EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSETEG00000018204 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: POLR1E
Alias: FLJ13390|FLJ13970|PAF53|PRAF1
Full Name: RNA polymerase I subunit E
Gene Type: protein_coding
Species: Echinops_telfairi
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 13500 bases
Position: chrGeneScaffold_3973:950-14449
Accession: 17631
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSETEP00000014791	RNA_pol_I_A49	PF06870.12	1.7e-90	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSETET00000018205	POLR1E-201	1074	-	ENSETEP00000014791	357 (aa)	-	UPI0000E42D1C

Gene Model

Click here to download ENSETEG00000018204's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSETEG00000018204's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	82.682	ENSG00000137054	POLR1E	85	82.682	Homo_sapiens
ENSETEG00000018204	POLR1E	89	41.693	ENSAPOG00000012452	polr1e	75	41.379	Acanthochromis_polyacanthus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	72.030	ENSAMEG00000010193	POLR1E	84	72.030	Ailuropoda_melanoleuca
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	41.620	ENSACIG00000009884	polr1e	89	41.341	Amphilophus_citrinellus
ENSETEG00000018204	POLR1E	89	45.283	ENSAOCG00000005665	polr1e	76	44.654	Amphiprion_ocellaris
ENSETEG00000018204	POLR1E	89	44.969	ENSAPEG00000020581	polr1e	76	44.654	Amphiprion_percula
ENSETEG00000018204	POLR1E	96	45.245	ENSATEG00000020609	polr1e	83	44.957	Anabas_testudineus
ENSETEG00000018204	POLR1E	93	53.704	ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	53.704	Anas_platyrhynchos
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	81.564	ENSANAG00000038046	POLR1E	85	81.564	Aotus_nancymaae
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	42.340	ENSACLG00000013685	polr1e	84	42.061	Astatotilapia_calliptera
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	41.504	ENSAMXG00000018181	polr1e	86	41.504	Astyanax_mexicanus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	82.123	ENSBTAG00000012243	POLR1E	85	82.123	Bos_taurus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	75.350	ENSCJAG00000010512	POLR1E	78	81.789	Callithrix_jacchus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	81.006	ENSCAFG00000002377	POLR1E	85	81.006	Canis_familiaris
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	81.285	ENSCAFG00020017851	POLR1E	85	81.285	Canis_lupus_dingo
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	81.285	ENSCHIG00000019479	POLR1E	85	81.285	Capra_hircus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	80.168	ENSTSYG00000002075	POLR1E	85	80.168	Carlito_syrichta
ENSETEG00000018204	POLR1E	80	80.351	ENSCAPG00000015653	POLR1E	99	80.351	Cavia_aperea
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	78.873	ENSCPOG00000009965	POLR1E	85	78.873	Cavia_porcellus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	72.905	ENSCCAG00000029460	POLR1E	84	72.905	Cebus_capucinus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	82.123	ENSCATG00000031732	POLR1E	85	82.123	Cercocebus_atys
ENSETEG00000018204	POLR1E	85	83.934	ENSCLAG00000012701	POLR1E	80	83.934	Chinchilla_lanigera
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	81.844	ENSCSAG00000010782	POLR1E	85	81.844	Chlorocebus_sabaeus
ENSETEG00000018204	POLR1E	93	78.979	ENSCHOG00000013024	POLR1E	70	78.979	Choloepus_hoffmanni
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	61.798	ENSCPBG00000006923	POLR1E	86	62.921	Chrysemys_picta_bellii
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	81.844	ENSCANG00000036112	POLR1E	85	81.844	Colobus_angolensis_palliatus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	76.620	ENSCGRG00001006197	Polr1e	82	76.620	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	76.056	ENSCGRG00000006430	Polr1e	82	75.843	Cricetulus_griseus_crigri
ENSETEG00000018204	POLR1E	96	42.775	ENSCSEG00000005121	polr1e	83	42.486	Cynoglossus_semilaevis
