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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSELUG00000002821 (Gene tree)
Gene ID: 105027267
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Esox_lucius
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 29116 bases
Position: chrLG14:23860764-23889879
Accession: 105027267
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSELUP00000001310	IBN_N	PF03810.19	2.1e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSELUT00000017597	-	2697	XM_020053337	ENSELUP00000001310	898 (aa)	XP_019908896	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSELUG00000002821	tnpo1	76	75.036	ENSELUG00000016542	-	99	70.324
ENSELUG00000002821	tnpo1	99	77.970	ENSELUG00000008680	tnpo2	99	78.078

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.166	ENSG00000083312	TNPO1	100	94.301	Homo_sapiens
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.829	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	89.216	Acanthochromis_polyacanthus
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	85.205	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	85.745	Ailuropoda_melanoleuca
ENSELUG00000002821	tnpo1	87	86.725	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	87.032	Amphilophus_citrinellus
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.829	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	89.216	Amphiprion_ocellaris
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.829	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	89.216	Amphiprion_percula
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.453	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	88.889	Anabas_testudineus
ENSELUG00000002821	tnpo1	99	82.804	ENSAPLG00000009619	-	99	82.443	Anas_platyrhynchos
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.383	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	86.819	Anolis_carolinensis
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	77.549	ENSANAG00000025351	-	99	77.549	Aotus_nancymaae
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	85.575	ENSANAG00000022453	-	99	86.166	Aotus_nancymaae
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.928	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	87.037	Astatotilapia_calliptera
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	87.800	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	87.800	Astyanax_mexicanus
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.275	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	86.492	Bos_taurus
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	85.683	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	86.275	Callithrix_jacchus
ENSELUG00000002821	tnpo1	96	85.989	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	86.441	Canis_familiaris
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	83.442	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	83.878	Canis_lupus_dingo
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.166	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	86.383	Capra_hircus
ENSELUG00000002821	tnpo1	96	84.824	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	85.277	Carlito_syrichta
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	85.575	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	86.009	Cebus_capucinus
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.166	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	86.601	Cercocebus_atys
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	85.730	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	86.166	Chinchilla_lanigera
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.166	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	86.601	Chlorocebus_sabaeus
ENSELUG00000002821	tnpo1	94	76.416	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	76.852	Choloepus_hoffmanni
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.443	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	87.255	Chrysemys_picta_bellii
ENSELUG00000002821	tnpo1	99	70.511	ENSCSAVG00000010981	-	99	69.730	Ciona_savignyi
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.166	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	86.601	Colobus_angolensis_palliatus
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.275	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	86.710	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSELUG00000002821	tnpo1	96	86.297	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	86.750	Cricetulus_griseus_crigri
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.710	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	87.037	Cynoglossus_semilaevis
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	87.744	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	88.562	Cyprinodon_variegatus
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	87.419	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	87.800	Danio_rerio
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	80.541	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	81.107	Dasypus_novemcinctus
ENSELUG00000002821	tnpo1	93	85.781	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	86.231	Dipodomys_ordii
ENSELUG00000002821	tnpo1	99	54.189	FBgn0035693	CG8219	99	53.754	Drosophila_melanogaster
ENSELUG00000002821	tnpo1	86	94.382	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.382	Echinops_telfairi
ENSELUG00000002821	tnpo1	94	78.326	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	78.326	Eptatretus_burgeri
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.166	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	86.601	Equus_asinus_asinus
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.383	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	86.819	Equus_caballus
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.166	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	86.601	Felis_catus
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.383	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	86.928	Ficedula_albicollis
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	85.839	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	86.275	Fukomys_damarensis
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	87.908	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	88.562	Fundulus_heteroclitus
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.241	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	86.398	Gadus_morhua
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.275	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	86.710	Gallus_gallus
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.178	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	88.998	Gambusia_affinis
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	87.908	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	88.126	Gasterosteus_aculeatus
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.492	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	87.146	Gopherus_agassizii
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	71.957	ENSGGOG00000022535	-	98	72.500	Gorilla_gorilla
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.166	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	86.601	Gorilla_gorilla
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.126	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	88.235	Haplochromis_burtoni
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	85.730	ENSHGLG00000000970	-	99	85.948	Heterocephalus_glaber_female
ENSELUG00000002821	tnpo1	97	69.669	ENSHGLG00100000963	-	99	69.441	Heterocephalus_glaber_male
ENSELUG00000002821	tnpo1	96	85.633	ENSHGLG00100017090	-	99	85.860	Heterocephalus_glaber_male
