EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSETEG00000017426 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SMARCA1
Alias: ISWI|NURF140|SNF2L|SNF2L1|SNF2LB|SWI|hSNF2L
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 1
Gene Type: protein_coding
Species: Echinops_telfairi
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 86718 bases
Position: chrGeneScaffold_1490:101965-188682
Accession: 11097
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSETEP00000014148	ResIII	PF04851.15	1.5e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSETET00000017426	SMARCA1-201	2886	-	ENSETEP00000014148	961 (aa)	-	UPI0000E41CF8

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	93.750	ENSG00000102038	SMARCA1	79	93.750	Homo_sapiens
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	81.818	ENSAPOG00000016035	smarca5	78	81.818	Acanthochromis_polyacanthus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	92.857	ENSAMEG00000015218	SMARCA1	77	92.857	Ailuropoda_melanoleuca
ENSETEG00000017426	SMARCA1	78	79.464	ENSACIG00000016982	smarca5	84	79.464	Amphilophus_citrinellus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	81.818	ENSAOCG00000015578	smarca5	78	81.818	Amphiprion_ocellaris
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	81.818	ENSAPEG00000011117	smarca5	89	78.571	Amphiprion_percula
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	81.818	ENSATEG00000012894	smarca5	80	81.818	Anabas_testudineus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	88.393	ENSAPLG00000013149	SMARCA1	83	88.393	Anas_platyrhynchos
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	90.909	ENSACAG00000011376	SMARCA1	77	90.909	Anolis_carolinensis
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	93.750	ENSANAG00000023098	SMARCA1	76	93.750	Aotus_nancymaae
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	81.818	ENSACLG00000025356	smarca5	78	81.818	Astatotilapia_calliptera
ENSETEG00000017426	SMARCA1	80	85.714	ENSAMXG00000011227	smarca1	91	85.714	Astyanax_mexicanus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	81.818	ENSAMXG00000005709	smarca5	78	81.818	Astyanax_mexicanus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	93.750	ENSBTAG00000002292	SMARCA1	79	93.750	Bos_taurus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	79	63.142	WBGene00002169	isw-1	76	62.330	Caenorhabditis_elegans
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	93.750	ENSCJAG00000002868	SMARCA1	77	93.750	Callithrix_jacchus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	92.857	ENSCAFG00000018673	SMARCA1	89	92.857	Canis_familiaris
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	92.857	ENSCAFG00020001751	SMARCA1	77	92.857	Canis_lupus_dingo
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	93.750	ENSCHIG00000009837	SMARCA1	80	93.750	Capra_hircus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	93.750	ENSTSYG00000004240	SMARCA1	82	93.750	Carlito_syrichta
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	92.857	ENSCPOG00000013601	SMARCA1	80	92.857	Cavia_porcellus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	81	93.750	ENSCCAG00000030817	SMARCA1	75	93.750	Cebus_capucinus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	93.750	ENSCATG00000015921	SMARCA1	79	93.750	Cercocebus_atys
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	91.964	ENSCLAG00000002171	SMARCA1	79	91.964	Chinchilla_lanigera
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	93.750	ENSCSAG00000008460	SMARCA1	77	93.750	Chlorocebus_sabaeus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	92.727	ENSCPBG00000001146	SMARCA1	77	92.727	Chrysemys_picta_bellii
ENSETEG00000017426	SMARCA1	84	72.321	ENSCING00000004110	swi/snf	79	72.321	Ciona_intestinalis
ENSETEG00000017426	SMARCA1	84	72.321	ENSCSAVG00000004620	-	85	72.321	Ciona_savignyi
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	93.750	ENSCANG00000007183	SMARCA1	77	93.750	Colobus_angolensis_palliatus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	92.857	ENSCGRG00001010776	Smarca1	79	92.857	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	92.857	ENSCGRG00000015301	Smarca1	82	92.857	Cricetulus_griseus_crigri
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	81.818	ENSCSEG00000000328	smarca5	78	81.818	Cynoglossus_semilaevis
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	80.000	ENSCVAG00000008668	smarca5	89	78.571	Cyprinodon_variegatus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	84.821	ENSDARG00000012776	smarca1	80	84.821	Danio_rerio
