EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFALG00000000460 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Ficedula_albicollis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10498 bases
Position: chrJH603214.1:551918-562415
Accession: 19824
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFALP00000000477	SYF2	PF08231.12	1.5e-56	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFALT00000000480	SYF2-201	4424	-	ENSFALP00000000477	246 (aa)	-	U3JCH3

Gene Model

Click here to download ENSFALG00000000460's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSFALG00000000460's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFALG00000000460	SYF2	88	84.259	ENSG00000117614	SYF2	84	84.804	Homo_sapiens
ENSFALG00000000460	SYF2	89	81.193	ENSAPOG00000001174	syf2	86	81.863	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFALG00000000460	SYF2	98	78.838	ENSAMEG00000010115	-	84	85.294	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFALG00000000460	SYF2	79	85.641	ENSAMEG00000010134	-	100	85.641	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFALG00000000460	SYF2	90	77.056	ENSACIG00000023688	syf2	82	80.882	Amphilophus_citrinellus
ENSFALG00000000460	SYF2	100	73.984	ENSAOCG00000022046	syf2	87	81.863	Amphiprion_ocellaris
ENSFALG00000000460	SYF2	85	77.619	ENSAOCG00000010912	syf2	58	80.214	Amphiprion_ocellaris
ENSFALG00000000460	SYF2	100	73.984	ENSAPEG00000018858	syf2	79	81.863	Amphiprion_percula
ENSFALG00000000460	SYF2	88	80.556	ENSATEG00000007745	syf2	86	80.882	Anabas_testudineus
ENSFALG00000000460	SYF2	80	94.949	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	94.949	Anas_platyrhynchos
ENSFALG00000000460	SYF2	67	76.048	ENSACAG00000026777	-	100	76.048	Anolis_carolinensis
ENSFALG00000000460	SYF2	80	86.869	ENSACAG00000013653	-	97	86.869	Anolis_carolinensis
ENSFALG00000000460	SYF2	88	85.185	ENSANAG00000032473	SYF2	84	85.784	Aotus_nancymaae
ENSFALG00000000460	SYF2	89	79.091	ENSACLG00000019916	syf2	86	80.882	Astatotilapia_calliptera
ENSFALG00000000460	SYF2	97	74.477	ENSAMXG00000004051	syf2	86	79.902	Astyanax_mexicanus
ENSFALG00000000460	SYF2	98	78.838	ENSBTAG00000001651	SYF2	86	85.294	Bos_taurus
ENSFALG00000000460	SYF2	85	50.476	WBGene00019402	syf-2	88	49.515	Caenorhabditis_elegans
ENSFALG00000000460	SYF2	88	85.185	ENSCJAG00000046570	SYF2	84	85.784	Callithrix_jacchus
ENSFALG00000000460	SYF2	95	75.966	ENSCAFG00000030331	-	89	81.373	Canis_familiaris
ENSFALG00000000460	SYF2	88	84.722	ENSCAFG00000012895	-	83	85.294	Canis_familiaris
ENSFALG00000000460	SYF2	74	78.022	ENSCAFG00020021094	-	95	78.022	Canis_lupus_dingo
ENSFALG00000000460	SYF2	88	84.722	ENSCAFG00020021091	-	83	85.294	Canis_lupus_dingo
ENSFALG00000000460	SYF2	93	82.251	ENSCHIG00000020874	SYF2	85	85.294	Capra_hircus
ENSFALG00000000460	SYF2	96	78.661	ENSTSYG00000005114	SYF2	84	84.314	Carlito_syrichta
ENSFALG00000000460	SYF2	80	85.787	ENSCAPG00000010006	SYF2	99	85.787	Cavia_aperea
ENSFALG00000000460	SYF2	92	81.739	ENSCPOG00000005326	SYF2	84	85.294	Cavia_porcellus
