EuRBPDB

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFALG00000008036 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: MTRF1
Alias: MGC47721|MTTRF1|RF1
Full Name: mitochondrial translation release factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Ficedula_albicollis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12886 bases
Position: chrJH603198.1:4982920-4995805
Accession: 7469
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFALP00000008384	RF-1	PF00472.20	1.8e-39	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFALT00000008422	MTRF1-201	2416	-	ENSFALP00000008384	403 (aa)	-	U3K030

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSFALG00000008036	MTRF1	73	49.662	ENSFALG00000012403	MTRF1L	97	49.662

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	68.831	ENSG00000120662	MTRF1	92	65.079	Homo_sapiens
ENSFALG00000008036	MTRF1	87	55.966	ENSAPOG00000010181	mtrf1	86	55.966	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	68.299	ENSAMEG00000008696	MTRF1	87	68.299	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFALG00000008036	MTRF1	56	70.044	ENSACIG00000001495	mtrf1	92	70.044	Amphilophus_citrinellus
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	54.499	ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	54.499	Amphiprion_ocellaris
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	54.242	ENSAPEG00000014844	mtrf1	88	54.242	Amphiprion_percula
ENSFALG00000008036	MTRF1	84	57.971	ENSATEG00000017403	mtrf1	82	57.971	Anabas_testudineus
ENSFALG00000008036	MTRF1	97	87.724	ENSAPLG00000009317	MTRF1	91	87.724	Anas_platyrhynchos
ENSFALG00000008036	MTRF1	97	67.352	ENSACAG00000000897	MTRF1	88	67.352	Anolis_carolinensis
ENSFALG00000008036	MTRF1	97	61.637	ENSANAG00000023063	-	87	61.637	Aotus_nancymaae
ENSFALG00000008036	MTRF1	90	64.365	ENSANAG00000025310	-	94	67.353	Aotus_nancymaae
ENSFALG00000008036	MTRF1	95	56.250	ENSACLG00000023945	mtrf1	86	56.250	Astatotilapia_calliptera
ENSFALG00000008036	MTRF1	58	66.524	ENSAMXG00000031859	mtrf1	97	66.524	Astyanax_mexicanus
ENSFALG00000008036	MTRF1	99	67.332	ENSBTAG00000012260	MTRF1	89	67.332	Bos_taurus
ENSFALG00000008036	MTRF1	97	66.923	ENSCJAG00000017739	MTRF1	99	73.256	Callithrix_jacchus
ENSFALG00000008036	MTRF1	98	67.172	ENSCAFG00000004795	MTRF1	89	67.172	Canis_familiaris
ENSFALG00000008036	MTRF1	98	67.172	ENSCAFG00020018178	MTRF1	89	67.172	Canis_lupus_dingo
ENSFALG00000008036	MTRF1	97	68.205	ENSCHIG00000011810	MTRF1	87	68.205	Capra_hircus
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	69.072	ENSTSYG00000006976	MTRF1	87	69.072	Carlito_syrichta
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	68.299	ENSCAPG00000013163	MTRF1	90	68.299	Cavia_aperea
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	68.041	ENSCPOG00000005264	MTRF1	87	68.041	Cavia_porcellus
ENSFALG00000008036	MTRF1	97	66.410	ENSCCAG00000035116	MTRF1	88	66.327	Cebus_capucinus
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	68.052	ENSCATG00000009909	MTRF1	87	68.052	Cercocebus_atys
ENSFALG00000008036	MTRF1	99	66.416	ENSCLAG00000000582	MTRF1	89	66.416	Chinchilla_lanigera
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	68.312	ENSCSAG00000017835	MTRF1	87	68.312	Chlorocebus_sabaeus
ENSFALG00000008036	MTRF1	88	63.739	ENSCHOG00000011915	-	86	63.739	Choloepus_hoffmanni
ENSFALG00000008036	MTRF1	98	76.396	ENSCPBG00000007969	MTRF1	88	76.396	Chrysemys_picta_bellii
