EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFALG00000007551 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Ficedula_albicollis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 20903 bases
Position: chrJH603433.1:14761-35663
Accession: 101814910
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFALP00000007876	GTP_EFTU	PF00009.27	5.4e-46	1	1
ENSFALP00000007876	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	9e-13	1	1
ENSFALP00000007876	EFG_IV	PF03764.18	1e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFALT00000007909	EFTUD2-201	4634	-	ENSFALP00000007876	972 (aa)	XP_005059651	U3JYM2

Gene Model

Click here to download ENSFALG00000007551's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSFALG00000007551's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSFALG00000007551	EFTUD2	87	38.946	ENSFALG00000000859	EEF2	99	38.946
ENSFALG00000007551	EFTUD2	83	34.507	ENSFALG00000011103	EFL1	83	34.507

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.975	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	91.872	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	98.045	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	98.045	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	88.374	ENSACIG00000009096	eftud2	100	88.272	Amphilophus_citrinellus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	87	88.000	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.000	Amphiprion_ocellaris
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.975	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	91.872	Amphiprion_percula
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	92.284	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.181	Anabas_testudineus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	99	95.572	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	95.572	Anas_platyrhynchos
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	98.251	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	98.251	Anolis_carolinensis
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	97.942	Aotus_nancymaae
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.872	ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.770	Astatotilapia_calliptera
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.198	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	90.890	Astyanax_mexicanus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.840	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	97.840	Bos_taurus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	99	70.455	WBGene00001166	eftu-2	99	70.351	Caenorhabditis_elegans
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	97.942	Callithrix_jacchus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	98.045	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	98.045	Canis_familiaris
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	98.045	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	98.045	Canis_lupus_dingo
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.840	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	97.840	Capra_hircus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.737	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	97.737	Carlito_syrichta
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.531	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	97.531	Cavia_aperea
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.531	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	97.531	Cavia_porcellus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	97.942	Cebus_capucinus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	97.942	Cercocebus_atys
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.428	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	97.428	Chinchilla_lanigera
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	97.942	Chlorocebus_sabaeus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	91	85.586	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	85.586	Choloepus_hoffmanni
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	98.560	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.560	Chrysemys_picta_bellii
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	77.641	ENSCING00000009372	-	100	77.347	Ciona_intestinalis
ENSFALG00000007551	EFTUD2	99	78.717	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.953	Ciona_savignyi
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	97.942	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.737	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	97.737	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.737	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	97.737	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.461	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.358	Cynoglossus_semilaevis
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	92.284	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.181	Cyprinodon_variegatus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	90.545	ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.376	Danio_rerio
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.428	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	97.428	Dasypus_novemcinctus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	98.045	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	98.045	Dipodomys_ordii
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	75.282	FBgn0039566	CG4849	100	75.077	Drosophila_melanogaster
ENSFALG00000007551	EFTUD2	92	98.913	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	98.913	Echinops_telfairi
ENSFALG00000007551	EFTUD2	74	93.532	ENSEBUG00000004047	-	96	87.065	Eptatretus_burgeri
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	98.045	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	98.045	Equus_asinus_asinus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	97.942	Equus_caballus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.049	ENSELUG00000017169	eftud2	100	91.152	Esox_lucius
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	97.942	Felis_catus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.840	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	97.840	Fukomys_damarensis
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	92.181	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	92.078	Fundulus_heteroclitus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	90.844	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.152	Gadus_morhua
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	99.486	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	99.677	Gallus_gallus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	92.181	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	92.078	Gambusia_affinis
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.564	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.255	Gasterosteus_aculeatus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	97.942	Gorilla_gorilla
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.770	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.667	Haplochromis_burtoni
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.531	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	97.531	Heterocephalus_glaber_female
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.531	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	97.531	Heterocephalus_glaber_male
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	90.947	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.853	Hippocampus_comes
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.049	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.461	Ictalurus_punctatus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	92.387	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	95.738	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	96	97.970	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	97.970	Jaculus_jaculus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.872	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.564	Kryptolebias_marmoratus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	95	91.586	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.588	Labrus_bergylta
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	94.239	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.758	Latimeria_chalumnae
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.975	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	92.181	Lepisosteus_oculatus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.634	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	97.634	Loxodonta_africana
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	97.942	Macaca_fascicularis
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	97.942	Macaca_nemestrina
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	97.942	Mandrillus_leucophaeus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	92.284	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.181	Mastacembelus_armatus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.872	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	91.770	Maylandia_zebra
