75	84.783	ENSCAPG00000010006	SYF2	70	84.783	Cavia_aperea
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	78.689	ENSCPOG00000005326	SYF2	75	78.689	Cavia_porcellus
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	81.967	ENSCCAG00000022459	SYF2	75	81.967	Cebus_capucinus
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	79.781	ENSCATG00000026917	SYF2	75	79.781	Cercocebus_atys
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	80.874	ENSCLAG00000008474	SYF2	75	80.874	Chinchilla_lanigera
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	79.781	ENSCSAG00000000948	SYF2	75	79.781	Chlorocebus_sabaeus
ENSEEUG00000015084	SYF2	96	68.571	ENSCHOG00000005273	-	96	68.571	Choloepus_hoffmanni
ENSEEUG00000015084	SYF2	89	77.301	ENSCPBG00000025073	SYF2	69	75.723	Chrysemys_picta_bellii
ENSEEUG00000015084	SYF2	82	44.737	ENSCING00000003017	-	63	44.737	Ciona_intestinalis
ENSEEUG00000015084	SYF2	82	42.763	ENSCSAVG00000006627	-	69	42.763	Ciona_savignyi
ENSEEUG00000015084	SYF2	84	77.922	ENSCANG00000037322	SYF2	73	77.922	Colobus_angolensis_palliatus
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	78.689	ENSCGRG00001020733	Syf2	75	78.689	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSEEUG00000015084	SYF2	74	81.481	ENSCGRG00000005095	Syf2	66	81.752	Cricetulus_griseus_crigri
ENSEEUG00000015084	SYF2	86	66.242	ENSCSEG00000000117	syf2	74	60.109	Cynoglossus_semilaevis
ENSEEUG00000015084	SYF2	88	70.186	ENSCVAG00000019543	syf2	74	66.480	Cyprinodon_variegatus
ENSEEUG00000015084	SYF2	96	68.182	ENSDARG00000004706	syf2	72	68.182	Danio_rerio
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	82.609	ENSDNOG00000047605	SYF2	75	82.609	Dasypus_novemcinctus
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	80.874	ENSDORG00000001274	Syf2	75	80.874	Dipodomys_ordii
ENSEEUG00000015084	SYF2	86	45.000	FBgn0033556	CG12343	70	45.000	Drosophila_melanogaster
ENSEEUG00000015084	SYF2	77	81.429	ENSETEG00000015729	SYF2	68	78.571	Echinops_telfairi
ENSEEUG00000015084	SYF2	74	50.735	ENSEBUG00000015402	syf2	63	50.735	Eptatretus_burgeri
ENSEEUG00000015084	SYF2	95	69.540	ENSEASG00005004232	-	76	69.540	Equus_asinus_asinus
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	81.522	ENSEASG00005004224	-	75	81.522	Equus_asinus_asinus
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	82.609	ENSECAG00000012023	-	75	82.609	Equus_caballus
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	81.421	ENSECAG00000010440	-	74	81.421	Equus_caballus
ENSEEUG00000015084	SYF2	87	74.375	ENSELUG00000003465	syf2	67	74.375	Esox_lucius
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	81.081	ENSFCAG00000043095	-	75	81.081	Felis_catus
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	82.065	ENSFCAG00000010324	-	64	82.065	Felis_catus
ENSEEUG00000015084	SYF2	78	71.329	ENSFALG00000000460	SYF2	65	69.697	Ficedula_albicollis
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	79.235	ENSFDAG00000008310	SYF2	75	79.235	Fukomys_damarensis
ENSEEUG00000015084	SYF2	89	50.920	ENSFHEG00000007238	syf2	72	50.307	Fundulus_heteroclitus
ENSEEUG00000015084	SYF2	86	71.338	ENSGMOG00000019138	syf2	69	72.727	Gadus_morhua
ENSEEUG00000015084	SYF2	91	75.904	ENSGALG00000013639	SYF2	68	73.410	Gallus_gallus
ENSEEUG00000015084	SYF2	93	65.882	ENSGAFG00000019435	syf2	70	65.882	Gambusia_affinis
