EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFALG00000014026 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: REXO5
Alias: NEF-sp
Full Name: RNA exonuclease 5
Gene Type: protein_coding
Species: Ficedula_albicollis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12522 bases
Position: chrJH603209.1:6165190-6177711
Accession: 24661
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFALP00000014638	RRM_1	PF00076.22	5.7e-19	1	2
ENSFALP00000014638	RRM_1	PF00076.22	5.7e-19	2	2
ENSFALP00000014638	RNase_T	PF00929.24	5.8e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFALT00000014702	REXO5-201	3396	-	ENSFALP00000014638	736 (aa)	-	U3KHY4

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFALG00000014026	REXO5	99	48.198	ENSG00000005189	REXO5	97	65.942	Homo_sapiens
ENSFALG00000014026	REXO5	97	36.585	ENSAPOG00000008514	REXO5	91	36.585	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFALG00000014026	REXO5	99	48.800	ENSAMEG00000006178	REXO5	93	48.800	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFALG00000014026	REXO5	97	36.884	ENSAPEG00000010627	REXO5	92	35.944	Amphiprion_percula
ENSFALG00000014026	REXO5	72	41.777	ENSATEG00000004682	REXO5	96	40.120	Anabas_testudineus
ENSFALG00000014026	REXO5	99	82.201	ENSAPLG00000015740	REXO5	100	82.201	Anas_platyrhynchos
ENSFALG00000014026	REXO5	99	52.233	ENSACAG00000009744	REXO5	94	52.233	Anolis_carolinensis
ENSFALG00000014026	REXO5	99	45.989	ENSANAG00000034379	REXO5	94	45.989	Aotus_nancymaae
ENSFALG00000014026	REXO5	81	37.037	ENSACLG00000004778	REXO5	99	37.037	Astatotilapia_calliptera
ENSFALG00000014026	REXO5	99	47.574	ENSBTAG00000006449	REXO5	91	47.574	Bos_taurus
ENSFALG00000014026	REXO5	99	46.371	ENSCJAG00000009363	REXO5	93	48.214	Callithrix_jacchus
ENSFALG00000014026	REXO5	99	48.862	ENSCAFG00000017924	REXO5	99	48.862	Canis_familiaris
ENSFALG00000014026	REXO5	99	47.664	ENSCAFG00020021846	REXO5	93	47.664	Canis_lupus_dingo
ENSFALG00000014026	REXO5	99	48.193	ENSCHIG00000022443	REXO5	93	48.193	Capra_hircus
ENSFALG00000014026	REXO5	99	43.386	ENSCPOG00000008940	REXO5	88	47.234	Cavia_porcellus
ENSFALG00000014026	REXO5	99	47.043	ENSCCAG00000034936	REXO5	93	47.043	Cebus_capucinus
ENSFALG00000014026	REXO5	99	48.331	ENSCATG00000044063	REXO5	94	48.331	Cercocebus_atys
ENSFALG00000014026	REXO5	99	45.928	ENSCLAG00000008033	REXO5	88	45.928	Chinchilla_lanigera
ENSFALG00000014026	REXO5	99	48.800	ENSCSAG00000007562	REXO5	94	48.800	Chlorocebus_sabaeus
ENSFALG00000014026	REXO5	71	57.143	ENSCHOG00000009146	-	70	57.143	Choloepus_hoffmanni
ENSFALG00000014026	REXO5	100	67.838	ENSCPBG00000019062	REXO5	94	67.838	Chrysemys_picta_bellii
