EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFALG00000011086 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: IPO11
Alias: RanBP11
Full Name: importin 11
Gene Type: protein_coding
Species: Ficedula_albicollis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 73807 bases
Position: chrJH603251.1:3818729-3892535
Accession: 101813201
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFALP00000011568	IBN_N	PF03810.19	4.4e-20	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFALT00000011615	IPO11-201	3421	XM_005060673	ENSFALP00000011568	975 (aa)	XP_005060730	U3K964

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFALG00000011086	IPO11	100	90.051	ENSG00000086200	IPO11	100	96.825	Homo_sapiens
ENSFALG00000011086	IPO11	100	84.513	ENSAPOG00000009256	ipo11	100	84.513	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	89.867	ENSAMEG00000004080	IPO11	99	89.867	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFALG00000011086	IPO11	91	85.786	ENSACIG00000003345	ipo11	98	85.608	Amphilophus_citrinellus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	80.879	ENSAOCG00000000164	ipo11	100	80.879	Amphiprion_ocellaris
ENSFALG00000011086	IPO11	100	80.777	ENSAPEG00000005496	ipo11	100	80.777	Amphiprion_percula
ENSFALG00000011086	IPO11	95	85.141	ENSATEG00000016853	ipo11	99	85.141	Anabas_testudineus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	89.239	ENSAPLG00000009338	IPO11	100	89.239	Anas_platyrhynchos
ENSFALG00000011086	IPO11	100	90.872	ENSACAG00000008472	IPO11	99	90.872	Anolis_carolinensis
ENSFALG00000011086	IPO11	100	89.949	ENSANAG00000027877	IPO11	99	89.949	Aotus_nancymaae
ENSFALG00000011086	IPO11	100	79.409	ENSACLG00000014997	ipo11	100	79.409	Astatotilapia_calliptera
ENSFALG00000011086	IPO11	100	76.127	ENSAMXG00000005993	ipo11	100	76.176	Astyanax_mexicanus
ENSFALG00000011086	IPO11	88	89.082	ENSBTAG00000018616	IPO11	98	89.125	Bos_taurus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	89.846	ENSCJAG00000015559	IPO11	99	89.846	Callithrix_jacchus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	90.462	ENSCAFG00000007240	IPO11	100	90.462	Canis_familiaris
ENSFALG00000011086	IPO11	72	89.062	ENSCAFG00020022776	-	99	89.062	Canis_lupus_dingo
ENSFALG00000011086	IPO11	100	89.436	ENSCHIG00000013218	IPO11	100	89.436	Capra_hircus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	88.205	ENSCPOG00000009412	IPO11	100	88.205	Cavia_porcellus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	90.051	ENSCCAG00000024860	IPO11	99	90.051	Cebus_capucinus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	89.949	ENSCATG00000040159	IPO11	100	89.949	Cercocebus_atys
ENSFALG00000011086	IPO11	100	89.949	ENSCLAG00000003889	IPO11	100	89.949	Chinchilla_lanigera
ENSFALG00000011086	IPO11	56	89.687	ENSCSAG00000016001	IPO11	96	89.687	Chlorocebus_sabaeus
ENSFALG00000011086	IPO11	76	88.090	ENSCHOG00000002780	IPO11	77	88.300	Choloepus_hoffmanni
ENSFALG00000011086	IPO11	100	93.641	ENSCPBG00000026824	IPO11	100	93.641	Chrysemys_picta_bellii
ENSFALG00000011086	IPO11	99	34.646	ENSCING00000006626	-	99	34.646	Ciona_intestinalis
ENSFALG00000011086	IPO11	99	34.347	ENSCSAVG00000003664	-	99	34.347	Ciona_savignyi
ENSFALG00000011086	IPO11	100	83.657	ENSCANG00000042405	IPO11	98	88.298	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	88.923	ENSCGRG00001012206	Ipo11	100	88.923	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFALG00000011086	IPO11	100	88.923	ENSCGRG00000003026	-	100	88.923	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFALG00000011086	IPO11	100	83.385	ENSCSEG00000017257	ipo11	100	83.385	Cynoglossus_semilaevis