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	42.061	ENSCVAG00000019759	polr1e	85	42.061	Cyprinodon_variegatus
ENSETEG00000018204	POLR1E	96	43.353	ENSDARG00000006434	polr1e	83	43.064	Danio_rerio
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	71.499	ENSDNOG00000010257	POLR1E	87	71.499	Dasypus_novemcinctus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	82.402	ENSEASG00005000675	POLR1E	85	82.402	Equus_asinus_asinus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	82.682	ENSECAG00000014669	POLR1E	85	82.682	Equus_caballus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	67.787	ENSEEUG00000011928	POLR1E	76	67.787	Erinaceus_europaeus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	44.290	ENSELUG00000008150	polr1e	85	44.011	Esox_lucius
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	81.006	ENSFCAG00000013081	POLR1E	85	81.006	Felis_catus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	59.270	ENSFALG00000012950	POLR1E	89	59.270	Ficedula_albicollis
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	78.873	ENSFDAG00000016917	POLR1E	85	78.873	Fukomys_damarensis
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	42.265	ENSFHEG00000009801	polr1e	86	42.265	Fundulus_heteroclitus
ENSETEG00000018204	POLR1E	96	37.644	ENSGMOG00000003336	POLR1E	81	37.644	Gadus_morhua
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	60.393	ENSGALG00000005395	POLR1E	86	60.393	Gallus_gallus
ENSETEG00000018204	POLR1E	96	42.571	ENSGAFG00000004850	polr1e	83	42.407	Gambusia_affinis
ENSETEG00000018204	POLR1E	88	42.812	ENSGACG00000016087	polr1e	76	42.188	Gasterosteus_aculeatus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	54.494	ENSGAGG00000001659	POLR1E	86	52.825	Gopherus_agassizii
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	82.682	ENSGGOG00000001882	POLR1E	85	82.682	Gorilla_gorilla
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	42.340	ENSHBUG00000002559	polr1e	84	42.061	Haplochromis_burtoni
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	79.494	ENSHGLG00000002036	POLR1E	85	79.494	Heterocephalus_glaber_female
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	79.775	ENSHGLG00100012784	POLR1E	85	79.775	Heterocephalus_glaber_male
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	41.504	ENSHCOG00000002774	polr1e	85	41.504	Hippocampus_comes
ENSETEG00000018204	POLR1E	96	41.449	ENSIPUG00000003019	polr1e	83	41.449	Ictalurus_punctatus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	80.168	ENSSTOG00000009810	POLR1E	85	80.168	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	78.492	ENSJJAG00000020731	Polr1e	82	78.492	Jaculus_jaculus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	40.278	ENSKMAG00000000046	polr1e	85	40.278	Kryptolebias_marmoratus
ENSETEG00000018204	POLR1E	96	43.732	ENSLBEG00000003104	polr1e	82	43.732	Labrus_bergylta
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	55.866	ENSLACG00000003416	POLR1E	99	55.866	Latimeria_chalumnae
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	46.927	ENSLOCG00000012859	polr1e	85	45.810	Lepisosteus_oculatus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	84.358	ENSLAFG00000012831	POLR1E	85	84.358	Loxodonta_africana
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	82.402	ENSMFAG00000045465	POLR1E	82	82.063	Macaca_fascicularis
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	82.402	ENSMMUG00000017892	POLR1E	85	82.402	Macaca_mulatta
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	74.932	ENSMNEG00000040283	POLR1E	82	82.063	Macaca_nemestrina
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	82.402	ENSMLEG00000031135	POLR1E	85	82.402	Mandrillus_leucophaeus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	40.443	ENSMAMG00000001260	polr1e	85	40.166	Mastacembelus_armatus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	42.618	ENSMZEG00005021536	polr1e	84	42.340	Maylandia_zebra
