EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFALG00000004441 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: XPO6
Alias: FLJ22519|KIAA0370|RANBP20
Full Name: exportin 6
Gene Type: protein_coding
Species: Ficedula_albicollis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 45217 bases
Position: chrJH603203.1:7275037-7320253
Accession: 101820557
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFALP00000004621	Xpo1	PF08389.12	9.3e-24	1	1
ENSFALP00000004621	IBN_N	PF03810.19	2.7e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFALT00000004645	XPO6-201	3976	XM_005054182	ENSFALP00000004621	1153 (aa)	XP_005054239	U3JPB7

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFALG00000004441	XPO6	98	92.226	ENSG00000169180	XPO6	100	100.000	Homo_sapiens
ENSFALG00000004441	XPO6	98	77.411	ENSAPOG00000012873	xpo6	99	77.411	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.784	ENSAMEG00000011014	XPO6	100	91.784	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFALG00000004441	XPO6	98	78.053	ENSACIG00000008055	xpo6	99	77.601	Amphilophus_citrinellus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	78.395	ENSAOCG00000001326	xpo6	99	78.395	Amphiprion_ocellaris
ENSFALG00000004441	XPO6	98	78.307	ENSAPEG00000016304	xpo6	99	78.307	Amphiprion_percula
ENSFALG00000004441	XPO6	98	78.023	ENSATEG00000002273	xpo6	99	77.748	Anabas_testudineus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	96.558	ENSAPLG00000007480	XPO6	100	96.558	Anas_platyrhynchos
ENSFALG00000004441	XPO6	98	78.888	ENSACAG00000016883	XPO6	99	79.389	Anolis_carolinensis
ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.961	ENSANAG00000031761	XPO6	99	91.873	Aotus_nancymaae
ENSFALG00000004441	XPO6	98	78.053	ENSACLG00000007048	xpo6	99	78.053	Astatotilapia_calliptera
ENSFALG00000004441	XPO6	98	73.275	ENSAMXG00000032539	xpo6	99	73.037	Astyanax_mexicanus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.784	ENSBTAG00000010309	XPO6	99	91.784	Bos_taurus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.961	ENSCJAG00000006014	XPO6	99	91.873	Callithrix_jacchus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	92.049	ENSCAFG00000017356	XPO6	100	92.049	Canis_familiaris
ENSFALG00000004441	XPO6	98	92.138	ENSCAFG00020011808	XPO6	100	91.879	Canis_lupus_dingo
ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.961	ENSCHIG00000022341	XPO6	99	91.961	Capra_hircus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	88.751	ENSTSYG00000012249	XPO6	100	88.751	Carlito_syrichta
ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.696	ENSCPOG00000012824	XPO6	99	91.696	Cavia_porcellus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.873	ENSCCAG00000036360	XPO6	99	91.784	Cebus_capucinus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	92.403	ENSCATG00000034030	XPO6	99	92.314	Cercocebus_atys
ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.961	ENSCLAG00000012270	XPO6	100	91.961	Chinchilla_lanigera
ENSFALG00000004441	XPO6	90	90.863	ENSCHOG00000004369	XPO6	91	90.863	Choloepus_hoffmanni
ENSFALG00000004441	XPO6	87	94.533	ENSCPBG00000024660	XPO6	99	97.059	Chrysemys_picta_bellii
ENSFALG00000004441	XPO6	98	46.823	ENSCING00000006884	-	99	46.870	Ciona_intestinalis
ENSFALG00000004441	XPO6	98	45.941	ENSCSAVG00000000850	-	100	45.941	Ciona_savignyi
ENSFALG00000004441	XPO6	98	92.226	ENSCANG00000041578	XPO6	99	92.138	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.696	ENSCGRG00001013173	Xpo6	99	91.696	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFALG00000004441	XPO6	98	77.140	ENSCSEG00000013622	xpo6	99	77.140	Cynoglossus_semilaevis
ENSFALG00000004441	XPO6	98	76.460	ENSCVAG00000017399	xpo6	100	77.143	Cyprinodon_variegatus
ENSFALG00000004441	XPO6	95	72.801	ENSDARG00000041217	xpo6	99	72.108	Danio_rerio
ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.784	ENSDNOG00000012449	XPO6	99	91.784	Dasypus_novemcinctus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.961	ENSDORG00000000919	Xpo6	99	91.961	Dipodomys_ordii
