EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFALG00000007574 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Ficedula_albicollis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 30419 bases
Position: chrJH603179.1:3716392-3746810
Accession: 101821937
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFALP00000007899	RRM_1	PF00076.22	7e-22	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFALT00000007932	MSI1-201	2119	XM_016302319	ENSFALP00000007899	300 (aa)	XP_016157805	U3JYP5

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSFALG00000007574	MSI1	53	42.308	ENSFALG00000014010	DAZAP1	51	42.308

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	ENSG00000135097	MSI1	98	95.820	Homo_sapiens
ENSFALG00000007574	MSI1	100	90.000	ENSAPOG00000023458	-	94	90.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	89.000	ENSAPOG00000003191	MSI1	94	89.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	67.945	ENSAMEG00000013302	MSI1	100	67.945	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFALG00000007574	MSI1	96	85.366	ENSACIG00000017754	-	78	82.828	Amphilophus_citrinellus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	89.000	ENSAOCG00000003804	MSI1	94	89.000	Amphiprion_ocellaris
ENSFALG00000007574	MSI1	100	80.333	ENSAOCG00000009031	-	95	80.333	Amphiprion_ocellaris
ENSFALG00000007574	MSI1	100	89.000	ENSAPEG00000003245	MSI1	94	89.000	Amphiprion_percula
ENSFALG00000007574	MSI1	100	90.000	ENSAPEG00000006857	-	79	90.000	Amphiprion_percula
ENSFALG00000007574	MSI1	100	89.667	ENSATEG00000017059	MSI1	95	89.667	Anabas_testudineus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	85.714	ENSATEG00000023779	-	93	85.714	Anabas_testudineus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	96.764	ENSACAG00000002762	MSI1	100	96.764	Anolis_carolinensis
ENSFALG00000007574	MSI1	80	94.979	ENSANAG00000027901	-	89	94.979	Aotus_nancymaae
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	ENSANAG00000027151	MSI1	98	95.820	Aotus_nancymaae
ENSFALG00000007574	MSI1	100	89.000	ENSACLG00000011230	MSI1	94	89.000	Astatotilapia_calliptera
ENSFALG00000007574	MSI1	100	89.333	ENSACLG00000000117	-	100	89.333	Astatotilapia_calliptera
ENSFALG00000007574	MSI1	100	88.000	ENSAMXG00000038960	msi1	76	88.000	Astyanax_mexicanus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	95.820	Bos_taurus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	ENSCJAG00000008578	MSI1	98	95.820	Callithrix_jacchus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.498	ENSCAFG00000010283	MSI1	98	95.498	Canis_familiaris
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	95.820	Canis_lupus_dingo
ENSFALG00000007574	MSI1	100	89.623	ENSCHIG00000024304	MSI1	98	89.623	Capra_hircus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	95.820	Carlito_syrichta
ENSFALG00000007574	MSI1	96	85.623	ENSCAPG00000003919	MSI1	89	85.623	Cavia_aperea
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	95.820	Cavia_porcellus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	ENSCCAG00000035567	MSI1	98	95.820	Cebus_capucinus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	ENSCATG00000030019	MSI1	98	95.820	Cercocebus_atys
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	95.820	Chinchilla_lanigera
ENSFALG00000007574	MSI1	73	94.690	ENSCSAG00000002265	MSI1	89	94.690	Chlorocebus_sabaeus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	99.667	ENSCPBG00000011349	MSI1	100	99.667	Chrysemys_picta_bellii
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	ENSCANG00000040651	MSI1	99	95.820	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	ENSCGRG00001018883	Msi1	98	95.820	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	ENSCGRG00000002191	Msi1	72	95.820	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFALG00000007574	MSI1	100	88.333	ENSCSEG00000008352	-	94	88.333	Cynoglossus_semilaevis
ENSFALG00000007574	MSI1	100	88.000	ENSCSEG00000005834	-	94	88.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSFALG00000007574	MSI1	100	81.333	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	81.333	Cynoglossus_semilaevis
