EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFALG00000005048 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SRPRA
Alias: SR-alpha|SRP-alpha|SRPR|Sralpha
Full Name: SRP receptor subunit alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Ficedula_albicollis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5071 bases
Position: chrJH603225.1:1699410-1704480
Accession: 11307
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFALP00000005247	SRP54	PF00448.22	1.4e-48	1	1
ENSFALP00000005247	SRP54_N	PF02881.19	3.5e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFALT00000005272	SRPRA-201	2439	-	ENSFALP00000005247	635 (aa)	-	U3JR43

Gene Model

Click here to download ENSFALG00000005048's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSFALG00000005048's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.727	ENSG00000182934	SRPRA	99	74.727	Homo_sapiens
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	66.971	ENSAPOG00000017588	srpra	99	67.846	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	75.039	ENSAMEG00000000117	SRPRA	99	74.883	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	66.564	ENSACIG00000021588	srpra	99	66.409	Amphilophus_citrinellus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	67.123	ENSAOCG00000018884	srpra	99	68.000	Amphiprion_ocellaris
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	67.123	ENSAPEG00000022286	srpra	99	64.110	Amphiprion_percula
ENSFALG00000005048	SRPRA	82	89.206	ENSATEG00000023578	srpra	91	89.172	Anabas_testudineus
ENSFALG00000005048	SRPRA	95	95.041	ENSAPLG00000016079	SRPRA	100	95.041	Anas_platyrhynchos
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	84.806	ENSACAG00000000108	SRPRA	99	84.806	Anolis_carolinensis
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.571	ENSANAG00000020346	SRPRA	99	74.571	Aotus_nancymaae
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	68.997	ENSACLG00000000518	srpra	99	70.046	Astatotilapia_calliptera
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	63.027	ENSAMXG00000009975	srpra	99	60.092	Astyanax_mexicanus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.806	ENSBTAG00000014105	SRPRA	99	75.272	Bos_taurus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	47.981	WBGene00009521	F38A1.8	98	48.466	Caenorhabditis_elegans
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.688	ENSCJAG00000008752	SRPRA	99	74.688	Callithrix_jacchus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	75.195	ENSCAFG00000010474	SRPRA	99	75.039	Canis_familiaris
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.883	ENSCAFG00020010608	SRPRA	99	74.727	Canis_lupus_dingo
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	75.894	ENSCHIG00000012423	SRPRA	99	75.117	Capra_hircus
ENSFALG00000005048	SRPRA	79	88.701	ENSTSYG00000005187	SRPRA	95	88.701	Carlito_syrichta
ENSFALG00000005048	SRPRA	95	75.993	ENSCAPG00000007098	SRPRA	91	93.233	Cavia_aperea
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.688	ENSCPOG00000014976	SRPRA	91	93.233	Cavia_porcellus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.922	ENSCCAG00000025602	SRPRA	99	74.922	Cebus_capucinus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	75.195	ENSCATG00000039354	SRPRA	99	75.039	Cercocebus_atys
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.531	ENSCLAG00000016839	SRPRA	99	74.375	Chinchilla_lanigera
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.883	ENSCSAG00000002271	SRPRA	99	74.883	Chlorocebus_sabaeus
ENSFALG00000005048	SRPRA	55	92.857	ENSCHOG00000010015	-	73	92.857	Choloepus_hoffmanni
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	86.223	ENSCPBG00000011128	SRPRA	99	86.378	Chrysemys_picta_bellii
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	54.630	ENSCING00000008954	-	99	54.351	Ciona_intestinalis
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	55.641	ENSCSAVG00000005602	-	99	55.178	Ciona_savignyi
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	75.039	ENSCANG00000032337	SRPRA	99	74.883	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.844	ENSCGRG00001017670	Srpr	99	74.688	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.844	ENSCGRG00000009892	Srpr	90	93.333	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	66.718	ENSCSEG00000002374	srpra	99	66.718	Cynoglossus_semilaevis
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	67.127	ENSCVAG00000019881	srpra	99	65.854	Cyprinodon_variegatus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	63.872	ENSDARG00000061124	srpra	99	64.482	Danio_rerio
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	73.920	ENSDNOG00000010821	SRPRA	99	73.148	Dasypus_novemcinctus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.844	ENSDORG00000016719	Srpr	99	74.688	Dipodomys_ordii
ENSFALG00000005048	SRPRA	93	51.650	FBgn0010391	Gtp-bp	92	50.909	Drosophila_melanogaster
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	73.758	ENSETEG00000013956	SRPRA	99	73.292	Echinops_telfairi
ENSFALG00000005048	SRPRA	51	81.231	ENSEBUG00000002602	srpra	92	67.933	Eptatretus_burgeri
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.883	ENSEASG00005022980	SRPRA	99	73.947	Equus_asinus_asinus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	75.039	ENSECAG00000014692	SRPRA	99	74.103	Equus_caballus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	68.487	ENSEEUG00000007920	SRPRA	99	68.224	Erinaceus_europaeus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	67.901	ENSELUG00000017643	srpra	99	68.210	Esox_lucius