ENSFALG00000004441	XPO6	81	92.278	ENSETEG00000018768	XPO6	85	92.278	Echinops_telfairi
ENSFALG00000004441	XPO6	98	61.775	ENSEBUG00000015560	xpo6	99	61.796	Eptatretus_burgeri
ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.784	ENSEASG00005017296	XPO6	99	91.784	Equus_asinus_asinus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.696	ENSECAG00000008601	XPO6	99	91.696	Equus_caballus
ENSFALG00000004441	XPO6	95	85.623	ENSEEUG00000014587	XPO6	100	85.623	Erinaceus_europaeus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	80.496	ENSELUG00000009159	xpo6	99	80.142	Esox_lucius
ENSFALG00000004441	XPO6	98	92.138	ENSFCAG00000010309	XPO6	99	92.138	Felis_catus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.784	ENSFDAG00000012689	XPO6	100	91.784	Fukomys_damarensis
ENSFALG00000004441	XPO6	98	76.984	ENSFHEG00000021190	xpo6	99	76.808	Fundulus_heteroclitus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	96.731	ENSGALG00000035360	XPO6	99	96.731	Gallus_gallus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	76.112	ENSGAFG00000004044	xpo6	99	75.850	Gambusia_affinis
ENSFALG00000004441	XPO6	93	95.345	ENSGAGG00000022738	XPO6	100	95.345	Gopherus_agassizii
ENSFALG00000004441	XPO6	98	92.138	ENSGGOG00000005609	XPO6	99	92.049	Gorilla_gorilla
ENSFALG00000004441	XPO6	98	77.324	ENSHBUG00000019504	xpo6	99	77.150	Haplochromis_burtoni
ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.431	ENSHGLG00000009679	-	99	91.431	Heterocephalus_glaber_female
ENSFALG00000004441	XPO6	92	74.448	ENSHGLG00000003865	-	99	75.079	Heterocephalus_glaber_female
ENSFALG00000004441	XPO6	92	77.918	ENSHGLG00100001081	-	99	77.918	Heterocephalus_glaber_male
ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.431	ENSHGLG00100003673	-	99	91.431	Heterocephalus_glaber_male
ENSFALG00000004441	XPO6	98	76.286	ENSHCOG00000004987	xpo6	99	76.286	Hippocampus_comes
ENSFALG00000004441	XPO6	98	72.680	ENSIPUG00000006516	xpo6	99	72.680	Ictalurus_punctatus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	92.403	ENSSTOG00000012161	XPO6	99	92.403	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.254	ENSJJAG00000019392	Xpo6	99	91.254	Jaculus_jaculus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	76.923	ENSKMAG00000010403	xpo6	99	76.923	Kryptolebias_marmoratus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	77.237	ENSLBEG00000023039	xpo6	99	77.966	Labrus_bergylta
ENSFALG00000004441	XPO6	98	86.926	ENSLACG00000017930	XPO6	99	86.484	Latimeria_chalumnae
ENSFALG00000004441	XPO6	92	83.380	ENSLOCG00000003304	xpo6	100	83.100	Lepisosteus_oculatus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.696	ENSLAFG00000011960	XPO6	100	91.696	Loxodonta_africana
ENSFALG00000004441	XPO6	98	92.403	ENSMFAG00000045067	XPO6	99	92.314	Macaca_fascicularis
ENSFALG00000004441	XPO6	98	92.403	ENSMMUG00000018623	XPO6	99	92.314	Macaca_mulatta
ENSFALG00000004441	XPO6	98	92.403	ENSMNEG00000028587	XPO6	99	92.314	Macaca_nemestrina
ENSFALG00000004441	XPO6	98	92.403	ENSMLEG00000029685	XPO6	99	92.314	Mandrillus_leucophaeus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	77.063	ENSMAMG00000001351	xpo6	100	77.738	Mastacembelus_armatus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	78.142	ENSMZEG00005010620	xpo6	99	78.142	Maylandia_zebra
ENSFALG00000004441	XPO6	96	96.018	ENSMGAG00000009566	XPO6	100	96.018	Meleagris_gallopavo
ENSFALG00000004441	XPO6	98	81.770	ENSMAUG00000012539	Xpo6	100	80.885	Mesocricetus_auratus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	92.491	ENSMICG00000001923	XPO6	99	92.491	Microcebus_murinus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.784	ENSMOCG00000008015	Xpo6	99	91.784	Microtus_ochrogaster
ENSFALG00000004441	XPO6	98	77.405	ENSMMOG00000011992	xpo6	99	77.493	Mola_mola
ENSFALG00000004441	XPO6	98	94.081	ENSMODG00000015516	XPO6	99	94.081	Monodelphis_domestica
