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Description

Ensembl ID: ENSFALG00000000209 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SMARCA1
Alias: ISWI|NURF140|SNF2L|SNF2L1|SNF2LB|SWI|hSNF2L
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 1
Gene Type: protein_coding
Species: Ficedula_albicollis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 24510 bases
Position: chrJH603329.1:900433-924942
Accession: 11097
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFALP00000000211	ResIII	PF04851.15	9.9e-12	1	1
ENSFALP00000000211	DEAD	PF00270.29	3.7e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFALT00000000213	SMARCA1-201	2972	-	ENSFALP00000000211	928 (aa)	-	U3JBQ7

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSFALG00000000209	SMARCA1	59	44.667	ENSFALG00000007136	HELLS	68	44.667
ENSFALG00000000209	SMARCA1	59	42.468	ENSFALG00000006087	CHD1L	60	43.219
ENSFALG00000000209	SMARCA1	50	32.727	ENSFALG00000003400	ERCC6L2	50	32.727
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	89.485	ENSFALG00000004987	SMARCA5	94	89.485

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	93.640	ENSG00000102038	SMARCA1	88	92.324	Homo_sapiens
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	85.339	ENSAPOG00000016035	smarca5	92	85.981	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	91.883	ENSAMEG00000015218	SMARCA1	86	91.784	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFALG00000000209	SMARCA1	91	86.272	ENSACIG00000016982	smarca5	93	86.396	Amphilophus_citrinellus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	85.339	ENSAOCG00000015578	smarca5	88	85.339	Amphiprion_ocellaris
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	85.339	ENSAPEG00000011117	smarca5	93	86.076	Amphiprion_percula
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	85.214	ENSATEG00000012894	smarca5	89	85.214	Anabas_testudineus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	99.123	ENSAPLG00000013149	SMARCA1	93	99.123	Anas_platyrhynchos
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	96.820	ENSACAG00000011376	SMARCA1	87	96.714	Anolis_carolinensis
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	87.939	ENSANAG00000023098	SMARCA1	86	87.842	Aotus_nancymaae
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	85.777	ENSACLG00000025356	smarca5	88	85.777	Astatotilapia_calliptera
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	86.199	ENSAMXG00000005709	smarca5	88	86.199	Astyanax_mexicanus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	94	92.369	ENSAMXG00000011227	smarca1	95	93.561	Astyanax_mexicanus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	92.654	ENSBTAG00000002292	SMARCA1	88	91.351	Bos_taurus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	64.962	WBGene00002169	isw-1	90	64.891	Caenorhabditis_elegans
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	93.640	ENSCJAG00000002868	SMARCA1	86	93.538	Callithrix_jacchus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	82.347	ENSCAFG00000018673	SMARCA1	93	83.059	Canis_familiaris
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	93.311	ENSCAFG00020001751	SMARCA1	86	93.209	Canis_lupus_dingo
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	92.763	ENSCHIG00000009837	SMARCA1	88	91.459	Capra_hircus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	93.750	ENSTSYG00000004240	SMARCA1	91	93.633	Carlito_syrichta
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	92.426	ENSCPOG00000013601	SMARCA1	88	91.135	Cavia_porcellus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	90.581	ENSCCAG00000030817	SMARCA1	86	90.481	Cebus_capucinus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	93.538	ENSCATG00000015921	SMARCA1	88	93.538	Cercocebus_atys
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	92.434	ENSCLAG00000002171	SMARCA1	88	91.135	Chinchilla_lanigera
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	93.640	ENSCSAG00000008460	SMARCA1	86	93.538	Chlorocebus_sabaeus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	97.588	ENSCPBG00000001146	SMARCA1	86	97.588	Chrysemys_picta_bellii
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	75.299	ENSCING00000004110	swi/snf	91	75.299	Ciona_intestinalis
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	74.973	ENSCSAVG00000004620	-	98	74.630	Ciona_savignyi