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	67.532	ENSCANG00000040353	MTRF1	87	67.532	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFALG00000008036	MTRF1	98	64.975	ENSCGRG00001003065	Mtrf1	88	64.975	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFALG00000008036	MTRF1	98	64.975	ENSCGRG00000002570	Mtrf1	88	64.975	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFALG00000008036	MTRF1	94	54.974	ENSCSEG00000005667	mtrf1	86	54.974	Cynoglossus_semilaevis
ENSFALG00000008036	MTRF1	94	53.158	ENSCVAG00000021729	mtrf1	88	53.158	Cyprinodon_variegatus
ENSFALG00000008036	MTRF1	58	57.940	ENSDARG00000033579	mtrf1	99	57.940	Danio_rerio
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	68.462	ENSDNOG00000034196	MTRF1	99	74.026	Dasypus_novemcinctus
ENSFALG00000008036	MTRF1	99	66.165	ENSDORG00000016429	Mtrf1	89	66.165	Dipodomys_ordii
ENSFALG00000008036	MTRF1	95	69.271	ENSETEG00000014811	MTRF1	86	69.271	Echinops_telfairi
ENSFALG00000008036	MTRF1	56	59.375	ENSEBUG00000000778	mtrf1	92	59.375	Eptatretus_burgeri
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	69.072	ENSEASG00005015715	MTRF1	87	69.072	Equus_asinus_asinus
ENSFALG00000008036	MTRF1	99	67.669	ENSECAG00000014389	MTRF1	87	67.669	Equus_caballus
ENSFALG00000008036	MTRF1	94	51.444	ENSEEUG00000004450	-	85	52.493	Erinaceus_europaeus
ENSFALG00000008036	MTRF1	97	53.590	ENSELUG00000006544	mtrf1	90	53.590	Esox_lucius
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	68.814	ENSFCAG00000031635	MTRF1	87	68.814	Felis_catus
ENSFALG00000008036	MTRF1	99	66.667	ENSFDAG00000017881	MTRF1	89	66.667	Fukomys_damarensis
ENSFALG00000008036	MTRF1	93	52.660	ENSFHEG00000019043	mtrf1	86	52.660	Fundulus_heteroclitus
ENSFALG00000008036	MTRF1	93	51.587	ENSGMOG00000008608	mtrf1	99	51.587	Gadus_morhua
ENSFALG00000008036	MTRF1	98	87.817	ENSGALG00000016951	MTRF1	87	87.817	Gallus_gallus
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	53.351	ENSGAFG00000007093	mtrf1	88	53.351	Gambusia_affinis
ENSFALG00000008036	MTRF1	92	55.496	ENSGACG00000013728	mtrf1	97	55.496	Gasterosteus_aculeatus
ENSFALG00000008036	MTRF1	78	78.662	ENSGAGG00000025696	MTRF1	99	78.662	Gopherus_agassizii
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	68.571	ENSGGOG00000002529	MTRF1	87	68.571	Gorilla_gorilla
ENSFALG00000008036	MTRF1	99	64.662	ENSHGLG00000003210	MTRF1	89	64.662	Heterocephalus_glaber_female
ENSFALG00000008036	MTRF1	99	64.662	ENSHGLG00100011843	MTRF1	89	64.662	Heterocephalus_glaber_male
ENSFALG00000008036	MTRF1	94	54.111	ENSHCOG00000009449	mtrf1	85	54.111	Hippocampus_comes
ENSFALG00000008036	MTRF1	94	70.604	ENSSTOG00000021682	MTRF1	86	70.604	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFALG00000008036	MTRF1	99	66.165	ENSJJAG00000017590	Mtrf1	89	66.165	Jaculus_jaculus
ENSFALG00000008036	MTRF1	93	56.764	ENSKMAG00000003231	mtrf1	84	56.764	Kryptolebias_marmoratus
ENSFALG00000008036	MTRF1	59	66.525	ENSLBEG00000027169	-	95	66.525	Labrus_bergylta
ENSFALG00000008036	MTRF1	59	66.525	ENSLBEG00000023151	mtrf1	95	66.525	Labrus_bergylta
ENSFALG00000008036	MTRF1	95	65.974	ENSLACG00000010582	MTRF1	86	65.974	Latimeria_chalumnae
ENSFALG00000008036	MTRF1	94	60.053	ENSLOCG00000005937	MTRF1	85	60.053	Lepisosteus_oculatus
ENSFALG00000008036	MTRF1	99	66.416	ENSLAFG00000022177	-	89	66.416	Loxodonta_africana
ENSFALG00000008036	MTRF1	99	51.880	ENSLAFG00000030499	-	88	51.880	Loxodonta_africana
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	67.792	ENSMFAG00000037972	MTRF1	87	67.792	Macaca_fascicularis
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	68.052	ENSMNEG00000035487	MTRF1	87	68.052	Macaca_nemestrina
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	68.052	ENSMLEG00000033582	MTRF1	87	68.052	Mandrillus_leucophaeus