ENSFALG00000007574	MSI1	73	70.909	ENSCVAG00000017463	-	89	70.909	Cyprinodon_variegatus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	90.000	ENSCVAG00000009100	MSI1	94	90.000	Cyprinodon_variegatus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	84.667	ENSDARG00000010710	msi1	100	88.426	Danio_rerio
ENSFALG00000007574	MSI1	73	87.156	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	89	87.156	Danio_rerio
ENSFALG00000007574	MSI1	100	91.667	ENSDNOG00000005713	MSI1	91	91.667	Dasypus_novemcinctus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	ENSDORG00000005610	Msi1	93	95.820	Dipodomys_ordii
ENSFALG00000007574	MSI1	100	91.640	ENSETEG00000004756	MSI1	99	91.640	Echinops_telfairi
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	ENSEASG00005004736	MSI1	98	95.820	Equus_asinus_asinus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	ENSECAG00000017526	MSI1	98	95.820	Equus_caballus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	84.333	ENSELUG00000023280	-	100	84.333	Esox_lucius
ENSFALG00000007574	MSI1	100	83.438	ENSELUG00000023219	MSI1	92	83.438	Esox_lucius
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	ENSFCAG00000011007	MSI1	98	95.820	Felis_catus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.498	ENSFDAG00000019586	MSI1	99	95.498	Fukomys_damarensis
ENSFALG00000007574	MSI1	100	90.333	ENSFHEG00000022446	MSI1	94	90.333	Fundulus_heteroclitus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	88.667	ENSFHEG00000003560	-	94	88.667	Fundulus_heteroclitus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	78.878	ENSGMOG00000017838	-	94	78.878	Gadus_morhua
ENSFALG00000007574	MSI1	100	87.333	ENSGMOG00000001006	MSI1	94	87.333	Gadus_morhua
ENSFALG00000007574	MSI1	87	100.000	ENSGALG00000007227	MSI1	96	85.000	Gallus_gallus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	88.000	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	88.000	Gambusia_affinis
ENSFALG00000007574	MSI1	100	71.429	ENSGAFG00000005860	-	89	71.429	Gambusia_affinis
ENSFALG00000007574	MSI1	100	81.350	ENSGACG00000008674	-	94	81.350	Gasterosteus_aculeatus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	88.667	ENSGACG00000012679	MSI1	94	88.667	Gasterosteus_aculeatus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	99.667	ENSGAGG00000016037	MSI1	94	99.667	Gopherus_agassizii
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	ENSGGOG00000010328	MSI1	99	95.820	Gorilla_gorilla
ENSFALG00000007574	MSI1	100	89.000	ENSHBUG00000021921	MSI1	94	89.000	Haplochromis_burtoni
ENSFALG00000007574	MSI1	100	89.333	ENSHBUG00000011841	-	94	89.333	Haplochromis_burtoni
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.498	ENSHGLG00000012782	MSI1	98	95.498	Heterocephalus_glaber_female
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.498	ENSHGLG00100016848	MSI1	99	95.498	Heterocephalus_glaber_male
ENSFALG00000007574	MSI1	100	83.667	ENSHCOG00000012019	MSI1	100	83.667	Hippocampus_comes
ENSFALG00000007574	MSI1	100	88.333	ENSHCOG00000012067	-	89	88.333	Hippocampus_comes
ENSFALG00000007574	MSI1	100	88.000	ENSIPUG00000001976	msi1	95	88.000	Ictalurus_punctatus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	95.820	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	ENSJJAG00000010463	Msi1	98	95.820	Jaculus_jaculus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	77.814	ENSJJAG00000010643	-	94	77.492	Jaculus_jaculus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	89.000	ENSKMAG00000011251	MSI1	94	89.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	85.000	ENSKMAG00000019877	-	100	85.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	89.333	ENSLBEG00000008789	MSI1	94	89.333	Labrus_bergylta
ENSFALG00000007574	MSI1	100	89.000	ENSLBEG00000001375	-	94	89.000	Labrus_bergylta
ENSFALG00000007574	MSI1	100	87.781	ENSLACG00000018287	MSI1	100	87.781	Latimeria_chalumnae
ENSFALG00000007574	MSI1	100	84.665	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	84.665	Loxodonta_africana
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	95.820	Macaca_fascicularis
