EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSETEG00000020259 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ZMAT1
Alias: KIAA1789
Full Name: zinc finger matrin-type 1
Gene Type: protein_coding
Species: Echinops_telfairi
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 47665 bases
Position: chrGeneScaffold_6321:15862-63526
Accession: 29377
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSETEP00000016459	zf-met	PF12874.7	0.00016	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSETET00000020259	ZMAT1-201	1788	-	ENSETEP00000016459	595 (aa)	-	UPI0000E415C8

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	58.167	ENSG00000166432	ZMAT1	93	59.000	Homo_sapiens
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	58.824	ENSAMEG00000004976	ZMAT1	99	58.306	Ailuropoda_melanoleuca
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	57.667	ENSANAG00000028725	ZMAT1	99	58.167	Aotus_nancymaae
ENSETEG00000020259	ZMAT1	100	45.930	ENSBTAG00000003601	ZMAT1	86	52.952	Bos_taurus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	58.167	ENSCJAG00000019724	ZMAT1	99	59.000	Callithrix_jacchus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	58.167	ENSCAFG00000017730	ZMAT1	99	58.667	Canis_familiaris
ENSETEG00000020259	ZMAT1	78	58.686	ENSCAFG00020007319	ZMAT1	100	59.322	Canis_lupus_dingo
ENSETEG00000020259	ZMAT1	78	55.907	ENSCHIG00000010507	ZMAT1	100	56.540	Capra_hircus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	54.591	ENSTSYG00000007330	ZMAT1	99	55.426	Carlito_syrichta
ENSETEG00000020259	ZMAT1	100	46.305	ENSCPOG00000000581	ZMAT1	98	46.305	Cavia_porcellus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	58.000	ENSCCAG00000023924	ZMAT1	99	58.833	Cebus_capucinus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	56.739	ENSCATG00000000551	ZMAT1	98	57.571	Cercocebus_atys
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	45.546	ENSCLAG00000004197	ZMAT1	96	45.546	Chinchilla_lanigera
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	55.288	ENSCSAG00000009795	ZMAT1	86	56.090	Chlorocebus_sabaeus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	93	40.310	ENSCPBG00000001356	ZMAT1	80	46.667	Chrysemys_picta_bellii
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	57.238	ENSCANG00000037194	ZMAT1	99	58.070	Colobus_angolensis_palliatus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	47.097	ENSCGRG00001023697	Zmat1	96	47.581	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	47.097	ENSCGRG00000001964	Zmat1	99	47.581	Cricetulus_griseus_crigri
ENSETEG00000020259	ZMAT1	94	55.712	ENSDNOG00000014852	-	100	56.063	Dasypus_novemcinctus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	79	45.175	ENSDNOG00000044924	-	99	46.407	Dasypus_novemcinctus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	100	47.588	ENSDORG00000006821	Zmat1	97	47.588	Dipodomys_ordii
ENSETEG00000020259	ZMAT1	100	54.908	ENSEASG00005014185	ZMAT1	94	55.408	Equus_asinus_asinus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	100	57.807	ENSECAG00000013390	ZMAT1	100	59.746	Equus_caballus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	100	55.814	ENSFCAG00000023394	ZMAT1	100	56.146	Felis_catus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	49.164	ENSFDAG00000004063	ZMAT1	92	49.164	Fukomys_damarensis
ENSETEG00000020259	ZMAT1	93	40.310	ENSGAGG00000002326	ZMAT1	93	35.263	Gopherus_agassizii
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	58.167	ENSGGOG00000025784	ZMAT1	95	59.000	Gorilla_gorilla
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	43.551	ENSHGLG00000002494	ZMAT1	96	46.231	Heterocephalus_glaber_female
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	49.264	ENSHGLG00100004968	ZMAT1	96	49.264	Heterocephalus_glaber_male
ENSETEG00000020259	ZMAT1	96	52.492	ENSSTOG00000011140	ZMAT1	99	55.037	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	43.610	ENSJJAG00000020188	Zmat1	96	44.089	Jaculus_jaculus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	94	56.716	ENSLAFG00000015656	ZMAT1	100	56.716	Loxodonta_africana
ENSETEG00000020259	ZMAT1	88	55.598	ENSMFAG00000042343	ZMAT1	90	55.598	Macaca_fascicularis
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	57.238	ENSMMUG00000002151	ZMAT1	95	58.070	Macaca_mulatta
