EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSETEG00000016175 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SRRT
Alias: ARS2|Asr2|serrate
Full Name: serrate%2C RNA effector molecule
Gene Type: protein_coding
Species: Echinops_telfairi
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 13030 bases
Position: chrGeneScaffold_1005:948-13977
Accession: 24101
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSETEP00000013118	ARS2	PF04959.13	5e-86	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSETET00000016177	SRRT-201	2640	-	ENSETEP00000013118	879 (aa)	-	UPI0000E4156E

Gene Model

Click here to download ENSETEG00000016175's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSETEG00000016175's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSETEG00000016175	SRRT	82	94.737	ENSG00000087087	SRRT	98	100.000	Homo_sapiens
ENSETEG00000016175	SRRT	71	73.150	ENSAPOG00000002304	srrt	77	69.898	Acanthochromis_polyacanthus
ENSETEG00000016175	SRRT	82	91.558	ENSAMEG00000014506	SRRT	87	88.870	Ailuropoda_melanoleuca
ENSETEG00000016175	SRRT	71	73.150	ENSACIG00000015795	srrt	80	73.150	Amphilophus_citrinellus
ENSETEG00000016175	SRRT	70	61.010	ENSAOCG00000009189	-	74	63.410	Amphiprion_ocellaris
ENSETEG00000016175	SRRT	71	73.362	ENSAOCG00000009693	srrt	79	73.362	Amphiprion_ocellaris
ENSETEG00000016175	SRRT	70	61.010	ENSAPEG00000020016	-	74	63.410	Amphiprion_percula
ENSETEG00000016175	SRRT	71	72.939	ENSAPEG00000003646	srrt	80	72.939	Amphiprion_percula
ENSETEG00000016175	SRRT	71	71.429	ENSATEG00000014425	srrt	78	71.670	Anabas_testudineus
ENSETEG00000016175	SRRT	56	60.317	ENSATEG00000003652	-	85	62.012	Anabas_testudineus
ENSETEG00000016175	SRRT	72	81.699	ENSACAG00000001014	SRRT	75	81.895	Anolis_carolinensis
ENSETEG00000016175	SRRT	82	94.386	ENSANAG00000031718	SRRT	86	94.386	Aotus_nancymaae
ENSETEG00000016175	SRRT	70	59.557	ENSACLG00000009423	-	73	61.331	Astatotilapia_calliptera
ENSETEG00000016175	SRRT	71	72.093	ENSACLG00000013156	srrt	71	72.093	Astatotilapia_calliptera
ENSETEG00000016175	SRRT	70	76.129	ENSAMXG00000016671	srrt	81	68.500	Astyanax_mexicanus
ENSETEG00000016175	SRRT	82	94.211	ENSBTAG00000001134	SRRT	86	94.211	Bos_taurus
ENSETEG00000016175	SRRT	51	48.936	WBGene00017085	E01A2.2	85	41.247	Caenorhabditis_elegans
ENSETEG00000016175	SRRT	82	94.211	ENSCJAG00000014917	SRRT	86	94.211	Callithrix_jacchus
ENSETEG00000016175	SRRT	82	94.386	ENSCAFG00000023538	SRRT	86	94.386	Canis_familiaris
ENSETEG00000016175	SRRT	82	93.509	ENSCAFG00020013358	SRRT	86	93.509	Canis_lupus_dingo
ENSETEG00000016175	SRRT	85	93.333	ENSCHIG00000010495	SRRT	86	94.211	Capra_hircus
ENSETEG00000016175	SRRT	82	92.857	ENSTSYG00000036426	SRRT	85	92.456	Carlito_syrichta
ENSETEG00000016175	SRRT	82	92.857	ENSCAPG00000013586	SRRT	91	90.554	Cavia_aperea
ENSETEG00000016175	SRRT	82	93.870	ENSCPOG00000001739	SRRT	86	93.870	Cavia_porcellus
ENSETEG00000016175	SRRT	82	94.561	ENSCCAG00000015877	SRRT	86	94.561	Cebus_capucinus