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	99.281	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	99.281	Meleagris_gallopavo
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.840	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	97.840	Mesocricetus_auratus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	97.942	Microcebus_murinus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.840	ENSMOCG00000009039	-	100	97.840	Microtus_ochrogaster
ENSFALG00000007551	EFTUD2	92	80.449	ENSMOCG00000017653	-	90	80.449	Microtus_ochrogaster
ENSFALG00000007551	EFTUD2	87	93.765	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.765	Mola_mola
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	98.045	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.045	Monodelphis_domestica
ENSFALG00000007551	EFTUD2	87	92.118	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.118	Monopterus_albus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.531	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	97.531	Mus_caroli
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.531	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	97.531	Mus_musculus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.531	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	97.531	Mus_pahari
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.531	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	97.531	Mus_spretus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	97	97.775	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	97.775	Mustela_putorius_furo
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	98.045	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	98.045	Myotis_lucifugus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	97.942	Nannospalax_galili
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.770	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.667	Neolamprologus_brichardi
ENSFALG00000007551	EFTUD2	97	96.068	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	96.068	Nomascus_leucogenys
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	94.239	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	94.239	Notamacropus_eugenii
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	89.609	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	89.609	Ochotona_princeps
ENSFALG00000007551	EFTUD2	93	78.879	ENSODEG00000003385	-	100	78.879	Octodon_degus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.119	ENSODEG00000018041	-	100	97.119	Octodon_degus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.872	ENSONIG00000000912	eftud2	100	91.770	Oreochromis_niloticus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.840	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	97.840	Oryctolagus_cuniculus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.564	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.564	Oryzias_latipes
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.461	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.461	Oryzias_latipes_hni
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.461	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.355	Oryzias_latipes_hsok
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	95.679	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	95.679	Otolemur_garnettii
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.840	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	97.840	Ovis_aries
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	97.942	Pan_paniscus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	98.045	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	98.045	Panthera_pardus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	98.045	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	98.045	Panthera_tigris_altaica
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	97.942	Pan_troglodytes
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	97.942	Papio_anubis
ENSFALG00000007551	EFTUD2	93	97.464	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.464	Pelodiscus_sinensis
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	84.465	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.465	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.737	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	97.737	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	97.942	Phascolarctos_cinereus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	92.181	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	92.078	Poecilia_formosa
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	92.181	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	92.078	Poecilia_latipinna
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	92.181	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	92.078	Poecilia_mexicana
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	96.502	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	96.502	Pongo_abelii
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	93.724	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	93.724	Procavia_capensis
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	97.942	Propithecus_coquereli
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	93.519	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	93.519	Pteropus_vampyrus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.770	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.667	Pundamilia_nyererei
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.461	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.078	Pygocentrus_nattereri
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.634	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	97.634	Rattus_norvegicus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.840	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	97.840	Rhinopithecus_bieti
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.840	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	97.840	Rhinopithecus_roxellana
ENSFALG00000007551	EFTUD2	97	34.091	YKL173W	SNU114	97	33.762	Saccharomyces_cerevisiae
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	97.942	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFALG00000007551	EFTUD2	97	97.974	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	97.974	Sarcophilus_harrisii
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.358	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.461	Scleropages_formosus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.667	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.564	Scophthalmus_maximus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.975	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.872	Seriola_dumerili
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	92.078	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	91.975	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	89.300	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	89.300	Sorex_araneus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.840	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.840	Sphenodon_punctatus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	92.078	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	91.975	Stegastes_partitus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.840	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	97.840	Sus_scrofa
ENSFALG00000007551	EFTUD2	84	99.270	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	99.270	Taeniopygia_guttata
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.152	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.049	Takifugu_rubripes
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	86.680	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.475	Tetraodon_nigroviridis
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	92.387	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	92.387	Tupaia_belangeri
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	89.403	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	89.403	Tursiops_truncatus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	96.920	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	96.920	Ursus_americanus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	98.045	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	98.045	Ursus_maritimus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	98.045	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	98.045	Vulpes_vulpes
ENSFALG00000007551	EFTUD2	97	94.989	ENSXETG00000003394	eftud2	98	96.083	Xenopus_tropicalis
ENSFALG00000007551	EFTUD2	81	93.622	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.622	Xiphophorus_couchianus
ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	92.181	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.078	Xiphophorus_maculatus