EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFALG00000010292 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Ficedula_albicollis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 53977 bases
Position: chrJH603206.1:5636610-5690586
Accession: 101817834
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFALP00000010734	IBN_N	PF03810.19	2e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFALT00000010777	TNPO1-201	3523	-	ENSFALP00000010734	890 (aa)	XP_005060854	U3K6T0

Gene Model

Click here to download ENSFALG00000010292's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSFALG00000010292's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.416	ENSG00000083312	TNPO1	100	97.927	Homo_sapiens
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	94.157	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	94.157	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	96.548	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	96.548	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFALG00000010292	TNPO1	87	93.669	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.669	Amphilophus_citrinellus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	94.270	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	94.270	Amphiprion_ocellaris
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	94.270	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	94.270	Amphiprion_percula
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	94.045	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	94.045	Anabas_testudineus
ENSFALG00000010292	TNPO1	99	93.799	ENSAPLG00000009619	-	99	93.799	Anas_platyrhynchos
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	98.539	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	98.539	Anolis_carolinensis
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	86.742	ENSANAG00000025351	-	99	86.742	Aotus_nancymaae
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	96.966	ENSANAG00000022453	-	99	96.966	Aotus_nancymaae
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	63.304	ENSANAG00000027118	-	99	63.525	Aotus_nancymaae
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	92.022	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	92.022	Astatotilapia_calliptera
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.049	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.713	Astyanax_mexicanus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.303	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	97.303	Bos_taurus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.079	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	97.079	Callithrix_jacchus
ENSFALG00000010292	TNPO1	96	97.316	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	97.316	Canis_familiaris
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	94.831	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	94.831	Canis_lupus_dingo
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.191	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	97.191	Capra_hircus
ENSFALG00000010292	TNPO1	99	93.559	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	96.023	Carlito_syrichta
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	96.966	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	96.966	Cebus_capucinus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.416	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	97.416	Cercocebus_atys
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	96.966	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	96.966	Chinchilla_lanigera
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.416	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	97.416	Chlorocebus_sabaeus
ENSFALG00000010292	TNPO1	94	84.863	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	84.863	Choloepus_hoffmanni
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	99.663	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	99.663	Chrysemys_picta_bellii
ENSFALG00000010292	TNPO1	99	75.870	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.645	Ciona_savignyi
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.416	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	97.416	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.303	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	97.303	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFALG00000010292	TNPO1	96	97.427	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	97.427	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.146	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	93.146	Cynoglossus_semilaevis
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.596	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.596	Cyprinodon_variegatus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.266	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.593	Danio_rerio
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	91.265	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	91.265	Dasypus_novemcinctus
ENSFALG00000010292	TNPO1	93	97.349	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	97.346	Dipodomys_ordii
ENSFALG00000010292	TNPO1	99	57.901	FBgn0035693	CG8219	99	57.901	Drosophila_melanogaster
ENSFALG00000010292	TNPO1	86	98.876	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	98.876	Echinops_telfairi
ENSFALG00000010292	TNPO1	94	85.357	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.476	Eptatretus_burgeri
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.416	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	97.416	Equus_asinus_asinus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.303	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	97.303	Equus_caballus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	86.928	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.383	Esox_lucius
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.416	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	97.416	Felis_catus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.079	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	97.079	Fukomys_damarensis
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.939	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.939	Fundulus_heteroclitus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	90.817	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.817	Gadus_morhua
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	98.427	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	98.427	Gallus_gallus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	92.825	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.825	Gambusia_affinis
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.483	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.483	Gasterosteus_aculeatus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	99.438	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	99.438	Gopherus_agassizii
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	81.278	ENSGGOG00000022535	-	98	81.278	Gorilla_gorilla
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.416	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	97.416	Gorilla_gorilla
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.708	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.708	Haplochromis_burtoni
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	96.742	ENSHGLG00000000970	-	99	96.742	Heterocephalus_glaber_female
ENSFALG00000010292	TNPO1	96	96.729	ENSHGLG00100017090	-	99	96.729	Heterocephalus_glaber_male
ENSFALG00000010292	TNPO1	97	75.698	ENSHGLG00100000963	-	99	75.233	Heterocephalus_glaber_male
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.528	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	97.528	Jaculus_jaculus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.933	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.933	Kryptolebias_marmoratus
ENSFALG00000010292	TNPO1	91	91.122	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	91.122	Labrus_bergylta
ENSFALG00000010292	TNPO1	96	89.535	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.535	Latimeria_chalumnae
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	96.292	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	96.292	Lepisosteus_oculatus
ENSFALG00000010292	TNPO1	97	96.998	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	96.998	Loxodonta_africana
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.416	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	97.416	Macaca_fascicularis
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.303	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	97.303	Macaca_mulatta
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.416	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	97.416	Macaca_nemestrina