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.766	ENSFCAG00000011274	-	99	73.832	Felis_catus
ENSFALG00000005048	SRPRA	79	68.677	ENSFCAG00000030894	-	99	67.510	Felis_catus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	75.156	ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	88.112	Fukomys_damarensis
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	68.349	ENSFHEG00000016959	srpra	99	69.113	Fundulus_heteroclitus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	66.512	ENSGMOG00000013244	srpra	99	66.149	Gadus_morhua
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	90.938	ENSGALG00000030759	SRPRA	99	90.938	Gallus_gallus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	67.588	ENSGAFG00000000453	srpra	99	68.510	Gambusia_affinis
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	67.492	ENSGACG00000006550	srpra	99	67.438	Gasterosteus_aculeatus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	85.471	ENSGAGG00000021157	SRPRA	99	85.626	Gopherus_agassizii
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.727	ENSGGOG00000012962	SRPRA	99	74.727	Gorilla_gorilla
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	68.845	ENSHBUG00000000119	srpra	99	69.892	Haplochromis_burtoni
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.219	ENSHGLG00000001597	SRPR	94	93.939	Heterocephalus_glaber_female
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.219	ENSHGLG00100006449	SRPR	94	93.939	Heterocephalus_glaber_male
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	66.565	ENSHCOG00000010749	srpra	99	66.565	Hippocampus_comes
ENSFALG00000005048	SRPRA	95	66.613	ENSIPUG00000000867	srpra	99	66.774	Ictalurus_punctatus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.571	ENSSTOG00000009897	SRPRA	99	74.571	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.259	ENSJJAG00000020272	Srpr	99	74.259	Jaculus_jaculus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	68.807	ENSKMAG00000002280	srpra	99	68.760	Kryptolebias_marmoratus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	67.178	ENSLBEG00000009608	srpra	99	68.606	Labrus_bergylta
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	69.646	ENSLACG00000017781	SRPRA	99	69.646	Latimeria_chalumnae
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	67.228	ENSLOCG00000002733	srpra	99	66.210	Lepisosteus_oculatus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	73.520	ENSLAFG00000010252	SRPRA	99	74.143	Loxodonta_africana
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	75.039	ENSMFAG00000032606	SRPRA	99	75.039	Macaca_fascicularis
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	75.039	ENSMMUG00000007938	SRPRA	99	75.039	Macaca_mulatta
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	75.039	ENSMNEG00000030709	SRPRA	99	75.039	Macaca_nemestrina
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	75.195	ENSMLEG00000043404	SRPRA	99	75.039	Mandrillus_leucophaeus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	67.643	ENSMAMG00000000473	srpra	99	67.228	Mastacembelus_armatus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	68.997	ENSMZEG00005013432	srpra	99	70.046	Maylandia_zebra
ENSFALG00000005048	SRPRA	95	94.850	ENSMGAG00000000732	SRPRA	100	94.850	Meleagris_gallopavo
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.844	ENSMAUG00000015648	Srpr	99	74.688	Mesocricetus_auratus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.727	ENSMICG00000015981	SRPRA	99	74.727	Microcebus_murinus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.531	ENSMOCG00000008311	Srpr	99	74.375	Microtus_ochrogaster
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	65.732	ENSMMOG00000005019	srpra	99	66.044	Mola_mola
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.103	ENSMODG00000004576	-	99	73.552	Monodelphis_domestica
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	67.435	ENSMALG00000011343	srpra	99	66.718	Monopterus_albus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.531	MGP_CAROLIEiJ_G0031951	Srpr	86	94.697	Mus_caroli
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.688	ENSMUSG00000032042	Srpr	86	93.939	Mus_musculus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.688	MGP_PahariEiJ_G0014816	Srpr	86	93.939	Mus_pahari
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	71.429	MGP_SPRETEiJ_G0033075	Srpr	99	71.429	Mus_spretus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.883	ENSMPUG00000006626	SRPRA	99	74.883	Mustela_putorius_furo
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	75.900	ENSMLUG00000017334	SRPRA	99	75.743	Myotis_lucifugus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.062	ENSNGAG00000015686	Srpr	99	74.062	Nannospalax_galili
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	68.845	ENSNBRG00000017311	srpra	99	69.892	Neolamprologus_brichardi
ENSFALG00000005048	SRPRA	96	77.162	ENSNLEG00000007467	SRPRA	99	77.162	Nomascus_leucogenys
ENSFALG00000005048	SRPRA	95	78.089	ENSMEUG00000004956	SRPRA	100	77.595	Notamacropus_eugenii
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	69.531	ENSOPRG00000013160	SRPRA	99	69.531	Ochotona_princeps
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.844	ENSODEG00000004730	SRPRA	99	74.688	Octodon_degus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	68.541	ENSONIG00000005324	srpra	99	69.585	Oreochromis_niloticus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.844	ENSOCUG00000017057	SRPRA	99	74.688	Oryctolagus_cuniculus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	67.445	ENSORLG00000014676	srpra	83	88.854	Oryzias_latipes
