EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSELUG00000003365 (Gene tree)
Gene ID: 105014425
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC105014425
Gene Type: protein_coding
Species: Esox_lucius
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 17328 bases
Position: chrLG13:23300076-23317403
Accession: 105014425
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSELUP00000027211	MMR_HSR1	PF01926.23	5.5e-08	1	1
ENSELUP00000001964	MMR_HSR1	PF01926.23	5.8e-08	1	1
ENSELUP00000001966	MMR_HSR1	PF01926.23	6.4e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSELUT00000016516	-	5255	XM_010876733	ENSELUP00000001964	449 (aa)	XP_010875035	UPI0005769D6C
ENSELUT00000016525	-	1092	-	ENSELUP00000027211	363 (aa)	-	-
ENSELUT00000016511	-	5382	-	ENSELUP00000001966	462 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	81.166	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	99	81.166	Acanthochromis_polyacanthus
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	59.867	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	59.867	Acanthochromis_polyacanthus
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	57.743	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	57.743	Amphilophus_citrinellus
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	81.390	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	99	81.390	Amphilophus_citrinellus
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	59.111	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Amphiprion_ocellaris
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	81.390	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	99	81.390	Amphiprion_ocellaris
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	81.166	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	99	81.166	Amphiprion_percula
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	58.889	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	58.889	Amphiprion_percula
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	81.839	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	99	81.839	Anabas_testudineus
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	60.976	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	60.976	Anabas_testudineus
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	58.499	ENSACAG00000028632	-	99	58.499	Anolis_carolinensis
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	59.202	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	59.202	Astatotilapia_calliptera
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	81.390	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	99	81.390	Astatotilapia_calliptera
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	78.842	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	78.842	Astyanax_mexicanus
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	60.310	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	60.310	Astyanax_mexicanus
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	81	66.890	ENSCING00000020807	-	93	63.068	Ciona_intestinalis
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	98	56.364	ENSCSAVG00000009987	-	98	56.364	Ciona_savignyi
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	79.596	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	77.541	Cynoglossus_semilaevis
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	58.444	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	58.537	Cynoglossus_semilaevis
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	79.372	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	99	79.372	Cyprinodon_variegatus
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	59.645	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	59.424	Cyprinodon_variegatus
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	60.532	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	74.619	Danio_rerio
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	98	81.818	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	81.818	Danio_rerio
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	84	55.844	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	97	52.893	Eptatretus_burgeri
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	59.956	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	59.956	Fundulus_heteroclitus
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	79.821	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	99	79.821	Fundulus_heteroclitus
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	90	54.208	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	100	54.208	Gadus_morhua
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	79.195	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	79.195	Gambusia_affinis
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	60.089	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	60.089	Gambusia_affinis
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	70	84.436	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	99	89.844	Gasterosteus_aculeatus
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	91	65.497	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	100	61.728	Gasterosteus_aculeatus
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	81.166	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	99	81.166	Haplochromis_burtoni
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	59.202	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	59.202	Haplochromis_burtoni
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	59.111	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Hippocampus_comes
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	77.027	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	77.027	Hippocampus_comes
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	83	63.312	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	83	57.672	Ictalurus_punctatus
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	96	58.661	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	58.756	Ictalurus_punctatus
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	76.392	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	76.392	Ictalurus_punctatus
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	80.942	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	99	80.942	Kryptolebias_marmoratus
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	59.645	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	59.424	Kryptolebias_marmoratus
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	80.942	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	99	80.942	Labrus_bergylta
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	62.108	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	62.332	Latimeria_chalumnae
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	67.184	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	99	67.184	Latimeria_chalumnae
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	61.693	ENSLACG00000004899	-	99	61.693	Latimeria_chalumnae
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	73.378	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	73.378	Lepisosteus_oculatus
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	91	66.276	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	61.060	Mastacembelus_armatus
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	81.166	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	99	81.166	Mastacembelus_armatus
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	58.980	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	58.980	Maylandia_zebra
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	81.390	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	99	81.390	Maylandia_zebra
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	58.537	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	58.537	Mola_mola
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	98	77.854	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	99	77.854	Monopterus_albus
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	59.333	Monopterus_albus
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	81.166	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	99	81.166	Neolamprologus_brichardi
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	91	65.103	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	99	59.318	Neolamprologus_brichardi
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	58.537	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	58.537	Oreochromis_niloticus
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	82.063	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	99	82.063	Oreochromis_niloticus
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	59.867	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	59.867	Oryzias_latipes
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	77.803	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	99	77.803	Oryzias_latipes
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	59.645	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	59.645	Oryzias_latipes_hni
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	80.493	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	99	80.493	Oryzias_latipes_hni
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	60.310	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	60.310	Oryzias_latipes_hsok
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ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	60.532	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	60.532	Oryzias_melastigma
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	81.839	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	99	82.367	Oryzias_melastigma
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	58.515	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	59.867	Paramormyrops_kingsleyae
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	77.283	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	77.283	Paramormyrops_kingsleyae
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	57.206	ENSPKIG00000023918	-	98	57.589	Paramormyrops_kingsleyae
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	77.803	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	99	77.803	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	60.177	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	99	60.177	Periophthalmus_magnuspinnatus
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