EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSETEG00000005620 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SBNO1
Alias: FLJ10701|FLJ10833|MOP3|Sno
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Echinops_telfairi
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 139569 bases
Position: chrGeneScaffold_4249:73432-213000
Accession: 22973
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSETEP00000004573	ResIII	PF04851.15	8e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSETET00000005625	SBNO1-201	4161	-	ENSETEP00000004573	1386 (aa)	-	UPI0000E41CFA

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.596	ENSG00000139697	SBNO1	93	90.596	Homo_sapiens
ENSETEG00000005620	SBNO1	76	73.628	ENSAPOG00000003196	sbno1	90	74.629	Acanthochromis_polyacanthus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.596	ENSAMEG00000015151	SBNO1	93	90.596	Ailuropoda_melanoleuca
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	71.746	ENSACIG00000008088	sbno1	91	71.746	Amphilophus_citrinellus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	71.384	ENSAOCG00000014859	sbno1	92	71.384	Amphiprion_ocellaris
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	71.384	ENSAPEG00000006069	sbno1	92	71.384	Amphiprion_percula
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	73.585	ENSATEG00000006667	sbno1	93	73.585	Anabas_testudineus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	85.893	ENSAPLG00000015674	SBNO1	93	85.893	Anas_platyrhynchos
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	84.639	ENSACAG00000015441	SBNO1	82	84.639	Anolis_carolinensis
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	89.662	ENSANAG00000029958	-	91	100.000	Aotus_nancymaae
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	71.429	ENSACLG00000024913	sbno1	92	71.429	Astatotilapia_calliptera
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	74.528	ENSAMXG00000019473	sbno1	93	75.157	Astyanax_mexicanus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.686	ENSBTAG00000020505	SBNO1	93	90.686	Bos_taurus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.282	ENSCJAG00000016599	SBNO1	93	90.282	Callithrix_jacchus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.596	ENSCAFG00000007503	SBNO1	93	90.596	Canis_familiaris
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.596	ENSCAFG00020015363	SBNO1	93	90.596	Canis_lupus_dingo
ENSETEG00000005620	SBNO1	88	99.291	ENSCHIG00000008382	SBNO1	92	99.291	Capra_hircus
ENSETEG00000005620	SBNO1	88	98.582	ENSTSYG00000012749	SBNO1	92	98.582	Carlito_syrichta
ENSETEG00000005620	SBNO1	89	91.223	ENSCAPG00000000384	SBNO1	93	91.223	Cavia_aperea
ENSETEG00000005620	SBNO1	88	98.582	ENSCPOG00000008109	SBNO1	92	99.275	Cavia_porcellus
ENSETEG00000005620	SBNO1	88	99.291	ENSCCAG00000035316	SBNO1	96	100.000	Cebus_capucinus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.596	ENSCATG00000008239	SBNO1	90	100.000	Cercocebus_atys
ENSETEG00000005620	SBNO1	88	97.872	ENSCLAG00000008995	SBNO1	92	98.551	Chinchilla_lanigera
ENSETEG00000005620	SBNO1	76	90.596	ENSCSAG00000002064	SBNO1	92	90.596	Chlorocebus_sabaeus
ENSETEG00000005620	SBNO1	91	86.885	ENSCHOG00000008814	SBNO1	91	86.885	Choloepus_hoffmanni
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	84.953	ENSCPBG00000025968	SBNO1	92	84.953	Chrysemys_picta_bellii
ENSETEG00000005620	SBNO1	88	95.184	ENSCANG00000042688	-	89	95.467	Colobus_angolensis_palliatus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.282	ENSCGRG00001017470	Sbno1	92	95.652	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.282	ENSCGRG00000004756	Sbno1	92	95.652	Cricetulus_griseus_crigri
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	70.755	ENSCSEG00000011919	sbno1	93	70.755	Cynoglossus_semilaevis
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	72.327	ENSCVAG00000007038	sbno1	93	72.327	Cyprinodon_variegatus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	74.603	ENSDARG00000099080	sbno1	93	74.921	Danio_rerio
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.282	ENSDNOG00000017147	SBNO1	95	90.802	Dasypus_novemcinctus
ENSETEG00000005620	SBNO1	88	90.282	ENSDORG00000015261	Sbno1	93	90.282	Dipodomys_ordii
ENSETEG00000005620	SBNO1	70	56.170	ENSEBUG00000013823	sbno1	87	55.172	Eptatretus_burgeri
