EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFCAG00000005466 (Gene tree)
Gene ID: 101081014
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Felis_catus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 43075 bases
Position: chrE1:44818527-44861601
Accession: 101081014
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFCAP00000005069	GTP_EFTU	PF00009.27	3.6e-45	1	1
ENSFCAP00000045236	GTP_EFTU	PF00009.27	3.6e-45	1	1
ENSFCAP00000005069	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.2e-12	1	1
ENSFCAP00000045236	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.2e-12	1	1
ENSFCAP00000005069	EFG_IV	PF03764.18	2.8e-23	1	1
ENSFCAP00000045236	EFG_IV	PF03764.18	2.8e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFCAT00000053545	EFTUD2-202	3505	XM_003996992	ENSFCAP00000045236	972 (aa)	XP_003997041	UPI000298C2AB
ENSFCAT00000005468	EFTUD2-201	6842	-	ENSFCAP00000005069	972 (aa)	-	M3W441

Gene Model

Click here to download ENSFCAG00000005466's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
fca03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSFCAG00000005466's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	53	31.206	ENSFCAG00000013291	GFM1	63	31.206
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	87	38.832	ENSFCAG00000000909	EEF2	99	38.832

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.794	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	92.078	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	91.872	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.897	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	99.897	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	88.580	ENSACIG00000009096	eftud2	100	88.374	Amphilophus_citrinellus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	87	88.118	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.118	Amphiprion_ocellaris
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	92.181	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	91.975	Amphiprion_percula
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	92.490	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.284	Anabas_testudineus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	99	94.336	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	94.336	Anas_platyrhynchos
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	97.531	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.531	Anolis_carolinensis
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.691	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.691	Aotus_nancymaae
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	92.078	ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.872	Astatotilapia_calliptera
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.607	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	Astyanax_mexicanus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.588	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	99.588	Bos_taurus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	99	70.248	WBGene00001166	eftu-2	99	69.938	Caenorhabditis_elegans
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.691	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.691	Callithrix_jacchus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.897	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	99.897	Canis_familiaris
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.897	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.897	Canis_lupus_dingo
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.588	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.588	Capra_hircus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.280	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.280	Carlito_syrichta
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.074	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	99.074	Cavia_aperea
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.074	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.074	Cavia_porcellus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.691	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	99.691	Cebus_capucinus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.691	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.691	Cercocebus_atys
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	98.971	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.971	Chinchilla_lanigera
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.691	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.691	Chlorocebus_sabaeus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	91	86.824	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	Choloepus_hoffmanni
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	98.560	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.560	Chrysemys_picta_bellii
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	77.641	ENSCING00000009372	-	100	77.641	Ciona_intestinalis
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	99	78.208	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.717	Ciona_savignyi
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.691	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	99.691	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.383	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.383	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.383	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	99.383	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.667	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.461	Cynoglossus_semilaevis
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	92.284	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.975	Cyprinodon_variegatus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	90.947	ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.049	Danio_rerio
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.074	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	99.074	Dasypus_novemcinctus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.486	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.486	Dipodomys_ordii
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	75.282	FBgn0039566	CG4849	100	75.179	Drosophila_melanogaster
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	92	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	74	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	Eptatretus_burgeri
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.897	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	99.897	Equus_asinus_asinus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.794	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	99.794	Equus_caballus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	90.947	ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.844	Esox_lucius
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	97.942	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	Ficedula_albicollis
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.280	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.280	Fukomys_damarensis
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	92.387	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	92.078	Fundulus_heteroclitus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.255	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.461	Gadus_morhua
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	98.045	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.707	Gallus_gallus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	92.078	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	91.872	Gambusia_affinis
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.770	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.358	Gasterosteus_aculeatus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.691	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	99.691	Gorilla_gorilla
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.975	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.770	Haplochromis_burtoni
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	98.868	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	98.868	Heterocephalus_glaber_female
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	98.868	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.868	Heterocephalus_glaber_male
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.255	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.255	Hippocampus_comes
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.461	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	Ictalurus_punctatus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	93.519	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	96	99.573	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.573	Jaculus_jaculus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.770	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.358	Kryptolebias_marmoratus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	95	91.802	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	Labrus_bergylta
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	94.136	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.656	Latimeria_chalumnae
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	92.078	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	92.078	Lepisosteus_oculatus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.177	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.177	Loxodonta_africana
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.691	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	99.691	Macaca_fascicularis
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.691	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.691	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	99.691	Macaca_nemestrina