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	80.000	ENSDARG00000052348	smarca5	78	80.000	Danio_rerio
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	92.727	ENSDNOG00000004315	SMARCA1	79	92.727	Dasypus_novemcinctus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	92.727	ENSDORG00000009270	Smarca1	79	92.727	Dipodomys_ordii
ENSETEG00000017426	SMARCA1	78	77.679	FBgn0011604	Iswi	75	77.679	Drosophila_melanogaster
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	80.357	ENSEBUG00000001239	smarca5	81	80.357	Eptatretus_burgeri
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	93.750	ENSEASG00005008218	SMARCA1	83	93.750	Equus_asinus_asinus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	93.750	ENSECAG00000012106	SMARCA1	77	93.750	Equus_caballus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	70	93.750	ENSEEUG00000014927	SMARCA1	69	93.750	Erinaceus_europaeus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	85.714	ENSELUG00000010515	smarca1	80	85.714	Esox_lucius
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	91.964	ENSFCAG00000018496	SMARCA1	77	91.964	Felis_catus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	81	88.393	ENSFALG00000000209	SMARCA1	84	88.393	Ficedula_albicollis
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	92.857	ENSFDAG00000009818	SMARCA1	82	92.857	Fukomys_damarensis
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	81.818	ENSFHEG00000007687	smarca5	78	81.818	Fundulus_heteroclitus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	89.091	ENSGALG00000008431	SMARCA1	81	89.091	Gallus_gallus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	81.818	ENSGAFG00000017731	smarca5	78	81.818	Gambusia_affinis
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	92.727	ENSGAGG00000023575	SMARCA1	84	92.727	Gopherus_agassizii
ENSETEG00000017426	SMARCA1	60	96.000	ENSGGOG00000012841	-	72	96.000	Gorilla_gorilla
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	91.071	ENSHGLG00000003080	SMARCA1	79	91.071	Heterocephalus_glaber_female
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	91.071	ENSHGLG00100001102	SMARCA1	83	91.071	Heterocephalus_glaber_male
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	81.818	ENSHCOG00000005458	smarca5	78	81.818	Hippocampus_comes
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	81.818	ENSIPUG00000005229	SMARCA5	80	81.818	Ictalurus_punctatus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	86.607	ENSIPUG00000016905	Smarca1	83	86.607	Ictalurus_punctatus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	93.750	ENSSTOG00000014524	SMARCA1	79	93.750	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	93.750	ENSJJAG00000002593	Smarca1	79	93.750	Jaculus_jaculus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	80.357	ENSKMAG00000003777	smarca5	78	80.357	Kryptolebias_marmoratus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	80.000	ENSLBEG00000018112	smarca5	78	80.000	Labrus_bergylta
ENSETEG00000017426	SMARCA1	81	80.000	ENSLBEG00000013295	SMARCA1	92	76.619	Labrus_bergylta
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	87.500	ENSLACG00000016697	SMARCA1	81	87.500	Latimeria_chalumnae
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	86.607	ENSLOCG00000014591	smarca1	80	86.607	Lepisosteus_oculatus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	92.857	ENSLAFG00000000896	SMARCA1	83	92.857	Loxodonta_africana
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	93.750	ENSMFAG00000002117	SMARCA1	81	93.750	Macaca_fascicularis
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	93.750	ENSMMUG00000008818	SMARCA1	85	93.750	Macaca_mulatta
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	93.750	ENSMNEG00000041768	SMARCA1	81	93.750	Macaca_nemestrina
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	93.750	ENSMLEG00000043198	SMARCA1	77	93.750	Mandrillus_leucophaeus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	81.818	ENSMAMG00000014294	smarca5	78	81.818	Mastacembelus_armatus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	81.818	ENSMZEG00005009369	smarca5	78	81.818	Maylandia_zebra
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	89.091	ENSMGAG00000007042	SMARCA1	81	89.091	Meleagris_gallopavo
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	93.750	ENSMAUG00000008133	Smarca1	79	93.750	Mesocricetus_auratus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	94.545	ENSMICG00000015768	SMARCA1	77	94.545	Microcebus_murinus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	92.857	ENSMOCG00000009464	Smarca1	79	92.857	Microtus_ochrogaster
