EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSETEG00000015729 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Echinops_telfairi
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5287 bases
Position: chrscaffold_309773:3471-8757
Accession: 19824
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSETEP00000012758	SYF2	PF08231.12	2.1e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSETET00000015729	SYF2-201	678	-	ENSETEP00000012758	226 (aa)	-	UPI0000E40719

Gene Model

Click here to download ENSETEG00000015729's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSETEG00000015729's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSETEG00000015729	SYF2	100	78.166	ENSG00000117614	SYF2	94	77.293	Homo_sapiens
ENSETEG00000015729	SYF2	90	70.048	ENSAPOG00000001174	syf2	87	70.048	Acanthochromis_polyacanthus
ENSETEG00000015729	SYF2	79	76.796	ENSAMEG00000010134	-	93	76.796	Ailuropoda_melanoleuca
ENSETEG00000015729	SYF2	99	75.439	ENSAMEG00000010115	-	92	75.893	Ailuropoda_melanoleuca
ENSETEG00000015729	SYF2	90	68.116	ENSACIG00000023688	syf2	83	68.116	Amphilophus_citrinellus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	67.249	ENSAOCG00000022046	syf2	88	70.531	Amphiprion_ocellaris
ENSETEG00000015729	SYF2	99	65.929	ENSAOCG00000010912	syf2	64	70.098	Amphiprion_ocellaris
ENSETEG00000015729	SYF2	100	67.249	ENSAPEG00000018858	syf2	80	70.531	Amphiprion_percula
ENSETEG00000015729	SYF2	88	68.966	ENSATEG00000007745	syf2	87	68.599	Anabas_testudineus
ENSETEG00000015729	SYF2	81	72.581	ENSAPLG00000016435	SYF2	93	72.581	Anas_platyrhynchos
ENSETEG00000015729	SYF2	66	59.477	ENSACAG00000026777	-	86	58.741	Anolis_carolinensis
ENSETEG00000015729	SYF2	83	68.947	ENSACAG00000013653	-	93	68.947	Anolis_carolinensis
ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.856	ENSANAG00000032473	SYF2	94	76.856	Aotus_nancymaae
ENSETEG00000015729	SYF2	90	67.633	ENSACLG00000019916	syf2	94	65.471	Astatotilapia_calliptera
ENSETEG00000015729	SYF2	100	65.066	ENSAMXG00000004051	syf2	87	69.082	Astyanax_mexicanus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.623	ENSBTAG00000001651	SYF2	94	77.477	Bos_taurus
ENSETEG00000015729	SYF2	85	41.327	WBGene00019402	syf-2	93	39.171	Caenorhabditis_elegans
ENSETEG00000015729	SYF2	100	77.293	ENSCJAG00000046570	SYF2	94	77.293	Callithrix_jacchus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	74.684	ENSCAFG00000012895	-	90	76.923	Canis_familiaris
ENSETEG00000015729	SYF2	100	66.812	ENSCAFG00000030331	-	91	68.468	Canis_familiaris
ENSETEG00000015729	SYF2	73	68.452	ENSCAFG00020021094	-	75	72.535	Canis_lupus_dingo
ENSETEG00000015729	SYF2	100	74.684	ENSCAFG00020021091	-	90	76.923	Canis_lupus_dingo
ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.856	ENSCHIG00000020874	SYF2	93	77.578	Capra_hircus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.419	ENSTSYG00000005114	SYF2	94	75.546	Carlito_syrichta
ENSETEG00000015729	SYF2	81	78.378	ENSCAPG00000010006	SYF2	93	78.378	Cavia_aperea
ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.293	ENSCPOG00000005326	SYF2	88	78.140	Cavia_porcellus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	77.293	ENSCCAG00000022459	SYF2	94	77.293	Cebus_capucinus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.856	ENSCATG00000026917	SYF2	94	75.983	Cercocebus_atys
ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.522	ENSCLAG00000008474	SYF2	91	77.828	Chinchilla_lanigera
ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.856	ENSCSAG00000000948	SYF2	94	75.983	Chlorocebus_sabaeus
ENSETEG00000015729	SYF2	65	72.973	ENSCHOG00000005273	-	76	74.648	Choloepus_hoffmanni
ENSETEG00000015729	SYF2	92	74.762	ENSCPBG00000025073	SYF2	88	73.516	Chrysemys_picta_bellii
ENSETEG00000015729	SYF2	86	41.709	ENSCING00000003017	-	83	41.709	Ciona_intestinalis
ENSETEG00000015729	SYF2	86	41.000	ENSCSAVG00000006627	-	91	41.000	Ciona_savignyi
ENSETEG00000015729	SYF2	100	75.109	ENSCANG00000037322	SYF2	93	74.236	Colobus_angolensis_palliatus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	77.729	ENSCGRG00001020733	Syf2	94	77.729	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSETEG00000015729	SYF2	79	78.022	ENSCGRG00000005095	Syf2	89	77.838	Cricetulus_griseus_crigri
ENSETEG00000015729	SYF2	89	64.706	ENSCSEG00000000117	syf2	91	62.162	Cynoglossus_semilaevis
ENSETEG00000015729	SYF2	91	67.308	ENSCVAG00000019543	syf2	87	67.308	Cyprinodon_variegatus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	65.939	ENSDARG00000004706	syf2	94	67.265	Danio_rerio
ENSETEG00000015729	SYF2	100	78.355	ENSDNOG00000047605	SYF2	91	78.924	Dasypus_novemcinctus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.087	ENSDORG00000001274	Syf2	91	77.376	Dipodomys_ordii
ENSETEG00000015729	SYF2	89	48.544	FBgn0033556	CG12343	91	48.544	Drosophila_melanogaster
ENSETEG00000015729	SYF2	80	48.087	ENSEBUG00000015402	syf2	88	48.087	Eptatretus_burgeri
ENSETEG00000015729	SYF2	99	75.330	ENSEASG00005004232	-	89	76.744	Equus_asinus_asinus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	77.056	ENSEASG00005004224	-	88	79.630	Equus_asinus_asinus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	77.056	ENSECAG00000012023	-	88	79.630	Equus_caballus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.419	ENSECAG00000010440	-	90	79.630	Equus_caballus
ENSETEG00000015729	SYF2	68	78.571	ENSEEUG00000015084	SYF2	77	81.429	Erinaceus_europaeus
ENSETEG00000015729	SYF2	96	66.368	ENSELUG00000003465	syf2	94	66.368	Esox_lucius
ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.724	ENSFCAG00000043095	-	90	76.471	Felis_catus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	77.489	ENSFCAG00000010324	-	80	77.489	Felis_catus
ENSETEG00000015729	SYF2	83	70.000	ENSFALG00000000460	SYF2	83	70.098	Ficedula_albicollis
ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.856	ENSFDAG00000008310	SYF2	94	76.856	Fukomys_damarensis
ENSETEG00000015729	SYF2	99	49.351	ENSFHEG00000007238	syf2	92	52.885	Fundulus_heteroclitus
ENSETEG00000015729	SYF2	89	69.118	ENSGMOG00000019138	syf2	91	69.118	Gadus_morhua
ENSETEG00000015729	SYF2	92	74.286	ENSGALG00000013639	SYF2	86	73.148	Gallus_gallus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	62.882	ENSGAFG00000019435	syf2	87	65.700	Gambusia_affinis