ENSFALG00000014026	REXO5	99	48.064	ENSCANG00000035776	REXO5	94	48.064	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFALG00000014026	REXO5	99	46.381	ENSCGRG00001016179	-	95	46.381	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFALG00000014026	REXO5	99	46.505	ENSCGRG00000010868	-	95	45.968	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFALG00000014026	REXO5	74	32.997	ENSCSEG00000002060	-	99	33.390	Cynoglossus_semilaevis
ENSFALG00000014026	REXO5	99	48.103	ENSEASG00005007266	REXO5	97	51.416	Equus_asinus_asinus
ENSFALG00000014026	REXO5	99	48.193	ENSECAG00000018769	REXO5	83	48.193	Equus_caballus
ENSFALG00000014026	REXO5	87	54.203	ENSEEUG00000003572	REXO5	88	54.203	Erinaceus_europaeus
ENSFALG00000014026	REXO5	99	47.872	ENSFCAG00000015160	REXO5	93	47.872	Felis_catus
ENSFALG00000014026	REXO5	97	34.238	ENSFHEG00000013388	REXO5	92	34.190	Fundulus_heteroclitus
ENSFALG00000014026	REXO5	100	80.326	ENSGALG00000002239	REXO5	95	80.326	Gallus_gallus
ENSFALG00000014026	REXO5	97	34.187	ENSGAFG00000011045	REXO5	91	34.363	Gambusia_affinis
ENSFALG00000014026	REXO5	50	43.360	ENSGACG00000019507	-	79	43.360	Gasterosteus_aculeatus
ENSFALG00000014026	REXO5	100	67.072	ENSGAGG00000008242	REXO5	94	67.072	Gopherus_agassizii
ENSFALG00000014026	REXO5	99	48.064	ENSGGOG00000004539	REXO5	93	48.064	Gorilla_gorilla
ENSFALG00000014026	REXO5	97	37.008	ENSHBUG00000017976	REXO5	92	37.008	Haplochromis_burtoni
ENSFALG00000014026	REXO5	91	44.606	ENSHGLG00000012652	REXO5	99	44.964	Heterocephalus_glaber_female
ENSFALG00000014026	REXO5	99	44.385	ENSHGLG00100013255	REXO5	98	47.391	Heterocephalus_glaber_male
ENSFALG00000014026	REXO5	67	40.404	ENSHCOG00000008648	REXO5	83	40.404	Hippocampus_comes
ENSFALG00000014026	REXO5	84	48.148	ENSSTOG00000007071	REXO5	88	48.148	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFALG00000014026	REXO5	99	47.035	ENSJJAG00000023821	-	94	47.035	Jaculus_jaculus
ENSFALG00000014026	REXO5	96	35.984	ENSKMAG00000009488	REXO5	91	35.984	Kryptolebias_marmoratus
ENSFALG00000014026	REXO5	97	35.958	ENSLBEG00000009276	REXO5	92	35.958	Labrus_bergylta
ENSFALG00000014026	REXO5	82	45.701	ENSLACG00000001758	REXO5	99	45.701	Latimeria_chalumnae
ENSFALG00000014026	REXO5	99	46.667	ENSLAFG00000006157	REXO5	94	46.667	Loxodonta_africana
ENSFALG00000014026	REXO5	99	48.331	ENSMFAG00000036613	REXO5	94	48.331	Macaca_fascicularis
ENSFALG00000014026	REXO5	99	48.331	ENSMMUG00000016748	REXO5	94	48.331	Macaca_mulatta
ENSFALG00000014026	REXO5	99	48.331	ENSMNEG00000045028	REXO5	94	48.331	Macaca_nemestrina
ENSFALG00000014026	REXO5	99	48.331	ENSMLEG00000029851	REXO5	94	48.331	Mandrillus_leucophaeus
ENSFALG00000014026	REXO5	99	34.699	ENSMAMG00000006915	REXO5	90	34.699	Mastacembelus_armatus
ENSFALG00000014026	REXO5	97	36.483	ENSMZEG00005013657	REXO5	92	36.483	Maylandia_zebra
