EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSELUG00000017169 (Gene tree)
Gene ID: 105013311
Gene Symbol: eftud2
Alias: wu:fi20f05|zgc:66214
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Esox_lucius
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11924 bases
Position: chrLG11:13557076-13568999
Accession: 105013311
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSELUP00000037482	GTP_EFTU	PF00009.27	6.7e-44	1	1
ENSELUP00000037482	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.9e-12	1	1
ENSELUP00000037482	EFG_IV	PF03764.18	1.3e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSELUT00000027059	-	3786	XM_013136100	ENSELUP00000037482	970 (aa)	XP_012991554	UPI000576FC4F

Gene Model

Click here to download ENSELUG00000017169's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
els03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSELUG00000017169's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSELUG00000017169	eftud2	86	37.486	ENSELUG00000013203	eef2l2	98	37.486
ENSELUG00000017169	eftud2	87	37.801	ENSELUG00000008109	eef2b	99	37.801
ENSELUG00000017169	eftud2	86	38.310	ENSELUG00000018859	eef2b	99	38.310
ENSELUG00000017169	eftud2	80	30.435	ENSELUG00000002520	efl1	94	33.451

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSELUG00000017169	eftud2	100	94.233	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	94.645	Acanthochromis_polyacanthus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	91.049	Ailuropoda_melanoleuca
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.422	ENSACIG00000009096	eftud2	100	90.731	Amphilophus_citrinellus
ENSELUG00000017169	eftud2	88	90.471	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	90.471	Amphiprion_ocellaris
ENSELUG00000017169	eftud2	100	96.189	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	96.189	Amphiprion_percula
ENSELUG00000017169	eftud2	100	96.087	ENSATEG00000000457	eftud2	100	96.087	Anabas_testudineus
ENSELUG00000017169	eftud2	99	87.745	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	87.848	Anas_platyrhynchos
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.535	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	90.741	Anolis_carolinensis
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	90.947	Aotus_nancymaae
ENSELUG00000017169	eftud2	100	94.027	ENSACLG00000001296	eftud2	100	94.439	Astatotilapia_calliptera
ENSELUG00000017169	eftud2	100	94.575	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	94.575	Astyanax_mexicanus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	91.049	Bos_taurus
ENSELUG00000017169	eftud2	99	70.588	WBGene00001166	eftu-2	99	70.041	Caenorhabditis_elegans
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	90.947	Callithrix_jacchus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	91.049	Canis_familiaris
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.049	Canis_lupus_dingo
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.049	Capra_hircus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	91.049	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	91.049	Carlito_syrichta
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.741	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	91.049	Cavia_aperea
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.741	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	91.049	Cavia_porcellus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	90.947	Cebus_capucinus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	90.947	Cercocebus_atys
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.638	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.049	Chinchilla_lanigera
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	90.947	Chlorocebus_sabaeus
ENSELUG00000017169	eftud2	92	80.405	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	80.405	Choloepus_hoffmanni
ENSELUG00000017169	eftud2	100	91.255	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	90.947	Chrysemys_picta_bellii
ENSELUG00000017169	eftud2	100	78.109	ENSCING00000009372	-	100	78.109	Ciona_intestinalis
ENSELUG00000017169	eftud2	99	77.937	ENSCSAVG00000004985	-	100	79.623	Ciona_savignyi
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	90.947	Colobus_angolensis_palliatus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	91.152	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	90.947	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSELUG00000017169	eftud2	100	91.152	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	90.947	Cricetulus_griseus_crigri
ENSELUG00000017169	eftud2	100	93.615	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	94.027	Cynoglossus_semilaevis
ENSELUG00000017169	eftud2	100	93.821	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	94.233	Cyprinodon_variegatus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	94.536	ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.536	Danio_rerio
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.638	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	90.638	Dasypus_novemcinctus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.049	Dipodomys_ordii
ENSELUG00000017169	eftud2	100	73.900	FBgn0039566	CG4849	100	73.641	Drosophila_melanogaster
ENSELUG00000017169	eftud2	92	98.370	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	98.370	Echinops_telfairi
ENSELUG00000017169	eftud2	74	93.532	ENSEBUG00000004047	-	96	86.648	Eptatretus_burgeri
