EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFALG00000004559 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: PELO
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Ficedula_albicollis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2473 bases
Position: chrAGTO01002132.1:103815-106287
Accession: 101811174
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFALP00000004742	eRF1_2	PF03464.15	5.6e-37	1	1
ENSFALP00000004742	eRF1_3	PF03465.15	2.8e-26	1	1
ENSFALP00000004742	eRF1_1	PF03463.15	5.6e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFALT00000004766	PELO-201	1503	-	ENSFALP00000004742	385 (aa)	XP_005061762	U3JPN8

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.026	ENSG00000152684	PELO	100	94.026	Homo_sapiens
ENSFALG00000004559	PELO	64	80.567	ENSAPOG00000023700	-	90	80.567	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFALG00000004559	PELO	64	80.567	ENSAPOG00000000616	pelo	90	80.567	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFALG00000004559	PELO	100	80.260	ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFALG00000004559	PELO	100	95.065	ENSAMEG00000007734	PELO	100	95.065	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFALG00000004559	PELO	97	75.871	ENSACIG00000014386	pelo	97	80.473	Amphilophus_citrinellus
ENSFALG00000004559	PELO	100	80.519	ENSAOCG00000023717	pelo	100	80.519	Amphiprion_ocellaris
ENSFALG00000004559	PELO	100	80.519	ENSAPEG00000011235	pelo	100	80.519	Amphiprion_percula
ENSFALG00000004559	PELO	100	80.779	ENSATEG00000019550	pelo	100	80.779	Anabas_testudineus
ENSFALG00000004559	PELO	77	89.597	ENSAPLG00000013265	PELO	100	89.597	Anas_platyrhynchos
ENSFALG00000004559	PELO	98	92.553	ENSACAG00000004352	PELO	100	92.468	Anolis_carolinensis
ENSFALG00000004559	PELO	100	95.065	ENSANAG00000014096	PELO	100	95.065	Aotus_nancymaae
ENSFALG00000004559	PELO	100	80.000	ENSACLG00000010305	pelo	100	80.000	Astatotilapia_calliptera
ENSFALG00000004559	PELO	97	81.501	ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.570	Astyanax_mexicanus
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.286	ENSBTAG00000003268	PELO	99	94.286	Bos_taurus
ENSFALG00000004559	PELO	98	59.309	WBGene00011280	pelo-1	99	59.309	Caenorhabditis_elegans
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.805	ENSCJAG00000035190	PELO	100	94.805	Callithrix_jacchus
ENSFALG00000004559	PELO	100	95.325	ENSCAFG00020023234	PELO	100	95.325	Canis_lupus_dingo
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.026	ENSCHIG00000016410	PELO	99	94.026	Capra_hircus
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.286	ENSTSYG00000005203	PELO	100	94.286	Carlito_syrichta
ENSFALG00000004559	PELO	100	95.065	ENSCPOG00000027406	PELO	100	95.065	Cavia_porcellus
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.805	ENSCCAG00000035600	PELO	100	94.805	Cebus_capucinus
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.545	ENSCATG00000011829	PELO	100	94.545	Cercocebus_atys
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.545	ENSCLAG00000005043	PELO	100	94.545	Chinchilla_lanigera
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.545	ENSCSAG00000016692	PELO	100	94.545	Chlorocebus_sabaeus
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.026	ENSCHOG00000000523	PELO	100	94.026	Choloepus_hoffmanni
ENSFALG00000004559	PELO	100	96.623	ENSCPBG00000007544	PELO	100	96.623	Chrysemys_picta_bellii
ENSFALG00000004559	PELO	96	68.919	ENSCING00000001979	-	100	68.831	Ciona_intestinalis
ENSFALG00000004559	PELO	100	69.610	ENSCSAVG00000006158	-	100	69.610	Ciona_savignyi
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.545	ENSCANG00000023382	PELO	100	94.545	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFALG00000004559	PELO	97	93.298	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	92.987	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFALG00000004559	PELO	97	94.638	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	94.286	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFALG00000004559	PELO	100	79.740	ENSCSEG00000008807	pelo	100	79.740	Cynoglossus_semilaevis
ENSFALG00000004559	PELO	100	82.078	ENSCVAG00000016082	pelo	100	82.078	Cyprinodon_variegatus