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	93.531	ENSCANG00000007183	SMARCA1	86	93.428	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	91.886	ENSCGRG00001010776	Smarca1	88	90.595	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	91.557	ENSCGRG00000015301	Smarca1	91	91.457	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	85.011	ENSCSEG00000000328	smarca5	88	85.011	Cynoglossus_semilaevis
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	84.683	ENSCVAG00000008668	smarca5	93	85.461	Cyprinodon_variegatus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	85.104	ENSDARG00000052348	smarca5	88	85.104	Danio_rerio
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	89.103	ENSDARG00000012776	smarca1	90	89.103	Danio_rerio
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	92.990	ENSDNOG00000004315	SMARCA1	88	92.990	Dasypus_novemcinctus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	91.676	ENSDORG00000009270	Smarca1	88	91.676	Dipodomys_ordii
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	75.435	FBgn0011604	Iswi	89	75.435	Drosophila_melanogaster
ENSFALG00000000209	SMARCA1	84	88.393	ENSETEG00000017426	SMARCA1	81	88.393	Echinops_telfairi
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	83.790	ENSEBUG00000001239	smarca5	90	83.790	Eptatretus_burgeri
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	89.376	ENSEASG00005008218	SMARCA1	92	89.704	Equus_asinus_asinus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	93.311	ENSECAG00000012106	SMARCA1	86	93.209	Equus_caballus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	82	92.384	ENSEEUG00000014927	SMARCA1	78	92.384	Erinaceus_europaeus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	91.148	ENSELUG00000010515	smarca1	90	91.148	Esox_lucius
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	93.202	ENSFCAG00000018496	SMARCA1	86	93.100	Felis_catus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	91.558	ENSFDAG00000009818	SMARCA1	91	91.459	Fukomys_damarensis
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	84.902	ENSFHEG00000007687	smarca5	91	85.614	Fundulus_heteroclitus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	99.124	ENSGALG00000008431	SMARCA1	90	99.124	Gallus_gallus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	85.120	ENSGAFG00000017731	smarca5	88	85.120	Gambusia_affinis
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	97.588	ENSGAGG00000023575	SMARCA1	94	97.588	Gopherus_agassizii
ENSFALG00000000209	SMARCA1	77	88.235	ENSGGOG00000012841	-	91	88.235	Gorilla_gorilla
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	91.886	ENSHGLG00000003080	SMARCA1	88	90.595	Heterocephalus_glaber_female
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	91.877	ENSHGLG00100001102	SMARCA1	91	91.776	Heterocephalus_glaber_male
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	85.120	ENSHCOG00000005458	smarca5	88	85.120	Hippocampus_comes
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	85.980	ENSIPUG00000005229	SMARCA5	90	85.980	Ictalurus_punctatus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	90.929	ENSIPUG00000016905	Smarca1	94	90.393	Ictalurus_punctatus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	93.311	ENSSTOG00000014524	SMARCA1	89	93.202	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	92.442	ENSJJAG00000002593	Smarca1	88	92.442	Jaculus_jaculus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	84.792	ENSKMAG00000003777	smarca5	88	84.792	Kryptolebias_marmoratus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	84.683	ENSLBEG00000018112	smarca5	88	84.683	Labrus_bergylta
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	84.775	ENSLBEG00000013295	SMARCA1	98	85.309	Labrus_bergylta
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	94.524	ENSLACG00000016697	SMARCA1	90	94.524	Latimeria_chalumnae
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	93.531	ENSLOCG00000014591	smarca1	89	93.531	Lepisosteus_oculatus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	93.085	ENSLAFG00000000896	SMARCA1	92	92.350	Loxodonta_africana
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	93.640	ENSMFAG00000002117	SMARCA1	91	93.531	Macaca_fascicularis
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	93.538	ENSMMUG00000008818	SMARCA1	95	93.414	Macaca_mulatta
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	93.633	ENSMNEG00000041768	SMARCA1	91	93.531	Macaca_nemestrina
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	93.640	ENSMLEG00000043198	SMARCA1	86	93.538	Mandrillus_leucophaeus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	85.339	ENSMAMG00000014294	smarca5	88	85.339	Mastacembelus_armatus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	85.777	ENSMZEG00005009369	smarca5	88	85.777	Maylandia_zebra