ENSFALG00000008036	MTRF1	93	54.907	ENSMAMG00000022048	mtrf1	85	54.907	Mastacembelus_armatus
ENSFALG00000008036	MTRF1	95	56.250	ENSMZEG00005017922	mtrf1	86	56.250	Maylandia_zebra
ENSFALG00000008036	MTRF1	98	86.294	ENSMGAG00000014971	MTRF1	94	86.294	Meleagris_gallopavo
ENSFALG00000008036	MTRF1	98	67.513	ENSMAUG00000011661	Mtrf1	88	67.513	Mesocricetus_auratus
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	69.330	ENSMICG00000033131	MTRF1	87	69.330	Microcebus_murinus
ENSFALG00000008036	MTRF1	98	66.244	ENSMOCG00000011945	Mtrf1	88	66.244	Microtus_ochrogaster
ENSFALG00000008036	MTRF1	58	59.227	ENSMMOG00000013394	mtrf1	96	59.227	Mola_mola
ENSFALG00000008036	MTRF1	94	67.905	ENSMODG00000014772	MTRF1	85	67.905	Monodelphis_domestica
ENSFALG00000008036	MTRF1	94	56.168	ENSMALG00000013274	mtrf1	87	56.168	Monopterus_albus
ENSFALG00000008036	MTRF1	93	68.267	MGP_CAROLIEiJ_G0019539	Mtrf1	84	68.267	Mus_caroli
ENSFALG00000008036	MTRF1	95	67.624	ENSMUSG00000022022	Mtrf1	86	67.624	Mus_musculus
ENSFALG00000008036	MTRF1	95	67.363	MGP_PahariEiJ_G0030557	Mtrf1	86	67.363	Mus_pahari
ENSFALG00000008036	MTRF1	99	65.337	MGP_SPRETEiJ_G0020435	Mtrf1	89	65.337	Mus_spretus
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	66.237	ENSMPUG00000001874	MTRF1	87	66.237	Mustela_putorius_furo
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	68.557	ENSMLUG00000017237	MTRF1	87	68.557	Myotis_lucifugus
ENSFALG00000008036	MTRF1	99	67.164	ENSNGAG00000014460	Mtrf1	90	67.164	Nannospalax_galili
ENSFALG00000008036	MTRF1	59	66.245	ENSNBRG00000004634	mtrf1	100	66.245	Neolamprologus_brichardi
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	68.312	ENSNLEG00000001236	MTRF1	87	68.312	Nomascus_leucogenys
ENSFALG00000008036	MTRF1	95	61.979	ENSMEUG00000001846	MTRF1	86	61.979	Notamacropus_eugenii
ENSFALG00000008036	MTRF1	69	42.857	ENSOPRG00000006450	-	84	42.857	Ochotona_princeps
ENSFALG00000008036	MTRF1	99	65.163	ENSODEG00000005782	MTRF1	90	65.163	Octodon_degus
ENSFALG00000008036	MTRF1	95	55.990	ENSONIG00000012476	mtrf1	99	55.990	Oreochromis_niloticus
ENSFALG00000008036	MTRF1	77	66.032	ENSOANG00000003383	-	100	66.032	Ornithorhynchus_anatinus
ENSFALG00000008036	MTRF1	99	67.168	ENSOCUG00000025207	MTRF1	89	67.168	Oryctolagus_cuniculus
ENSFALG00000008036	MTRF1	94	54.712	ENSORLG00000003225	mtrf1	87	54.712	Oryzias_latipes
ENSFALG00000008036	MTRF1	94	54.974	ENSORLG00020021048	mtrf1	86	54.974	Oryzias_latipes_hni
ENSFALG00000008036	MTRF1	94	55.236	ENSORLG00015020957	mtrf1	87	55.236	Oryzias_latipes_hsok
ENSFALG00000008036	MTRF1	95	55.181	ENSOMEG00000002022	mtrf1	88	55.181	Oryzias_melastigma
ENSFALG00000008036	MTRF1	99	63.910	ENSOGAG00000009719	-	89	63.910	Otolemur_garnettii
ENSFALG00000008036	MTRF1	81	61.656	ENSOGAG00000026411	-	100	61.656	Otolemur_garnettii
ENSFALG00000008036	MTRF1	97	68.205	ENSOARG00000006994	MTRF1	87	68.205	Ovis_aries
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	68.831	ENSPPAG00000000050	MTRF1	87	68.831	Pan_paniscus
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	68.814	ENSPPRG00000009511	MTRF1	87	68.814	Panthera_pardus
ENSFALG00000008036	MTRF1	99	67.419	ENSPTIG00000006673	MTRF1	88	67.419	Panthera_tigris_altaica
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	68.831	ENSPTRG00000005815	MTRF1	87	68.831	Pan_troglodytes
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	68.052	ENSPANG00000010809	MTRF1	87	68.052	Papio_anubis
ENSFALG00000008036	MTRF1	92	54.032	ENSPKIG00000015711	mtrf1	87	54.032	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFALG00000008036	MTRF1	98	74.555	ENSPSIG00000004773	MTRF1	88	74.555	Pelodiscus_sinensis
