EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSFALG00000010044 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: REXO2
Alias: CGI-114|DKFZP566E144|SFN
Full Name: RNA exonuclease 2
Gene Type: protein_coding
Species: Ficedula_albicollis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5584 bases
Position: chrJH603380.1:623423-629006
Accession: 17851
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFALP00000010476	RNase_T	PF00929.24	1.3e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFALT00000010518	REXO2-201	1887	-	ENSFALP00000010476	202 (aa)	-	U3K622

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.360	ENSG00000076043	REXO2	100	88.830	Homo_sapiens
ENSFALG00000010044	REXO2	55	76.577	ENSAPOG00000011971	smfn	96	76.577	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.889	ENSAMEG00000013263	REXO2	80	88.889	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFALG00000010044	REXO2	92	79.032	ENSACIG00000023553	smfn	100	79.032	Amphilophus_citrinellus
ENSFALG00000010044	REXO2	85	59.884	ENSAOCG00000011565	smfn	91	59.884	Amphiprion_ocellaris
ENSFALG00000010044	REXO2	90	78.571	ENSAPEG00000012435	smfn	67	78.571	Amphiprion_percula
ENSFALG00000010044	REXO2	93	78.610	ENSATEG00000015385	smfn	67	78.610	Anabas_testudineus
ENSFALG00000010044	REXO2	99	94.472	ENSAPLG00000005045	REXO2	99	94.472	Anas_platyrhynchos
ENSFALG00000010044	REXO2	87	76.000	ENSACAG00000011631	REXO2	82	76.000	Anolis_carolinensis
ENSFALG00000010044	REXO2	94	89.418	ENSANAG00000020834	REXO2	80	89.418	Aotus_nancymaae
ENSFALG00000010044	REXO2	57	72.414	ENSANAG00000027457	-	99	67.361	Aotus_nancymaae
ENSFALG00000010044	REXO2	92	77.838	ENSACLG00000024566	smfn	95	79.121	Astatotilapia_calliptera
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.889	ENSBTAG00000005843	REXO2	80	88.889	Bos_taurus
ENSFALG00000010044	REXO2	85	46.784	WBGene00007429	C08B6.8	93	53.425	Caenorhabditis_elegans
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.360	ENSCJAG00000012434	REXO2	80	88.360	Callithrix_jacchus
ENSFALG00000010044	REXO2	94	87.831	ENSCAFG00000013511	REXO2	80	87.831	Canis_familiaris
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.889	ENSCAFG00020002513	REXO2	80	88.889	Canis_lupus_dingo
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.889	ENSCHIG00000009264	REXO2	80	88.889	Capra_hircus
ENSFALG00000010044	REXO2	94	89.947	ENSTSYG00000002237	REXO2	80	89.947	Carlito_syrichta
ENSFALG00000010044	REXO2	94	79.275	ENSTSYG00000027948	-	99	79.275	Carlito_syrichta
ENSFALG00000010044	REXO2	93	89.894	ENSCAPG00000006093	REXO2	100	89.894	Cavia_aperea
ENSFALG00000010044	REXO2	94	89.418	ENSCPOG00000010548	REXO2	80	89.418	Cavia_porcellus
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.889	ENSCCAG00000034979	REXO2	80	88.889	Cebus_capucinus
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.360	ENSCATG00000015278	REXO2	80	88.360	Cercocebus_atys
ENSFALG00000010044	REXO2	94	89.418	ENSCLAG00000011195	REXO2	80	89.418	Chinchilla_lanigera
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.360	ENSCSAG00000002754	REXO2	80	88.360	Chlorocebus_sabaeus
ENSFALG00000010044	REXO2	99	83.663	ENSCHOG00000000642	-	85	83.663	Choloepus_hoffmanni
ENSFALG00000010044	REXO2	72	91.034	ENSCPBG00000009359	REXO2	100	91.034	Chrysemys_picta_bellii
ENSFALG00000010044	REXO2	83	59.880	ENSCING00000009858	-	80	59.880	Ciona_intestinalis
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.360	ENSCANG00000034756	REXO2	80	88.360	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFALG00000010044	REXO2	99	81.683	ENSCGRG00001010922	-	99	81.683	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.889	ENSCGRG00001019814	-	80	88.889	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFALG00000010044	REXO2	99	82.673	ENSCGRG00001013673	-	99	82.673	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.889	ENSCGRG00000006235	Rexo2	80	88.889	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFALG00000010044	REXO2	91	78.261	ENSCSEG00000007214	smfn	66	78.261	Cynoglossus_semilaevis