ENSFALG00000000460	SYF2	88	85.185	ENSCCAG00000022459	SYF2	84	85.784	Cebus_capucinus
ENSFALG00000000460	SYF2	93	80.172	ENSCATG00000026917	SYF2	84	84.314	Cercocebus_atys
ENSFALG00000000460	SYF2	93	81.624	ENSCLAG00000008474	SYF2	84	85.784	Chinchilla_lanigera
ENSFALG00000000460	SYF2	92	81.223	ENSCSAG00000000948	SYF2	84	84.314	Chlorocebus_sabaeus
ENSFALG00000000460	SYF2	65	66.875	ENSCHOG00000005273	-	79	76.744	Choloepus_hoffmanni
ENSFALG00000000460	SYF2	90	86.222	ENSCPBG00000025073	SYF2	82	88.235	Chrysemys_picta_bellii
ENSFALG00000000460	SYF2	86	52.804	ENSCING00000003017	-	86	53.883	Ciona_intestinalis
ENSFALG00000000460	SYF2	86	51.869	ENSCSAVG00000006627	-	94	52.427	Ciona_savignyi
ENSFALG00000000460	SYF2	93	71.552	ENSCANG00000037322	SYF2	81	73.529	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFALG00000000460	SYF2	96	79.832	ENSCGRG00001020733	Syf2	84	84.804	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFALG00000000460	SYF2	79	85.641	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	85.354	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFALG00000000460	SYF2	89	75.688	ENSCSEG00000000117	syf2	85	76.471	Cynoglossus_semilaevis
ENSFALG00000000460	SYF2	89	79.091	ENSCVAG00000019543	syf2	85	79.902	Cyprinodon_variegatus
ENSFALG00000000460	SYF2	93	80.263	ENSDARG00000004706	syf2	86	82.353	Danio_rerio
ENSFALG00000000460	SYF2	93	80.870	ENSDNOG00000047605	SYF2	83	83.824	Dasypus_novemcinctus
ENSFALG00000000460	SYF2	92	82.969	ENSDORG00000001274	Syf2	84	85.784	Dipodomys_ordii
ENSFALG00000000460	SYF2	89	55.204	FBgn0033556	CG12343	91	57.282	Drosophila_melanogaster
ENSFALG00000000460	SYF2	83	70.098	ENSETEG00000015729	SYF2	83	70.000	Echinops_telfairi
ENSFALG00000000460	SYF2	80	60.914	ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.914	Eptatretus_burgeri
ENSFALG00000000460	SYF2	92	74.348	ENSEASG00005004232	-	84	75.980	Equus_asinus_asinus
ENSFALG00000000460	SYF2	92	80.000	ENSEASG00005004224	-	83	86.275	Equus_asinus_asinus
ENSFALG00000000460	SYF2	93	83.043	ENSECAG00000010440	-	85	86.275	Equus_caballus
ENSFALG00000000460	SYF2	91	82.969	ENSECAG00000012023	-	83	85.784	Equus_caballus
ENSFALG00000000460	SYF2	65	69.697	ENSEEUG00000015084	SYF2	78	71.329	Erinaceus_europaeus
ENSFALG00000000460	SYF2	89	81.818	ENSELUG00000003465	syf2	86	82.843	Esox_lucius
ENSFALG00000000460	SYF2	98	79.253	ENSFCAG00000043095	-	83	85.784	Felis_catus
ENSFALG00000000460	SYF2	93	83.550	ENSFCAG00000010324	-	71	86.275	Felis_catus
ENSFALG00000000460	SYF2	96	79.079	ENSFDAG00000008310	SYF2	84	85.784	Fukomys_damarensis
ENSFALG00000000460	SYF2	89	67.123	ENSFHEG00000007238	syf2	91	66.341	Fundulus_heteroclitus
ENSFALG00000000460	SYF2	87	78.605	ENSGMOG00000019138	syf2	91	78.922	Gadus_morhua
ENSFALG00000000460	SYF2	92	91.189	ENSGALG00000013639	SYF2	81	94.118	Gallus_gallus
ENSFALG00000000460	SYF2	92	76.652	ENSGAFG00000019435	syf2	86	78.431	Gambusia_affinis
ENSFALG00000000460	SYF2	87	81.395	ENSGACG00000007305	syf2	85	81.863	Gasterosteus_aculeatus