ENSEEUG00000015084	SYF2	84	72.727	ENSGACG00000007305	syf2	71	68.786	Gasterosteus_aculeatus
ENSEEUG00000015084	SYF2	89	78.395	ENSGAGG00000010670	SYF2	69	76.301	Gopherus_agassizii
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	81.421	ENSGGOG00000012796	SYF2	75	81.421	Gorilla_gorilla
ENSEEUG00000015084	SYF2	95	68.208	ENSHBUG00000020477	syf2	73	68.208	Haplochromis_burtoni
ENSEEUG00000015084	SYF2	89	71.779	ENSHGLG00000004304	-	70	67.052	Heterocephalus_glaber_female
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	78.689	ENSHGLG00000014393	SYF2	75	78.689	Heterocephalus_glaber_female
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	78.689	ENSHGLG00100014722	SYF2	75	78.689	Heterocephalus_glaber_male
ENSEEUG00000015084	SYF2	97	66.667	ENSHCOG00000012904	syf2	59	66.667	Hippocampus_comes
ENSEEUG00000015084	SYF2	98	68.715	ENSIPUG00000019859	syf2	74	68.715	Ictalurus_punctatus
ENSEEUG00000015084	SYF2	75	86.232	ENSSTOG00000023984	SYF2	95	86.232	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSEEUG00000015084	SYF2	75	84.058	ENSJJAG00000013301	Syf2	65	84.058	Jaculus_jaculus
ENSEEUG00000015084	SYF2	88	70.807	ENSKMAG00000013856	syf2	68	70.807	Kryptolebias_marmoratus
ENSEEUG00000015084	SYF2	86	72.785	ENSLBEG00000014425	syf2	74	67.598	Labrus_bergylta
ENSEEUG00000015084	SYF2	86	73.248	ENSLACG00000012064	SYF2	66	73.248	Latimeria_chalumnae
ENSEEUG00000015084	SYF2	95	71.676	ENSLOCG00000002728	syf2	67	71.676	Lepisosteus_oculatus
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	81.522	ENSLAFG00000023150	-	75	81.522	Loxodonta_africana
ENSEEUG00000015084	SYF2	81	63.333	ENSLAFG00000030814	-	81	63.333	Loxodonta_africana
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	80.328	ENSMFAG00000041831	SYF2	75	80.328	Macaca_fascicularis
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	79.781	ENSMMUG00000002968	SYF2	75	79.781	Macaca_mulatta
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	80.328	ENSMNEG00000030180	SYF2	75	80.328	Macaca_nemestrina
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	79.781	ENSMLEG00000030248	SYF2	75	79.781	Mandrillus_leucophaeus
ENSEEUG00000015084	SYF2	85	70.513	ENSMAMG00000010403	syf2	72	65.922	Mastacembelus_armatus
ENSEEUG00000015084	SYF2	98	66.480	ENSMZEG00005006429	syf2	74	66.480	Maylandia_zebra
ENSEEUG00000015084	SYF2	75	75.362	ENSMGAG00000002019	SYF2	69	75.362	Meleagris_gallopavo
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	78.689	ENSMAUG00000018974	Syf2	75	78.689	Mesocricetus_auratus
ENSEEUG00000015084	SYF2	75	84.058	ENSMICG00000016191	SYF2	69	84.058	Microcebus_murinus
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	79.781	ENSMOCG00000022938	Syf2	75	79.781	Microtus_ochrogaster
ENSEEUG00000015084	SYF2	95	66.474	ENSMMOG00000002396	syf2	72	66.474	Mola_mola
ENSEEUG00000015084	SYF2	91	79.167	ENSMODG00000013951	-	73	79.167	Monodelphis_domestica
ENSEEUG00000015084	SYF2	93	69.767	ENSMALG00000010706	syf2	70	69.767	Monopterus_albus
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	79.781	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	75	79.781	Mus_caroli
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	79.781	ENSMUSG00000028821	Syf2	75	79.781	Mus_musculus
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	79.781	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	75	79.781	Mus_pahari