ENSETEG00000015729	SYF2	88	68.657	ENSGACG00000007305	syf2	94	64.732	Gasterosteus_aculeatus
ENSETEG00000015729	SYF2	92	75.238	ENSGAGG00000010670	SYF2	88	73.516	Gopherus_agassizii
ENSETEG00000015729	SYF2	100	78.166	ENSGGOG00000012796	SYF2	94	77.293	Gorilla_gorilla
ENSETEG00000015729	SYF2	90	67.633	ENSHBUG00000020477	syf2	94	65.471	Haplochromis_burtoni
ENSETEG00000015729	SYF2	92	67.143	ENSHGLG00000004304	-	90	63.426	Heterocephalus_glaber_female
ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.522	ENSHGLG00000014393	SYF2	91	76.923	Heterocephalus_glaber_female
ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.522	ENSHGLG00100014722	SYF2	91	76.923	Heterocephalus_glaber_male
ENSETEG00000015729	SYF2	100	64.629	ENSHCOG00000012904	syf2	68	67.633	Hippocampus_comes
ENSETEG00000015729	SYF2	99	66.376	ENSIPUG00000019859	syf2	87	69.903	Ictalurus_punctatus
ENSETEG00000015729	SYF2	81	77.838	ENSJJAG00000013301	Syf2	88	77.838	Jaculus_jaculus
ENSETEG00000015729	SYF2	90	67.633	ENSKMAG00000013856	syf2	87	67.633	Kryptolebias_marmoratus
ENSETEG00000015729	SYF2	89	68.780	ENSLBEG00000014425	syf2	87	68.599	Labrus_bergylta
ENSETEG00000015729	SYF2	89	72.059	ENSLACG00000012064	SYF2	86	72.059	Latimeria_chalumnae
ENSETEG00000015729	SYF2	100	66.812	ENSLOCG00000002728	syf2	83	69.856	Lepisosteus_oculatus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	78.355	ENSLAFG00000023150	-	91	79.279	Loxodonta_africana
ENSETEG00000015729	SYF2	51	75.000	ENSLAFG00000030814	-	63	75.000	Loxodonta_africana
ENSETEG00000015729	SYF2	100	77.293	ENSMFAG00000041831	SYF2	94	76.419	Macaca_fascicularis
ENSETEG00000015729	SYF2	100	77.729	ENSMMUG00000002968	SYF2	94	76.856	Macaca_mulatta
ENSETEG00000015729	SYF2	100	77.293	ENSMNEG00000030180	SYF2	94	76.419	Macaca_nemestrina
ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.856	ENSMLEG00000030248	SYF2	94	75.983	Mandrillus_leucophaeus
ENSETEG00000015729	SYF2	88	68.473	ENSMAMG00000010403	syf2	86	68.116	Mastacembelus_armatus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	62.882	ENSMZEG00005006429	syf2	87	67.633	Maylandia_zebra
ENSETEG00000015729	SYF2	81	72.973	ENSMGAG00000002019	SYF2	93	72.973	Meleagris_gallopavo
ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.419	ENSMAUG00000018974	Syf2	94	76.419	Mesocricetus_auratus
ENSETEG00000015729	SYF2	81	79.459	ENSMICG00000016191	SYF2	93	79.459	Microcebus_murinus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	77.729	ENSMOCG00000022938	Syf2	94	77.729	Microtus_ochrogaster
ENSETEG00000015729	SYF2	96	64.840	ENSMMOG00000002396	syf2	90	64.840	Mola_mola
ENSETEG00000015729	SYF2	92	73.239	ENSMODG00000013951	-	93	73.239	Monodelphis_domestica
ENSETEG00000015729	SYF2	100	64.655	ENSMALG00000010706	syf2	86	68.750	Monopterus_albus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.419	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	91	77.828	Mus_caroli
ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.419	ENSMUSG00000028821	Syf2	91	77.828	Mus_musculus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.419	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	91	77.828	Mus_pahari
ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.419	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	91	77.828	Mus_spretus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.293	ENSMPUG00000015802	-	90	76.923	Mustela_putorius_furo
ENSETEG00000015729	SYF2	100	75.431	ENSMPUG00000015801	-	91	76.339	Mustela_putorius_furo
ENSETEG00000015729	SYF2	94	79.630	ENSMLUG00000001885	SYF2	91	76.923	Myotis_lucifugus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	77.155	ENSNGAG00000007912	Syf2	94	77.155	Nannospalax_galili
ENSETEG00000015729	SYF2	100	55.652	ENSNBRG00000010720	syf2	84	60.606	Neolamprologus_brichardi
ENSETEG00000015729	SYF2	100	78.166	ENSNLEG00000035185	SYF2	94	77.293	Nomascus_leucogenys
ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.419	ENSOPRG00000012870	SYF2	94	76.419	Ochotona_princeps
ENSETEG00000015729	SYF2	100	68.696	ENSODEG00000014338	-	92	69.683	Octodon_degus
ENSETEG00000015729	SYF2	94	77.209	ENSODEG00000017664	-	90	77.209	Octodon_degus
ENSETEG00000015729	SYF2	90	67.633	ENSONIG00000008213	syf2	92	66.210	Oreochromis_niloticus
ENSETEG00000015729	SYF2	82	73.404	ENSOANG00000009552	SYF2	93	73.404	Ornithorhynchus_anatinus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	79.130	ENSOCUG00000013050	SYF2	91	79.186	Oryctolagus_cuniculus
ENSETEG00000015729	SYF2	93	65.297	ENSORLG00000028820	syf2	94	65.297	Oryzias_latipes
ENSETEG00000015729	SYF2	96	65.022	ENSORLG00020018333	syf2	94	65.022	Oryzias_latipes_hni
ENSETEG00000015729	SYF2	96	64.574	ENSORLG00015014665	syf2	94	64.574	Oryzias_latipes_hsok
ENSETEG00000015729	SYF2	94	66.210	ENSOMEG00000013911	syf2	92	66.210	Oryzias_melastigma
ENSETEG00000015729	SYF2	100	79.130	ENSOGAG00000009962	SYF2	91	78.733	Otolemur_garnettii
ENSETEG00000015729	SYF2	79	54.444	ENSOARG00000006269	-	94	54.444	Ovis_aries
ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.824	ENSOARG00000006348	-	91	77.232	Ovis_aries
ENSETEG00000015729	SYF2	100	78.166	ENSPPAG00000036579	SYF2	94	77.293	Pan_paniscus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.724	ENSPPRG00000001651	-	90	76.471	Panthera_pardus
ENSETEG00000015729	SYF2	99	76.522	ENSPPRG00000001638	-	90	78.281	Panthera_pardus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	75.862	ENSPTIG00000007036	-	90	76.471	Panthera_tigris_altaica
ENSETEG00000015729	SYF2	88	81.188	ENSPTIG00000005711	-	80	77.376	Panthera_tigris_altaica
ENSETEG00000015729	SYF2	100	78.166	ENSPTRG00000000352	SYF2	94	77.293	Pan_troglodytes
ENSETEG00000015729	SYF2	100	77.293	ENSPANG00000008139	SYF2	94	76.419	Papio_anubis
ENSETEG00000015729	SYF2	96	68.182	ENSPKIG00000008130	syf2	94	67.273	Paramormyrops_kingsleyae
ENSETEG00000015729	SYF2	99	71.366	ENSPSIG00000011816	SYF2	86	72.727	Pelodiscus_sinensis
ENSETEG00000015729	SYF2	92	69.048	ENSPMGG00000008755	syf2	82	68.095	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	78.166	ENSPEMG00000008283	Syf2	94	77.293	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSETEG00000015729	SYF2	92	76.303	ENSPCIG00000014235	SYF2	87	75.688	Phascolarctos_cinereus
ENSETEG00000015729	SYF2	90	66.667	ENSPFOG00000004116	syf2	86	66.667	Poecilia_formosa
ENSETEG00000015729	SYF2	99	62.996	ENSPLAG00000006691	syf2	89	66.667	Poecilia_latipinna