ENSFALG00000000460	SYF2	90	86.667	ENSGAGG00000010670	SYF2	82	88.725	Gopherus_agassizii
ENSFALG00000000460	SYF2	88	84.722	ENSGGOG00000012796	SYF2	84	85.294	Gorilla_gorilla
ENSFALG00000000460	SYF2	94	76.824	ENSHBUG00000020477	syf2	88	80.882	Haplochromis_burtoni
ENSFALG00000000460	SYF2	93	81.624	ENSHGLG00000014393	SYF2	84	86.275	Heterocephalus_glaber_female
ENSFALG00000000460	SYF2	89	73.394	ENSHGLG00000004304	-	84	74.020	Heterocephalus_glaber_female
ENSFALG00000000460	SYF2	93	81.624	ENSHGLG00100014722	SYF2	84	86.275	Heterocephalus_glaber_male
ENSFALG00000000460	SYF2	89	78.899	ENSHCOG00000012904	syf2	67	79.902	Hippocampus_comes
ENSFALG00000000460	SYF2	90	79.279	ENSIPUG00000019859	syf2	86	80.882	Ictalurus_punctatus
ENSFALG00000000460	SYF2	59	81.379	ENSSTOG00000023984	SYF2	99	81.379	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFALG00000000460	SYF2	87	80.465	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	85.859	Jaculus_jaculus
ENSFALG00000000460	SYF2	96	76.596	ENSKMAG00000013856	syf2	86	80.392	Kryptolebias_marmoratus
ENSFALG00000000460	SYF2	88	81.944	ENSLBEG00000014425	syf2	86	81.863	Labrus_bergylta
ENSFALG00000000460	SYF2	89	81.364	ENSLACG00000012064	SYF2	86	82.353	Latimeria_chalumnae
ENSFALG00000000460	SYF2	91	80.000	ENSLOCG00000002728	syf2	81	82.843	Lepisosteus_oculatus
ENSFALG00000000460	SYF2	99	76.955	ENSLAFG00000023150	-	83	83.824	Loxodonta_africana
ENSFALG00000000460	SYF2	74	58.824	ENSLAFG00000030814	-	97	59.669	Loxodonta_africana
ENSFALG00000000460	SYF2	93	80.172	ENSMFAG00000041831	SYF2	84	84.314	Macaca_fascicularis
ENSFALG00000000460	SYF2	88	83.796	ENSMMUG00000002968	SYF2	84	84.314	Macaca_mulatta
ENSFALG00000000460	SYF2	93	80.172	ENSMNEG00000030180	SYF2	84	84.314	Macaca_nemestrina
ENSFALG00000000460	SYF2	93	80.172	ENSMLEG00000030248	SYF2	84	84.314	Mandrillus_leucophaeus
ENSFALG00000000460	SYF2	88	79.630	ENSMAMG00000010403	syf2	85	79.902	Mastacembelus_armatus
ENSFALG00000000460	SYF2	91	77.155	ENSMZEG00005006429	syf2	86	80.882	Maylandia_zebra
ENSFALG00000000460	SYF2	80	94.949	ENSMGAG00000002019	SYF2	99	94.949	Meleagris_gallopavo
ENSFALG00000000460	SYF2	93	81.116	ENSMAUG00000018974	Syf2	84	84.804	Mesocricetus_auratus
ENSFALG00000000460	SYF2	80	86.364	ENSMICG00000016191	SYF2	99	86.364	Microcebus_murinus
ENSFALG00000000460	SYF2	93	81.116	ENSMOCG00000022938	Syf2	84	84.804	Microtus_ochrogaster
ENSFALG00000000460	SYF2	96	73.640	ENSMMOG00000002396	syf2	85	78.922	Mola_mola
ENSFALG00000000460	SYF2	90	80.702	ENSMODG00000013951	-	90	82.524	Monodelphis_domestica
ENSFALG00000000460	SYF2	89	78.995	ENSMALG00000010706	syf2	85	80.000	Monopterus_albus
ENSFALG00000000460	SYF2	93	81.545	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	84	85.294	Mus_caroli
ENSFALG00000000460	SYF2	93	81.545	ENSMUSG00000028821	Syf2	84	85.294	Mus_musculus
ENSFALG00000000460	SYF2	93	81.545	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	84	85.294	Mus_pahari
