EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSETEG00000017805 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Echinops_telfairi
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 77990 bases
Position: chrGeneScaffold_927:95-78084
Accession: 6401
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSETEP00000014467	IBN_N	PF03810.19	1.4e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSETET00000017807	TNPO1-201	2586	-	ENSETEP00000014467	862 (aa)	-	UPI0000E4376E

Gene Model

Click here to download ENSETEG00000017805's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSETEG00000017805's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSETEG00000017805	TNPO1	63	75.090	ENSETEG00000014785	TNPO2	64	75.090

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	ENSG00000083312	TNPO1	93	92.857	Homo_sapiens
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	95.506	ENSAPOG00000003453	tnpo1	86	95.506	Acanthochromis_polyacanthus
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	99.625	ENSAMEG00000007147	TNPO1	86	99.625	Ailuropoda_melanoleuca
ENSETEG00000017805	TNPO1	80	93.548	ENSACIG00000003711	tnpo1	89	93.548	Amphilophus_citrinellus
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	95.506	ENSAOCG00000008154	tnpo1	86	95.506	Amphiprion_ocellaris
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	95.506	ENSAPEG00000001112	tnpo1	86	95.506	Amphiprion_percula
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	95.131	ENSATEG00000010408	tnpo1	86	95.131	Anabas_testudineus
ENSETEG00000017805	TNPO1	88	97.407	ENSAPLG00000009619	-	85	97.407	Anas_platyrhynchos
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	98.502	ENSACAG00000009599	TNPO1	86	98.502	Anolis_carolinensis
ENSETEG00000017805	TNPO1	81	93.243	ENSANAG00000025351	-	79	93.243	Aotus_nancymaae
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	98.502	ENSANAG00000022453	-	86	98.502	Aotus_nancymaae
ENSETEG00000017805	TNPO1	62	77.586	ENSANAG00000027118	-	61	72.414	Aotus_nancymaae
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.007	ENSACLG00000027223	tnpo1	87	94.007	Astatotilapia_calliptera
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.007	ENSAMXG00000009842	tnpo1	86	94.007	Astyanax_mexicanus
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	ENSBTAG00000007979	TNPO1	86	99.625	Bos_taurus
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	98.502	ENSCJAG00000016409	TNPO1	86	98.502	Callithrix_jacchus
ENSETEG00000017805	TNPO1	85	99.625	ENSCAFG00000008081	TNPO1	86	99.625	Canis_familiaris
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	99.625	ENSCAFG00020017397	TNPO1	86	99.625	Canis_lupus_dingo
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	ENSCHIG00000023462	TNPO1	86	99.625	Capra_hircus
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	98.502	ENSTSYG00000001871	TNPO1	86	98.502	Carlito_syrichta
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	98.502	ENSCCAG00000026472	TNPO1	86	98.502	Cebus_capucinus
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	ENSCATG00000043792	TNPO1	86	99.625	Cercocebus_atys
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	98.876	ENSCLAG00000016191	TNPO1	86	98.876	Chinchilla_lanigera
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	ENSCSAG00000015616	TNPO1	86	99.625	Chlorocebus_sabaeus
ENSETEG00000017805	TNPO1	78	98.305	ENSCHOG00000001746	TNPO1	79	98.305	Choloepus_hoffmanni
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	98.876	ENSCPBG00000000260	TNPO1	85	98.876	Chrysemys_picta_bellii
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	76.030	ENSCSAVG00000010981	-	86	76.030	Ciona_savignyi
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	ENSCANG00000004353	TNPO1	86	99.625	Colobus_angolensis_palliatus
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.251	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	86	99.251	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSETEG00000017805	TNPO1	85	99.251	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	86	99.251	Cricetulus_griseus_crigri
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	93.633	ENSCSEG00000012674	tnpo1	86	93.633	Cynoglossus_semilaevis
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.757	ENSCVAG00000001010	tnpo1	86	94.757	Cyprinodon_variegatus
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	92.509	ENSDARG00000035390	tnpo1	86	92.509	Danio_rerio
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	80.150	ENSDNOG00000006647	TNPO1	85	80.150	Dasypus_novemcinctus
ENSETEG00000017805	TNPO1	82	99.625	ENSDORG00000006476	Tnpo1	85	99.625	Dipodomys_ordii
ENSETEG00000017805	TNPO1	88	54.340	FBgn0035693	CG8219	76	75.676	Drosophila_melanogaster
ENSETEG00000017805	TNPO1	83	85.768	ENSEBUG00000001895	tnpo1	85	85.768	Eptatretus_burgeri
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	ENSEASG00005018055	TNPO1	86	99.625	Equus_asinus_asinus
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	ENSECAG00000024424	TNPO1	86	99.625	Equus_caballus
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.382	ENSELUG00000002821	tnpo1	86	94.382	Esox_lucius
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	ENSFCAG00000013181	TNPO1	86	99.625	Felis_catus