ENSETEG00000016175	SRRT	82	96.140	ENSCATG00000036306	SRRT	86	94.386	Cercocebus_atys
ENSETEG00000016175	SRRT	82	94.211	ENSCLAG00000007568	SRRT	100	91.461	Chinchilla_lanigera
ENSETEG00000016175	SRRT	82	94.561	ENSCSAG00000017996	SRRT	86	94.561	Chlorocebus_sabaeus
ENSETEG00000016175	SRRT	62	83.766	ENSCPBG00000011553	SRRT	74	80.612	Chrysemys_picta_bellii
ENSETEG00000016175	SRRT	84	47.007	ENSCING00000003506	-	62	50.816	Ciona_intestinalis
ENSETEG00000016175	SRRT	76	47.521	ENSCSAVG00000008394	-	67	55.172	Ciona_savignyi
ENSETEG00000016175	SRRT	82	93.509	ENSCANG00000034556	SRRT	86	93.509	Colobus_angolensis_palliatus
ENSETEG00000016175	SRRT	82	93.007	ENSCGRG00001001594	Srrt	86	92.308	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSETEG00000016175	SRRT	81	93.007	ENSCGRG00000007292	Srrt	92	92.308	Cricetulus_griseus_crigri
ENSETEG00000016175	SRRT	75	56.827	ENSCSEG00000005233	-	77	60.833	Cynoglossus_semilaevis
ENSETEG00000016175	SRRT	71	70.440	ENSCSEG00000017878	srrt	73	69.500	Cynoglossus_semilaevis
ENSETEG00000016175	SRRT	81	71.429	ENSCVAG00000019848	srrt	77	71.882	Cyprinodon_variegatus
ENSETEG00000016175	SRRT	66	60.044	ENSCVAG00000017344	-	75	60.000	Cyprinodon_variegatus
ENSETEG00000016175	SRRT	71	74.194	ENSDARG00000017762	srrt	73	75.053	Danio_rerio
ENSETEG00000016175	SRRT	82	94.386	ENSDNOG00000003851	SRRT	86	94.386	Dasypus_novemcinctus
ENSETEG00000016175	SRRT	82	93.506	ENSDORG00000005584	Srrt	100	89.792	Dipodomys_ordii
ENSETEG00000016175	SRRT	75	50.000	FBgn0033062	Ars2	68	50.206	Drosophila_melanogaster
ENSETEG00000016175	SRRT	54	60.127	ENSEBUG00000008517	-	65	60.549	Eptatretus_burgeri
ENSETEG00000016175	SRRT	82	94.035	ENSEASG00005016956	SRRT	86	94.035	Equus_asinus_asinus
ENSETEG00000016175	SRRT	82	94.211	ENSECAG00000012292	SRRT	86	94.211	Equus_caballus
ENSETEG00000016175	SRRT	71	96.951	ENSEEUG00000009117	SRRT	72	96.951	Erinaceus_europaeus
ENSETEG00000016175	SRRT	68	61.350	ENSELUG00000021216	-	75	62.168	Esox_lucius
ENSETEG00000016175	SRRT	82	94.561	ENSFCAG00000006855	SRRT	86	94.561	Felis_catus
ENSETEG00000016175	SRRT	82	92.208	ENSFDAG00000021347	SRRT	100	84.061	Fukomys_damarensis
ENSETEG00000016175	SRRT	55	53.131	ENSFHEG00000004105	-	93	53.542	Fundulus_heteroclitus
ENSETEG00000016175	SRRT	65	72.727	ENSFHEG00000002756	srrt	81	71.362	Fundulus_heteroclitus
ENSETEG00000016175	SRRT	58	78.000	ENSGMOG00000018694	-	76	60.554	Gadus_morhua
ENSETEG00000016175	SRRT	71	67.653	ENSGMOG00000018619	srrt	73	68.288	Gadus_morhua
ENSETEG00000016175	SRRT	71	71.882	ENSGAFG00000005423	srrt	74	71.882	Gambusia_affinis
ENSETEG00000016175	SRRT	68	57.829	ENSGAFG00000020383	-	77	58.750	Gambusia_affinis
ENSETEG00000016175	SRRT	70	57.540	ENSGACG00000001100	-	74	59.091	Gasterosteus_aculeatus
ENSETEG00000016175	SRRT	73	70.323	ENSGACG00000020387	srrt	74	71.639	Gasterosteus_aculeatus
ENSETEG00000016175	SRRT	82	94.737	ENSGGOG00000001508	SRRT	86	94.737	Gorilla_gorilla
ENSETEG00000016175	SRRT	71	72.304	ENSHBUG00000002942	srrt	71	72.304	Haplochromis_burtoni
