EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFALG00000000790 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: AGO1
Alias: EIF2C1|hAGO1
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Ficedula_albicollis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 33599 bases
Position: chrJH603214.1:3000217-3033815
Accession: 3262
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFALP00000000819	PAZ	PF02170.22	2.4e-28	1	1
ENSFALP00000000819	Piwi	PF02171.17	5.5e-111	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFALT00000000823	AGO1-201	2743	-	ENSFALP00000000819	784 (aa)	-	U3JDG5

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSFALG00000000790	AGO1	100	83.879	ENSFALG00000000802	AGO3	92	83.879
ENSFALG00000000790	AGO1	100	83.057	ENSFALG00000002838	AGO2	91	83.057

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSG00000092847	AGO1	100	92.219	Homo_sapiens
ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.816	ENSAPOG00000024299	ago1	97	93.831	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSAMEG00000000504	AGO1	91	92.219	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFALG00000000790	AGO1	88	89.826	ENSACIG00000005298	ago1	95	89.826	Amphilophus_citrinellus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.816	ENSAOCG00000017727	ago1	91	90.816	Amphiprion_ocellaris
ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.816	ENSAPEG00000004458	ago1	92	90.816	Amphiprion_percula
ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.816	ENSATEG00000008523	ago1	91	90.816	Anabas_testudineus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	85.551	ENSAPLG00000010440	AGO1	90	85.551	Anas_platyrhynchos
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSACAG00000029174	AGO1	100	92.219	Anolis_carolinensis
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSANAG00000037711	AGO1	91	92.219	Aotus_nancymaae
ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.689	ENSACLG00000000890	ago1	100	87.929	Astatotilapia_calliptera
ENSFALG00000000790	AGO1	90	93.324	ENSAMXG00000001917	ago1	99	93.324	Astyanax_mexicanus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.092	ENSBTAG00000012253	AGO1	91	92.092	Bos_taurus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSCJAG00000032023	AGO1	91	92.219	Callithrix_jacchus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSCAFG00000003443	AGO1	91	92.219	Canis_familiaris
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSCAFG00020009251	AGO1	91	99.683	Canis_lupus_dingo
ENSFALG00000000790	AGO1	100	91.837	ENSCHIG00000011848	-	92	91.001	Capra_hircus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSTSYG00000009767	-	92	92.219	Carlito_syrichta
ENSFALG00000000790	AGO1	100	72.959	ENSTSYG00000032426	-	99	75.783	Carlito_syrichta
ENSFALG00000000790	AGO1	80	92.537	ENSCAPG00000010228	AGO1	89	92.537	Cavia_aperea
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSCPOG00000011568	AGO1	91	92.219	Cavia_porcellus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSCCAG00000011823	AGO1	91	92.219	Cebus_capucinus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSCATG00000031521	AGO1	100	92.219	Cercocebus_atys
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSCLAG00000011507	AGO1	92	92.219	Chinchilla_lanigera
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSCSAG00000001091	AGO1	91	92.219	Chlorocebus_sabaeus
ENSFALG00000000790	AGO1	85	94.574	ENSCHOG00000011591	AGO1	78	94.574	Choloepus_hoffmanni
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSCPBG00000018594	AGO1	91	92.219	Chrysemys_picta_bellii
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSCANG00000039798	AGO1	91	92.219	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSCGRG00001022708	Ago1	91	92.219	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSCGRG00000010386	Ago1	92	92.219	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFALG00000000790	AGO1	100	89.111	ENSCSEG00000001051	ago1	92	89.111	Cynoglossus_semilaevis
ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.816	ENSCVAG00000018173	ago1	91	90.816	Cyprinodon_variegatus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.689	ENSDARG00000092644	ago1	91	90.689	Danio_rerio
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	92.219	Dasypus_novemcinctus
ENSFALG00000000790	AGO1	90	100.000	ENSDORG00000008494	Ago1	90	100.000	Dipodomys_ordii
ENSFALG00000000790	AGO1	83	83.488	ENSETEG00000007626	AGO1	90	83.488	Echinops_telfairi
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSEASG00005012086	AGO1	91	92.219	Equus_asinus_asinus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSECAG00000024353	AGO1	91	92.219	Equus_caballus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	83.801	ENSEEUG00000005349	AGO1	91	83.801	Erinaceus_europaeus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.689	ENSELUG00000016803	ago1	100	90.689	Esox_lucius
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSFCAG00000000746	AGO1	91	92.219	Felis_catus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSFDAG00000017210	AGO1	91	92.219	Fukomys_damarensis
ENSFALG00000000790	AGO1	96	92.000	ENSFHEG00000017927	ago1	90	92.000	Fundulus_heteroclitus
ENSFALG00000000790	AGO1	96	79.494	ENSGMOG00000019413	ago1	100	79.494	Gadus_morhua
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSGALG00000002249	AGO1	91	92.219	Gallus_gallus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.816	ENSGAFG00000009775	ago1	91	90.816	Gambusia_affinis
ENSFALG00000000790	AGO1	96	91.501	ENSGACG00000012443	ago1	100	91.501	Gasterosteus_aculeatus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSGAGG00000012893	-	100	92.219	Gopherus_agassizii
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSGGOG00000003316	AGO1	91	92.219	Gorilla_gorilla
ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.689	ENSHBUG00000010459	ago1	100	87.929	Haplochromis_burtoni
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSHGLG00000011540	AGO1	91	92.219	Heterocephalus_glaber_female
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSHGLG00100005568	AGO1	91	92.219	Heterocephalus_glaber_male
ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.816	ENSHCOG00000005708	ago1	92	90.816	Hippocampus_comes
ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.816	ENSIPUG00000023216	ago1	100	86.879	Ictalurus_punctatus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSSTOG00000010857	AGO1	91	92.219	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSJJAG00000019449	Ago1	91	92.219	Jaculus_jaculus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.816	ENSKMAG00000019464	ago1	91	90.816	Kryptolebias_marmoratus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.816	ENSLBEG00000007694	ago1	97	90.131	Labrus_bergylta
ENSFALG00000000790	AGO1	100	86.005	ENSLACG00000017009	AGO1	92	86.005	Latimeria_chalumnae
ENSFALG00000000790	AGO1	100	88.010	ENSLOCG00000000504	AGO1	91	88.010	Lepisosteus_oculatus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSLAFG00000010835	AGO1	92	92.219	Loxodonta_africana
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSMFAG00000002846	AGO1	91	92.219	Macaca_fascicularis
ENSFALG00000000790	AGO1	100	87.500	ENSMMUG00000006251	AGO1	93	87.372	Macaca_mulatta
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	92.219	Macaca_nemestrina
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSMLEG00000038388	AGO1	91	92.219	Mandrillus_leucophaeus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.816	ENSMAMG00000008381	ago1	99	91.594	Mastacembelus_armatus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.689	ENSMZEG00005007996	ago1	100	87.929	Maylandia_zebra
ENSFALG00000000790	AGO1	100	86.726	ENSMGAG00000003822	AGO1	92	86.726	Meleagris_gallopavo
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSMAUG00000015189	Ago1	91	92.219	Mesocricetus_auratus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSMICG00000016147	AGO1	91	92.219	Microcebus_murinus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.092	ENSMOCG00000000537	Ago1	91	92.092	Microtus_ochrogaster
ENSFALG00000000790	AGO1	85	94.918	ENSMMOG00000018459	ago1	93	94.918	Mola_mola
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSMODG00000023335	AGO1	91	92.219	Monodelphis_domestica
ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.689	ENSMALG00000011057	ago1	93	90.561	Monopterus_albus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	96.396	Mus_caroli
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	96.396	Mus_musculus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	96.396	Mus_pahari
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	96.396	Mus_spretus
ENSFALG00000000790	AGO1	92	94.444	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	94.444	Mustela_putorius_furo
ENSFALG00000000790	AGO1	58	86.214	ENSMLUG00000009628	AGO1	87	86.214	Myotis_lucifugus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSNGAG00000017448	Ago1	92	92.219	Nannospalax_galili
ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.689	ENSNBRG00000010867	ago1	100	90.689	Neolamprologus_brichardi
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSNLEG00000011181	AGO1	91	92.219	Nomascus_leucogenys
ENSFALG00000000790	AGO1	91	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSFALG00000000790	AGO1	92	100.000	ENSOPRG00000012325	AGO1	84	100.000	Ochotona_princeps
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSODEG00000005321	AGO1	91	92.219	Octodon_degus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.689	ENSONIG00000016345	ago1	92	90.689	Oreochromis_niloticus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	83.627	ENSOANG00000002080	AGO1	91	84.625	Ornithorhynchus_anatinus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.092	ENSOCUG00000023116	AGO1	91	92.092	Oryctolagus_cuniculus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.816	ENSORLG00000014965	ago1	91	90.816	Oryzias_latipes
ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.816	ENSORLG00020018253	ago1	91	90.816	Oryzias_latipes_hni
ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.816	ENSORLG00015003287	ago1	91	90.816	Oryzias_latipes_hsok
ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.816	ENSOMEG00000020528	ago1	91	90.816	Oryzias_melastigma
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSOGAG00000010279	AGO1	91	92.219	Otolemur_garnettii
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.092	ENSOARG00000019591	AGO1	91	92.092	Ovis_aries
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSPPAG00000034838	AGO1	91	92.219	Pan_paniscus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSPPRG00000006475	AGO1	91	92.219	Panthera_pardus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	91.964	ENSPTIG00000020991	AGO1	91	91.964	Panthera_tigris_altaica
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSPTRG00000000528	AGO1	91	92.219	Pan_troglodytes
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSPANG00000009060	AGO1	91	92.219	Papio_anubis
ENSFALG00000000790	AGO1	100	91.349	ENSPSIG00000017482	AGO1	93	91.349	Pelodiscus_sinensis
ENSFALG00000000790	AGO1	88	93.478	ENSPMGG00000024099	ago1	98	93.478	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSPEMG00000023313	Ago1	91	92.219	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSPCIG00000000172	AGO1	91	92.219	Phascolarctos_cinereus
ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.816	ENSPFOG00000005867	ago1	91	90.816	Poecilia_formosa
ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.816	ENSPLAG00000002824	ago1	99	94.501	Poecilia_latipinna
ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.816	ENSPMEG00000001787	ago1	99	94.501	Poecilia_mexicana
ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.816	ENSPREG00000006534	ago1	91	90.816	Poecilia_reticulata
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSPPYG00000001551	AGO1	91	92.219	Pongo_abelii
ENSFALG00000000790	AGO1	53	100.000	ENSPCAG00000005604	AGO1	55	100.000	Procavia_capensis
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSPCOG00000022061	AGO1	100	92.219	Propithecus_coquereli
ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	ENSPVAG00000005082	AGO1	91	92.219	Pteropus_vampyrus
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