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Description

Ensembl ID: ENSFALG00000010416 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: BAF190|BRM|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Ficedula_albicollis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 125939 bases
Position: chrJH603206.1:6905987-7031925
Accession: 101821220
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFALP00000010894	ResIII	PF04851.15	1e-08	1	1
ENSFALP00000010890	ResIII	PF04851.15	1.1e-08	1	1
ENSFALP00000010894	BRK	PF07533.16	7.1e-18	1	1
ENSFALP00000010890	BRK	PF07533.16	7.8e-18	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFALT00000010938	SMARCA2-202	6648	-	ENSFALP00000010894	1458 (aa)	-	U3K790
ENSFALT00000010934	SMARCA2-201	6648	-	ENSFALP00000010890	1568 (aa)	XP_005060876	U3K786

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSFALG00000010416	SMARCA2	80	84.357	ENSFALG00000004208	SMARCA4	92	76.362

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	92.760	ENSG00000080503	SMARCA2	100	97.987	Homo_sapiens
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	82.027	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.064	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	86	95.856	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	95.856	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	80.660	ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.153	Amphilophus_citrinellus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	81.849	ENSAOCG00000009647	-	97	80.090	Amphiprion_ocellaris
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	81.959	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	97	80.129	Amphiprion_percula
ENSFALG00000010416	SMARCA2	98	82.647	ENSATEG00000006916	SMARCA2	95	80.757	Anabas_testudineus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	98	87.476	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	100	87.476	Anas_platyrhynchos
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	93.347	ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	92.994	Anolis_carolinensis
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	92.466	ENSANAG00000026498	SMARCA2	100	92.048	Aotus_nancymaae
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	81.948	ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	79.359	Astatotilapia_calliptera
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	82.749	ENSAMXG00000012404	smarca2	97	82.045	Astyanax_mexicanus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	92.740	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	100	92.181	Bos_taurus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	92.292	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	91.883	Callithrix_jacchus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	92.877	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	100	92.303	Canis_familiaris
ENSFALG00000010416	SMARCA2	82	94.491	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	97	94.491	Canis_lupus_dingo
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	92.740	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	100	92.181	Capra_hircus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	89.384	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	91.571	Carlito_syrichta
ENSFALG00000010416	SMARCA2	99	87.762	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	99	85.949	Cavia_aperea
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	90.872	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	100	89.021	Cavia_porcellus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	92.466	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	100	92.176	Cebus_capucinus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	91.997	ENSCATG00000031470	SMARCA2	100	90.641	Cercocebus_atys
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	90.167	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	91.614	Chinchilla_lanigera
ENSFALG00000010416	SMARCA2	93	92.415	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	92.089	Chlorocebus_sabaeus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	85	87.821	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	86	87.821	Choloepus_hoffmanni
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	95.748	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	100	95.541	Chrysemys_picta_bellii
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	92.123	ENSCANG00000039597	SMARCA2	100	92.005	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	88	88.949	ENSCGRG00001002323	Smarca2	100	85.487	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFALG00000010416	SMARCA2	98	77.778	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	94	75.181	Cynoglossus_semilaevis
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	84.071	ENSDARG00000008904	smarca2	97	82.219	Danio_rerio
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	91.599	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	100	91.436	Dasypus_novemcinctus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	91.923	ENSDORG00000014832	Smarca2	100	91.698	Dipodomys_ordii
ENSFALG00000010416	SMARCA2	86	58.537	FBgn0000212	brm	90	52.396	Drosophila_melanogaster
ENSFALG00000010416	SMARCA2	95	72.175	ENSEBUG00000011442	-	95	69.539	Eptatretus_burgeri
ENSFALG00000010416	SMARCA2	94	62.314	ENSEBUG00000002449	-	95	64.396	Eptatretus_burgeri
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	92.466	ENSEASG00005010312	SMARCA2	100	92.430	Equus_asinus_asinus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	69	94.444	ENSEEUG00000015540	-	67	94.444	Erinaceus_europaeus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	94	82.749	ENSELUG00000010318	smarca2	95	80.367	Esox_lucius
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	92.534	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	100	91.858	Felis_catus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	99	90.285	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	100	89.228	Fukomys_damarensis
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	81.727	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.127	Fundulus_heteroclitus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	98	78.527	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.654	Gadus_morhua
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	98.354	ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	98.214	Gallus_gallus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	94	76.906	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	91	75.275	Gambusia_affinis
ENSFALG00000010416	SMARCA2	98	80.835	ENSGACG00000014488	SMARCA2	97	78.669	Gasterosteus_aculeatus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	95.679	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	100	95.541	Gopherus_agassizii
ENSFALG00000010416	SMARCA2	92	96.653	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	98	95.128	Gorilla_gorilla
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	81.794	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	80.424	Haplochromis_burtoni
ENSFALG00000010416	SMARCA2	99	90.859	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	98	90.230	Heterocephalus_glaber_female