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.275	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	86.710	Jaculus_jaculus
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.562	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	88.562	Kryptolebias_marmoratus
ENSELUG00000002821	tnpo1	91	85.084	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	85.084	Labrus_bergylta
ENSELUG00000002821	tnpo1	96	81.306	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	81.306	Latimeria_chalumnae
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.453	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	88.453	Lepisosteus_oculatus
ENSELUG00000002821	tnpo1	97	85.459	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	85.906	Loxodonta_africana
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.166	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	86.601	Macaca_fascicularis
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.166	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	86.652	Macaca_mulatta
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.166	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	86.601	Macaca_nemestrina
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.166	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	86.601	Mandrillus_leucophaeus
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.671	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	89.107	Mastacembelus_armatus
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	87.691	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	87.800	Maylandia_zebra
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.275	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	89.888	Mesocricetus_auratus
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	82.353	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	82.789	Microcebus_murinus
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.275	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	86.710	Microtus_ochrogaster
ENSELUG00000002821	tnpo1	87	86.783	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	87.282	Mola_mola
ENSELUG00000002821	tnpo1	99	82.353	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	82.353	Monodelphis_domestica
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.768	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	87.146	Monopterus_albus
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.275	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	89.888	Mus_caroli
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.275	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	89.888	Mus_musculus
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.383	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	89.888	Mus_pahari
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.275	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	89.888	Mus_spretus
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.166	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	86.601	Mustela_putorius_furo
ENSELUG00000002821	tnpo1	96	85.569	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	86.020	Myotis_lucifugus
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.383	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	86.819	Nannospalax_galili
ENSELUG00000002821	tnpo1	87	86.849	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	87.157	Neolamprologus_brichardi
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.166	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	86.601	Nomascus_leucogenys
ENSELUG00000002821	tnpo1	90	86.901	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	86.901	Ochotona_princeps
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	85.512	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	85.948	Octodon_degus
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	87.284	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	87.554	Oreochromis_niloticus
ENSELUG00000002821	tnpo1	92	86.203	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	86.910	Ornithorhynchus_anatinus
ENSELUG00000002821	tnpo1	96	82.727	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	82.727	Oryctolagus_cuniculus
ENSELUG00000002821	tnpo1	87	86.550	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	87.234	Oryzias_latipes
ENSELUG00000002821	tnpo1	99	87.978	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	88.415	Oryzias_latipes_hni
ENSELUG00000002821	tnpo1	99	88.139	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	88.743	Oryzias_latipes_hsok
ENSELUG00000002821	tnpo1	99	88.197	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	88.634	Oryzias_melastigma
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.166	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	86.601	Otolemur_garnettii
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	85.792	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	86.334	Ovis_aries
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.166	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	86.601	Pan_paniscus
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.166	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	86.601	Panthera_pardus
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.166	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	86.601	Panthera_tigris_altaica
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.166	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	86.601	Pan_troglodytes
ENSELUG00000002821	tnpo1	94	74.202	ENSPTRG00000047731	-	100	74.867	Pan_troglodytes
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.166	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	86.601	Papio_anubis
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	83.948	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	84.641	Paramormyrops_kingsleyae
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.601	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	87.146	Pelodiscus_sinensis
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	84.875	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	84.984	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSELUG00000002821	tnpo1	96	86.297	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	86.750	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.985	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	87.364	Phascolarctos_cinereus
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.683	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	88.792	Poecilia_formosa
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.683	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	88.792	Poecilia_latipinna
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.235	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	88.889	Poecilia_mexicana
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.344	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	88.998	Poecilia_reticulata
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	85.948	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	86.383	Pongo_abelii
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.166	ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	86.601	Propithecus_coquereli
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	85.948	ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	86.601	Pteropus_vampyrus
ENSELUG00000002821	tnpo1	100	87.908	ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	88.017	Pundamilia_nyererei
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ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.453	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	88.998	Xiphophorus_maculatus