EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSETEG00000005678 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Echinops_telfairi
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 61746 bases
Position: chrGeneScaffold_3448:12918-74663
Accession: 30858
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSETEP00000004619	GTP_EFTU	PF00009.27	1.7e-22	1	1
ENSETEP00000004619	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	6.7e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSETET00000005681	EFTUD2-201	2916	-	ENSETEP00000004619	971 (aa)	-	UPI0000E432E7

Gene Model

Click here to download ENSETEG00000005678's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSETEG00000005678's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSETEG00000005678	EFTUD2	59	45.509	ENSETEG00000018414	EEF2	67	45.509

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSG00000108883	EFTUD2	92	99.457	Homo_sapiens
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSAPOG00000002433	eftud2	92	97.826	Acanthochromis_polyacanthus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	92	99.457	Ailuropoda_melanoleuca
ENSETEG00000005678	EFTUD2	85	97.826	ENSACIG00000009096	eftud2	86	97.826	Amphilophus_citrinellus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	70	97.826	ENSAOCG00000023385	eftud2	84	97.826	Amphiprion_ocellaris
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSAPEG00000003321	eftud2	92	97.826	Amphiprion_percula
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSATEG00000000457	eftud2	92	97.826	Anabas_testudineus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	98.913	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	92	98.913	Anas_platyrhynchos
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	98.913	ENSACAG00000007637	EFTUD2	92	98.913	Anolis_carolinensis
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSANAG00000025320	EFTUD2	92	99.457	Aotus_nancymaae
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSACLG00000001296	eftud2	92	97.826	Astatotilapia_calliptera
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	98.370	ENSAMXG00000000568	eftud2	92	98.370	Astyanax_mexicanus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	92	99.457	Bos_taurus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	91	81.818	WBGene00001166	eftu-2	91	81.818	Caenorhabditis_elegans
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	92	99.457	Callithrix_jacchus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	92	99.457	Canis_familiaris
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	92	99.457	Canis_lupus_dingo
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	92	99.457	Capra_hircus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	92	99.457	Carlito_syrichta
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	92	99.457	Cavia_aperea
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	92	99.457	Cavia_porcellus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	92	99.457	Cebus_capucinus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSCATG00000035809	EFTUD2	92	99.457	Cercocebus_atys
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	92	99.457	Chinchilla_lanigera
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	92	99.457	Chlorocebus_sabaeus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	83	99.346	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	90	99.346	Choloepus_hoffmanni
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	98.913	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	92	98.913	Chrysemys_picta_bellii
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	91.304	ENSCING00000009372	-	92	91.304	Ciona_intestinalis
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	90.659	ENSCSAVG00000004985	-	95	90.217	Ciona_savignyi
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSCANG00000026557	EFTUD2	92	99.457	Colobus_angolensis_palliatus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSCGRG00001009904	Eftud2	92	99.457	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSCGRG00000003825	Eftud2	92	99.457	Cricetulus_griseus_crigri
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSCSEG00000016775	eftud2	92	97.826	Cynoglossus_semilaevis
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSCVAG00000012537	eftud2	92	97.826	Cyprinodon_variegatus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.283	ENSDARG00000012261	eftud2	92	97.283	Danio_rerio
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	92	99.457	Dasypus_novemcinctus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSDORG00000011566	Eftud2	92	99.457	Dipodomys_ordii
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	89.674	FBgn0039566	CG4849	92	89.674	Drosophila_melanogaster
ENSETEG00000005678	EFTUD2	62	94.565	ENSEBUG00000004047	-	78	92.727	Eptatretus_burgeri
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSEASG00005010321	EFTUD2	92	99.457	Equus_asinus_asinus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	98.913	ENSECAG00000019363	EFTUD2	85	98.913	Equus_caballus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	64	99.153	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	71	99.153	Erinaceus_europaeus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	98.370	ENSELUG00000017169	eftud2	92	98.370	Esox_lucius
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	92	99.457	Felis_catus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	98.913	ENSFALG00000007551	EFTUD2	92	98.913	Ficedula_albicollis
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	92	99.457	Fukomys_damarensis
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSFHEG00000013479	eftud2	92	97.826	Fundulus_heteroclitus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSGMOG00000014277	eftud2	92	97.826	Gadus_morhua
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	98.913	ENSGALG00000000988	EFTUD2	92	98.913	Gallus_gallus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSGAFG00000002263	eftud2	92	97.826	Gambusia_affinis
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSGACG00000009163	eftud2	92	97.826	Gasterosteus_aculeatus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	92	99.457	Gorilla_gorilla
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSHBUG00000023546	eftud2	92	97.826	Haplochromis_burtoni
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	92	99.457	Heterocephalus_glaber_female
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	92	99.457	Heterocephalus_glaber_male
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSHCOG00000017689	eftud2	92	97.826	Hippocampus_comes
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSIPUG00000023182	Eftud2	92	97.826	Ictalurus_punctatus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	91	99.457	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	88	99.457	ENSJJAG00000018268	Eftud2	91	99.457	Jaculus_jaculus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	95.652	ENSKMAG00000021027	eftud2	92	95.652	Kryptolebias_marmoratus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	87	97.842	ENSLBEG00000005875	eftud2	91	97.842	Labrus_bergylta
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.283	ENSLACG00000012918	EFTUD2	92	97.283	Latimeria_chalumnae
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	98.370	ENSLOCG00000011460	eftud2	92	98.370	Lepisosteus_oculatus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	92	99.457	Loxodonta_africana
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	92	99.457	Macaca_fascicularis
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	92	99.457	Macaca_mulatta
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	92	99.457	Macaca_nemestrina