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	97.835	ENSMGAG00000007042	SMARCA1	91	97.835	Meleagris_gallopavo
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	91.457	ENSMAUG00000008133	Smarca1	87	91.457	Mesocricetus_auratus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	93.531	ENSMICG00000015768	SMARCA1	86	93.428	Microcebus_murinus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	91.557	ENSMOCG00000009464	Smarca1	88	90.378	Microtus_ochrogaster
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	83.698	ENSMMOG00000005547	smarca5	92	83.698	Mola_mola
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	95.838	ENSMODG00000013187	-	88	95.838	Monodelphis_domestica
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	85.120	ENSMALG00000002081	smarca5	92	84.348	Monopterus_albus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	91.886	MGP_CAROLIEiJ_G0033034	Smarca1	89	90.483	Mus_caroli
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	91.886	ENSMUSG00000031099	Smarca1	89	90.483	Mus_musculus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	91.776	MGP_PahariEiJ_G0031579	Smarca1	89	90.337	Mus_pahari
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	91.886	MGP_SPRETEiJ_G0034192	Smarca1	89	90.483	Mus_spretus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	91.883	ENSMPUG00000017423	SMARCA1	82	91.784	Mustela_putorius_furo
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	90.605	ENSMLUG00000029614	SMARCA1	87	90.507	Myotis_lucifugus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	92.442	ENSNGAG00000006492	Smarca1	87	92.442	Nannospalax_galili
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	85.777	ENSNBRG00000004463	smarca5	92	85.777	Neolamprologus_brichardi
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	92.873	ENSNLEG00000015179	SMARCA1	91	92.771	Nomascus_leucogenys
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	85.390	ENSMEUG00000008819	SMARCA1	97	85.390	Notamacropus_eugenii
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	91.135	ENSODEG00000012163	SMARCA1	88	91.135	Octodon_degus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	85.777	ENSONIG00000009993	smarca5	88	85.777	Oreochromis_niloticus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	97.259	ENSOANG00000002862	SMARCA1	94	97.259	Ornithorhynchus_anatinus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	92.982	ENSOCUG00000001047	SMARCA1	86	92.881	Oryctolagus_cuniculus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	85.777	ENSORLG00000021998	smarca5	88	85.777	Oryzias_latipes
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	85.886	ENSORLG00020017679	smarca5	88	85.886	Oryzias_latipes_hni
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	85.777	ENSORLG00015017210	smarca5	88	85.777	Oryzias_latipes_hsok
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	85.886	ENSOMEG00000000086	smarca5	88	85.886	Oryzias_melastigma
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	92.649	ENSOGAG00000004399	SMARCA1	88	92.649	Otolemur_garnettii
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	92.763	ENSOARG00000014638	SMARCA1	93	92.662	Ovis_aries
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	93.640	ENSPPAG00000034647	SMARCA1	86	93.538	Pan_paniscus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	93.202	ENSPPRG00000008929	SMARCA1	86	93.100	Panthera_pardus
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	91.066	ENSPTIG00000000915	SMARCA1	90	90.968	Panthera_tigris_altaica
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	93.640	ENSPTRG00000049876	SMARCA1	88	93.538	Pan_troglodytes
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	93.640	ENSPANG00000003871	SMARCA1	86	93.538	Papio_anubis
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	90.263	ENSPKIG00000013411	smarca1	92	90.263	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	97.588	ENSPSIG00000010101	SMARCA1	94	97.588	Pelodiscus_sinensis
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	91.895	ENSPEMG00000017503	Smarca1	87	91.895	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	96.491	ENSPCIG00000015460	SMARCA1	91	96.386	Phascolarctos_cinereus
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ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	85.011	ENSPLAG00000003363	smarca5	88	85.011	Poecilia_latipinna
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