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	67.445	ENSORLG00020009240	srpra	99	68.168	Oryzias_latipes_hni
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	67.290	ENSORLG00015015405	srpra	99	67.551	Oryzias_latipes_hsok
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	67.290	ENSOMEG00000005872	srpra	99	67.707	Oryzias_melastigma
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	75.156	ENSOGAG00000008926	SRPRA	99	75.156	Otolemur_garnettii
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.383	ENSOARG00000012397	SRPRA	99	74.574	Ovis_aries
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.727	ENSPPAG00000030813	SRPRA	99	74.727	Pan_paniscus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.766	ENSPPRG00000001542	SRPRA	99	73.832	Panthera_pardus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.611	ENSPTIG00000006989	SRPRA	99	73.676	Panthera_tigris_altaica
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.727	ENSPTRG00000028360	SRPRA	99	74.727	Pan_troglodytes
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	75.039	ENSPANG00000010858	SRPRA	99	75.039	Papio_anubis
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	65.674	ENSPKIG00000016106	srpra	99	65.325	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFALG00000005048	SRPRA	95	88.962	ENSPSIG00000012009	SRPRA	100	89.127	Pelodiscus_sinensis
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	68.006	ENSPMGG00000001393	srpra	99	67.697	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.688	ENSPEMG00000018279	Srpr	99	74.531	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	60.280	ENSPMAG00000009559	srpra	99	60.404	Petromyzon_marinus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	73.676	ENSPCIG00000010207	SRPRA	99	74.299	Phascolarctos_cinereus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	67.331	ENSPFOG00000003114	srpra	99	68.300	Poecilia_formosa
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	67.331	ENSPLAG00000007323	srpra	99	68.453	Poecilia_latipinna
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	67.331	ENSPMEG00000015658	srpra	99	68.300	Poecilia_mexicana
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	68.341	ENSPREG00000004937	srpra	99	69.102	Poecilia_reticulata
ENSFALG00000005048	SRPRA	88	97.368	ENSPPYG00000004045	SRPRA	99	97.368	Pongo_abelii
ENSFALG00000005048	SRPRA	53	98.450	ENSPCAG00000003801	-	54	98.450	Procavia_capensis
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.727	ENSPCOG00000025726	SRPRA	99	74.727	Propithecus_coquereli
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	75.274	ENSPVAG00000000993	SRPRA	99	75.117	Pteropus_vampyrus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	68.997	ENSPNYG00000012371	srpra	99	70.046	Pundamilia_nyererei
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	65.258	ENSPNAG00000013476	srpra	98	65.571	Pygocentrus_nattereri
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.844	ENSRNOG00000010543	Srpra	99	74.688	Rattus_norvegicus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.727	ENSRBIG00000008702	SRPRA	99	74.727	Rhinopithecus_bieti
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.571	ENSRROG00000029494	SRPRA	99	74.571	Rhinopithecus_roxellana
ENSFALG00000005048	SRPRA	51	42.690	YDR292C	-	74	36.192	Saccharomyces_cerevisiae
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.571	ENSSBOG00000035892	SRPRA	99	74.571	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFALG00000005048	SRPRA	95	78.089	ENSSHAG00000009168	SRPRA	99	77.265	Sarcophilus_harrisii
ENSFALG00000005048	SRPRA	96	65.082	ENSSFOG00015008837	srpra	94	63.651	Scleropages_formosus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	64.099	ENSSMAG00000002783	srpra	99	62.519	Scophthalmus_maximus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	66.921	ENSSDUG00000013920	srpra	99	64.961	Seriola_dumerili
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	66.921	ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.278	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFALG00000005048	SRPRA	76	72.016	ENSSARG00000012434	SRPRA	80	72.222	Sorex_araneus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	83.204	ENSSPUG00000018221	SRPRA	99	83.204	Sphenodon_punctatus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	67.643	ENSSPAG00000005103	srpra	99	68.865	Stegastes_partitus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	75.663	ENSSSCG00000015227	SRPRA	99	75.507	Sus_scrofa
ENSFALG00000005048	SRPRA	95	96.844	ENSTGUG00000000815	SRPRA	100	96.844	Taeniopygia_guttata
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	67.907	ENSTRUG00000006856	srpra	99	68.992	Takifugu_rubripes
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	65.350	ENSTNIG00000010316	srpra	99	64.894	Tetraodon_nigroviridis
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.806	ENSTTRG00000001558	SRPRA	99	74.184	Tursiops_truncatus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.883	ENSUAMG00000005510	SRPRA	99	74.883	Ursus_americanus
ENSFALG00000005048	SRPRA	95	72.594	ENSUMAG00000002269	SRPRA	98	72.594	Ursus_maritimus
ENSFALG00000005048	SRPRA	70	98.450	ENSVPAG00000001077	SRPRA	75	98.450	Vicugna_pacos
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.883	ENSVVUG00000020094	SRPRA	99	74.727	Vulpes_vulpes
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	63.093	ENSXETG00000003920	srpra	99	63.247	Xenopus_tropicalis
ENSFALG00000005048	SRPRA	77	87.915	ENSXCOG00000001286	srpra	91	89.809	Xiphophorus_couchianus
ENSFALG00000005048	SRPRA	99	68.356	ENSXMAG00000028401	srpra	99	69.172	Xiphophorus_maculatus