ENSETEG00000016175	SRRT	82	94.737	ENSHGLG00000008344	Srrt	91	92.259	Heterocephalus_glaber_female
ENSETEG00000016175	SRRT	82	92.857	ENSHGLG00100018857	Srrt	90	91.213	Heterocephalus_glaber_male
ENSETEG00000016175	SRRT	68	58.125	ENSHCOG00000008904	-	79	58.750	Hippocampus_comes
ENSETEG00000016175	SRRT	73	69.133	ENSHCOG00000005403	srrt	79	69.388	Hippocampus_comes
ENSETEG00000016175	SRRT	82	93.684	ENSSTOG00000013776	SRRT	86	93.684	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSETEG00000016175	SRRT	82	92.857	ENSJJAG00000010446	Srrt	100	89.753	Jaculus_jaculus
ENSETEG00000016175	SRRT	63	70.769	ENSKMAG00000008468	-	75	59.919	Kryptolebias_marmoratus
ENSETEG00000016175	SRRT	72	71.429	ENSKMAG00000013599	srrt	78	71.459	Kryptolebias_marmoratus
ENSETEG00000016175	SRRT	71	74.839	ENSLBEG00000016308	srrt	77	73.207	Labrus_bergylta
ENSETEG00000016175	SRRT	80	79.085	ENSLACG00000001089	SRRT	86	76.410	Latimeria_chalumnae
ENSETEG00000016175	SRRT	51	78.378	ENSLOCG00000013658	srrt	66	78.378	Lepisosteus_oculatus
ENSETEG00000016175	SRRT	82	92.857	ENSLAFG00000007725	SRRT	86	93.860	Loxodonta_africana
ENSETEG00000016175	SRRT	82	95.965	ENSMFAG00000033745	SRRT	85	95.965	Macaca_fascicularis
ENSETEG00000016175	SRRT	82	94.912	ENSMMUG00000021255	SRRT	87	94.464	Macaca_mulatta
ENSETEG00000016175	SRRT	84	95.965	ENSMNEG00000041864	SRRT	86	94.561	Macaca_nemestrina
ENSETEG00000016175	SRRT	82	95.965	ENSMLEG00000029479	SRRT	84	95.965	Mandrillus_leucophaeus
ENSETEG00000016175	SRRT	70	60.765	ENSMAMG00000010681	-	74	62.786	Mastacembelus_armatus
ENSETEG00000016175	SRRT	71	72.078	ENSMAMG00000014311	srrt	74	72.093	Mastacembelus_armatus
ENSETEG00000016175	SRRT	71	72.093	ENSMZEG00005016135	srrt	71	72.093	Maylandia_zebra
ENSETEG00000016175	SRRT	70	59.557	ENSMZEG00005028002	-	73	61.331	Maylandia_zebra
ENSETEG00000016175	SRRT	82	92.982	ENSMAUG00000011386	Srrt	91	91.632	Mesocricetus_auratus
ENSETEG00000016175	SRRT	82	95.965	ENSMICG00000009471	SRRT	86	94.561	Microcebus_murinus
ENSETEG00000016175	SRRT	82	93.497	ENSMOCG00000001971	Srrt	91	91.841	Microtus_ochrogaster
ENSETEG00000016175	SRRT	73	58.111	ENSMMOG00000011137	-	72	63.522	Mola_mola
ENSETEG00000016175	SRRT	78	71.429	ENSMMOG00000016399	srrt	77	71.459	Mola_mola
ENSETEG00000016175	SRRT	54	89.099	ENSMODG00000004862	SRRT	90	90.397	Monodelphis_domestica
ENSETEG00000016175	SRRT	59	47.674	ENSMALG00000005567	-	84	49.894	Monopterus_albus
ENSETEG00000016175	SRRT	75	79.091	ENSMALG00000018604	srrt	72	69.979	Monopterus_albus
ENSETEG00000016175	SRRT	82	93.684	MGP_CAROLIEiJ_G0027870	Srrt	100	92.500	Mus_caroli
ENSETEG00000016175	SRRT	82	93.684	ENSMUSG00000037364	Srrt	100	92.030	Mus_musculus
ENSETEG00000016175	SRRT	82	93.333	MGP_PahariEiJ_G0024456	Srrt	100	92.143	Mus_pahari
ENSETEG00000016175	SRRT	82	93.684	MGP_SPRETEiJ_G0028875	Srrt	100	92.500	Mus_spretus
ENSETEG00000016175	SRRT	82	94.912	ENSMPUG00000015839	SRRT	86	94.912	Mustela_putorius_furo