ENSFALG00000008036	MTRF1	58	65.517	ENSPMGG00000006724	mtrf1	94	65.517	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFALG00000008036	MTRF1	95	66.841	ENSPEMG00000020982	Mtrf1	86	66.841	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFALG00000008036	MTRF1	84	52.312	ENSPMAG00000009849	mtrf1	99	52.601	Petromyzon_marinus
ENSFALG00000008036	MTRF1	95	67.188	ENSPCIG00000012940	MTRF1	87	67.188	Phascolarctos_cinereus
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	52.577	ENSPFOG00000000254	mtrf1	88	52.577	Poecilia_formosa
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	52.835	ENSPLAG00000014280	mtrf1	88	52.835	Poecilia_latipinna
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	52.577	ENSPMEG00000023245	mtrf1	88	52.577	Poecilia_mexicana
ENSFALG00000008036	MTRF1	58	60.944	ENSPREG00000018619	mtrf1	96	60.944	Poecilia_reticulata
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	68.052	ENSPPYG00000005313	MTRF1	87	68.052	Pongo_abelii
ENSFALG00000008036	MTRF1	99	67.168	ENSPCOG00000018133	MTRF1	89	67.168	Propithecus_coquereli
ENSFALG00000008036	MTRF1	98	66.244	ENSPVAG00000008573	MTRF1	88	66.244	Pteropus_vampyrus
ENSFALG00000008036	MTRF1	59	67.227	ENSPNYG00000004357	mtrf1	96	67.227	Pundamilia_nyererei
ENSFALG00000008036	MTRF1	92	56.836	ENSPNAG00000010682	mtrf1	85	56.836	Pygocentrus_nattereri
ENSFALG00000008036	MTRF1	99	64.589	ENSRNOG00000047106	Mtrf1	93	79.646	Rattus_norvegicus
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	67.792	ENSRBIG00000007069	MTRF1	87	67.792	Rhinopithecus_bieti
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	67.792	ENSRROG00000035345	MTRF1	87	67.792	Rhinopithecus_roxellana
ENSFALG00000008036	MTRF1	93	67.733	ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	67.733	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFALG00000008036	MTRF1	86	68.876	ENSSHAG00000018109	MTRF1	85	68.876	Sarcophilus_harrisii
ENSFALG00000008036	MTRF1	95	55.556	ENSSFOG00015006191	mtrf1	88	55.556	Scleropages_formosus
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	53.351	ENSSMAG00000015740	mtrf1	87	53.351	Scophthalmus_maximus
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	55.013	ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	55.013	Seriola_dumerili
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	54.756	ENSSLDG00000013584	mtrf1	76	54.756	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	65.296	ENSSARG00000002306	MTRF1	88	65.296	Sorex_araneus
ENSFALG00000008036	MTRF1	58	77.253	ENSSPUG00000007354	MTRF1	96	77.253	Sphenodon_punctatus
ENSFALG00000008036	MTRF1	94	54.450	ENSSPAG00000000881	mtrf1	86	54.450	Stegastes_partitus
ENSFALG00000008036	MTRF1	99	68.170	ENSSSCG00000009436	MTRF1	89	68.170	Sus_scrofa
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ENSFALG00000008036	MTRF1	96	55.784	ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	55.784	Takifugu_rubripes
ENSFALG00000008036	MTRF1	91	58.424	ENSTNIG00000017149	-	98	58.005	Tetraodon_nigroviridis
ENSFALG00000008036	MTRF1	59	66.527	ENSTBEG00000004696	-	100	66.527	Tupaia_belangeri
ENSFALG00000008036	MTRF1	99	66.667	ENSTTRG00000010370	MTRF1	89	66.667	Tursiops_truncatus
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ENSFALG00000008036	MTRF1	98	66.583	ENSVVUG00000028755	MTRF1	89	66.583	Vulpes_vulpes
ENSFALG00000008036	MTRF1	95	63.089	ENSXETG00000018904	mtrf1	99	63.089	Xenopus_tropicalis
ENSFALG00000008036	MTRF1	51	67.633	ENSXCOG00000020386	mtrf1	88	67.633	Xiphophorus_couchianus
ENSFALG00000008036	MTRF1	96	53.608	ENSXMAG00000009853	mtrf1	88	53.608	Xiphophorus_maculatus