ENSFALG00000004559	PELO	100	82.338	ENSDARG00000055477	pelo	100	82.338	Danio_rerio
ENSFALG00000004559	PELO	100	91.710	ENSDNOG00000036721	PELO	100	91.710	Dasypus_novemcinctus
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.805	ENSDORG00000016689	Pelo	100	94.805	Dipodomys_ordii
ENSFALG00000004559	PELO	96	67.568	FBgn0011207	pelo	96	67.018	Drosophila_melanogaster
ENSFALG00000004559	PELO	71	80.117	ENSEBUG00000004955	pelo	99	80.117	Eptatretus_burgeri
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.805	ENSEASG00005013348	PELO	100	94.805	Equus_asinus_asinus
ENSFALG00000004559	PELO	100	80.779	ENSELUG00000023229	pelo	100	80.779	Esox_lucius
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.805	ENSFCAG00000032341	PELO	100	94.805	Felis_catus
ENSFALG00000004559	PELO	74	95.070	ENSFDAG00000002076	PELO	88	95.070	Fukomys_damarensis
ENSFALG00000004559	PELO	100	80.779	ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.779	Fundulus_heteroclitus
ENSFALG00000004559	PELO	98	79.841	ENSGMOG00000005849	pelo	100	79.481	Gadus_morhua
ENSFALG00000004559	PELO	100	81.299	ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.299	Gambusia_affinis
ENSFALG00000004559	PELO	100	80.260	ENSGACG00000007245	pelo	100	80.260	Gasterosteus_aculeatus
ENSFALG00000004559	PELO	100	96.883	ENSGAGG00000004018	PELO	100	96.883	Gopherus_agassizii
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.545	ENSGGOG00000012635	PELO	100	94.545	Gorilla_gorilla
ENSFALG00000004559	PELO	100	80.000	ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.000	Haplochromis_burtoni
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.286	ENSHGLG00000005932	PELO	100	94.286	Heterocephalus_glaber_female
ENSFALG00000004559	PELO	100	91.948	ENSHGLG00100017627	PELO	100	91.948	Heterocephalus_glaber_male
ENSFALG00000004559	PELO	100	78.182	ENSHCOG00000016782	pelo	100	78.182	Hippocampus_comes
ENSFALG00000004559	PELO	100	79.740	ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.740	Ictalurus_punctatus
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.805	ENSSTOG00000027378	PELO	100	94.805	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFALG00000004559	PELO	100	92.468	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	92.468	Jaculus_jaculus
ENSFALG00000004559	PELO	100	81.558	ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.558	Kryptolebias_marmoratus
ENSFALG00000004559	PELO	99	80.469	ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.469	Labrus_bergylta
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.026	ENSLAFG00000020551	PELO	100	94.026	Loxodonta_africana
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.545	ENSMFAG00000000651	PELO	100	94.545	Macaca_fascicularis
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.545	ENSMMUG00000039101	PELO	100	94.545	Macaca_mulatta
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.545	ENSMNEG00000035538	PELO	100	94.545	Macaca_nemestrina
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.545	ENSMLEG00000039113	PELO	100	94.545	Mandrillus_leucophaeus
ENSFALG00000004559	PELO	97	82.842	ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.338	Mastacembelus_armatus
ENSFALG00000004559	PELO	100	80.000	ENSMZEG00005014258	pelo	100	80.000	Maylandia_zebra
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.286	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	94.286	Mesocricetus_auratus
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.286	ENSMICG00000044040	PELO	100	94.286	Microcebus_murinus
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.545	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	94.545	Microtus_ochrogaster
ENSFALG00000004559	PELO	100	78.701	ENSMMOG00000001324	pelo	100	78.701	Mola_mola
ENSFALG00000004559	PELO	100	80.519	ENSMALG00000008194	pelo	100	80.519	Monopterus_albus
ENSFALG00000004559	PELO	100	95.065	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	95.065	Mus_caroli
ENSFALG00000004559	PELO	100	95.065	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	95.065	Mus_musculus
ENSFALG00000004559	PELO	100	95.325	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	95.325	Mus_pahari