ENSETEG00000016175	SRRT	82	93.860	ENSMLUG00000009975	SRRT	86	93.860	Myotis_lucifugus
ENSETEG00000016175	SRRT	82	93.684	ENSNGAG00000023715	Srrt	84	100.000	Nannospalax_galili
ENSETEG00000016175	SRRT	71	71.036	ENSNBRG00000019100	srrt	74	71.036	Neolamprologus_brichardi
ENSETEG00000016175	SRRT	81	91.333	ENSNLEG00000011987	SRRT	83	90.780	Nomascus_leucogenys
ENSETEG00000016175	SRRT	80	75.524	ENSMEUG00000011941	SRRT	86	71.478	Notamacropus_eugenii
ENSETEG00000016175	SRRT	63	91.603	ENSOPRG00000002502	-	67	91.603	Ochotona_princeps
ENSETEG00000016175	SRRT	82	92.857	ENSODEG00000016856	SRRT	90	90.795	Octodon_degus
ENSETEG00000016175	SRRT	70	60.521	ENSONIG00000016080	-	73	61.077	Oreochromis_niloticus
ENSETEG00000016175	SRRT	71	75.325	ENSONIG00000004242	srrt	74	72.449	Oreochromis_niloticus
ENSETEG00000016175	SRRT	74	73.548	ENSORLG00000008120	srrt	74	71.429	Oryzias_latipes
ENSETEG00000016175	SRRT	82	73.548	ENSORLG00020003058	srrt	74	71.429	Oryzias_latipes_hni
ENSETEG00000016175	SRRT	82	73.548	ENSORLG00015008062	srrt	74	71.429	Oryzias_latipes_hsok
ENSETEG00000016175	SRRT	71	72.903	ENSOMEG00000003155	srrt	80	71.459	Oryzias_melastigma
ENSETEG00000016175	SRRT	63	63.529	ENSOMEG00000006963	-	75	62.213	Oryzias_melastigma
ENSETEG00000016175	SRRT	82	94.737	ENSOGAG00000017242	SRRT	86	94.737	Otolemur_garnettii
ENSETEG00000016175	SRRT	82	93.860	ENSOARG00000015645	SRRT	87	93.860	Ovis_aries
ENSETEG00000016175	SRRT	82	93.860	ENSPPAG00000041090	SRRT	86	93.860	Pan_paniscus
ENSETEG00000016175	SRRT	82	93.158	ENSPPRG00000009557	SRRT	86	93.158	Panthera_pardus
ENSETEG00000016175	SRRT	82	94.386	ENSPTIG00000014355	SRRT	86	94.386	Panthera_tigris_altaica
ENSETEG00000016175	SRRT	82	93.860	ENSPTRG00000019511	SRRT	86	93.860	Pan_troglodytes
ENSETEG00000016175	SRRT	82	95.965	ENSPANG00000020763	SRRT	83	95.965	Papio_anubis
ENSETEG00000016175	SRRT	75	74.194	ENSPKIG00000005434	srrt	84	70.500	Paramormyrops_kingsleyae
ENSETEG00000016175	SRRT	69	73.362	ENSPKIG00000022212	-	75	73.996	Paramormyrops_kingsleyae
ENSETEG00000016175	SRRT	77	83.226	ENSPSIG00000016311	SRRT	87	79.592	Pelodiscus_sinensis
ENSETEG00000016175	SRRT	68	73.600	ENSPMGG00000002841	srrt	79	72.093	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSETEG00000016175	SRRT	82	92.208	ENSPEMG00000010834	Srrt	100	89.753	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSETEG00000016175	SRRT	81	56.846	ENSPMAG00000009614	-	77	62.218	Petromyzon_marinus
ENSETEG00000016175	SRRT	82	90.260	ENSPCIG00000000816	SRRT	87	88.889	Phascolarctos_cinereus
ENSETEG00000016175	SRRT	71	72.078	ENSPFOG00000005704	srrt	74	71.941	Poecilia_formosa
ENSETEG00000016175	SRRT	68	58.125	ENSPFOG00000016554	-	77	58.750	Poecilia_formosa
ENSETEG00000016175	SRRT	68	57.796	ENSPLAG00000004526	-	78	58.420	Poecilia_latipinna
ENSETEG00000016175	SRRT	71	72.078	ENSPMEG00000001182	srrt	81	71.519	Poecilia_mexicana
ENSETEG00000016175	SRRT	65	56.923	ENSPMEG00000001520	-	76	57.582	Poecilia_mexicana
ENSETEG00000016175	SRRT	71	72.078	ENSPREG00000022308	srrt	74	71.941	Poecilia_reticulata