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.416	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	97.416	Mandrillus_leucophaeus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	94.045	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	94.045	Mastacembelus_armatus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.371	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.371	Maylandia_zebra
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.303	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	97.753	Mesocricetus_auratus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.371	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	93.371	Microcebus_murinus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.303	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	97.303	Microtus_ochrogaster
ENSFALG00000010292	TNPO1	87	93.428	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	93.428	Mola_mola
ENSFALG00000010292	TNPO1	99	98.085	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	98.085	Monodelphis_domestica
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	92.697	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.697	Monopterus_albus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.079	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	97.753	Mus_caroli
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.303	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	97.753	Mus_musculus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.191	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	97.753	Mus_pahari
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.079	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	97.753	Mus_spretus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.303	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	97.303	Mustela_putorius_furo
ENSFALG00000010292	TNPO1	96	96.857	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	96.857	Myotis_lucifugus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.303	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	97.303	Nannospalax_galili
ENSFALG00000010292	TNPO1	87	93.540	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	93.540	Neolamprologus_brichardi
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.416	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	97.416	Nomascus_leucogenys
ENSFALG00000010292	TNPO1	90	91.054	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	91.054	Ochotona_princeps
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	96.742	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	96.742	Octodon_degus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	92.969	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.969	Oreochromis_niloticus
ENSFALG00000010292	TNPO1	92	98.537	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	98.537	Ornithorhynchus_anatinus
ENSFALG00000010292	TNPO1	96	91.005	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	91.005	Oryctolagus_cuniculus
ENSFALG00000010292	TNPO1	87	93.515	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	93.515	Oryzias_latipes
ENSFALG00000010292	TNPO1	99	93.461	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.461	Oryzias_latipes_hni
ENSFALG00000010292	TNPO1	99	93.687	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.687	Oryzias_latipes_hsok
ENSFALG00000010292	TNPO1	99	93.574	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.574	Oryzias_melastigma
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.416	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	97.416	Otolemur_garnettii
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.303	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	97.303	Ovis_aries
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.416	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	97.416	Pan_paniscus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.416	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	97.416	Panthera_pardus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.416	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	97.416	Panthera_tigris_altaica
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.416	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	97.416	Pan_troglodytes
ENSFALG00000010292	TNPO1	94	85.221	ENSPTRG00000047731	-	100	85.221	Pan_troglodytes
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.416	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	97.416	Papio_anubis
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	90.562	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	99.438	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	99.438	Pelodiscus_sinensis
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	90.460	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.460	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFALG00000010292	TNPO1	96	97.427	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	97.427	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	98.539	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.539	Phascolarctos_cinereus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.617	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	93.617	Poecilia_formosa
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.617	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.617	Poecilia_latipinna
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.820	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.820	Poecilia_mexicana
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.722	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.722	Poecilia_reticulata
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.303	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	97.303	Pongo_abelii
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.416	ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	97.416	Propithecus_coquereli
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.303	ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	97.303	Pteropus_vampyrus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.490	ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	93.490	Pundamilia_nyererei
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	92.601	ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	93.049	Pygocentrus_nattereri
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.528	ENSRNOG00000014999	Tnpo1	100	97.528	Rattus_norvegicus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.416	ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	97.416	Rhinopithecus_bieti
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.416	ENSRROG00000035271	TNPO1	99	97.416	Rhinopithecus_roxellana
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.079	ENSSBOG00000029256	TNPO1	100	97.079	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFALG00000010292	TNPO1	97	97.801	ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.801	Sarcophilus_harrisii
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	94.613	ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.613	Scleropages_formosus
ENSFALG00000010292	TNPO1	96	93.808	ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.808	Scophthalmus_maximus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	94.157	ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	94.157	Seriola_dumerili
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	94.157	ENSSLDG00000014578	tnpo1	100	94.157	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	98.764	ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	98.764	Sphenodon_punctatus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	94.270	ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	94.270	Stegastes_partitus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.416	ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	97.416	Sus_scrofa
ENSFALG00000010292	TNPO1	99	97.768	ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	97.768	Taeniopygia_guttata
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.708	ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	93.708	Takifugu_rubripes
ENSFALG00000010292	TNPO1	69	89.448	ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	89.448	Tetraodon_nigroviridis
ENSFALG00000010292	TNPO1	87	98.667	ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	98.667	Tupaia_belangeri
ENSFALG00000010292	TNPO1	96	93.801	ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	93.801	Tursiops_truncatus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.416	ENSUMAG00000007635	TNPO1	100	97.416	Ursus_maritimus
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.371	ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	93.371	Vicugna_pacos
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.416	ENSVVUG00000007338	TNPO1	100	97.416	Vulpes_vulpes
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	94.831	ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.831	Xenopus_tropicalis
ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.490	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.490	Xiphophorus_maculatus