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	56.905	ENSMNEG00000036310	ZMAT1	95	57.737	Macaca_nemestrina
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	56.905	ENSMLEG00000005031	ZMAT1	95	57.737	Mandrillus_leucophaeus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	47.097	ENSMAUG00000002941	Zmat1	96	47.581	Mesocricetus_auratus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	57.596	ENSMICG00000003313	ZMAT1	99	57.930	Microcebus_murinus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	46.990	ENSMOCG00000000169	Zmat1	96	47.492	Microtus_ochrogaster
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	45.498	ENSMUSG00000052676	Zmat1	96	45.981	Mus_musculus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	46.006	MGP_PahariEiJ_G0031943	Zmat1	96	46.486	Mus_pahari
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	45.586	MGP_SPRETEiJ_G0034567	Zmat1	96	46.067	Mus_spretus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	52.757	ENSMPUG00000002130	ZMAT1	99	53.309	Mustela_putorius_furo
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	56.093	ENSMLUG00000004417	ZMAT1	99	56.594	Myotis_lucifugus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	46.935	ENSNGAG00000006608	Zmat1	96	47.258	Nannospalax_galili
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	54.925	ENSNLEG00000030520	ZMAT1	93	55.259	Nomascus_leucogenys
ENSETEG00000020259	ZMAT1	68	45.455	ENSOPRG00000009950	-	99	45.455	Ochotona_princeps
ENSETEG00000020259	ZMAT1	87	46.881	ENSOCUG00000004164	ZMAT1	89	46.154	Oryctolagus_cuniculus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	57.333	ENSOGAG00000033601	ZMAT1	99	57.833	Otolemur_garnettii
ENSETEG00000020259	ZMAT1	100	54.801	ENSOARG00000001897	ZMAT1	100	55.298	Ovis_aries
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	58.167	ENSPPAG00000039554	ZMAT1	94	59.000	Pan_paniscus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	100	56.811	ENSPPRG00000005258	ZMAT1	100	57.143	Panthera_pardus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	100	56.146	ENSPTIG00000019057	ZMAT1	100	56.478	Panthera_tigris_altaica
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	58.167	ENSPTRG00000041840	ZMAT1	94	59.000	Pan_troglodytes
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	47.267	ENSPEMG00000009944	Zmat1	96	47.749	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	56.260	ENSPPYG00000020561	ZMAT1	93	57.095	Pongo_abelii
ENSETEG00000020259	ZMAT1	100	56.739	ENSPCAG00000010283	ZMAT1	100	56.739	Procavia_capensis
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	56.572	ENSPCOG00000021386	ZMAT1	99	57.072	Propithecus_coquereli
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	56.020	ENSPVAG00000013206	ZMAT1	99	56.020	Pteropus_vampyrus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	45.806	ENSRNOG00000024135	Zmat1	96	46.290	Rattus_norvegicus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	57.000	ENSRBIG00000034121	ZMAT1	94	57.833	Rhinopithecus_bieti
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	57.571	ENSRROG00000036747	ZMAT1	93	58.403	Rhinopithecus_roxellana
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	58.500	ENSSBOG00000029970	ZMAT1	99	58.500	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSETEG00000020259	ZMAT1	96	40.625	ENSSHAG00000011087	-	100	41.016	Sarcophilus_harrisii
ENSETEG00000020259	ZMAT1	61	48.052	ENSSARG00000003063	-	61	50.463	Sorex_araneus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	74	42.623	ENSSPUG00000004951	ZMAT1	86	42.623	Sphenodon_punctatus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	54.735	ENSSSCG00000012512	ZMAT1	100	57.839	Sus_scrofa
ENSETEG00000020259	ZMAT1	94	53.616	ENSTBEG00000012967	ZMAT1	100	54.145	Tupaia_belangeri
ENSETEG00000020259	ZMAT1	100	56.146	ENSTTRG00000016662	ZMAT1	100	56.645	Tursiops_truncatus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	78	58.898	ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	59.534	Ursus_americanus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	78	58.898	ENSUMAG00000000627	ZMAT1	100	59.534	Ursus_maritimus
ENSETEG00000020259	ZMAT1	100	57.807	ENSVPAG00000006267	ZMAT1	100	58.140	Vicugna_pacos
ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	56.019	ENSVVUG00000005342	ZMAT1	87	56.501	Vulpes_vulpes