ENSFALG00000000460	SYF2	93	81.545	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	84	85.294	Mus_spretus
ENSFALG00000000460	SYF2	98	78.838	ENSMPUG00000015801	-	83	85.294	Mustela_putorius_furo
ENSFALG00000000460	SYF2	88	84.722	ENSMPUG00000015802	-	83	85.294	Mustela_putorius_furo
ENSFALG00000000460	SYF2	92	82.251	ENSMLUG00000001885	SYF2	84	85.294	Myotis_lucifugus
ENSFALG00000000460	SYF2	93	81.466	ENSNGAG00000007912	Syf2	83	85.294	Nannospalax_galili
ENSFALG00000000460	SYF2	99	65.844	ENSNBRG00000010720	syf2	87	73.039	Neolamprologus_brichardi
ENSFALG00000000460	SYF2	88	84.722	ENSNLEG00000035185	SYF2	84	85.294	Nomascus_leucogenys
ENSFALG00000000460	SYF2	96	78.661	ENSOPRG00000012870	SYF2	84	84.314	Ochotona_princeps
ENSFALG00000000460	SYF2	92	81.739	ENSODEG00000017664	-	86	85.784	Octodon_degus
ENSFALG00000000460	SYF2	93	71.795	ENSODEG00000014338	-	84	75.000	Octodon_degus
ENSFALG00000000460	SYF2	89	79.091	ENSONIG00000008213	syf2	86	80.392	Oreochromis_niloticus
ENSFALG00000000460	SYF2	82	87.129	ENSOANG00000009552	SYF2	100	87.129	Ornithorhynchus_anatinus
ENSFALG00000000460	SYF2	88	85.185	ENSOCUG00000013050	SYF2	84	85.784	Oryctolagus_cuniculus
ENSFALG00000000460	SYF2	88	82.870	ENSORLG00000028820	syf2	88	83.333	Oryzias_latipes
ENSFALG00000000460	SYF2	88	82.870	ENSORLG00020018333	syf2	86	83.333	Oryzias_latipes_hni
ENSFALG00000000460	SYF2	94	78.788	ENSORLG00015014665	syf2	86	83.333	Oryzias_latipes_hsok
ENSFALG00000000460	SYF2	89	82.110	ENSOMEG00000013911	syf2	86	82.843	Oryzias_melastigma
ENSFALG00000000460	SYF2	89	84.404	ENSOGAG00000009962	SYF2	84	85.294	Otolemur_garnettii
ENSFALG00000000460	SYF2	98	78.189	ENSOARG00000006348	-	83	84.466	Ovis_aries
ENSFALG00000000460	SYF2	79	60.513	ENSOARG00000006269	-	100	60.513	Ovis_aries
ENSFALG00000000460	SYF2	88	84.722	ENSPPAG00000036579	SYF2	84	85.294	Pan_paniscus
ENSFALG00000000460	SYF2	98	79.253	ENSPPRG00000001651	-	83	85.784	Panthera_pardus
ENSFALG00000000460	SYF2	93	83.550	ENSPPRG00000001638	-	83	86.275	Panthera_pardus
ENSFALG00000000460	SYF2	88	85.648	ENSPTIG00000005711	-	74	86.275	Panthera_tigris_altaica
ENSFALG00000000460	SYF2	98	79.668	ENSPTIG00000007036	-	83	85.784	Panthera_tigris_altaica
ENSFALG00000000460	SYF2	88	84.722	ENSPTRG00000000352	SYF2	84	85.294	Pan_troglodytes
ENSFALG00000000460	SYF2	93	80.172	ENSPANG00000008139	SYF2	84	84.314	Papio_anubis
ENSFALG00000000460	SYF2	88	81.019	ENSPKIG00000008130	syf2	87	80.882	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFALG00000000460	SYF2	98	80.408	ENSPSIG00000011816	SYF2	79	87.745	Pelodiscus_sinensis
ENSFALG00000000460	SYF2	95	74.359	ENSPMGG00000008755	syf2	80	78.922	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFALG00000000460	SYF2	93	80.687	ENSPEMG00000008283	Syf2	84	84.314	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFALG00000000460	SYF2	89	87.273	ENSPCIG00000014235	SYF2	82	88.235	Phascolarctos_cinereus
ENSFALG00000000460	SYF2	92	77.974	ENSPFOG00000004116	syf2	84	79.902	Poecilia_formosa
