EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSETEG00000002205 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: RAB1A
Alias: RAB1|YPT1
Full Name: RAB1A%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Echinops_telfairi
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 36664 bases
Position: chrGeneScaffold_2510:265227-301890
Accession: 9758
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSETEP00000001786	MMR_HSR1	PF01926.23	8.2e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSETET00000002202	RAB1A-201	609	-	ENSETEP00000001786	202 (aa)	-	UPI0000006BCB

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSETEG00000002205	RAB1A	59	43.333	ENSETEG00000009412	-	58	43.333
ENSETEG00000002205	RAB1A	77	39.623	ENSETEG00000018698	RAB9B	79	39.623
ENSETEG00000002205	RAB1A	87	43.820	ENSETEG00000009624	RAB39B	84	43.820
ENSETEG00000002205	RAB1A	88	30.601	ENSETEG00000010802	RERG	90	30.601
ENSETEG00000002205	RAB1A	85	34.463	ENSETEG00000019899	HRAS	93	34.463
ENSETEG00000002205	RAB1A	50	33.000	ENSETEG00000010467	-	91	33.000
ENSETEG00000002205	RAB1A	80	37.267	ENSETEG00000005963	-	94	37.267
ENSETEG00000002205	RAB1A	84	42.857	ENSETEG00000003629	RAB33B	76	42.857
ENSETEG00000002205	RAB1A	82	35.928	ENSETEG00000016304	MRAS	80	35.928
ENSETEG00000002205	RAB1A	83	53.571	ENSETEG00000004920	RAB11A	77	53.571
ENSETEG00000002205	RAB1A	68	36.301	ENSETEG00000008991	-	95	36.301
ENSETEG00000002205	RAB1A	81	37.805	ENSETEG00000002355	KRAS	86	37.805
ENSETEG00000002205	RAB1A	57	32.773	ENSETEG00000000437	ARL14	59	32.773
ENSETEG00000002205	RAB1A	98	45.673	ENSETEG00000000905	-	96	45.673
ENSETEG00000002205	RAB1A	98	45.238	ENSETEG00000010340	RAB2A	99	45.238

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSG00000138069	RAB1A	99	100.000	Homo_sapiens
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	95.545	ENSAPOG00000008143	-	100	95.545	Acanthochromis_polyacanthus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSAMEG00000001127	RAB1A	99	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	95.545	ENSAOCG00000020606	-	100	95.545	Amphiprion_ocellaris
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	95.545	ENSAPEG00000022488	-	100	95.545	Amphiprion_percula
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSANAG00000020929	RAB1A	99	100.000	Aotus_nancymaae
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	96.040	ENSACLG00000003326	-	100	96.040	Astatotilapia_calliptera
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	94.554	ENSAMXG00000034850	-	100	94.554	Astyanax_mexicanus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	100.000	Bos_taurus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	100.000	Callithrix_jacchus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00000003187	RAB1A	99	100.000	Canis_familiaris
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00020026971	RAB1A	99	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSETEG00000002205	RAB1A	98	100.000	ENSCHIG00000014060	RAB1A	96	100.000	Capra_hircus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	98.515	ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSCPOG00000015437	RAB1A	99	100.000	Cavia_porcellus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSCCAG00000021869	RAB1A	99	100.000	Cebus_capucinus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSCATG00000030853	RAB1A	99	100.000	Cercocebus_atys
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSCLAG00000014766	RAB1A	99	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	99.505	ENSCPBG00000013243	RAB1A	99	99.505	Chrysemys_picta_bellii
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	97.525	ENSCANG00000035916	RAB1A	99	97.525	Colobus_angolensis_palliatus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00001012691	-	99	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00000008456	-	99	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSDNOG00000018236	RAB1A	99	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSDORG00000028628	-	99	100.000	Dipodomys_ordii
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	84.236	FBgn0285937	Rab1	99	84.236	Drosophila_melanogaster
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSEASG00005007298	RAB1A	99	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSECAG00000009926	RAB1A	99	100.000	Equus_caballus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSEEUG00000011721	RAB1A	100	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	95.588	ENSELUG00000012166	RAB1A	96	95.588	Esox_lucius
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSFCAG00000002536	RAB1A	99	100.000	Felis_catus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	97.525	ENSFALG00000013624	RAB1A	99	97.525	Ficedula_albicollis
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSFDAG00000019505	-	99	100.000	Fukomys_damarensis
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	94.554	ENSFHEG00000014414	-	100	94.554	Fundulus_heteroclitus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	99.505	ENSGALG00000031582	RAB1A	99	99.505	Gallus_gallus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	94.554	ENSGAFG00000000918	-	100	94.554	Gambusia_affinis
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	99.505	ENSGAGG00000006802	RAB1A	99	99.505	Gopherus_agassizii
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSGGOG00000026603	RAB1A	99	100.000	Gorilla_gorilla
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSHGLG00000013585	RAB1A	99	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	98.515	ENSHGLG00100007994	RAB1A	99	98.515	Heterocephalus_glaber_male
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSSTOG00000020693	-	99	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSETEG00000002205	RAB1A	98	100.000	ENSJJAG00000014396	Rab1a	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSETEG00000002205	RAB1A	98	95.431	ENSKMAG00000014038	-	93	95.431	Kryptolebias_marmoratus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	95.050	ENSLBEG00000028426	RAB1A	100	95.050	Labrus_bergylta