ENSETEG00000016175	SRRT	82	92.857	ENSPPYG00000017432	SRRT	85	87.692	Pongo_abelii
ENSETEG00000016175	SRRT	82	92.857	ENSPCAG00000001621	SRRT	87	91.869	Procavia_capensis
ENSETEG00000016175	SRRT	82	94.737	ENSPCOG00000025751	SRRT	86	94.737	Propithecus_coquereli
ENSETEG00000016175	SRRT	65	86.316	ENSPVAG00000000834	SRRT	83	86.316	Pteropus_vampyrus
ENSETEG00000016175	SRRT	71	72.093	ENSPNYG00000018710	srrt	74	72.093	Pundamilia_nyererei
ENSETEG00000016175	SRRT	64	74.026	ENSPNAG00000010629	srrt	74	68.182	Pygocentrus_nattereri
ENSETEG00000016175	SRRT	54	82.563	ENSRNOG00000048277	AABR07035787.1	93	82.563	Rattus_norvegicus
ENSETEG00000016175	SRRT	84	95.965	ENSRBIG00000035718	SRRT	86	94.561	Rhinopithecus_bieti
ENSETEG00000016175	SRRT	84	95.965	ENSRROG00000030622	SRRT	85	95.965	Rhinopithecus_roxellana
ENSETEG00000016175	SRRT	82	94.561	ENSSBOG00000033570	SRRT	86	94.561	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSETEG00000016175	SRRT	65	86.678	ENSSHAG00000007349	-	90	87.889	Sarcophilus_harrisii
ENSETEG00000016175	SRRT	70	75.840	ENSSFOG00015017293	srrt	73	76.681	Scleropages_formosus
ENSETEG00000016175	SRRT	57	84.848	ENSSMAG00000018195	-	77	58.932	Scophthalmus_maximus
ENSETEG00000016175	SRRT	71	72.078	ENSSMAG00000015342	srrt	78	72.304	Scophthalmus_maximus
ENSETEG00000016175	SRRT	55	51.724	ENSSDUG00000002051	-	93	51.867	Seriola_dumerili
ENSETEG00000016175	SRRT	71	72.078	ENSSDUG00000012049	srrt	76	72.727	Seriola_dumerili
ENSETEG00000016175	SRRT	71	71.670	ENSSLDG00000017477	srrt	77	72.516	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSETEG00000016175	SRRT	71	72.059	ENSSPAG00000005665	srrt	74	70.040	Stegastes_partitus
ENSETEG00000016175	SRRT	59	62.379	ENSSPAG00000018943	-	93	54.927	Stegastes_partitus
ENSETEG00000016175	SRRT	81	92.667	ENSSSCG00000024789	SRRT	84	90.780	Sus_scrofa
ENSETEG00000016175	SRRT	67	57.447	ENSTRUG00000000023	-	73	58.376	Takifugu_rubripes
ENSETEG00000016175	SRRT	71	70.968	ENSTRUG00000016075	srrt	74	70.807	Takifugu_rubripes
ENSETEG00000016175	SRRT	54	70.564	ENSTNIG00000011779	srrt	72	70.552	Tetraodon_nigroviridis
ENSETEG00000016175	SRRT	63	65.625	ENSTNIG00000003111	-	75	58.873	Tetraodon_nigroviridis
ENSETEG00000016175	SRRT	59	94.851	ENSTBEG00000005212	SRRT	63	95.628	Tupaia_belangeri
ENSETEG00000016175	SRRT	86	95.088	ENSTTRG00000011104	SRRT	86	95.088	Tursiops_truncatus
ENSETEG00000016175	SRRT	82	94.737	ENSUAMG00000027997	SRRT	84	94.737	Ursus_americanus
ENSETEG00000016175	SRRT	82	94.737	ENSUMAG00000011295	SRRT	86	94.737	Ursus_maritimus
ENSETEG00000016175	SRRT	82	94.386	ENSVVUG00000023572	SRRT	86	94.386	Vulpes_vulpes
ENSETEG00000016175	SRRT	71	76.129	ENSXETG00000025124	srrt	76	74.841	Xenopus_tropicalis
ENSETEG00000016175	SRRT	56	47.967	ENSXCOG00000013105	-	90	48.421	Xiphophorus_couchianus
ENSETEG00000016175	SRRT	71	72.727	ENSXMAG00000007627	srrt	80	72.727	Xiphophorus_maculatus
ENSETEG00000016175	SRRT	69	57.085	ENSXMAG00000002090	-	77	58.577	Xiphophorus_maculatus