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	79.781	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	75	79.781	Mus_spretus
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	81.622	ENSMPUG00000015802	-	75	81.622	Mustela_putorius_furo
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	81.081	ENSMPUG00000015801	-	75	81.622	Mustela_putorius_furo
ENSEEUG00000015084	SYF2	98	81.006	ENSMLUG00000001885	SYF2	73	81.006	Myotis_lucifugus
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	81.081	ENSNGAG00000007912	Syf2	75	81.081	Nannospalax_galili
ENSEEUG00000015084	SYF2	98	64.444	ENSNBRG00000010720	syf2	73	64.444	Neolamprologus_brichardi
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	81.421	ENSNLEG00000035185	SYF2	75	81.421	Nomascus_leucogenys
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	78.689	ENSOPRG00000012870	SYF2	75	78.689	Ochotona_princeps
ENSEEUG00000015084	SYF2	92	82.738	ENSODEG00000017664	-	71	82.738	Octodon_degus
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	64.481	ENSODEG00000014338	-	72	64.481	Octodon_degus
ENSEEUG00000015084	SYF2	88	69.565	ENSONIG00000008213	syf2	74	66.480	Oreochromis_niloticus
ENSEEUG00000015084	SYF2	77	78.723	ENSOANG00000009552	SYF2	70	78.723	Ornithorhynchus_anatinus
ENSEEUG00000015084	SYF2	99	81.319	ENSOCUG00000013050	SYF2	74	81.319	Oryctolagus_cuniculus
ENSEEUG00000015084	SYF2	96	67.045	ENSORLG00000028820	syf2	74	67.045	Oryzias_latipes
ENSEEUG00000015084	SYF2	88	70.807	ENSORLG00020018333	syf2	68	70.807	Oryzias_latipes_hni
ENSEEUG00000015084	SYF2	96	67.045	ENSORLG00015014665	syf2	73	67.045	Oryzias_latipes_hsok
ENSEEUG00000015084	SYF2	93	70.760	ENSOMEG00000013911	syf2	70	70.760	Oryzias_melastigma
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	80.328	ENSOGAG00000009962	SYF2	75	80.328	Otolemur_garnettii
ENSEEUG00000015084	SYF2	73	60.448	ENSOARG00000006269	-	69	60.448	Ovis_aries
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	80.645	ENSOARG00000006348	-	75	80.645	Ovis_aries
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	81.421	ENSPPAG00000036579	SYF2	75	81.421	Pan_paniscus
ENSEEUG00000015084	SYF2	96	82.955	ENSPPRG00000001638	-	72	82.955	Panthera_pardus
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	81.081	ENSPPRG00000001651	-	75	81.081	Panthera_pardus
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	81.081	ENSPTIG00000007036	-	75	81.081	Panthera_tigris_altaica
ENSEEUG00000015084	SYF2	85	87.097	ENSPTIG00000005711	-	57	87.261	Panthera_tigris_altaica
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	81.421	ENSPTRG00000000352	SYF2	75	81.421	Pan_troglodytes
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	80.328	ENSPANG00000008139	SYF2	75	80.328	Papio_anubis
ENSEEUG00000015084	SYF2	93	69.591	ENSPKIG00000008130	syf2	70	69.591	Paramormyrops_kingsleyae
ENSEEUG00000015084	SYF2	95	74.566	ENSPSIG00000011816	SYF2	67	74.566	Pelodiscus_sinensis
ENSEEUG00000015084	SYF2	96	66.857	ENSPMGG00000008755	syf2	68	66.857	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	79.235	ENSPEMG00000008283	Syf2	75	79.235	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSEEUG00000015084	SYF2	90	82.927	ENSPCIG00000014235	SYF2	76	77.249	Phascolarctos_cinereus
ENSEEUG00000015084	SYF2	93	66.471	ENSPFOG00000004116	syf2	69	66.471	Poecilia_formosa