ENSFALG00000010044	REXO2	91	77.049	ENSCVAG00000012008	smfn	99	77.049	Cyprinodon_variegatus
ENSFALG00000010044	REXO2	91	78.142	ENSDARG00000009806	smfn	69	78.142	Danio_rerio
ENSFALG00000010044	REXO2	80	92.547	ENSDNOG00000046533	REXO2	77	92.547	Dasypus_novemcinctus
ENSFALG00000010044	REXO2	94	70.370	ENSDORG00000025142	-	88	67.327	Dipodomys_ordii
ENSFALG00000010044	REXO2	94	89.418	ENSDORG00000011255	Rexo2	80	89.418	Dipodomys_ordii
ENSFALG00000010044	REXO2	83	54.167	FBgn0039115	CG10214	80	54.167	Drosophila_melanogaster
ENSFALG00000010044	REXO2	85	76.163	ENSEBUG00000013964	REXO2	59	76.163	Eptatretus_burgeri
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.889	ENSEASG00005006674	REXO2	80	88.889	Equus_asinus_asinus
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.889	ENSECAG00000005988	REXO2	80	88.889	Equus_caballus
ENSFALG00000010044	REXO2	93	77.660	ENSELUG00000020072	smfn	65	77.660	Esox_lucius
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.889	ENSFCAG00000018632	REXO2	80	88.889	Felis_catus
ENSFALG00000010044	REXO2	94	89.418	ENSFDAG00000011764	REXO2	80	89.418	Fukomys_damarensis
ENSFALG00000010044	REXO2	86	79.310	ENSGMOG00000006370	smfn	90	79.310	Gadus_morhua
ENSFALG00000010044	REXO2	94	96.825	ENSGALG00000035980	REXO2	81	96.825	Gallus_gallus
ENSFALG00000010044	REXO2	93	75.401	ENSGAFG00000015349	smfn	67	75.401	Gambusia_affinis
ENSFALG00000010044	REXO2	89	74.444	ENSGACG00000020096	smfn	89	74.444	Gasterosteus_aculeatus
ENSFALG00000010044	REXO2	94	91.005	ENSGAGG00000021126	REXO2	82	91.005	Gopherus_agassizii
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.360	ENSGGOG00000023267	REXO2	80	88.360	Gorilla_gorilla
ENSFALG00000010044	REXO2	64	74.615	ENSHBUG00000020097	REXO2	63	74.615	Haplochromis_burtoni
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.889	ENSHGLG00000013556	REXO2	80	88.889	Heterocephalus_glaber_female
ENSFALG00000010044	REXO2	94	89.418	ENSHGLG00100005257	REXO2	80	89.418	Heterocephalus_glaber_male
ENSFALG00000010044	REXO2	89	76.111	ENSHCOG00000007122	smfn	98	76.111	Hippocampus_comes
ENSFALG00000010044	REXO2	93	80.851	ENSIPUG00000020440	rexo2	69	80.851	Ictalurus_punctatus
ENSFALG00000010044	REXO2	94	89.418	ENSSTOG00000012465	REXO2	80	89.418	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFALG00000010044	REXO2	94	89.418	ENSJJAG00000013710	-	80	89.418	Jaculus_jaculus
ENSFALG00000010044	REXO2	94	60.317	ENSJJAG00000022605	-	74	60.317	Jaculus_jaculus
ENSFALG00000010044	REXO2	92	75.135	ENSKMAG00000016795	smfn	65	75.135	Kryptolebias_marmoratus
ENSFALG00000010044	REXO2	90	77.901	ENSLBEG00000006021	smfn	96	77.901	Labrus_bergylta
ENSFALG00000010044	REXO2	91	75.806	ENSLACG00000018623	REXO2	76	75.806	Latimeria_chalumnae
ENSFALG00000010044	REXO2	94	79.894	ENSLOCG00000002389	smfn	90	79.894	Lepisosteus_oculatus
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.889	ENSLAFG00000012451	REXO2	80	88.889	Loxodonta_africana
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.360	ENSMFAG00000041155	REXO2	80	88.360	Macaca_fascicularis
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.360	ENSMMUG00000012269	REXO2	80	88.360	Macaca_mulatta
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.360	ENSMNEG00000033379	REXO2	80	88.360	Macaca_nemestrina
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.360	ENSMLEG00000036571	REXO2	80	88.360	Mandrillus_leucophaeus
ENSFALG00000010044	REXO2	93	79.255	ENSMAMG00000021209	smfn	68	79.255	Mastacembelus_armatus
ENSFALG00000010044	REXO2	92	77.838	ENSMZEG00005023224	-	71	77.838	Maylandia_zebra
ENSFALG00000010044	REXO2	92	77.838	ENSMZEG00005020730	REXO2	71	77.838	Maylandia_zebra
ENSFALG00000010044	REXO2	80	94.479	ENSMGAG00000003026	REXO2	100	94.479	Meleagris_gallopavo