ENSFALG00000000460	SYF2	94	76.395	ENSPLAG00000006691	syf2	88	79.902	Poecilia_latipinna
ENSFALG00000000460	SYF2	96	73.305	ENSPMEG00000011684	syf2	87	76.471	Poecilia_mexicana
ENSFALG00000000460	SYF2	88	80.093	ENSPREG00000003009	syf2	86	79.902	Poecilia_reticulata
ENSFALG00000000460	SYF2	93	81.034	ENSPPYG00000001713	SYF2	84	85.294	Pongo_abelii
ENSFALG00000000460	SYF2	95	55.882	ENSPCOG00000027011	SYF2	75	71.698	Propithecus_coquereli
ENSFALG00000000460	SYF2	92	73.043	ENSPVAG00000005841	SYF2	83	75.000	Pteropus_vampyrus
ENSFALG00000000460	SYF2	89	79.091	ENSPNYG00000004979	syf2	86	80.882	Pundamilia_nyererei
ENSFALG00000000460	SYF2	91	80.000	ENSPNAG00000015570	syf2	86	81.863	Pygocentrus_nattereri
ENSFALG00000000460	SYF2	93	81.545	ENSRNOG00000060597	Syf2	84	85.294	Rattus_norvegicus
ENSFALG00000000460	SYF2	93	78.879	ENSRBIG00000042970	SYF2	84	81.863	Rhinopithecus_bieti
ENSFALG00000000460	SYF2	93	80.172	ENSRROG00000001347	SYF2	84	84.314	Rhinopithecus_roxellana
ENSFALG00000000460	SYF2	88	84.722	ENSSBOG00000020184	SYF2	84	85.294	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFALG00000000460	SYF2	89	86.364	ENSSHAG00000015630	-	82	87.255	Sarcophilus_harrisii
ENSFALG00000000460	SYF2	83	86.893	ENSSHAG00000007152	-	96	88.384	Sarcophilus_harrisii
ENSFALG00000000460	SYF2	91	79.821	ENSSFOG00015023647	syf2	86	81.373	Scleropages_formosus
ENSFALG00000000460	SYF2	89	78.440	ENSSMAG00000009867	syf2	86	78.922	Scophthalmus_maximus
ENSFALG00000000460	SYF2	89	80.275	ENSSDUG00000013072	syf2	86	80.882	Seriola_dumerili
ENSFALG00000000460	SYF2	89	80.275	ENSSLDG00000012677	syf2	86	80.882	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFALG00000000460	SYF2	92	66.522	ENSSARG00000012889	SYF2	64	85.350	Sorex_araneus
ENSFALG00000000460	SYF2	98	77.459	ENSSPUG00000005251	SYF2	81	84.314	Sphenodon_punctatus
ENSFALG00000000460	SYF2	89	78.899	ENSSPAG00000009626	syf2	86	79.902	Stegastes_partitus
ENSFALG00000000460	SYF2	93	82.174	ENSSSCG00000037481	SYF2	83	85.294	Sus_scrofa
ENSFALG00000000460	SYF2	69	72.674	ENSTGUG00000001126	SYF2	74	69.536	Taeniopygia_guttata
ENSFALG00000000460	SYF2	89	78.182	ENSTRUG00000001499	syf2	82	79.412	Takifugu_rubripes
ENSFALG00000000460	SYF2	89	77.982	ENSTNIG00000016912	syf2	91	78.431	Tetraodon_nigroviridis
ENSFALG00000000460	SYF2	92	60.870	ENSTBEG00000017370	SYF2	81	60.784	Tupaia_belangeri
ENSFALG00000000460	SYF2	88	84.722	ENSTTRG00000003550	SYF2	84	85.294	Tursiops_truncatus
ENSFALG00000000460	SYF2	98	78.423	ENSUAMG00000002897	SYF2	83	84.804	Ursus_americanus
ENSFALG00000000460	SYF2	88	84.259	ENSUMAG00000013108	SYF2	83	84.804	Ursus_maritimus
ENSFALG00000000460	SYF2	99	79.508	ENSVPAG00000005705	SYF2	84	85.784	Vicugna_pacos
ENSFALG00000000460	SYF2	83	84.390	ENSVVUG00000027181	-	82	84.314	Vulpes_vulpes
ENSFALG00000000460	SYF2	88	84.722	ENSVVUG00000027175	-	83	85.294	Vulpes_vulpes
ENSFALG00000000460	SYF2	98	75.000	ENSXETG00000022797	syf2	82	82.353	Xenopus_tropicalis
ENSFALG00000000460	SYF2	87	80.000	ENSXMAG00000022698	syf2	86	79.902	Xiphophorus_maculatus