ENSFALG00000004559	PELO	100	95.065	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	95.065	Mus_spretus
ENSFALG00000004559	PELO	100	92.208	ENSMLUG00000024132	PELO	100	92.208	Myotis_lucifugus
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.545	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	94.545	Nannospalax_galili
ENSFALG00000004559	PELO	100	80.000	ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.000	Neolamprologus_brichardi
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.545	ENSNLEG00000035970	PELO	100	94.545	Nomascus_leucogenys
ENSFALG00000004559	PELO	100	93.506	ENSMEUG00000005468	PELO	100	93.506	Notamacropus_eugenii
ENSFALG00000004559	PELO	98	93.140	ENSOPRG00000018793	PELO	100	93.140	Ochotona_princeps
ENSFALG00000004559	PELO	100	95.065	ENSODEG00000017579	PELO	100	95.065	Octodon_degus
ENSFALG00000004559	PELO	96	80.054	ENSONIG00000011511	pelo	100	79.740	Oreochromis_niloticus
ENSFALG00000004559	PELO	100	95.065	ENSOCUG00000023902	PELO	100	95.065	Oryctolagus_cuniculus
ENSFALG00000004559	PELO	100	80.779	ENSORLG00000005827	pelo	100	80.779	Oryzias_latipes
ENSFALG00000004559	PELO	100	81.039	ENSORLG00020016456	pelo	100	81.039	Oryzias_latipes_hni
ENSFALG00000004559	PELO	100	81.299	ENSORLG00015014447	pelo	100	81.389	Oryzias_latipes_hsok
ENSFALG00000004559	PELO	100	83.117	ENSOMEG00000021567	pelo	100	83.117	Oryzias_melastigma
ENSFALG00000004559	PELO	100	95.065	ENSOGAG00000027940	PELO	100	95.065	Otolemur_garnettii
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.286	ENSOARG00000008324	PELO	99	94.286	Ovis_aries
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.545	ENSPPAG00000038951	PELO	100	94.545	Pan_paniscus
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.805	ENSPPRG00000018800	PELO	100	94.805	Panthera_pardus
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.805	ENSPTIG00000019988	PELO	100	94.805	Panthera_tigris_altaica
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.286	ENSPTRG00000034409	PELO	100	94.286	Pan_troglodytes
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.545	ENSPANG00000010902	PELO	100	94.545	Papio_anubis
ENSFALG00000004559	PELO	100	83.636	ENSPKIG00000015190	pelo	100	83.636	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFALG00000004559	PELO	100	96.364	ENSPSIG00000004971	PELO	100	96.364	Pelodiscus_sinensis
ENSFALG00000004559	PELO	67	77.132	ENSPMGG00000014561	pelo	95	77.132	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.286	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	94.286	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.026	ENSPCIG00000004880	PELO	100	94.026	Phascolarctos_cinereus
ENSFALG00000004559	PELO	100	81.818	ENSPFOG00000007277	pelo	100	81.818	Poecilia_formosa
ENSFALG00000004559	PELO	100	82.078	ENSPLAG00000020787	pelo	100	82.078	Poecilia_latipinna
ENSFALG00000004559	PELO	100	81.818	ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.818	Poecilia_mexicana
ENSFALG00000004559	PELO	100	82.078	ENSPREG00000023071	pelo	100	82.078	Poecilia_reticulata
ENSFALG00000004559	PELO	97	94.370	ENSPPYG00000015451	PELO	96	94.286	Pongo_abelii
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.286	ENSPCOG00000021178	PELO	100	94.286	Propithecus_coquereli
ENSFALG00000004559	PELO	100	80.000	ENSPNYG00000017325	pelo	100	80.000	Pundamilia_nyererei
ENSFALG00000004559	PELO	97	82.574	ENSPNAG00000012458	pelo	99	81.558	Pygocentrus_nattereri
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.805	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	94.805	Rattus_norvegicus
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.545	ENSRBIG00000007299	PELO	100	94.545	Rhinopithecus_bieti
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.545	ENSRROG00000035507	PELO	100	94.545	Rhinopithecus_roxellana
ENSFALG00000004559	PELO	99	34.447	YNL001W	-	99	34.447	Saccharomyces_cerevisiae
ENSFALG00000004559	PELO	100	94.545	ENSSBOG00000036140	PELO	100	94.545	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFALG00000004559	PELO	63	93.033	ENSSHAG00000010770	PELO	100	93.033	Sarcophilus_harrisii
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