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Description

Ensembl ID: ENSELUG00000023229 (Gene tree)
Gene ID: 105024388
Gene Symbol: pelo
Alias: wu:fa12c12|wu:fb97f07|zgc:56550
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Esox_lucius
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9457 bases
Position: chrLG05:32130046-32139502
Accession: 105024388
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSELUP00000042138	eRF1_2	PF03464.15	4.6e-33	1	1
ENSELUP00000042133	eRF1_2	PF03464.15	5.2e-33	1	1
ENSELUP00000042133	eRF1_3	PF03465.15	1.4e-24	1	1
ENSELUP00000042138	eRF1_3	PF03465.15	2e-16	1	1
ENSELUP00000042138	eRF1_1	PF03463.15	2.1e-51	1	1
ENSELUP00000042133	eRF1_1	PF03463.15	2.2e-51	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSELUT00000035928	-	2060	XM_010894318	ENSELUP00000042133	385 (aa)	XP_010892620	UPI000575FDF9
ENSELUT00000035930	-	2262	-	ENSELUP00000042138	362 (aa)	-	-

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
els03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	ENSG00000152684	PELO	100	80.519	Homo_sapiens
ENSELUG00000023229	pelo	100	91.429	ENSAPOG00000023072	pelo	100	91.429	Acanthochromis_polyacanthus
ENSELUG00000023229	pelo	68	92.308	ENSAPOG00000000616	pelo	90	92.308	Acanthochromis_polyacanthus
ENSELUG00000023229	pelo	68	92.308	ENSAPOG00000023700	-	90	92.308	Acanthochromis_polyacanthus
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	ENSAMEG00000007734	PELO	100	80.519	Ailuropoda_melanoleuca
ENSELUG00000023229	pelo	93	90.476	ENSACIG00000014386	pelo	97	90.237	Amphilophus_citrinellus
ENSELUG00000023229	pelo	100	91.688	ENSAOCG00000023717	pelo	100	91.688	Amphiprion_ocellaris
ENSELUG00000023229	pelo	100	91.688	ENSAPEG00000011235	pelo	100	91.688	Amphiprion_percula
ENSELUG00000023229	pelo	100	91.948	ENSATEG00000019550	pelo	100	91.948	Anabas_testudineus
ENSELUG00000023229	pelo	77	72.483	ENSAPLG00000013265	PELO	100	72.483	Anas_platyrhynchos
ENSELUG00000023229	pelo	98	80.845	ENSACAG00000004352	PELO	100	79.740	Anolis_carolinensis
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	ENSANAG00000014096	PELO	100	80.519	Aotus_nancymaae
ENSELUG00000023229	pelo	100	90.390	ENSACLG00000010305	pelo	100	90.390	Astatotilapia_calliptera
ENSELUG00000023229	pelo	98	93.521	ENSAMXG00000020299	pelo	99	92.987	Astyanax_mexicanus
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.000	ENSBTAG00000003268	PELO	99	80.000	Bos_taurus
ENSELUG00000023229	pelo	99	60.367	WBGene00011280	pelo-1	100	60.367	Caenorhabditis_elegans
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.260	ENSCJAG00000035190	PELO	100	80.260	Callithrix_jacchus
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.779	ENSCAFG00020023234	PELO	100	80.779	Canis_lupus_dingo
ENSELUG00000023229	pelo	100	79.740	ENSCHIG00000016410	PELO	99	79.740	Capra_hircus
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.779	ENSTSYG00000005203	PELO	100	80.779	Carlito_syrichta
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.779	ENSCPOG00000027406	PELO	100	80.779	Cavia_porcellus
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.260	ENSCCAG00000035600	PELO	100	80.260	Cebus_capucinus
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	ENSCATG00000011829	PELO	100	80.519	Cercocebus_atys
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.260	ENSCLAG00000005043	PELO	100	80.260	Chinchilla_lanigera
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	ENSCSAG00000016692	PELO	100	80.519	Chlorocebus_sabaeus
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	ENSCHOG00000000523	PELO	100	80.519	Choloepus_hoffmanni
ENSELUG00000023229	pelo	98	81.127	ENSCPBG00000007544	PELO	100	80.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSELUG00000023229	pelo	98	64.789	ENSCING00000001979	-	100	64.323	Ciona_intestinalis
ENSELUG00000023229	pelo	98	67.887	ENSCSAVG00000006158	-	100	66.146	Ciona_savignyi
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	ENSCANG00000023382	PELO	100	80.519	Colobus_angolensis_palliatus