ENSFALG00000011086	IPO11	100	83.590	ENSCVAG00000011995	ipo11	100	83.590	Cyprinodon_variegatus
ENSFALG00000011086	IPO11	99	83.573	ENSDARG00000054224	ipo11	99	83.573	Danio_rerio
ENSFALG00000011086	IPO11	100	86.872	ENSDORG00000002721	Ipo11	100	86.872	Dipodomys_ordii
ENSFALG00000011086	IPO11	99	35.431	FBgn0284254	Impbeta11	95	34.360	Drosophila_melanogaster
ENSFALG00000011086	IPO11	99	60.082	ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.185	Eptatretus_burgeri
ENSFALG00000011086	IPO11	54	83.962	ENSEASG00005006951	-	98	83.962	Equus_asinus_asinus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	89.846	ENSECAG00000014185	IPO11	98	89.846	Equus_caballus
ENSFALG00000011086	IPO11	92	90.337	ENSEEUG00000000271	IPO11	92	90.337	Erinaceus_europaeus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	83.077	ENSELUG00000002842	ipo11	98	86.857	Esox_lucius
ENSFALG00000011086	IPO11	100	90.462	ENSFCAG00000003236	IPO11	100	90.462	Felis_catus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	89.846	ENSFDAG00000016117	IPO11	100	89.846	Fukomys_damarensis
ENSFALG00000011086	IPO11	93	88.372	ENSFHEG00000017985	ipo11	100	88.372	Fundulus_heteroclitus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	81.641	ENSGMOG00000007727	ipo11	100	81.641	Gadus_morhua
ENSFALG00000011086	IPO11	100	93.026	ENSGALG00000014740	IPO11	100	93.026	Gallus_gallus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	83.385	ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.931	Gambusia_affinis
ENSFALG00000011086	IPO11	100	82.154	ENSGACG00000006939	ipo11	100	82.154	Gasterosteus_aculeatus
ENSFALG00000011086	IPO11	92	87.319	ENSGAGG00000008880	IPO11	99	87.447	Gopherus_agassizii
ENSFALG00000011086	IPO11	100	90.154	ENSGGOG00000003240	IPO11	100	90.154	Gorilla_gorilla
ENSFALG00000011086	IPO11	100	84.308	ENSHBUG00000004364	ipo11	100	84.308	Haplochromis_burtoni
ENSFALG00000011086	IPO11	100	89.846	ENSHGLG00000002375	IPO11	100	89.846	Heterocephalus_glaber_female
ENSFALG00000011086	IPO11	100	89.949	ENSHGLG00100011662	IPO11	100	89.949	Heterocephalus_glaber_male
ENSFALG00000011086	IPO11	100	79.735	ENSHCOG00000013529	ipo11	100	79.735	Hippocampus_comes
ENSFALG00000011086	IPO11	99	70.154	ENSIPUG00000019077	clc4f	99	70.154	Ictalurus_punctatus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	90.256	ENSSTOG00000006070	IPO11	100	90.256	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	89.436	ENSJJAG00000007223	Ipo11	100	89.436	Jaculus_jaculus
ENSFALG00000011086	IPO11	99	82.922	ENSKMAG00000013674	ipo11	100	83.230	Kryptolebias_marmoratus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	84.308	ENSLBEG00000003126	ipo11	100	84.615	Labrus_bergylta
ENSFALG00000011086	IPO11	100	82.786	ENSLOCG00000007848	ipo11	100	85.559	Lepisosteus_oculatus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	90.051	ENSLAFG00000003115	IPO11	100	89.401	Loxodonta_africana
ENSFALG00000011086	IPO11	100	89.949	ENSMFAG00000035631	IPO11	98	89.949	Macaca_fascicularis
ENSFALG00000011086	IPO11	100	89.949	ENSMMUG00000001233	IPO11	100	95.062	Macaca_mulatta
ENSFALG00000011086	IPO11	100	90.051	ENSMNEG00000032061	IPO11	98	90.051	Macaca_nemestrina
ENSFALG00000011086	IPO11	100	89.846	ENSMLEG00000014468	IPO11	100	89.846	Mandrillus_leucophaeus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	84.513	ENSMAMG00000020889	ipo11	100	88.953	Mastacembelus_armatus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	84.308	ENSMZEG00005006586	ipo11	100	84.308	Maylandia_zebra
ENSFALG00000011086	IPO11	100	80.996	ENSMGAG00000004204	IPO11	100	80.996	Meleagris_gallopavo