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.889	ENSMAUG00000014576	Rexo2	80	88.889	Mesocricetus_auratus
ENSFALG00000010044	REXO2	94	89.418	ENSMICG00000010094	REXO2	80	89.418	Microcebus_murinus
ENSFALG00000010044	REXO2	94	89.418	ENSMOCG00000009016	Rexo2	80	89.418	Microtus_ochrogaster
ENSFALG00000010044	REXO2	93	76.596	ENSMMOG00000006430	smfn	70	76.596	Mola_mola
ENSFALG00000010044	REXO2	94	90.476	ENSMODG00000013913	REXO2	80	90.476	Monodelphis_domestica
ENSFALG00000010044	REXO2	93	76.471	ENSMALG00000018130	smfn	53	76.471	Monopterus_albus
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.360	MGP_CAROLIEiJ_G0032166	Rexo2	80	88.360	Mus_caroli
ENSFALG00000010044	REXO2	94	87.831	ENSMUSG00000032026	Rexo2	80	87.831	Mus_musculus
ENSFALG00000010044	REXO2	94	87.831	MGP_PahariEiJ_G0015034	Rexo2	80	87.831	Mus_pahari
ENSFALG00000010044	REXO2	94	87.831	MGP_SPRETEiJ_G0033305	Rexo2	80	87.831	Mus_spretus
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.889	ENSMPUG00000003947	REXO2	80	88.889	Mustela_putorius_furo
ENSFALG00000010044	REXO2	94	87.831	ENSMLUG00000009030	REXO2	80	87.831	Myotis_lucifugus
ENSFALG00000010044	REXO2	99	84.653	ENSNGAG00000008819	Rexo2	99	84.653	Nannospalax_galili
ENSFALG00000010044	REXO2	90	78.571	ENSNBRG00000006529	smfn	96	78.571	Neolamprologus_brichardi
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.360	ENSNLEG00000029745	REXO2	80	88.360	Nomascus_leucogenys
ENSFALG00000010044	REXO2	94	89.947	ENSMEUG00000011558	REXO2	87	89.947	Notamacropus_eugenii
ENSFALG00000010044	REXO2	66	90.299	ENSOPRG00000011076	REXO2	57	90.299	Ochotona_princeps
ENSFALG00000010044	REXO2	93	89.894	ENSODEG00000009750	-	100	89.894	Octodon_degus
ENSFALG00000010044	REXO2	80	72.222	ENSODEG00000016046	-	80	72.222	Octodon_degus
ENSFALG00000010044	REXO2	91	79.891	ENSONIG00000001954	smfn	79	79.891	Oreochromis_niloticus
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.360	ENSOANG00000001754	REXO2	79	88.360	Ornithorhynchus_anatinus
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.889	ENSOCUG00000004274	REXO2	76	88.889	Oryctolagus_cuniculus
ENSFALG00000010044	REXO2	92	79.032	ENSORLG00000005119	smfn	60	79.032	Oryzias_latipes
ENSFALG00000010044	REXO2	92	79.032	ENSORLG00020010121	smfn	60	79.032	Oryzias_latipes_hni
ENSFALG00000010044	REXO2	92	78.495	ENSORLG00015015699	smfn	60	78.495	Oryzias_latipes_hsok
ENSFALG00000010044	REXO2	70	77.465	ENSOMEG00000008940	-	99	77.465	Oryzias_melastigma
ENSFALG00000010044	REXO2	92	77.419	ENSOMEG00000016878	REXO2	68	77.419	Oryzias_melastigma
ENSFALG00000010044	REXO2	94	89.418	ENSOGAG00000016860	REXO2	80	89.418	Otolemur_garnettii
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.889	ENSOARG00000001040	REXO2	96	84.314	Ovis_aries
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.360	ENSPPAG00000039849	REXO2	80	88.360	Pan_paniscus
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.889	ENSPPRG00000007255	REXO2	80	88.889	Panthera_pardus
ENSFALG00000010044	REXO2	93	89.362	ENSPTIG00000015578	REXO2	100	89.362	Panthera_tigris_altaica
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.360	ENSPTRG00000004306	REXO2	80	88.360	Pan_troglodytes
ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.360	ENSPANG00000010675	REXO2	80	88.360	Papio_anubis
ENSFALG00000010044	REXO2	91	81.421	ENSPKIG00000000911	smfn	77	84.459	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFALG00000010044	REXO2	94	92.063	ENSPSIG00000005151	REXO2	69	92.063	Pelodiscus_sinensis
ENSFALG00000010044	REXO2	93	77.660	ENSPMGG00000007442	smfn	100	77.660	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFALG00000010044	REXO2	88	75.978	ENSPEMG00000001421	Rexo2	79	75.978	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFALG00000010044	REXO2	56	80.702	ENSPMAG00000001022	REXO2	98	80.702	Petromyzon_marinus
ENSFALG00000010044	REXO2	99	86.139	ENSPCIG00000011227	REXO2	50	90.476	Phascolarctos_cinereus
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