ENSELUG00000023229	pelo	98	81.127	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	80.519	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSELUG00000023229	pelo	98	81.972	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	81.299	Cricetulus_griseus_crigri
ENSELUG00000023229	pelo	100	89.610	ENSCSEG00000008807	pelo	100	89.610	Cynoglossus_semilaevis
ENSELUG00000023229	pelo	100	90.909	ENSCVAG00000016082	pelo	100	90.909	Cyprinodon_variegatus
ENSELUG00000023229	pelo	100	91.429	ENSDARG00000055477	pelo	100	91.429	Danio_rerio
ENSELUG00000023229	pelo	100	77.720	ENSDNOG00000036721	PELO	100	77.720	Dasypus_novemcinctus
ENSELUG00000023229	pelo	100	81.299	ENSDORG00000016689	Pelo	100	81.299	Dipodomys_ordii
ENSELUG00000023229	pelo	98	67.324	FBgn0011207	pelo	97	66.319	Drosophila_melanogaster
ENSELUG00000023229	pelo	71	77.193	ENSEBUG00000004955	pelo	99	77.193	Eptatretus_burgeri
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	ENSEASG00005013348	PELO	100	80.519	Equus_asinus_asinus
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	ENSFCAG00000032341	PELO	100	80.519	Felis_catus
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.779	ENSFALG00000004559	PELO	100	80.779	Ficedula_albicollis
ENSELUG00000023229	pelo	78	80.634	ENSFDAG00000002076	PELO	88	80.634	Fukomys_damarensis
ENSELUG00000023229	pelo	100	90.130	ENSFHEG00000009769	pelo	100	90.130	Fundulus_heteroclitus
ENSELUG00000023229	pelo	98	90.451	ENSGMOG00000005849	pelo	100	90.390	Gadus_morhua
ENSELUG00000023229	pelo	100	89.610	ENSGAFG00000019350	pelo	100	89.610	Gambusia_affinis
ENSELUG00000023229	pelo	100	92.208	ENSGACG00000007245	pelo	100	92.208	Gasterosteus_aculeatus
ENSELUG00000023229	pelo	98	81.408	ENSGAGG00000004018	PELO	100	80.260	Gopherus_agassizii
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	ENSGGOG00000012635	PELO	100	80.519	Gorilla_gorilla
ENSELUG00000023229	pelo	100	90.390	ENSHBUG00000005866	pelo	100	90.390	Haplochromis_burtoni
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	ENSHGLG00000005932	PELO	100	80.519	Heterocephalus_glaber_female
ENSELUG00000023229	pelo	100	78.442	ENSHGLG00100017627	PELO	100	78.442	Heterocephalus_glaber_male
ENSELUG00000023229	pelo	100	88.831	ENSHCOG00000016782	pelo	100	88.831	Hippocampus_comes
ENSELUG00000023229	pelo	100	89.870	ENSIPUG00000020627	pelo	100	89.870	Ictalurus_punctatus
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	ENSSTOG00000027378	PELO	100	80.519	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSELUG00000023229	pelo	100	78.701	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	78.701	Jaculus_jaculus
ENSELUG00000023229	pelo	99	91.623	ENSKMAG00000021305	pelo	99	91.623	Kryptolebias_marmoratus
ENSELUG00000023229	pelo	99	91.406	ENSLBEG00000022399	pelo	100	91.406	Labrus_bergylta
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.260	ENSLAFG00000020551	PELO	100	80.260	Loxodonta_africana
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	ENSMFAG00000000651	PELO	100	80.519	Macaca_fascicularis
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	ENSMMUG00000039101	PELO	100	80.519	Macaca_mulatta
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	ENSMNEG00000035538	PELO	100	80.519	Macaca_nemestrina
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	ENSMLEG00000039113	PELO	100	80.519	Mandrillus_leucophaeus
ENSELUG00000023229	pelo	98	92.676	ENSMAMG00000013260	pelo	100	92.208	Mastacembelus_armatus
ENSELUG00000023229	pelo	100	90.390	ENSMZEG00005014258	pelo	100	90.390	Maylandia_zebra
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	80.519	Mesocricetus_auratus
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	ENSMICG00000044040	PELO	100	80.519	Microcebus_murinus
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.779	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	80.779	Microtus_ochrogaster
ENSELUG00000023229	pelo	100	90.909	ENSMMOG00000001324	pelo	100	90.909	Mola_mola
ENSELUG00000023229	pelo	100	91.429	ENSMALG00000008194	pelo	100	91.429	Monopterus_albus
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.260	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	80.260	Mus_caroli