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	91.049	Equus_asinus_asinus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.844	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	90.947	Equus_caballus
ENSELUG00000017169	eftud2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.844	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	90.947	Felis_catus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	91.152	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.049	Ficedula_albicollis
ENSELUG00000017169	eftud2	100	91.255	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	91.049	Fukomys_damarensis
ENSELUG00000017169	eftud2	100	93.718	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	94.130	Fundulus_heteroclitus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	94.645	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	94.851	Gadus_morhua
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.261	Gallus_gallus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	93.821	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	94.130	Gambusia_affinis
ENSELUG00000017169	eftud2	100	93.615	ENSGACG00000009163	eftud2	100	94.027	Gasterosteus_aculeatus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	90.947	Gorilla_gorilla
ENSELUG00000017169	eftud2	100	93.924	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	94.336	Haplochromis_burtoni
ENSELUG00000017169	eftud2	100	91.152	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	91.049	Heterocephalus_glaber_female
ENSELUG00000017169	eftud2	100	91.152	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.049	Heterocephalus_glaber_male
ENSELUG00000017169	eftud2	100	94.959	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	94.342	Hippocampus_comes
ENSELUG00000017169	eftud2	100	94.851	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.954	Ictalurus_punctatus
ENSELUG00000017169	eftud2	92	92.455	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.273	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSELUG00000017169	eftud2	95	93.152	ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.152	Jaculus_jaculus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	93.615	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	94.027	Kryptolebias_marmoratus
ENSELUG00000017169	eftud2	95	94.168	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	95.765	Labrus_bergylta
ENSELUG00000017169	eftud2	100	92.379	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.585	Latimeria_chalumnae
ENSELUG00000017169	eftud2	100	95.361	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	95.361	Lepisosteus_oculatus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.844	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	90.947	Loxodonta_africana
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	90.947	Macaca_fascicularis
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	90.947	Macaca_nemestrina
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	90.947	Mandrillus_leucophaeus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	96.292	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	96.292	Mastacembelus_armatus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	94.027	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	94.439	Maylandia_zebra
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.657	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	90.760	Meleagris_gallopavo
ENSELUG00000017169	eftud2	100	91.049	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	91.049	Mesocricetus_auratus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	90.947	Microcebus_murinus
ENSELUG00000017169	eftud2	92	74.719	ENSMOCG00000017653	-	90	74.719	Microtus_ochrogaster
ENSELUG00000017169	eftud2	100	91.049	ENSMOCG00000009039	-	100	91.049	Microtus_ochrogaster
ENSELUG00000017169	eftud2	88	96.706	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	96.706	Mola_mola
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	90.947	Monodelphis_domestica
ENSELUG00000017169	eftud2	88	94.706	ENSMALG00000014501	eftud2	100	94.706	Monopterus_albus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	90.741	Mus_caroli
ENSELUG00000017169	eftud2	100	91.143	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	90.834	Mus_musculus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	90.741	Mus_pahari
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	90.741	Mus_spretus
ENSELUG00000017169	eftud2	97	90.678	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	90.784	Mustela_putorius_furo
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	91.049	Myotis_lucifugus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	91.049	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.152	Nannospalax_galili
ENSELUG00000017169	eftud2	100	93.924	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	94.336	Neolamprologus_brichardi
ENSELUG00000017169	eftud2	97	88.842	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	88.842	Nomascus_leucogenys
ENSELUG00000017169	eftud2	100	87.243	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	87.243	Notamacropus_eugenii
ENSELUG00000017169	eftud2	100	83.128	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	83.230	Ochotona_princeps
ENSELUG00000017169	eftud2	100	91.358	ENSODEG00000018041	-	100	90.947	Octodon_degus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	63.228	ENSODEG00000003385	-	100	62.921	Octodon_degus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	94.027	ENSONIG00000000912	eftud2	100	94.439	Oreochromis_niloticus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	91.049	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.049	Oryctolagus_cuniculus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	93.100	ENSORLG00000003109	eftud2	100	93.306	Oryzias_latipes