ENSEEUG00000015084	SYF2	93	66.471	ENSPLAG00000006691	syf2	74	65.698	Poecilia_latipinna
ENSEEUG00000015084	SYF2	96	66.286	ENSPMEG00000011684	syf2	76	66.286	Poecilia_mexicana
ENSEEUG00000015084	SYF2	85	69.677	ENSPREG00000003009	syf2	71	65.882	Poecilia_reticulata
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	81.421	ENSPPYG00000001713	SYF2	75	81.421	Pongo_abelii
ENSEEUG00000015084	SYF2	84	51.299	ENSPCOG00000027011	SYF2	66	51.299	Propithecus_coquereli
ENSEEUG00000015084	SYF2	87	79.503	ENSPVAG00000005841	SYF2	66	79.503	Pteropus_vampyrus
ENSEEUG00000015084	SYF2	88	69.565	ENSPNYG00000004979	syf2	74	66.480	Pundamilia_nyererei
ENSEEUG00000015084	SYF2	95	69.318	ENSPNAG00000015570	syf2	74	69.318	Pygocentrus_nattereri
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	79.781	ENSRNOG00000060597	Syf2	75	79.781	Rattus_norvegicus
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	77.049	ENSRBIG00000042970	SYF2	75	77.049	Rhinopithecus_bieti
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	80.328	ENSRROG00000001347	SYF2	75	80.328	Rhinopithecus_roxellana
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	80.328	ENSSBOG00000020184	SYF2	75	80.874	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSEEUG00000015084	SYF2	79	82.069	ENSSHAG00000007152	-	70	82.069	Sarcophilus_harrisii
ENSEEUG00000015084	SYF2	91	81.325	ENSSHAG00000015630	-	76	75.532	Sarcophilus_harrisii
ENSEEUG00000015084	SYF2	90	71.951	ENSSFOG00015023647	syf2	69	71.951	Scleropages_formosus
ENSEEUG00000015084	SYF2	98	66.480	ENSSMAG00000009867	syf2	74	66.480	Scophthalmus_maximus
ENSEEUG00000015084	SYF2	86	72.611	ENSSDUG00000013072	syf2	73	67.797	Seriola_dumerili
ENSEEUG00000015084	SYF2	86	72.611	ENSSLDG00000012677	syf2	73	67.797	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	56.831	ENSSARG00000012889	SYF2	75	56.831	Sorex_araneus
ENSEEUG00000015084	SYF2	98	71.508	ENSSPUG00000005251	SYF2	71	71.508	Sphenodon_punctatus
ENSEEUG00000015084	SYF2	98	67.598	ENSSPAG00000009626	syf2	74	67.598	Stegastes_partitus
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	82.065	ENSSSCG00000037481	SYF2	75	82.065	Sus_scrofa
ENSEEUG00000015084	SYF2	78	50.345	ENSTGUG00000001126	SYF2	78	52.229	Taeniopygia_guttata
ENSEEUG00000015084	SYF2	98	62.778	ENSTRUG00000001499	syf2	71	63.687	Takifugu_rubripes
ENSEEUG00000015084	SYF2	86	69.427	ENSTNIG00000016912	syf2	70	69.427	Tetraodon_nigroviridis
ENSEEUG00000015084	SYF2	93	73.099	ENSTBEG00000017370	SYF2	81	72.515	Tupaia_belangeri
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	83.060	ENSTTRG00000003550	SYF2	75	83.060	Tursiops_truncatus
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	80.541	ENSUAMG00000002897	SYF2	75	80.541	Ursus_americanus
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	81.081	ENSUMAG00000013108	SYF2	75	81.081	Ursus_maritimus
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	80.328	ENSVPAG00000005705	SYF2	75	80.328	Vicugna_pacos
ENSEEUG00000015084	SYF2	96	80.682	ENSVVUG00000027181	-	71	80.682	Vulpes_vulpes
ENSEEUG00000015084	SYF2	100	80.541	ENSVVUG00000027175	-	75	80.541	Vulpes_vulpes
ENSEEUG00000015084	SYF2	96	69.886	ENSXETG00000022797	syf2	71	69.886	Xenopus_tropicalis
ENSEEUG00000015084	SYF2	84	69.481	ENSXMAG00000022698	syf2	74	63.333	Xiphophorus_maculatus