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.260	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	80.260	Mus_musculus
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	80.519	Mus_pahari
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.260	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	80.260	Mus_spretus
ENSELUG00000023229	pelo	99	79.688	ENSMLUG00000024132	PELO	100	79.688	Myotis_lucifugus
ENSELUG00000023229	pelo	100	81.039	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	81.039	Nannospalax_galili
ENSELUG00000023229	pelo	100	90.390	ENSNBRG00000011799	pelo	100	90.390	Neolamprologus_brichardi
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	ENSNLEG00000035970	PELO	100	80.519	Nomascus_leucogenys
ENSELUG00000023229	pelo	100	79.221	ENSMEUG00000005468	PELO	100	79.221	Notamacropus_eugenii
ENSELUG00000023229	pelo	98	80.563	ENSOPRG00000018793	PELO	100	80.211	Ochotona_princeps
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.779	ENSODEG00000017579	PELO	100	80.779	Octodon_degus
ENSELUG00000023229	pelo	98	90.986	ENSONIG00000011511	pelo	100	90.909	Oreochromis_niloticus
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	ENSOCUG00000023902	PELO	100	80.519	Oryctolagus_cuniculus
ENSELUG00000023229	pelo	100	89.870	ENSORLG00000005827	pelo	100	89.870	Oryzias_latipes
ENSELUG00000023229	pelo	100	90.130	ENSORLG00020016456	pelo	100	90.130	Oryzias_latipes_hni
ENSELUG00000023229	pelo	100	90.130	ENSORLG00015014447	pelo	100	90.130	Oryzias_latipes_hsok
ENSELUG00000023229	pelo	100	91.688	ENSOMEG00000021567	pelo	100	91.688	Oryzias_melastigma
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.779	ENSOGAG00000027940	PELO	100	80.779	Otolemur_garnettii
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.000	ENSOARG00000008324	PELO	99	80.000	Ovis_aries
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	ENSPPAG00000038951	PELO	100	80.519	Pan_paniscus
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	ENSPPRG00000018800	PELO	100	80.519	Panthera_pardus
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	ENSPTIG00000019988	PELO	100	80.519	Panthera_tigris_altaica
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.260	ENSPTRG00000034409	PELO	100	80.260	Pan_troglodytes
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	ENSPANG00000010902	PELO	100	80.519	Papio_anubis
ENSELUG00000023229	pelo	100	91.948	ENSPKIG00000015190	pelo	100	91.948	Paramormyrops_kingsleyae
ENSELUG00000023229	pelo	98	80.563	ENSPSIG00000004971	PELO	100	79.740	Pelodiscus_sinensis
ENSELUG00000023229	pelo	71	89.535	ENSPMGG00000014561	pelo	95	89.535	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.779	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	80.779	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSELUG00000023229	pelo	99	80.418	ENSPCIG00000004880	PELO	99	80.418	Phascolarctos_cinereus
ENSELUG00000023229	pelo	100	90.390	ENSPFOG00000007277	pelo	100	90.390	Poecilia_formosa
ENSELUG00000023229	pelo	100	90.390	ENSPLAG00000020787	pelo	100	90.390	Poecilia_latipinna
ENSELUG00000023229	pelo	100	90.390	ENSPMEG00000016964	pelo	100	90.390	Poecilia_mexicana
ENSELUG00000023229	pelo	100	90.390	ENSPREG00000023071	pelo	100	90.390	Poecilia_reticulata
ENSELUG00000023229	pelo	98	81.408	ENSPPYG00000015451	PELO	96	80.519	Pongo_abelii
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	ENSPCOG00000021178	PELO	100	80.519	Propithecus_coquereli
ENSELUG00000023229	pelo	100	90.390	ENSPNYG00000017325	pelo	100	90.390	Pundamilia_nyererei
ENSELUG00000023229	pelo	98	92.958	ENSPNAG00000012458	pelo	100	92.746	Pygocentrus_nattereri
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.779	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	80.779	Rattus_norvegicus
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	ENSRBIG00000007299	PELO	100	80.519	Rhinopithecus_bieti
ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	ENSRROG00000035507	PELO	100	80.519	Rhinopithecus_roxellana
ENSELUG00000023229	pelo	97	32.275	YNL001W	-	97	32.275	Saccharomyces_cerevisiae
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