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.691	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	99.691	Mandrillus_leucophaeus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	92.490	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.284	Mastacembelus_armatus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	92.078	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	91.872	Maylandia_zebra
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	98.049	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	Meleagris_gallopavo
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.383	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	99.383	Mesocricetus_auratus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.691	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	99.691	Microcebus_murinus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.486	ENSMOCG00000009039	-	100	99.486	Microtus_ochrogaster
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	92	81.573	ENSMOCG00000017653	-	90	81.573	Microtus_ochrogaster
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	87	93.882	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.882	Mola_mola
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.383	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.383	Monodelphis_domestica
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	87	92.118	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.118	Monopterus_albus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.177	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	99.177	Mus_caroli
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.177	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	99.177	Mus_musculus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.177	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.177	Mus_pahari
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.177	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	99.177	Mus_spretus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	97	99.682	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	99.682	Mustela_putorius_furo
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.897	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	99.897	Myotis_lucifugus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.588	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.588	Nannospalax_galili
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.975	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.770	Neolamprologus_brichardi
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	97	97.875	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.875	Nomascus_leucogenys
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	95.679	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.679	Notamacropus_eugenii
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.358	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.358	Ochotona_princeps
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	98.560	ENSODEG00000018041	-	100	98.560	Octodon_degus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	93	79.741	ENSODEG00000003385	-	100	79.741	Octodon_degus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	92.078	ENSONIG00000000912	eftud2	100	91.872	Oreochromis_niloticus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.691	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.691	Oryctolagus_cuniculus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.667	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.667	Oryzias_latipes
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.564	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.564	Oryzias_latipes_hni
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.564	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.573	Oryzias_latipes_hsok
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	97.428	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	97.428	Otolemur_garnettii
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.588	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	99.588	Ovis_aries
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.794	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	99.794	Pan_paniscus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.897	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	99.897	Panthera_pardus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.897	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	99.897	Panthera_tigris_altaica
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.794	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.794	Pan_troglodytes
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.691	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	99.691	Papio_anubis
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	93	97.244	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.244	Pelodiscus_sinensis
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	84.568	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.362	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.383	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	99.383	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.383	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	99.383	Phascolarctos_cinereus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	92.078	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	91.872	Poecilia_formosa
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	92.078	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	91.872	Poecilia_latipinna
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	92.078	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	91.872	Poecilia_mexicana
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	98.251	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.251	Pongo_abelii
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	95.576	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.576	Procavia_capensis
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.588	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.588	Propithecus_coquereli
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	94.959	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.959	Pteropus_vampyrus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.975	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.770	Pundamilia_nyererei
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.872	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	Pygocentrus_nattereri
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.177	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.177	Rattus_norvegicus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.588	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	99.588	Rhinopithecus_bieti
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.588	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.588	Rhinopithecus_roxellana
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	97	34.190	YKL173W	SNU114	97	33.794	Saccharomyces_cerevisiae
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.691	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.691	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	97	99.360	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.360	Sarcophilus_harrisii
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.872	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.770	Scleropages_formosus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.872	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.667	Scophthalmus_maximus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	92.181	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.975	Seriola_dumerili
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	92.284	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	92.078	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.049	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.049	Sorex_araneus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	97.428	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.428	Sphenodon_punctatus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	92.284	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	92.078	Stegastes_partitus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.897	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.897	Sus_scrofa
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	84	97.324	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	Taeniopygia_guttata
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.255	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.049	Takifugu_rubripes
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	86.783	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.578	Tetraodon_nigroviridis
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	94.033	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.033	Tupaia_belangeri
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	90.947	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	Tursiops_truncatus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	98.768	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.768	Ursus_americanus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.897	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	99.897	Ursus_maritimus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.897	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	99.897	Vulpes_vulpes
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	97	94.883	ENSXETG00000003394	eftud2	98	95.865	Xenopus_tropicalis
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	81	93.495	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	Xiphophorus_couchianus
ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	92.078	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.872	Xiphophorus_maculatus