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	ENSMMUG00000031527	MSI1	97	95.820	Macaca_mulatta
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	ENSMNEG00000040034	MSI1	98	95.820	Macaca_nemestrina
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	ENSMLEG00000003921	MSI1	99	95.820	Mandrillus_leucophaeus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	88.667	ENSMAMG00000018426	-	94	88.667	Mastacembelus_armatus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	88.667	ENSMAMG00000002279	MSI1	94	88.667	Mastacembelus_armatus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	89.000	ENSMZEG00005026892	MSI1	94	89.000	Maylandia_zebra
ENSFALG00000007574	MSI1	100	89.333	ENSMZEG00005000340	-	94	89.333	Maylandia_zebra
ENSFALG00000007574	MSI1	56	100.000	ENSMGAG00000016518	-	100	100.000	Meleagris_gallopavo
ENSFALG00000007574	MSI1	71	99.057	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	99.057	Mesocricetus_auratus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	ENSMICG00000033181	MSI1	98	95.820	Microcebus_murinus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.498	ENSMOCG00000002286	Msi1	98	95.498	Microtus_ochrogaster
ENSFALG00000007574	MSI1	100	79.000	ENSMMOG00000010492	MSI1	96	79.000	Mola_mola
ENSFALG00000007574	MSI1	100	85.333	ENSMMOG00000012265	-	99	85.333	Mola_mola
ENSFALG00000007574	MSI1	100	63.057	ENSMODG00000003189	-	100	63.057	Monodelphis_domestica
ENSFALG00000007574	MSI1	100	89.333	ENSMALG00000017889	MSI1	94	89.333	Monopterus_albus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	88.000	ENSMALG00000001426	-	100	88.000	Monopterus_albus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.177	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	98	95.177	Mus_caroli
ENSFALG00000007574	MSI1	100	98.667	ENSMUSG00000054256	Msi1	99	98.667	Mus_musculus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	98.333	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	98	98.333	Mus_pahari
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.177	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	98	95.177	Mus_spretus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	ENSMPUG00000003168	MSI1	100	95.820	Mustela_putorius_furo
ENSFALG00000007574	MSI1	100	85.535	ENSMLUG00000010313	MSI1	100	85.535	Myotis_lucifugus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	ENSNGAG00000014508	Msi1	93	95.820	Nannospalax_galili
ENSFALG00000007574	MSI1	82	81.707	ENSNBRG00000018012	MSI1	99	81.707	Neolamprologus_brichardi
ENSFALG00000007574	MSI1	100	89.333	ENSNBRG00000000841	-	94	89.333	Neolamprologus_brichardi
ENSFALG00000007574	MSI1	100	84.887	ENSNLEG00000015636	MSI1	94	84.887	Nomascus_leucogenys
ENSFALG00000007574	MSI1	100	74.277	ENSMEUG00000015759	MSI1	95	74.277	Notamacropus_eugenii
ENSFALG00000007574	MSI1	96	87.248	ENSOPRG00000016879	MSI1	99	87.248	Ochotona_princeps
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	ENSODEG00000006328	MSI1	99	95.820	Octodon_degus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	89.333	ENSONIG00000011182	MSI1	94	89.333	Oreochromis_niloticus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	85.852	ENSONIG00000019452	-	94	85.852	Oreochromis_niloticus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.498	ENSOCUG00000027716	MSI1	100	95.498	Oryctolagus_cuniculus
ENSFALG00000007574	MSI1	100	90.000	ENSORLG00000019978	-	94	90.000	Oryzias_latipes
ENSFALG00000007574	MSI1	100	88.333	ENSORLG00000029593	MSI1	94	88.333	Oryzias_latipes
ENSFALG00000007574	MSI1	100	88.333	ENSORLG00020008266	MSI1	99	85.000	Oryzias_latipes_hni
ENSFALG00000007574	MSI1	100	90.000	ENSORLG00020001208	-	67	90.000	Oryzias_latipes_hni
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ENSFALG00000007574	MSI1	100	88.333	ENSORLG00015003916	MSI1	99	85.000	Oryzias_latipes_hsok
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ENSFALG00000007574	MSI1	100	89.333	ENSOMEG00000002272	-	97	89.333	Oryzias_melastigma
ENSFALG00000007574	MSI1	100	94.904	ENSOGAG00000003847	MSI1	98	94.904	Otolemur_garnettii
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