ENSFALG00000014026	REXO5	100	81.275	ENSMGAG00000010369	REXO5	100	81.275	Meleagris_gallopavo
ENSFALG00000014026	REXO5	99	48.331	ENSMICG00000014886	REXO5	93	48.331	Microcebus_murinus
ENSFALG00000014026	REXO5	62	49.348	ENSMOCG00000010062	-	98	49.348	Microtus_ochrogaster
ENSFALG00000014026	REXO5	99	50.197	ENSMODG00000007059	REXO5	89	50.197	Monodelphis_domestica
ENSFALG00000014026	REXO5	99	44.669	MGP_CAROLIEiJ_G0030385	-	94	44.669	Mus_caroli
ENSFALG00000014026	REXO5	99	44.208	ENSMUSG00000030924	Rexo5	97	47.588	Mus_musculus
ENSFALG00000014026	REXO5	99	44.430	MGP_SPRETEiJ_G0031499	-	94	44.430	Mus_spretus
ENSFALG00000014026	REXO5	99	48.336	ENSMPUG00000013643	REXO5	93	48.336	Mustela_putorius_furo
ENSFALG00000014026	REXO5	99	44.236	ENSNGAG00000002025	-	98	48.913	Nannospalax_galili
ENSFALG00000014026	REXO5	71	38.476	ENSNBRG00000006877	REXO5	82	38.476	Neolamprologus_brichardi
ENSFALG00000014026	REXO5	99	47.664	ENSNLEG00000012334	REXO5	93	47.664	Nomascus_leucogenys
ENSFALG00000014026	REXO5	98	47.147	ENSMEUG00000015298	REXO5	99	47.147	Notamacropus_eugenii
ENSFALG00000014026	REXO5	87	54.545	ENSOPRG00000011398	REXO5	81	54.545	Ochotona_princeps
ENSFALG00000014026	REXO5	97	36.269	ENSONIG00000000148	REXO5	98	42.461	Oreochromis_niloticus
ENSFALG00000014026	REXO5	99	48.396	ENSOANG00000014291	REXO5	100	48.396	Ornithorhynchus_anatinus
ENSFALG00000014026	REXO5	99	47.925	ENSOCUG00000009913	REXO5	92	47.925	Oryctolagus_cuniculus
ENSFALG00000014026	REXO5	97	34.605	ENSORLG00000009738	REXO5	93	34.605	Oryzias_latipes
ENSFALG00000014026	REXO5	97	35.178	ENSORLG00020010270	REXO5	93	35.178	Oryzias_latipes_hni
ENSFALG00000014026	REXO5	97	35.271	ENSORLG00015009678	REXO5	93	35.271	Oryzias_latipes_hsok
ENSFALG00000014026	REXO5	97	35.467	ENSOMEG00000019491	REXO5	92	35.467	Oryzias_melastigma
ENSFALG00000014026	REXO5	99	46.925	ENSOGAG00000011564	REXO5	93	46.925	Otolemur_garnettii
ENSFALG00000014026	REXO5	99	47.791	ENSOARG00000013401	REXO5	94	47.530	Ovis_aries
ENSFALG00000014026	REXO5	99	48.331	ENSPPAG00000035005	REXO5	93	48.331	Pan_paniscus
ENSFALG00000014026	REXO5	99	46.021	ENSPPRG00000022345	REXO5	93	46.215	Panthera_pardus
ENSFALG00000014026	REXO5	99	47.480	ENSPTIG00000012096	REXO5	93	47.676	Panthera_tigris_altaica
ENSFALG00000014026	REXO5	99	48.533	ENSPTRG00000007851	REXO5	93	48.533	Pan_troglodytes
ENSFALG00000014026	REXO5	99	48.331	ENSPANG00000006898	REXO5	93	48.331	Papio_anubis
ENSFALG00000014026	REXO5	97	40.000	ENSPKIG00000014406	REXO5	94	40.000	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFALG00000014026	REXO5	100	65.676	ENSPSIG00000012172	REXO5	94	65.676	Pelodiscus_sinensis
ENSFALG00000014026	REXO5	94	56.021	ENSPCIG00000029238	-	94	49.605	Phascolarctos_cinereus
ENSFALG00000014026	REXO5	97	33.033	ENSPFOG00000012767	REXO5	92	33.162	Poecilia_formosa