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	76.536	ENSMAUG00000021044	Polr1e	82	76.536	Mesocricetus_auratus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	81.844	ENSMICG00000003673	POLR1E	85	81.844	Microcebus_murinus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	76.901	ENSMOCG00000012920	Polr1e	82	76.901	Microtus_ochrogaster
ENSETEG00000018204	POLR1E	96	42.651	ENSMMOG00000007391	polr1e	84	42.363	Mola_mola
ENSETEG00000018204	POLR1E	96	69.971	ENSMODG00000002884	POLR1E	84	69.971	Monodelphis_domestica
ENSETEG00000018204	POLR1E	90	45.963	ENSMALG00000002665	polr1e	76	45.652	Monopterus_albus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	74.930	MGP_CAROLIEiJ_G0025967	Polr1e	87	74.930	Mus_caroli
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	74.930	ENSMUSG00000028318	Polr1e	87	74.930	Mus_musculus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	77.183	MGP_PahariEiJ_G0024114	Polr1e	87	77.183	Mus_pahari
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	74.366	MGP_SPRETEiJ_G0026930	Polr1e	87	74.366	Mus_spretus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	71.814	ENSMPUG00000006040	POLR1E	87	71.569	Mustela_putorius_furo
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	80.447	ENSMLUG00000012688	POLR1E	82	80.447	Myotis_lucifugus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	81.285	ENSNGAG00000002520	Polr1e	82	81.285	Nannospalax_galili
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	42.618	ENSNBRG00000016822	polr1e	84	42.340	Neolamprologus_brichardi
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	82.682	ENSNLEG00000003616	POLR1E	85	82.682	Nomascus_leucogenys
ENSETEG00000018204	POLR1E	75	75.000	ENSMEUG00000015372	-	71	75.000	Notamacropus_eugenii
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	67.877	ENSOPRG00000014206	POLR1E	99	67.877	Ochotona_princeps
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	80.282	ENSODEG00000014565	POLR1E	83	80.282	Octodon_degus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	42.382	ENSONIG00000008921	polr1e	84	42.061	Oreochromis_niloticus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	80.726	ENSOCUG00000024773	POLR1E	85	80.726	Oryctolagus_cuniculus
ENSETEG00000018204	POLR1E	96	43.353	ENSORLG00000005143	polr1e	83	43.353	Oryzias_latipes
ENSETEG00000018204	POLR1E	96	42.120	ENSORLG00020007271	polr1e	88	41.908	Oryzias_latipes_hni
ENSETEG00000018204	POLR1E	96	43.064	ENSORLG00015000137	polr1e	83	43.064	Oryzias_latipes_hsok
ENSETEG00000018204	POLR1E	96	42.363	ENSOMEG00000013264	polr1e	81	42.363	Oryzias_melastigma
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	82.682	ENSOGAG00000012981	POLR1E	83	82.682	Otolemur_garnettii
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	81.564	ENSOARG00000011465	POLR1E	82	81.564	Ovis_aries
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	82.682	ENSPPAG00000034566	POLR1E	85	82.682	Pan_paniscus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	81.564	ENSPPRG00000005649	POLR1E	85	81.564	Panthera_pardus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	81.564	ENSPTIG00000009774	POLR1E	85	81.564	Panthera_tigris_altaica
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	82.682	ENSPTRG00000020944	POLR1E	85	82.682	Pan_troglodytes
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	82.402	ENSPANG00000025563	POLR1E	85	82.402	Papio_anubis
ENSETEG00000018204	POLR1E	100	45.304	ENSPKIG00000003562	polr1e	86	45.304	Paramormyrops_kingsleyae
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	57.423	ENSPSIG00000003274	POLR1E	83	57.584	Pelodiscus_sinensis
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	41.341	ENSPMGG00000024169	polr1e	86	41.061	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	60.615	ENSPEMG00000022300	-	81	60.615	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	75.630	ENSPEMG00000019151	-	82	75.630	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSETEG00000018204	POLR1E	96	70.554	ENSPCIG00000014798	POLR1E	84	70.554	Phascolarctos_cinereus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	40.260	ENSPFOG00000019627	polr1e	85	39.740	Poecilia_formosa