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	92	99.457	Mandrillus_leucophaeus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSMAMG00000022190	eftud2	92	97.826	Mastacembelus_armatus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSMZEG00005022885	eftud2	92	97.826	Maylandia_zebra
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	98.913	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	92	98.913	Meleagris_gallopavo
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSMAUG00000021178	Eftud2	92	99.457	Mesocricetus_auratus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSMICG00000016592	EFTUD2	92	99.457	Microcebus_murinus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	84	80.392	ENSMOCG00000017653	-	81	80.392	Microtus_ochrogaster
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSMOCG00000009039	-	92	99.457	Microtus_ochrogaster
ENSETEG00000005678	EFTUD2	80	97.826	ENSMMOG00000020811	eftud2	91	97.826	Mola_mola
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSMODG00000011347	EFTUD2	92	99.457	Monodelphis_domestica
ENSETEG00000005678	EFTUD2	80	97.826	ENSMALG00000014501	eftud2	91	97.826	Monopterus_albus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	92	99.457	Mus_caroli
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSMUSG00000020929	Eftud2	92	99.457	Mus_musculus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	92	99.457	Mus_pahari
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	92	99.457	Mus_spretus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	89	98.718	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	83	98.718	Mustela_putorius_furo
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	92	99.457	Myotis_lucifugus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSNGAG00000017834	Eftud2	92	99.457	Nannospalax_galili
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSNBRG00000020081	eftud2	92	97.826	Neolamprologus_brichardi
ENSETEG00000005678	EFTUD2	89	99.346	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	88	99.346	Nomascus_leucogenys
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	89.155	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	92	89.155	Notamacropus_eugenii
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	98.913	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	92	98.913	Ochotona_princeps
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSODEG00000018041	-	92	99.457	Octodon_degus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	84	82.143	ENSODEG00000003385	-	90	82.143	Octodon_degus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSONIG00000000912	eftud2	92	97.826	Oreochromis_niloticus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	92	99.457	Oryctolagus_cuniculus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSORLG00000003109	eftud2	92	97.826	Oryzias_latipes
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSORLG00020009865	eftud2	92	97.826	Oryzias_latipes_hni
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSORLG00015002611	eftud2	92	97.826	Oryzias_latipes_hsok
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	92	99.457	Otolemur_garnettii
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSOARG00000009078	EFTUD2	90	99.457	Ovis_aries
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	92	99.457	Pan_paniscus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	92	99.457	Panthera_pardus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	92	99.457	Panthera_tigris_altaica
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	92	99.457	Pan_troglodytes
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSPANG00000021284	EFTUD2	92	99.457	Papio_anubis
ENSETEG00000005678	EFTUD2	85	98.276	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	90	98.276	Pelodiscus_sinensis
ENSETEG00000005678	EFTUD2	86	97.283	ENSPMGG00000007281	eftud2	91	97.283	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSPEMG00000005129	Eftud2	92	99.457	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	92	99.457	Phascolarctos_cinereus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSPFOG00000008515	eftud2	92	97.826	Poecilia_formosa
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSPLAG00000010393	eftud2	92	97.826	Poecilia_latipinna
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSPMEG00000005087	eftud2	92	97.826	Poecilia_mexicana
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	92	99.457	Pongo_abelii
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	88.873	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	92	88.873	Procavia_capensis
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	92	99.457	Propithecus_coquereli
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	98.913	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	92	98.913	Pteropus_vampyrus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSPNYG00000012448	eftud2	92	97.826	Pundamilia_nyererei
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSPNAG00000012490	eftud2	92	97.826	Pygocentrus_nattereri
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSRNOG00000002818	Eftud2	92	99.457	Rattus_norvegicus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	92	99.457	Rhinopithecus_bieti
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSRROG00000042925	EFTUD2	92	99.457	Rhinopithecus_roxellana
ENSETEG00000005678	EFTUD2	80	40.141	YKL173W	SNU114	73	40.141	Saccharomyces_cerevisiae
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	92	99.457	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSETEG00000005678	EFTUD2	88	99.457	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	91	99.457	Sarcophilus_harrisii
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSSFOG00015023272	eftud2	92	97.826	Scleropages_formosus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSSMAG00000010174	eftud2	92	97.826	Scophthalmus_maximus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSSDUG00000022675	eftud2	92	97.826	Seriola_dumerili
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSSLDG00000001595	eftud2	92	97.826	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	95.109	ENSSARG00000008664	EFTUD2	92	95.109	Sorex_araneus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	98.913	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	92	98.913	Sphenodon_punctatus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSSPAG00000016235	eftud2	91	97.826	Stegastes_partitus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	92	99.457	Sus_scrofa
ENSETEG00000005678	EFTUD2	76	98.485	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	90	98.485	Taeniopygia_guttata
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSTRUG00000016422	eftud2	92	97.826	Takifugu_rubripes
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSTNIG00000005346	eftud2	92	97.826	Tetraodon_nigroviridis
ENSETEG00000005678	EFTUD2	87	99.259	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	87	99.259	Tupaia_belangeri
ENSETEG00000005678	EFTUD2	86	94.286	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	86	94.286	Tursiops_truncatus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	92	99.457	Ursus_americanus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	92	99.457	Ursus_maritimus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	80	98.507	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	80	98.507	Vicugna_pacos
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	92	99.457	Vulpes_vulpes
ENSETEG00000005678	EFTUD2	88	98.370	ENSXETG00000003394	eftud2	90	98.370	Xenopus_tropicalis
ENSETEG00000005678	EFTUD2	73	96.610	ENSXCOG00000017309	eftud2	86	96.610	Xiphophorus_couchianus
ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	ENSXMAG00000008494	eftud2	92	97.826	Xiphophorus_maculatus