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	91.814	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	100	90.127	Heterocephalus_glaber_male
ENSFALG00000010416	SMARCA2	78	85.856	ENSHCOG00000015348	-	86	86.067	Hippocampus_comes
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	82.105	ENSIPUG00000011060	smarca2	96	81.872	Ictalurus_punctatus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	91.934	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	100	91.683	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	91.712	ENSJJAG00000010867	Smarca2	100	90.829	Jaculus_jaculus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	80.533	ENSKMAG00000015844	-	98	79.771	Kryptolebias_marmoratus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	84.953	ENSLOCG00000011499	smarca2	100	84.476	Lepisosteus_oculatus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	90.780	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	90.800	Loxodonta_africana
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	90.637	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	100	86.452	Macaca_fascicularis
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	92.603	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	100	92.132	Macaca_mulatta
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	91.724	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	100	91.931	Macaca_nemestrina
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	89.745	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	100	90.413	Mandrillus_leucophaeus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	82.219	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	98	80.190	Mastacembelus_armatus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	81.959	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	97	80.579	Maylandia_zebra
ENSFALG00000010416	SMARCA2	77	81.545	ENSMGAG00000005160	-	100	79.416	Meleagris_gallopavo
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	92.397	ENSMICG00000005162	SMARCA2	100	92.112	Microcebus_murinus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	92.266	ENSMOCG00000001611	Smarca2	100	91.429	Microtus_ochrogaster
ENSFALG00000010416	SMARCA2	98	79.571	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	95	77.955	Mola_mola
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	95.134	ENSMODG00000003578	SMARCA2	100	94.526	Monodelphis_domestica
ENSFALG00000010416	SMARCA2	98	81.774	ENSMALG00000009611	SMARCA2	96	80.040	Monopterus_albus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	90	95.427	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	100	90.680	Mus_caroli
ENSFALG00000010416	SMARCA2	90	95.496	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	98.324	Mus_musculus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	90	95.038	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	100	90.662	Mus_pahari
ENSFALG00000010416	SMARCA2	89	96.071	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	95	100.000	Mus_spretus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	87	95.632	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	94	95.632	Mustela_putorius_furo
ENSFALG00000010416	SMARCA2	99	87.643	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	99	87.270	Myotis_lucifugus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	99	90.000	ENSNGAG00000000108	Smarca2	99	89.119	Nannospalax_galili
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	69.179	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	83.085	Neolamprologus_brichardi
ENSFALG00000010416	SMARCA2	87	95.886	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	90.573	Nomascus_leucogenys
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	85.148	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	100	85.085	Notamacropus_eugenii
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	86.826	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	86.174	Ochotona_princeps
ENSFALG00000010416	SMARCA2	88	95.046	ENSODEG00000005452	SMARCA2	98	90.364	Octodon_degus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	98	82.090	ENSONIG00000014163	SMARCA2	96	80.374	Oreochromis_niloticus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	53	92.949	ENSOANG00000008299	-	95	96.501	Ornithorhynchus_anatinus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	87	97.082	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	100	89.303	Oryctolagus_cuniculus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	80.689	ENSORLG00000020820	SMARCA2	100	79.511	Oryzias_latipes
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	81.014	ENSORLG00015006289	SMARCA2	100	78.585	Oryzias_latipes_hsok
ENSFALG00000010416	SMARCA2	98	82.133	ENSOMEG00000009736	-	100	79.698	Oryzias_melastigma
ENSFALG00000010416	SMARCA2	87	96.919	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	90.095	Otolemur_garnettii
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	91.918	ENSOARG00000013265	SMARCA2	100	89.805	Ovis_aries
ENSFALG00000010416	SMARCA2	93	96.715	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	97	96.715	Pan_paniscus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	92.603	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	100	91.921	Panthera_pardus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	93.092	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	100	92.249	Pan_troglodytes
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	86.612	ENSPANG00000025121	SMARCA2	100	84.831	Papio_anubis
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	85.479	ENSPKIG00000018469	-	100	83.471	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	95.483	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	100	95.296	Pelodiscus_sinensis
ENSFALG00000010416	SMARCA2	98	75.482	ENSPMGG00000013696	-	93	76.168	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	89.683	ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	90.476	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFALG00000010416	SMARCA2	94	74.723	ENSPMAG00000005337	-	94	72.900	Petromyzon_marinus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	95.065	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	100	94.462	Phascolarctos_cinereus
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	81.751	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	98	79.797	Poecilia_formosa
ENSFALG00000010416	SMARCA2	98	81.301	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	94	79.832	Poecilia_latipinna
ENSFALG00000010416	SMARCA2	98	81.220	ENSPMEG00000001815	-	97	79.670	Poecilia_mexicana
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	81.121	ENSPREG00000013800	SMARCA2	98	79.810	Poecilia_reticulata
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	92.555	ENSPPYG00000019258	SMARCA2	100	91.624	Pongo_abelii
ENSFALG00000010416	SMARCA2	79	79.298	ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	79.298	Procavia_capensis
ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	90.212	ENSPCOG00000025709	SMARCA2	100	90.013	Propithecus_coquereli
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