ENSFALG00000014026	REXO5	97	32.905	ENSPLAG00000006408	REXO5	92	33.033	Poecilia_latipinna
ENSFALG00000014026	REXO5	97	32.863	ENSPMEG00000007726	REXO5	92	32.991	Poecilia_mexicana
ENSFALG00000014026	REXO5	97	33.463	ENSPREG00000000146	REXO5	93	33.592	Poecilia_reticulata
ENSFALG00000014026	REXO5	99	47.931	ENSPPYG00000007163	REXO5	93	47.931	Pongo_abelii
ENSFALG00000014026	REXO5	96	44.521	ENSPCAG00000006265	REXO5	99	44.521	Procavia_capensis
ENSFALG00000014026	REXO5	99	48.064	ENSPCOG00000018775	REXO5	93	48.064	Propithecus_coquereli
ENSFALG00000014026	REXO5	99	46.765	ENSPVAG00000003293	REXO5	98	46.765	Pteropus_vampyrus
ENSFALG00000014026	REXO5	76	40.283	ENSPNYG00000006922	REXO5	81	37.590	Pundamilia_nyererei
ENSFALG00000014026	REXO5	97	36.676	ENSPNAG00000018866	-	92	36.676	Pygocentrus_nattereri
ENSFALG00000014026	REXO5	99	44.744	ENSRNOG00000014513	Rexo5	95	44.744	Rattus_norvegicus
ENSFALG00000014026	REXO5	99	48.198	ENSRBIG00000035163	REXO5	83	48.198	Rhinopithecus_bieti
ENSFALG00000014026	REXO5	99	48.331	ENSRROG00000034741	REXO5	94	48.331	Rhinopithecus_roxellana
ENSFALG00000014026	REXO5	99	46.267	ENSSBOG00000029650	REXO5	95	46.785	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFALG00000014026	REXO5	99	50.598	ENSSHAG00000005042	REXO5	94	50.598	Sarcophilus_harrisii
ENSFALG00000014026	REXO5	99	40.617	ENSSFOG00015007581	REXO5	94	40.617	Scleropages_formosus
ENSFALG00000014026	REXO5	97	35.593	ENSSMAG00000000709	REXO5	91	35.538	Scophthalmus_maximus
ENSFALG00000014026	REXO5	97	35.379	ENSSDUG00000014528	REXO5	91	35.317	Seriola_dumerili
ENSFALG00000014026	REXO5	97	35.132	ENSSLDG00000007641	REXO5	91	35.156	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFALG00000014026	REXO5	99	47.152	ENSSSCG00000007855	REXO5	94	47.152	Sus_scrofa
ENSFALG00000014026	REXO5	100	92.799	ENSTGUG00000009219	REXO5	100	92.799	Taeniopygia_guttata
ENSFALG00000014026	REXO5	97	35.556	ENSTRUG00000015295	-	90	35.556	Takifugu_rubripes
ENSFALG00000014026	REXO5	90	44.708	ENSTBEG00000008797	REXO5	84	44.708	Tupaia_belangeri
ENSFALG00000014026	REXO5	99	47.263	ENSTTRG00000016439	REXO5	93	47.606	Tursiops_truncatus
ENSFALG00000014026	REXO5	91	46.628	ENSUAMG00000017756	REXO5	98	46.628	Ursus_americanus
ENSFALG00000014026	REXO5	53	43.317	ENSUMAG00000010466	-	91	43.317	Ursus_maritimus
ENSFALG00000014026	REXO5	99	43.065	ENSVPAG00000003459	REXO5	93	43.065	Vicugna_pacos
ENSFALG00000014026	REXO5	99	48.735	ENSVVUG00000023257	REXO5	93	48.735	Vulpes_vulpes
ENSFALG00000014026	REXO5	99	44.505	ENSXETG00000016735	rexo5	98	44.505	Xenopus_tropicalis
ENSFALG00000014026	REXO5	76	37.544	ENSXCOG00000015997	REXO5	65	37.189	Xiphophorus_couchianus
ENSFALG00000014026	REXO5	97	34.749	ENSXMAG00000014770	REXO5	92	34.878	Xiphophorus_maculatus