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	42.659	ENSPLAG00000022679	polr1e	85	42.105	Poecilia_latipinna
ENSETEG00000018204	POLR1E	96	43.228	ENSPMEG00000022123	polr1e	89	42.651	Poecilia_mexicana
ENSETEG00000018204	POLR1E	96	42.000	ENSPREG00000009470	polr1e	83	41.429	Poecilia_reticulata
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	81.844	ENSPPYG00000019061	POLR1E	85	81.844	Pongo_abelii
ENSETEG00000018204	POLR1E	85	70.066	ENSPCAG00000004891	POLR1E	100	70.066	Procavia_capensis
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	82.123	ENSPCOG00000027448	POLR1E	85	82.123	Propithecus_coquereli
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	81.844	ENSPVAG00000007940	POLR1E	75	81.844	Pteropus_vampyrus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	42.340	ENSPNYG00000001032	polr1e	84	42.061	Pundamilia_nyererei
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	40.845	ENSPNAG00000006987	polr1e	84	40.563	Pygocentrus_nattereri
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	76.056	ENSRNOG00000012664	Polr1e	82	76.056	Rattus_norvegicus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	81.844	ENSRBIG00000034214	POLR1E	94	81.844	Rhinopithecus_bieti
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	81.844	ENSRROG00000031986	POLR1E	85	81.844	Rhinopithecus_roxellana
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	81.285	ENSSBOG00000021415	POLR1E	85	81.285	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSETEG00000018204	POLR1E	96	69.186	ENSSHAG00000016084	POLR1E	96	69.186	Sarcophilus_harrisii
ENSETEG00000018204	POLR1E	96	45.349	ENSSFOG00015002293	polr1e	82	44.767	Scleropages_formosus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	44.011	ENSSMAG00000011672	polr1e	79	43.733	Scophthalmus_maximus
ENSETEG00000018204	POLR1E	96	43.966	ENSSDUG00000022279	polr1e	82	43.678	Seriola_dumerili
ENSETEG00000018204	POLR1E	96	43.678	ENSSLDG00000024918	polr1e	82	43.678	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSETEG00000018204	POLR1E	65	72.845	ENSSARG00000009810	-	58	72.845	Sorex_araneus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	62.712	ENSSPUG00000009499	POLR1E	85	62.712	Sphenodon_punctatus
ENSETEG00000018204	POLR1E	89	46.541	ENSSPAG00000021240	polr1e	76	46.541	Stegastes_partitus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	80.726	ENSSSCG00000005347	POLR1E	85	80.726	Sus_scrofa
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	51.733	ENSTGUG00000007169	POLR1E	91	51.733	Taeniopygia_guttata
ENSETEG00000018204	POLR1E	89	44.025	ENSTRUG00000020779	polr1e	83	43.711	Takifugu_rubripes
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	41.598	ENSTNIG00000017812	polr1e	86	41.322	Tetraodon_nigroviridis
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	81.844	ENSTBEG00000013786	POLR1E	76	81.844	Tupaia_belangeri
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	80.332	ENSTTRG00000008294	POLR1E	77	80.332	Tursiops_truncatus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	81.285	ENSUAMG00000012474	POLR1E	83	83.660	Ursus_americanus
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	81.285	ENSUMAG00000011496	POLR1E	85	81.285	Ursus_maritimus
ENSETEG00000018204	POLR1E	78	85.714	ENSVPAG00000009048	POLR1E	66	85.714	Vicugna_pacos
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	81.285	ENSVVUG00000019954	POLR1E	85	81.285	Vulpes_vulpes
ENSETEG00000018204	POLR1E	99	48.199	ENSXETG00000006533	polr1e	86	48.199	Xenopus_tropicalis
ENSETEG00000018204	POLR1E	96	40.688	ENSXCOG00000013706	polr1e	82	40.688	Xiphophorus_couchianus
ENSETEG00000018204	POLR1E	96	43.143	ENSXMAG00000012484	polr1e	83	43.143	Xiphophorus_maculatus