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	81.818	ENSMMOG00000005547	smarca5	81	81.818	Mola_mola
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	88.393	ENSMODG00000013187	-	79	88.393	Monodelphis_domestica
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	81.818	ENSMALG00000002081	smarca5	81	81.818	Monopterus_albus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	93.750	MGP_CAROLIEiJ_G0033034	Smarca1	78	93.750	Mus_caroli
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	93.750	ENSMUSG00000031099	Smarca1	78	93.750	Mus_musculus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	93.750	MGP_PahariEiJ_G0031579	Smarca1	78	93.750	Mus_pahari
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	93.750	MGP_SPRETEiJ_G0034192	Smarca1	78	93.750	Mus_spretus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	92.857	ENSMPUG00000017423	SMARCA1	73	92.857	Mustela_putorius_furo
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	93.750	ENSMLUG00000029614	SMARCA1	77	93.750	Myotis_lucifugus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	93.750	ENSNGAG00000006492	Smarca1	79	93.750	Nannospalax_galili
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	81.818	ENSNBRG00000004463	smarca5	82	81.818	Neolamprologus_brichardi
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	93.750	ENSNLEG00000015179	SMARCA1	82	93.750	Nomascus_leucogenys
ENSETEG00000017426	SMARCA1	81	88.393	ENSMEUG00000008819	SMARCA1	83	88.393	Notamacropus_eugenii
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	92.857	ENSODEG00000012163	SMARCA1	79	92.857	Octodon_degus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	81.818	ENSONIG00000009993	smarca5	78	81.818	Oreochromis_niloticus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	92.727	ENSOANG00000002862	SMARCA1	84	92.727	Ornithorhynchus_anatinus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	93.750	ENSOCUG00000001047	SMARCA1	77	93.750	Oryctolagus_cuniculus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	81.818	ENSORLG00000021998	smarca5	78	81.818	Oryzias_latipes
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	81.818	ENSORLG00020017679	smarca5	78	81.818	Oryzias_latipes_hni
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	81.818	ENSORLG00015017210	smarca5	78	81.818	Oryzias_latipes_hsok
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	81.818	ENSOMEG00000000086	smarca5	78	81.818	Oryzias_melastigma
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	92.857	ENSOGAG00000004399	SMARCA1	79	92.857	Otolemur_garnettii
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	93.750	ENSOARG00000014638	SMARCA1	83	93.750	Ovis_aries
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	93.750	ENSPPAG00000034647	SMARCA1	77	93.750	Pan_paniscus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	92.857	ENSPPRG00000008929	SMARCA1	77	92.857	Panthera_pardus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	92.857	ENSPTIG00000000915	SMARCA1	80	92.857	Panthera_tigris_altaica
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	93.750	ENSPTRG00000049876	SMARCA1	79	93.750	Pan_troglodytes
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	93.750	ENSPANG00000003871	SMARCA1	77	93.750	Papio_anubis
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	80.273	ENSPKIG00000013411	smarca1	83	80.273	Paramormyrops_kingsleyae
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	92.727	ENSPSIG00000010101	SMARCA1	84	92.727	Pelodiscus_sinensis
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	93.750	ENSPEMG00000017503	Smarca1	79	93.750	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	88.393	ENSPCIG00000015460	SMARCA1	85	88.393	Phascolarctos_cinereus
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	81.818	ENSPFOG00000007649	smarca5	78	81.818	Poecilia_formosa
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	81.818	ENSPLAG00000003363	smarca5	78	81.818	Poecilia_latipinna
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	81.818	ENSPMEG00000019849	smarca5	79	81.818	Poecilia_mexicana
ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	81.818	ENSPREG00000023250	smarca5	79	81.818	Poecilia_reticulata
ENSETEG00000017426	SMARCA1	85	93.578	ENSPPYG00000020703	SMARCA1	77	93.578	Pongo_abelii
ENSETEG00000017426	SMARCA1	66	94.545	ENSPCOG00000020722	SMARCA1	73	94.545	Propithecus_coquereli
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ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	81.818	ENSXCOG00000011170	smarca5	80	81.818	Xiphophorus_couchianus
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