EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFALG00000010989 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: XPO1
Alias: CRM1|emb
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Ficedula_albicollis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 33362 bases
Position: chrJH603248.1:1138544-1171905
Accession: 101805916
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFALP00000011465	CRM1_C	PF08767.11	1.8e-135	1	1
ENSFALP00000011465	Xpo1	PF08389.12	1.9e-41	1	1
ENSFALP00000011465	IBN_N	PF03810.19	1.3e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFALT00000011511	XPO1-201	6367	-	ENSFALP00000011465	1071 (aa)	XP_005042701	U3K8W1

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFALG00000010989	XPO1	100	98.319	ENSG00000082898	XPO1	100	99.441	Homo_sapiens
ENSFALG00000010989	XPO1	100	96.452	ENSAPOG00000004984	-	100	96.452	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFALG00000010989	XPO1	88	90.532	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	90.532	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.347	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	99.347	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFALG00000010989	XPO1	88	96.702	ENSACIG00000010818	-	100	96.702	Amphilophus_citrinellus
ENSFALG00000010989	XPO1	88	92.872	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.872	Amphilophus_citrinellus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	96.452	ENSAOCG00000010121	-	100	96.452	Amphiprion_ocellaris
ENSFALG00000010989	XPO1	100	92.063	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	92.063	Amphiprion_ocellaris
ENSFALG00000010989	XPO1	100	96.452	ENSAPEG00000007038	-	100	96.452	Amphiprion_percula
ENSFALG00000010989	XPO1	91	92.688	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	92.688	Amphiprion_percula
ENSFALG00000010989	XPO1	100	96.452	ENSATEG00000008816	-	100	96.452	Anabas_testudineus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	91.690	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	91.690	Anabas_testudineus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.720	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	99.720	Anas_platyrhynchos
ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.533	ENSACAG00000002501	XPO1	100	99.533	Anolis_carolinensis
ENSFALG00000010989	XPO1	100	98.319	ENSANAG00000020802	XPO1	100	98.319	Aotus_nancymaae
ENSFALG00000010989	XPO1	88	93.191	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	93.191	Astatotilapia_calliptera
ENSFALG00000010989	XPO1	100	96.265	ENSACLG00000015192	-	100	96.265	Astatotilapia_calliptera
ENSFALG00000010989	XPO1	100	96.825	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	96.825	Astyanax_mexicanus
ENSFALG00000010989	XPO1	88	94.068	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	94.068	Astyanax_mexicanus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.440	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	99.440	Bos_taurus
ENSFALG00000010989	XPO1	99	51.941	WBGene00002078	xpo-1	99	51.941	Caenorhabditis_elegans
ENSFALG00000010989	XPO1	100	98.319	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.319	Callithrix_jacchus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.440	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	99.440	Canis_familiaris
ENSFALG00000010989	XPO1	93	99.398	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	99.398	Canis_lupus_dingo
ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.440	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	99.440	Capra_hircus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.440	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	99.440	Carlito_syrichta
ENSFALG00000010989	XPO1	53	94.858	ENSCAPG00000006454	-	100	94.858	Cavia_aperea
ENSFALG00000010989	XPO1	100	97.946	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	97.946	Cavia_porcellus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	79.314	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.499	Cebus_capucinus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	96.555	ENSCATG00000032674	XPO1	100	98.191	Cercocebus_atys
ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.160	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	99.160	Chinchilla_lanigera
ENSFALG00000010989	XPO1	100	98.319	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.319	Chlorocebus_sabaeus
ENSFALG00000010989	XPO1	83	99.481	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.481	Choloepus_hoffmanni
ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.627	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.627	Chrysemys_picta_bellii
ENSFALG00000010989	XPO1	100	81.192	ENSCING00000024562	-	100	81.192	Ciona_intestinalis
ENSFALG00000010989	XPO1	99	80.205	ENSCSAVG00000005965	-	99	80.205	Ciona_savignyi
ENSFALG00000010989	XPO1	100	94.211	ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.050	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	98.133	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.133	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFALG00000010989	XPO1	100	98.133	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	98.133	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFALG00000010989	XPO1	88	95.532	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.532	Cynoglossus_semilaevis
ENSFALG00000010989	XPO1	100	96.359	ENSCVAG00000016788	-	100	96.359	Cyprinodon_variegatus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	91.410	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	91.410	Cyprinodon_variegatus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	93.091	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	95.356	Danio_rerio
ENSFALG00000010989	XPO1	100	97.199	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	97.199	Danio_rerio
ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.533	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	99.533	Dasypus_novemcinctus
ENSFALG00000010989	XPO1	92	95.969	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	95.969	Dipodomys_ordii
ENSFALG00000010989	XPO1	99	71.134	FBgn0020497	emb	99	71.134	Drosophila_melanogaster
ENSFALG00000010989	XPO1	94	98.155	ENSETEG00000018045	XPO1	94	98.155	Echinops_telfairi
ENSFALG00000010989	XPO1	90	79.876	ENSEBUG00000012580	-	100	88.402	Eptatretus_burgeri
ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.440	ENSEASG00005007223	XPO1	100	99.440	Equus_asinus_asinus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.440	ENSECAG00000024920	XPO1	100	99.440	Equus_caballus
ENSFALG00000010989	XPO1	92	100.000	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSFALG00000010989	XPO1	88	95.319	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	95.319	Esox_lucius
ENSFALG00000010989	XPO1	87	93.255	ENSELUG00000014306	-	99	93.255	Esox_lucius
ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.440	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	99.440	Felis_catus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	97.572	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	97.572	Fukomys_damarensis
ENSFALG00000010989	XPO1	100	91.783	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	91.783	Fundulus_heteroclitus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	92.904	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	92.904	Gadus_morhua
ENSFALG00000010989	XPO1	100	90.383	ENSGMOG00000019063	-	100	90.383	Gadus_morhua
ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.720	ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.720	Gallus_gallus
ENSFALG00000010989	XPO1	88	92.766	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.766	Gambusia_affinis
ENSFALG00000010989	XPO1	91	96.395	ENSGAFG00000003355	-	98	96.395	Gambusia_affinis
ENSFALG00000010989	XPO1	100	91.597	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.597	Gasterosteus_aculeatus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	96.172	ENSGACG00000002743	-	100	96.172	Gasterosteus_aculeatus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.533	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.533	Gopherus_agassizii
ENSFALG00000010989	XPO1	100	98.319	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	98.319	Gorilla_gorilla
ENSFALG00000010989	XPO1	100	96.359	ENSHBUG00000020037	-	100	96.359	Haplochromis_burtoni
ENSFALG00000010989	XPO1	100	92.250	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	92.250	Haplochromis_burtoni
ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.066	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	99.066	Heterocephalus_glaber_female
ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.066	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	99.066	Heterocephalus_glaber_male
ENSFALG00000010989	XPO1	88	95.638	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	95.638	Hippocampus_comes
ENSFALG00000010989	XPO1	100	96.825	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	96.825	Ictalurus_punctatus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	94.118	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.118	Ictalurus_punctatus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.253	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.253	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.160	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	99.160	Jaculus_jaculus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	91.690	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	91.690	Kryptolebias_marmoratus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	95.892	ENSKMAG00000016218	-	100	95.892	Kryptolebias_marmoratus
ENSFALG00000010989	XPO1	88	90.254	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	90.254	Labrus_bergylta
ENSFALG00000010989	XPO1	100	96.452	ENSLBEG00000005740	-	100	96.452	Labrus_bergylta
ENSFALG00000010989	XPO1	100	77.562	ENSLACG00000018213	XPO1	100	77.562	Latimeria_chalumnae
ENSFALG00000010989	XPO1	100	97.106	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	97.106	Lepisosteus_oculatus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.066	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	99.066	Loxodonta_africana
ENSFALG00000010989	XPO1	100	98.319	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	98.319	Macaca_fascicularis
ENSFALG00000010989	XPO1	100	98.319	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	98.319	Macaca_mulatta
ENSFALG00000010989	XPO1	100	98.319	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	98.319	Macaca_nemestrina
ENSFALG00000010989	XPO1	100	96.558	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	96.558	Mandrillus_leucophaeus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	91.970	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	91.970	Mastacembelus_armatus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	96.359	ENSMAMG00000010568	-	100	96.359	Mastacembelus_armatus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	92.250	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	92.250	Maylandia_zebra
ENSFALG00000010989	XPO1	100	96.265	ENSMZEG00005018158	-	98	96.395	Maylandia_zebra
ENSFALG00000010989	XPO1	68	99.449	ENSMGAG00000001496	-	100	99.449	Meleagris_gallopavo
ENSFALG00000010989	XPO1	100	98.133	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	98.133	Mesocricetus_auratus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.440	ENSMICG00000027770	XPO1	100	99.440	Microcebus_murinus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	98.413	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	98.413	Microtus_ochrogaster
ENSFALG00000010989	XPO1	87	96.371	ENSMMOG00000008001	-	99	96.371	Mola_mola
ENSFALG00000010989	XPO1	88	92.872	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	92.872	Mola_mola
ENSFALG00000010989	XPO1	100	98.506	ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.506	Monodelphis_domestica
ENSFALG00000010989	XPO1	100	95.985	ENSMALG00000007085	-	100	95.985	Monopterus_albus
ENSFALG00000010989	XPO1	88	92.136	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	92.136	Monopterus_albus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	98.506	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	98.506	Mus_caroli
ENSFALG00000010989	XPO1	100	98.599	ENSMUSG00000020290	Xpo1	100	98.599	Mus_musculus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	98.599	MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	98.599	Mus_pahari
ENSFALG00000010989	XPO1	100	98.599	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	100	98.599	Mus_spretus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.440	ENSMPUG00000005560	XPO1	100	99.440	Mustela_putorius_furo
ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.346	ENSMLUG00000010670	XPO1	100	99.346	Myotis_lucifugus
ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.253	ENSNGAG00000022158	Xpo1	100	99.253	Nannospalax_galili
ENSFALG00000010989	XPO1	96	95.741	ENSNBRG00000012229	-	100	96.809	Neolamprologus_brichardi
ENSFALG00000010989	XPO1	100	92.250	ENSNBRG00000003776	xpo1a	100	92.250	Neolamprologus_brichardi
ENSFALG00000010989	XPO1	100	94.449	ENSNLEG00000009680	XPO1	100	94.449	Nomascus_leucogenys
ENSFALG00000010989	XPO1	63	100.000	ENSMEUG00000013277	-	63	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSFALG00000010989	XPO1	100	93.838	ENSOPRG00000012615	XPO1	100	93.838	Ochotona_princeps
ENSFALG00000010989	XPO1	100	97.852	ENSODEG00000012632	XPO1	100	97.852	Octodon_degus
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ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.440	ENSVVUG00000012009	XPO1	100	99.440	Vulpes_vulpes
ENSFALG00000010989	XPO1	100	97.852	ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.852	Xenopus_tropicalis
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ENSFALG00000010989	XPO1	78	97.187	ENSXCOG00000006625	-	97	97.187	Xiphophorus_couchianus
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