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	98.876	ENSFALG00000010292	TNPO1	86	98.876	Ficedula_albicollis
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	98.876	ENSFDAG00000013345	TNPO1	86	98.876	Fukomys_damarensis
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	95.131	ENSFHEG00000019234	tnpo1	86	95.131	Fundulus_heteroclitus
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	91.760	ENSGMOG00000000347	tnpo1	86	91.760	Gadus_morhua
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	98.502	ENSGALG00000015014	TNPO1	89	98.502	Gallus_gallus
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.757	ENSGAFG00000000943	tnpo1	86	94.757	Gambusia_affinis
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.382	ENSGACG00000015841	tnpo1	86	94.382	Gasterosteus_aculeatus
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	98.876	ENSGAGG00000013419	TNPO1	86	98.876	Gopherus_agassizii
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	82.772	ENSGGOG00000022535	-	84	82.772	Gorilla_gorilla
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	ENSGGOG00000026800	TNPO1	86	99.625	Gorilla_gorilla
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.382	ENSHBUG00000008068	tnpo1	86	94.382	Haplochromis_burtoni
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	98.876	ENSHGLG00000000970	-	86	98.876	Heterocephalus_glaber_female
ENSETEG00000017805	TNPO1	85	98.876	ENSHGLG00100017090	-	85	98.876	Heterocephalus_glaber_male
ENSETEG00000017805	TNPO1	82	84.644	ENSHGLG00100000963	-	82	84.644	Heterocephalus_glaber_male
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	99.625	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	84	99.625	Jaculus_jaculus
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.007	ENSKMAG00000018195	tnpo1	86	94.007	Kryptolebias_marmoratus
ENSETEG00000017805	TNPO1	83	84.234	ENSLBEG00000009521	tnpo1	86	84.234	Labrus_bergylta
ENSETEG00000017805	TNPO1	84	80.608	ENSLACG00000012199	TNPO1	85	80.608	Latimeria_chalumnae
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	97.004	ENSLOCG00000011092	tnpo1	84	97.004	Lepisosteus_oculatus
ENSETEG00000017805	TNPO1	86	100.000	ENSLAFG00000011796	TNPO1	86	100.000	Loxodonta_africana
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	ENSMFAG00000003636	TNPO1	86	99.625	Macaca_fascicularis
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	ENSMMUG00000020923	TNPO1	86	99.625	Macaca_mulatta
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	ENSMNEG00000044581	TNPO1	86	99.625	Macaca_nemestrina
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	ENSMLEG00000030740	TNPO1	86	99.625	Mandrillus_leucophaeus
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	95.506	ENSMAMG00000001357	tnpo1	86	95.506	Mastacembelus_armatus
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.007	ENSMZEG00005004913	tnpo1	86	94.007	Maylandia_zebra
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.251	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	86	99.251	Mesocricetus_auratus
ENSETEG00000017805	TNPO1	76	99.625	ENSMICG00000008468	TNPO1	76	99.625	Microcebus_murinus
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.251	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	86	99.251	Microtus_ochrogaster
ENSETEG00000017805	TNPO1	80	93.011	ENSMMOG00000005551	tnpo1	88	93.011	Mola_mola
ENSETEG00000017805	TNPO1	80	100.000	ENSMODG00000001721	TNPO1	64	100.000	Monodelphis_domestica
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	95.506	ENSMALG00000009782	tnpo1	86	95.506	Monopterus_albus
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.251	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	89	99.543	Mus_caroli
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.251	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	89	99.543	Mus_musculus
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.251	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	89	99.543	Mus_pahari
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	98.876	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	89	99.087	Mus_spretus
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	ENSMPUG00000014387	TNPO1	86	99.625	Mustela_putorius_furo
ENSETEG00000017805	TNPO1	85	99.625	ENSMLUG00000016317	TNPO1	86	99.625	Myotis_lucifugus
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.251	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	86	99.251	Nannospalax_galili
ENSETEG00000017805	TNPO1	80	93.548	ENSNBRG00000009998	tnpo1	88	93.548	Neolamprologus_brichardi
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	ENSNLEG00000004572	TNPO1	86	99.625	Nomascus_leucogenys
ENSETEG00000017805	TNPO1	76	97.753	ENSOPRG00000012390	TNPO1	73	97.753	Ochotona_princeps
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	98.876	ENSODEG00000001771	TNPO1	86	98.876	Octodon_degus
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	91.941	ENSONIG00000011151	tnpo1	86	91.941	Oreochromis_niloticus
ENSETEG00000017805	TNPO1	85	98.876	ENSOANG00000015785	TNPO1	89	98.876	Ornithorhynchus_anatinus
ENSETEG00000017805	TNPO1	85	99.251	ENSOCUG00000013318	TNPO1	85	99.251	Oryctolagus_cuniculus