ENSELUG00000017169	eftud2	100	92.997	ENSORLG00020009865	eftud2	100	93.203	Oryzias_latipes_hni
ENSELUG00000017169	eftud2	100	92.997	ENSORLG00015002611	eftud2	100	95.643	Oryzias_latipes_hsok
ENSELUG00000017169	eftud2	100	89.198	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	89.198	Otolemur_garnettii
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	91.049	Ovis_aries
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	90.947	Pan_paniscus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	91.049	Panthera_pardus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	91.049	Panthera_tigris_altaica
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	90.947	Pan_troglodytes
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	90.947	Papio_anubis
ENSELUG00000017169	eftud2	93	89.526	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	89.195	Pelodiscus_sinensis
ENSELUG00000017169	eftud2	100	86.701	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	86.392	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	90.947	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	90.947	Phascolarctos_cinereus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	93.821	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	94.130	Poecilia_formosa
ENSELUG00000017169	eftud2	100	93.821	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	94.130	Poecilia_latipinna
ENSELUG00000017169	eftud2	100	93.821	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	94.130	Poecilia_mexicana
ENSELUG00000017169	eftud2	100	89.712	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	89.712	Pongo_abelii
ENSELUG00000017169	eftud2	100	86.934	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	86.934	Procavia_capensis
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	90.947	Propithecus_coquereli
ENSELUG00000017169	eftud2	100	86.626	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	86.728	Pteropus_vampyrus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	94.027	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	94.439	Pundamilia_nyererei
ENSELUG00000017169	eftud2	100	94.542	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.645	Pygocentrus_nattereri
ENSELUG00000017169	eftud2	100	91.246	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	90.937	Rattus_norvegicus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.844	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	90.844	Rhinopithecus_bieti
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.844	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	90.844	Rhinopithecus_roxellana
ENSELUG00000017169	eftud2	97	33.729	YKL173W	SNU114	91	34.249	Saccharomyces_cerevisiae
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	90.947	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSELUG00000017169	eftud2	95	93.152	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.152	Sarcophilus_harrisii
ENSELUG00000017169	eftud2	100	95.773	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	95.773	Scleropages_formosus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	93.821	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	94.233	Scophthalmus_maximus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	94.130	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	94.542	Seriola_dumerili
ENSELUG00000017169	eftud2	100	94.233	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	94.645	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSELUG00000017169	eftud2	100	82.922	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	82.922	Sorex_araneus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.741	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	90.432	Sphenodon_punctatus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	94.130	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	94.542	Stegastes_partitus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.844	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.049	Sus_scrofa
ENSELUG00000017169	eftud2	83	92.040	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.040	Taeniopygia_guttata
ENSELUG00000017169	eftud2	100	92.894	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	93.306	Takifugu_rubripes
ENSELUG00000017169	eftud2	100	88.410	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	88.821	Tetraodon_nigroviridis
ENSELUG00000017169	eftud2	100	85.597	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	85.597	Tupaia_belangeri
ENSELUG00000017169	eftud2	91	89.217	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	89.217	Tursiops_truncatus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.113	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.216	Ursus_americanus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	91.049	Ursus_maritimus
ENSELUG00000017169	eftud2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	91.049	Vulpes_vulpes
ENSELUG00000017169	eftud2	96	91.230	ENSXETG00000003394	eftud2	98	92.165	Xenopus_tropicalis
ENSELUG00000017169	eftud2	81	96.173	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	96.173	Xiphophorus_couchianus
ENSELUG00000017169	eftud2	100	93.821	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	94.130	Xiphophorus_maculatus