ENSETEG00000005620	SBNO1	51	84.561	ENSEASG00005012595	-	92	84.561	Equus_asinus_asinus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.993	ENSECAG00000006127	SBNO1	93	91.230	Equus_caballus
ENSETEG00000005620	SBNO1	76	97.802	ENSEEUG00000003793	SBNO1	76	97.802	Erinaceus_europaeus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	75.472	ENSELUG00000002886	sbno1	93	75.472	Esox_lucius
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.686	ENSFCAG00000015331	SBNO1	93	90.686	Felis_catus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	85.893	ENSFALG00000009273	SBNO1	93	85.893	Ficedula_albicollis
ENSETEG00000005620	SBNO1	91	90.444	ENSFDAG00000014232	SBNO1	90	99.275	Fukomys_damarensis
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	72.642	ENSFHEG00000007360	sbno1	93	72.642	Fundulus_heteroclitus
ENSETEG00000005620	SBNO1	87	71.635	ENSGMOG00000018229	sbno1	92	71.809	Gadus_morhua
ENSETEG00000005620	SBNO1	81	84.221	ENSGALG00000003392	SBNO1	91	83.692	Gallus_gallus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	72.642	ENSGAFG00000003960	sbno1	93	72.642	Gambusia_affinis
ENSETEG00000005620	SBNO1	87	71.565	ENSGACG00000015633	sbno1	92	71.565	Gasterosteus_aculeatus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	84.953	ENSGAGG00000001065	SBNO1	91	97.826	Gopherus_agassizii
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.596	ENSGGOG00000015000	SBNO1	92	100.000	Gorilla_gorilla
ENSETEG00000005620	SBNO1	84	74.874	ENSHBUG00000011910	sbno1	86	74.874	Haplochromis_burtoni
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.909	ENSHGLG00000014165	-	91	99.275	Heterocephalus_glaber_female
ENSETEG00000005620	SBNO1	85	83.893	ENSHCOG00000003246	sbno1	88	90.511	Hippocampus_comes
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	74.843	ENSIPUG00000015830	Sbno1	91	74.843	Ictalurus_punctatus
ENSETEG00000005620	SBNO1	88	98.582	ENSSTOG00000023221	SBNO1	92	98.582	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSETEG00000005620	SBNO1	86	98.582	ENSJJAG00000001741	Sbno1	91	100.000	Jaculus_jaculus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	72.381	ENSKMAG00000009696	sbno1	93	72.381	Kryptolebias_marmoratus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	73.270	ENSLBEG00000007623	sbno1	93	73.270	Labrus_bergylta
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	76.041	ENSLACG00000017227	SBNO1	93	76.751	Latimeria_chalumnae
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	78.616	ENSLOCG00000005725	sbno1	91	78.616	Lepisosteus_oculatus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.909	ENSLAFG00000002135	SBNO1	93	90.909	Loxodonta_africana
ENSETEG00000005620	SBNO1	88	98.582	ENSMFAG00000031429	SBNO1	92	100.000	Macaca_fascicularis
ENSETEG00000005620	SBNO1	88	98.582	ENSMMUG00000011496	SBNO1	92	100.000	Macaca_mulatta
ENSETEG00000005620	SBNO1	88	98.582	ENSMLEG00000033260	SBNO1	92	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	72.956	ENSMAMG00000005473	sbno1	93	72.956	Mastacembelus_armatus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	86.207	ENSMGAG00000003274	SBNO1	93	86.207	Meleagris_gallopavo
ENSETEG00000005620	SBNO1	50	82.902	ENSMAUG00000004834	-	99	83.333	Mesocricetus_auratus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.596	ENSMICG00000006573	-	99	85.063	Microcebus_murinus
ENSETEG00000005620	SBNO1	88	97.163	ENSMOCG00000009390	Sbno1	92	97.826	Microtus_ochrogaster
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	72.642	ENSMMOG00000008691	sbno1	92	72.642	Mola_mola
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	88.050	ENSMODG00000012470	SBNO1	92	88.050	Monodelphis_domestica
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	71.069	ENSMALG00000001056	sbno1	93	71.069	Monopterus_albus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.566	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	99.561	Mus_caroli
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.566	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	99.561	Mus_musculus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.256	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	99.561	Mus_pahari