ENSFALG00000004441	XPO6	98	71.555	ENSMALG00000020612	xpo6	99	71.378	Monopterus_albus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	92.049	MGP_CAROLIEiJ_G0030439	Xpo6	99	92.049	Mus_caroli
ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.961	ENSMUSG00000000131	Xpo6	99	91.961	Mus_musculus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	92.138	MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	92.138	Mus_pahari
ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.784	MGP_SPRETEiJ_G0031553	Xpo6	99	91.784	Mus_spretus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.534	ENSMPUG00000012920	XPO6	98	91.534	Mustela_putorius_furo
ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.343	ENSMLUG00000012970	XPO6	100	91.343	Myotis_lucifugus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	92.138	ENSNGAG00000012740	Xpo6	99	92.138	Nannospalax_galili
ENSFALG00000004441	XPO6	98	77.324	ENSNBRG00000007275	xpo6	99	77.150	Neolamprologus_brichardi
ENSFALG00000004441	XPO6	98	92.226	ENSNLEG00000011518	XPO6	99	92.138	Nomascus_leucogenys
ENSFALG00000004441	XPO6	85	89.873	ENSOPRG00000009278	XPO6	87	88.354	Ochotona_princeps
ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.343	ENSODEG00000012917	XPO6	99	91.343	Octodon_degus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	77.237	ENSONIG00000019366	xpo6	99	76.977	Oreochromis_niloticus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.873	ENSOCUG00000002727	XPO6	100	91.873	Oryctolagus_cuniculus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	76.849	ENSORLG00000011231	xpo6	100	76.144	Oryzias_latipes
ENSFALG00000004441	XPO6	98	77.699	ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.699	Oryzias_latipes_hni
ENSFALG00000004441	XPO6	98	76.762	ENSORLG00015003636	xpo6	99	76.588	Oryzias_latipes_hsok
ENSFALG00000004441	XPO6	98	76.849	ENSOMEG00000016505	xpo6	100	75.659	Oryzias_melastigma
ENSFALG00000004441	XPO6	98	92.580	ENSOGAG00000012844	XPO6	100	92.580	Otolemur_garnettii
ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.961	ENSOARG00000000960	XPO6	100	91.961	Ovis_aries
ENSFALG00000004441	XPO6	98	92.138	ENSPPAG00000033668	XPO6	99	92.049	Pan_paniscus
ENSFALG00000004441	XPO6	97	92.136	ENSPPRG00000001454	XPO6	100	92.136	Panthera_pardus
ENSFALG00000004441	XPO6	95	91.408	ENSPTIG00000016663	XPO6	99	91.408	Panthera_tigris_altaica
ENSFALG00000004441	XPO6	98	92.138	ENSPTRG00000007919	XPO6	99	92.049	Pan_troglodytes
ENSFALG00000004441	XPO6	98	92.403	ENSPANG00000017103	XPO6	99	92.314	Papio_anubis
ENSFALG00000004441	XPO6	98	80.759	ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.475	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFALG00000004441	XPO6	97	92.857	ENSPSIG00000018225	XPO6	100	92.857	Pelodiscus_sinensis
ENSFALG00000004441	XPO6	97	77.748	ENSPMGG00000014436	xpo6	100	77.748	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.608	ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	91.608	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFALG00000004441	XPO6	98	72.242	ENSPMAG00000003127	xpo6	100	72.242	Petromyzon_marinus
ENSFALG00000004441	XPO6	95	93.540	ENSPCIG00000003863	XPO6	100	93.476	Phascolarctos_cinereus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	76.481	ENSPFOG00000008763	xpo6	99	76.220	Poecilia_formosa
ENSFALG00000004441	XPO6	98	76.460	ENSPLAG00000014054	xpo6	99	76.199	Poecilia_latipinna
ENSFALG00000004441	XPO6	98	76.373	ENSPMEG00000018994	xpo6	99	76.112	Poecilia_mexicana
ENSFALG00000004441	XPO6	96	76.186	ENSPREG00000016421	xpo6	96	75.918	Poecilia_reticulata
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ENSFALG00000004441	XPO6	88	95.058	ENSPCAG00000008918	XPO6	90	95.058	Procavia_capensis
ENSFALG00000004441	XPO6	98	92.491	ENSPCOG00000017886	XPO6	99	92.491	Propithecus_coquereli
ENSFALG00000004441	XPO6	79	98.529	ENSPVAG00000012234	XPO6	80	98.529	Pteropus_vampyrus
ENSFALG00000004441	XPO6	98	78.199	ENSPNYG00000008375	xpo6	99	78.269	Pundamilia_nyererei
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