ENSETEG00000017805	TNPO1	79	93.548	ENSORLG00000003182	tnpo1	88	93.548	Oryzias_latipes
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.007	ENSORLG00020011559	tnpo1	86	94.007	Oryzias_latipes_hni
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.382	ENSORLG00015019113	tnpo1	86	94.382	Oryzias_latipes_hsok
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.007	ENSOMEG00000014567	tnpo1	86	94.007	Oryzias_melastigma
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	ENSOGAG00000000808	TNPO1	86	99.625	Otolemur_garnettii
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	ENSOARG00000005038	TNPO1	73	99.625	Ovis_aries
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	ENSPPAG00000042518	TNPO1	86	99.625	Pan_paniscus
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	ENSPPRG00000022336	TNPO1	86	99.625	Panthera_pardus
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	ENSPTIG00000018839	TNPO1	86	99.625	Panthera_tigris_altaica
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	ENSPTRG00000016972	TNPO1	89	99.625	Pan_troglodytes
ENSETEG00000017805	TNPO1	83	88.889	ENSPTRG00000047731	-	84	88.889	Pan_troglodytes
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	ENSPANG00000006074	TNPO1	86	99.625	Papio_anubis
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	95.131	ENSPKIG00000019795	tnpo1	86	95.131	Paramormyrops_kingsleyae
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	98.876	ENSPSIG00000014366	TNPO1	86	98.876	Pelodiscus_sinensis
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	92.164	ENSPMGG00000017014	tnpo1	86	92.164	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSETEG00000017805	TNPO1	85	99.251	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	86	99.251	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	99.625	ENSPCIG00000026080	TNPO1	86	99.625	Phascolarctos_cinereus
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.382	ENSPFOG00000011447	tnpo1	86	94.382	Poecilia_formosa
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.382	ENSPLAG00000018696	tnpo1	86	94.382	Poecilia_latipinna
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.382	ENSPMEG00000024121	tnpo1	86	94.382	Poecilia_mexicana
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.382	ENSPREG00000020705	tnpo1	86	94.382	Poecilia_reticulata
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	ENSPPYG00000015545	TNPO1	86	99.625	Pongo_abelii
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	ENSPCOG00000004254	TNPO1	86	99.625	Propithecus_coquereli
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	ENSPVAG00000013051	TNPO1	86	99.625	Pteropus_vampyrus
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.382	ENSPNYG00000001522	tnpo1	86	94.382	Pundamilia_nyererei
ENSETEG00000017805	TNPO1	80	95.946	ENSPNAG00000021484	tnpo1	86	94.007	Pygocentrus_nattereri
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	99.251	ENSRNOG00000014999	Tnpo1	86	99.251	Rattus_norvegicus
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	ENSRBIG00000021642	TNPO1	86	99.625	Rhinopithecus_bieti
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	ENSRROG00000035271	TNPO1	86	99.625	Rhinopithecus_roxellana
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	98.502	ENSSBOG00000029256	TNPO1	86	98.502	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSETEG00000017805	TNPO1	86	99.625	ENSSHAG00000007120	TNPO1	86	99.625	Sarcophilus_harrisii
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	95.880	ENSSFOG00015015448	tnpo1	86	95.880	Scleropages_formosus
ENSETEG00000017805	TNPO1	85	94.757	ENSSMAG00000011202	tnpo1	83	94.757	Scophthalmus_maximus
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	95.506	ENSSDUG00000007943	tnpo1	86	95.506	Seriola_dumerili
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	95.506	ENSSLDG00000014578	tnpo1	86	95.506	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	98.876	ENSSPUG00000000149	TNPO1	86	98.876	Sphenodon_punctatus
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	95.506	ENSSPAG00000000258	tnpo1	86	95.506	Stegastes_partitus
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	99.625	ENSSSCG00000027293	TNPO1	86	99.625	Sus_scrofa
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	91.667	ENSTGUG00000005729	TNPO1	86	91.667	Taeniopygia_guttata
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	92.884	ENSTRUG00000018491	tnpo1	86	92.884	Takifugu_rubripes
ENSETEG00000017805	TNPO1	58	60.792	ENSTNIG00000007483	tnpo1	81	60.792	Tetraodon_nigroviridis
ENSETEG00000017805	TNPO1	75	99.625	ENSTBEG00000007848	TNPO1	72	99.625	Tupaia_belangeri
ENSETEG00000017805	TNPO1	85	86.891	ENSTTRG00000000209	TNPO1	82	86.891	Tursiops_truncatus
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	99.625	ENSUMAG00000007635	TNPO1	86	99.625	Ursus_maritimus
ENSETEG00000017805	TNPO1	90	97.004	ENSVPAG00000009601	TNPO1	86	97.004	Vicugna_pacos
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	99.625	ENSVVUG00000007338	TNPO1	86	99.625	Vulpes_vulpes
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	95.880	ENSXETG00000016812	tnpo1	85	95.880	Xenopus_tropicalis
ENSETEG00000017805	TNPO1	89	95.131	ENSXMAG00000005440	tnpo1	86	95.131	Xiphophorus_maculatus