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.566	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	99.561	Mus_spretus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.596	ENSMPUG00000001658	SBNO1	93	90.596	Mustela_putorius_furo
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.481	ENSMLUG00000017159	SBNO1	93	90.481	Myotis_lucifugus
ENSETEG00000005620	SBNO1	85	98.582	ENSNGAG00000012620	Sbno1	90	100.000	Nannospalax_galili
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	71.429	ENSNBRG00000019189	sbno1	92	71.429	Neolamprologus_brichardi
ENSETEG00000005620	SBNO1	88	98.582	ENSNLEG00000001502	SBNO1	93	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSETEG00000005620	SBNO1	62	91.083	ENSMEUG00000008768	-	93	91.720	Notamacropus_eugenii
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	88.125	ENSOPRG00000011054	SBNO1	93	88.125	Ochotona_princeps
ENSETEG00000005620	SBNO1	88	98.582	ENSODEG00000009997	SBNO1	92	99.275	Octodon_degus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	71.429	ENSONIG00000015348	sbno1	93	71.429	Oreochromis_niloticus
ENSETEG00000005620	SBNO1	91	89.857	ENSOCUG00000002441	SBNO1	88	89.857	Oryctolagus_cuniculus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	72.013	ENSORLG00000001593	sbno1	93	72.013	Oryzias_latipes
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	72.013	ENSORLG00020015216	sbno1	93	72.013	Oryzias_latipes_hni
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	72.013	ENSORLG00015002726	sbno1	93	72.013	Oryzias_latipes_hsok
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	72.152	ENSOMEG00000019313	sbno1	93	72.152	Oryzias_melastigma
ENSETEG00000005620	SBNO1	50	79.885	ENSOGAG00000010781	-	99	80.603	Otolemur_garnettii
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.286	ENSOARG00000004404	SBNO1	93	90.286	Ovis_aries
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.282	ENSPPAG00000024635	SBNO1	92	100.000	Pan_paniscus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.686	ENSPPRG00000022092	SBNO1	93	90.686	Panthera_pardus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.596	ENSPTIG00000017803	SBNO1	93	90.596	Panthera_tigris_altaica
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.596	ENSPTRG00000005597	SBNO1	92	100.000	Pan_troglodytes
ENSETEG00000005620	SBNO1	88	98.582	ENSPANG00000011640	SBNO1	92	100.000	Papio_anubis
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	76.656	ENSPKIG00000001441	sbno1	93	76.656	Paramormyrops_kingsleyae
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	84.639	ENSPSIG00000009572	-	93	84.639	Pelodiscus_sinensis
ENSETEG00000005620	SBNO1	85	80.714	ENSPSIG00000009256	-	92	79.694	Pelodiscus_sinensis
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.282	ENSPEMG00000016087	Sbno1	92	95.652	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	87.736	ENSPCIG00000010985	SBNO1	93	87.736	Phascolarctos_cinereus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	72.642	ENSPFOG00000005069	sbno1	93	72.642	Poecilia_formosa
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	72.642	ENSPLAG00000015015	sbno1	93	72.642	Poecilia_latipinna
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	72.642	ENSPMEG00000021212	sbno1	93	72.642	Poecilia_mexicana
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	72.642	ENSPREG00000017746	sbno1	93	72.642	Poecilia_reticulata
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.596	ENSPPYG00000005084	SBNO1	93	90.596	Pongo_abelii
ENSETEG00000005620	SBNO1	66	100.000	ENSPCAG00000008634	SBNO1	66	100.000	Procavia_capensis
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.596	ENSPCOG00000024277	SBNO1	93	90.596	Propithecus_coquereli
ENSETEG00000005620	SBNO1	73	100.000	ENSPVAG00000015304	SBNO1	73	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSETEG00000005620	SBNO1	93	71.429	ENSPNYG00000004291	sbno1	93	71.429	Pundamilia_nyererei
ENSETEG00000005620	SBNO1	89	76.880	ENSPNAG00000015622	sbno1	90	77.095	Pygocentrus_nattereri
ENSETEG00000005620	SBNO1	88	99.291	ENSRNOG00000001064	Sbno1	92	100.000	Rattus_norvegicus
ENSETEG00000005620	SBNO1	88	98.582	ENSRROG00000034230	SBNO1	92	100.000	Rhinopithecus_roxellana
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ENSETEG00000005620	SBNO1	93	76.656	ENSSFOG00015019025	sbno1	93	76.656	Scleropages_formosus
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