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	99.010	ENSLACG00000012869	RAB1A	99	99.010	Latimeria_chalumnae
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSLAFG00000016666	RAB1A	99	100.000	Loxodonta_africana
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSMFAG00000046246	RAB1A	99	100.000	Macaca_fascicularis
ENSETEG00000002205	RAB1A	98	100.000	ENSMMUG00000021721	RAB1A	91	100.000	Macaca_mulatta
ENSETEG00000002205	RAB1A	95	99.476	ENSMNEG00000028414	-	96	99.476	Macaca_nemestrina
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSMLEG00000042535	RAB1A	99	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	96.040	ENSMZEG00005013959	-	100	96.040	Maylandia_zebra
ENSETEG00000002205	RAB1A	98	99.492	ENSMGAG00000004611	RAB1A	98	99.492	Meleagris_gallopavo
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	99.505	ENSMAUG00000012156	Rab1a	99	99.505	Mesocricetus_auratus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSMICG00000012587	RAB1A	99	100.000	Microcebus_murinus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	99.505	ENSMOCG00000017022	Rab1a	99	99.505	Microtus_ochrogaster
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	93.564	ENSMMOG00000018709	RAB1A	100	93.564	Mola_mola
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	99.505	ENSMODG00000003340	RAB1A	99	99.505	Monodelphis_domestica
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0016115	Rab1a	99	100.000	Mus_caroli
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSMUSG00000020149	Rab1a	100	100.000	Mus_musculus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0016776	Rab1a	99	100.000	Mus_pahari
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0016958	Rab1a	100	100.000	Mus_spretus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSMPUG00000006139	RAB1A	80	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSMLUG00000009489	RAB1A	99	100.000	Myotis_lucifugus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSNGAG00000005838	Rab1a	99	100.000	Nannospalax_galili
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	96.040	ENSNBRG00000020492	-	100	96.040	Neolamprologus_brichardi
ENSETEG00000002205	RAB1A	98	100.000	ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	Ochotona_princeps
ENSETEG00000002205	RAB1A	95	100.000	ENSODEG00000011248	-	96	100.000	Octodon_degus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	94.059	ENSONIG00000006819	-	99	94.059	Oreochromis_niloticus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	99.505	ENSOANG00000012438	RAB1A	99	99.505	Ornithorhynchus_anatinus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSOCUG00000017003	RAB1A	99	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSOGAG00000026181	RAB1A	99	100.000	Otolemur_garnettii
ENSETEG00000002205	RAB1A	98	100.000	ENSOARG00000019997	RAB1A	97	100.000	Ovis_aries
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSPPAG00000030253	RAB1A	100	100.000	Pan_paniscus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	100.000	Panthera_pardus
ENSETEG00000002205	RAB1A	98	100.000	ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSPTRG00000011989	RAB1A	99	100.000	Pan_troglodytes
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSPANG00000010485	RAB1A	99	100.000	Papio_anubis
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	97.030	ENSPSIG00000008028	RAB1A	99	97.030	Pelodiscus_sinensis
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	96.040	ENSPMGG00000021015	-	99	96.040	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSPEMG00000009340	Rab1a	99	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	99.505	ENSPCIG00000023212	RAB1A	99	99.505	Phascolarctos_cinereus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	94.059	ENSPFOG00000000498	-	98	94.059	Poecilia_formosa
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	94.059	ENSPLAG00000015592	-	100	94.059	Poecilia_latipinna
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	94.059	ENSPMEG00000005288	-	100	94.059	Poecilia_mexicana
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSPPYG00000012360	RAB1A	99	100.000	Pongo_abelii
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSPCOG00000017244	RAB1A	99	100.000	Propithecus_coquereli
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	96.040	ENSPNYG00000015841	-	100	96.040	Pundamilia_nyererei
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSRNOG00000004992	Rab1a	99	100.000	Rattus_norvegicus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSSBOG00000023732	RAB1A	99	100.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSETEG00000002205	RAB1A	98	99.492	ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	Sarcophilus_harrisii
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	95.545	ENSSMAG00000021049	-	100	95.545	Scophthalmus_maximus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	96.040	ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.040	Seriola_dumerili
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	99.505	ENSSPUG00000012822	RAB1A	99	99.505	Sphenodon_punctatus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	95.545	ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	Stegastes_partitus
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSSSCG00000008359	RAB1A	100	100.000	Sus_scrofa
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	97.525	ENSTGUG00000002328	RAB1A	99	97.525	Taeniopygia_guttata
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	95.050	ENSTRUG00000024994	RAB1A	100	95.050	Takifugu_rubripes
ENSETEG00000002205	RAB1A	98	100.000	ENSUMAG00000021038	RAB1A	99	100.000	Ursus_maritimus
ENSETEG00000002205	RAB1A	98	99.495	ENSVPAG00000005640	RAB1A	99	99.495	Vicugna_pacos
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	ENSVVUG00000027588	RAB1A	99	100.000	Vulpes_vulpes
ENSETEG00000002205	RAB1A	100	94.554	ENSXMAG00000015776	-	100	94.554	Xiphophorus_maculatus