ENSFALG00000011086	IPO11	100	77.120	ENSMAUG00000020293	Ipo11	100	76.098	Mesocricetus_auratus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	88.103	ENSMICG00000036842	-	100	88.103	Microcebus_murinus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	90.051	ENSMICG00000016463	-	100	90.051	Microcebus_murinus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	88.615	ENSMOCG00000000236	Ipo11	100	88.615	Microtus_ochrogaster
ENSFALG00000011086	IPO11	100	81.059	ENSMMOG00000001391	ipo11	100	81.059	Mola_mola
ENSFALG00000011086	IPO11	100	90.051	ENSMODG00000019612	IPO11	100	90.051	Monodelphis_domestica
ENSFALG00000011086	IPO11	100	83.487	ENSMALG00000017198	ipo11	100	83.487	Monopterus_albus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	88.615	MGP_CAROLIEiJ_G0018871	Ipo11	100	88.615	Mus_caroli
ENSFALG00000011086	IPO11	100	88.821	ENSMUSG00000042590	Ipo11	100	88.821	Mus_musculus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	87.795	MGP_PahariEiJ_G0015943	Ipo11	100	87.795	Mus_pahari
ENSFALG00000011086	IPO11	100	88.821	MGP_SPRETEiJ_G0019750	Ipo11	100	88.821	Mus_spretus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	87.385	ENSMPUG00000007026	IPO11	100	87.385	Mustela_putorius_furo
ENSFALG00000011086	IPO11	100	89.026	ENSMLUG00000011760	IPO11	99	89.026	Myotis_lucifugus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	89.436	ENSNGAG00000007024	Ipo11	100	89.436	Nannospalax_galili
ENSFALG00000011086	IPO11	95	78.919	ENSNBRG00000013831	ipo11	99	78.919	Neolamprologus_brichardi
ENSFALG00000011086	IPO11	100	89.949	ENSNLEG00000003072	IPO11	100	89.949	Nomascus_leucogenys
ENSFALG00000011086	IPO11	74	89.130	ENSMEUG00000003783	-	74	89.130	Notamacropus_eugenii
ENSFALG00000011086	IPO11	100	89.538	ENSODEG00000017269	IPO11	100	89.538	Octodon_degus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	84.410	ENSONIG00000015147	ipo11	100	84.410	Oreochromis_niloticus
ENSFALG00000011086	IPO11	84	88.617	ENSOANG00000012524	IPO11	89	88.653	Ornithorhynchus_anatinus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	83.282	ENSORLG00000004267	ipo11	100	88.372	Oryzias_latipes
ENSFALG00000011086	IPO11	100	83.487	ENSORLG00020002280	ipo11	100	83.487	Oryzias_latipes_hni
ENSFALG00000011086	IPO11	100	83.282	ENSORLG00015010565	ipo11	100	88.953	Oryzias_latipes_hsok
ENSFALG00000011086	IPO11	100	83.590	ENSOMEG00000021765	ipo11	100	83.590	Oryzias_melastigma
ENSFALG00000011086	IPO11	100	90.462	ENSOGAG00000000533	IPO11	99	90.462	Otolemur_garnettii
ENSFALG00000011086	IPO11	100	89.436	ENSOARG00000006763	IPO11	99	89.436	Ovis_aries
ENSFALG00000011086	IPO11	100	90.051	ENSPPAG00000042249	IPO11	100	90.051	Pan_paniscus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	90.564	ENSPPRG00000000856	IPO11	99	90.564	Panthera_pardus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	90.564	ENSPTIG00000015280	IPO11	100	90.564	Panthera_tigris_altaica
ENSFALG00000011086	IPO11	100	90.154	ENSPTRG00000016915	IPO11	100	90.154	Pan_troglodytes
ENSFALG00000011086	IPO11	100	89.949	ENSPANG00000013348	IPO11	100	89.949	Papio_anubis
ENSFALG00000011086	IPO11	100	84.308	ENSPKIG00000016964	ipo11	100	84.308	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFALG00000011086	IPO11	100	92.623	ENSPSIG00000002959	IPO11	100	92.623	Pelodiscus_sinensis
ENSFALG00000011086	IPO11	91	77.678	ENSPMGG00000013232	ipo11	96	77.678	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFALG00000011086	IPO11	100	88.513	ENSPEMG00000018393	Ipo11	100	88.513	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFALG00000011086	IPO11	100	89.846	ENSPCIG00000023292	IPO11	100	89.846	Phascolarctos_cinereus
ENSFALG00000011086	IPO11	74	90.678	ENSPFOG00000019348	ipo11	98	84.477	Poecilia_formosa
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