ENSETEG00000015729	SYF2	100	60.262	ENSPMEG00000011684	syf2	88	63.768	Poecilia_mexicana
ENSETEG00000015729	SYF2	88	67.822	ENSPREG00000003009	syf2	88	66.029	Poecilia_reticulata
ENSETEG00000015729	SYF2	100	78.166	ENSPPYG00000001713	SYF2	94	77.293	Pongo_abelii
ENSETEG00000015729	SYF2	100	58.952	ENSPCOG00000027011	SYF2	92	58.952	Propithecus_coquereli
ENSETEG00000015729	SYF2	100	85.281	ENSPVAG00000005841	SYF2	88	87.963	Pteropus_vampyrus
ENSETEG00000015729	SYF2	90	67.633	ENSPNYG00000004979	syf2	92	66.210	Pundamilia_nyererei
ENSETEG00000015729	SYF2	100	67.249	ENSPNAG00000015570	syf2	87	70.192	Pygocentrus_nattereri
ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.419	ENSRNOG00000060597	Syf2	91	77.828	Rattus_norvegicus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	74.672	ENSRBIG00000042970	SYF2	94	73.799	Rhinopithecus_bieti
ENSETEG00000015729	SYF2	100	77.293	ENSRROG00000001347	SYF2	94	76.419	Rhinopithecus_roxellana
ENSETEG00000015729	SYF2	100	77.293	ENSSBOG00000020184	SYF2	94	76.419	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSETEG00000015729	SYF2	92	74.882	ENSSHAG00000015630	-	88	73.853	Sarcophilus_harrisii
ENSETEG00000015729	SYF2	83	75.000	ENSSHAG00000007152	-	93	75.000	Sarcophilus_harrisii
ENSETEG00000015729	SYF2	100	65.939	ENSSFOG00015023647	syf2	89	69.194	Scleropages_formosus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	64.192	ENSSMAG00000009867	syf2	86	68.137	Scophthalmus_maximus
ENSETEG00000015729	SYF2	89	68.627	ENSSDUG00000013072	syf2	94	65.471	Seriola_dumerili
ENSETEG00000015729	SYF2	89	68.627	ENSSLDG00000012677	syf2	94	65.471	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSETEG00000015729	SYF2	100	58.261	ENSSARG00000012889	SYF2	89	58.796	Sorex_araneus
ENSETEG00000015729	SYF2	94	73.611	ENSSPUG00000005251	SYF2	85	72.685	Sphenodon_punctatus
ENSETEG00000015729	SYF2	94	67.123	ENSSPAG00000009626	syf2	92	67.123	Stegastes_partitus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.623	ENSSSCG00000037481	SYF2	91	77.477	Sus_scrofa
ENSETEG00000015729	SYF2	51	58.475	ENSTGUG00000001126	SYF2	72	56.552	Taeniopygia_guttata
ENSETEG00000015729	SYF2	90	67.633	ENSTRUG00000001499	syf2	83	67.633	Takifugu_rubripes
ENSETEG00000015729	SYF2	90	67.633	ENSTNIG00000016912	syf2	93	67.633	Tetraodon_nigroviridis
ENSETEG00000015729	SYF2	99	59.649	ENSTBEG00000017370	SYF2	92	59.211	Tupaia_belangeri
ENSETEG00000015729	SYF2	100	77.391	ENSTTRG00000003550	SYF2	94	77.391	Tursiops_truncatus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	75.431	ENSUAMG00000002897	SYF2	91	75.785	Ursus_americanus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.724	ENSUMAG00000013108	SYF2	91	76.233	Ursus_maritimus
ENSETEG00000015729	SYF2	100	77.826	ENSVPAG00000005705	SYF2	94	76.957	Vicugna_pacos
ENSETEG00000015729	SYF2	100	74.684	ENSVVUG00000027175	-	90	76.923	Vulpes_vulpes
ENSETEG00000015729	SYF2	83	78.534	ENSVVUG00000027181	-	90	75.785	Vulpes_vulpes
ENSETEG00000015729	SYF2	98	70.089	ENSXETG00000022797	syf2	84	71.429	Xenopus_tropicalis
ENSETEG00000015729	SYF2	88	67.662	ENSXMAG00000022698	syf2	87	66.184	Xiphophorus_maculatus