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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSFCAG00000011007 (Gene tree)
Gene ID: 101081170
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Felis_catus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 22923 bases
Position: chrD3:16705371-16728293
Accession: 101081170
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFCAP00000046896	RRM_1	PF00076.22	6.4e-34	1	2
ENSFCAP00000046896	RRM_1	PF00076.22	6.4e-34	2	2
ENSFCAP00000010223	RRM_1	PF00076.22	1.1e-33	1	2
ENSFCAP00000010223	RRM_1	PF00076.22	1.1e-33	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFCAT00000054040	MSI1-201	2971	XM_023241485	ENSFCAP00000046896	362 (aa)	XP_023097253	UPI0000073DD8
ENSFCAT00000011010	MSI1-202	1333	XM_023241487	ENSFCAP00000010223	436 (aa)	XP_023097255	M3WEB7

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
fca03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSFCAG00000011007	MSI1	96	69.341	ENSFCAG00000041686	MSI2	91	80.531
ENSFCAG00000011007	MSI1	50	41.758	ENSFCAG00000042512	-	91	43.169
ENSFCAG00000011007	MSI1	51	37.931	ENSFCAG00000033796	-	86	35.270
ENSFCAG00000011007	MSI1	50	47.222	ENSFCAG00000027603	HNRNPAB	82	39.130
ENSFCAG00000011007	MSI1	50	43.094	ENSFCAG00000035826	-	87	43.605
ENSFCAG00000011007	MSI1	50	38.674	ENSFCAG00000012001	-	83	38.953
ENSFCAG00000011007	MSI1	68	36.842	ENSFCAG00000042916	RBM38	64	42.373
ENSFCAG00000011007	MSI1	51	38.830	ENSFCAG00000028796	-	97	39.106
ENSFCAG00000011007	MSI1	52	41.346	ENSFCAG00000010767	DAZAP1	55	41.346
ENSFCAG00000011007	MSI1	51	40.686	ENSFCAG00000012146	HNRNPA3	70	38.403
ENSFCAG00000011007	MSI1	50	42.308	ENSFCAG00000010150	HNRNPA1	76	41.584
ENSFCAG00000011007	MSI1	53	37.824	ENSFCAG00000026009	-	74	35.124

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	100.000	ENSG00000135097	MSI1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	84.254	ENSAPOG00000023458	-	100	84.254	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	83.791	ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.791	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFCAG00000011007	MSI1	98	81.365	ENSAMEG00000013302	MSI1	100	85.635	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFCAG00000011007	MSI1	91	82.675	ENSACIG00000017754	-	79	87.540	Amphilophus_citrinellus
ENSFCAG00000011007	MSI1	98	77.485	ENSAOCG00000009031	-	97	81.155	Amphiprion_ocellaris
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	83.791	ENSAOCG00000003804	MSI1	100	83.791	Amphiprion_ocellaris
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	84.254	ENSAPEG00000006857	-	84	84.254	Amphiprion_percula
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	83.791	ENSAPEG00000003245	MSI1	100	83.791	Amphiprion_percula
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	78.415	ENSATEG00000023779	-	100	78.415	Anabas_testudineus
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	80.435	ENSATEG00000017059	MSI1	100	80.435	Anabas_testudineus
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	96.419	ENSACAG00000002762	MSI1	100	96.419	Anolis_carolinensis
ENSFCAG00000011007	MSI1	82	96.309	ENSANAG00000027901	-	92	96.309	Aotus_nancymaae
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	100.000	ENSANAG00000027151	MSI1	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	83.978	ENSACLG00000000117	-	100	85.337	Astatotilapia_calliptera
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	83.242	ENSACLG00000011230	MSI1	100	83.242	Astatotilapia_calliptera
ENSFCAG00000011007	MSI1	94	83.735	ENSAMXG00000038960	msi1	75	84.984	Astyanax_mexicanus
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	100.000	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	100.000	Bos_taurus
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	100.000	ENSCJAG00000008578	MSI1	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	99.724	ENSCAFG00000010283	MSI1	100	99.724	Canis_familiaris
ENSFCAG00000011007	MSI1	94	100.000	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	94.580	ENSCHIG00000024304	MSI1	100	94.580	Capra_hircus
ENSFCAG00000011007	MSI1	94	100.000	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	Carlito_syrichta
ENSFCAG00000011007	MSI1	94	89.776	ENSCAPG00000003919	MSI1	89	89.776	Cavia_aperea
ENSFCAG00000011007	MSI1	98	100.000	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	100.000	ENSCCAG00000035567	MSI1	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	100.000	ENSCATG00000030019	MSI1	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSFCAG00000011007	MSI1	98	100.000	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSFCAG00000011007	MSI1	75	96.390	ENSCSAG00000002265	MSI1	96	96.390	Chlorocebus_sabaeus
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	95.856	ENSCPBG00000011349	MSI1	100	95.856	Chrysemys_picta_bellii
ENSFCAG00000011007	MSI1	98	100.000	ENSCANG00000040651	MSI1	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	100.000	ENSCGRG00001018883	Msi1	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFCAG00000011007	MSI1	94	100.000	ENSCGRG00000002191	Msi1	72	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	83.516	ENSCSEG00000005834	-	100	83.516	Cynoglossus_semilaevis
ENSFCAG00000011007	MSI1	98	78.299	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	82.919	Cynoglossus_semilaevis
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	83.149	ENSCSEG00000008352	-	100	83.149	Cynoglossus_semilaevis
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	84.254	ENSCVAG00000009100	MSI1	100	84.254	Cyprinodon_variegatus
ENSFCAG00000011007	MSI1	64	68.398	ENSCVAG00000017463	-	89	68.398	Cyprinodon_variegatus
ENSFCAG00000011007	MSI1	98	81.402	ENSDARG00000010710	msi1	99	86.408	Danio_rerio
ENSFCAG00000011007	MSI1	80	82.096	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	89	82.096	Danio_rerio
ENSFCAG00000011007	MSI1	98	89.970	ENSDNOG00000005713	MSI1	91	89.970	Dasypus_novemcinctus
ENSFCAG00000011007	MSI1	98	99.102	ENSDORG00000005610	Msi1	99	95.480	Dipodomys_ordii
ENSFCAG00000011007	MSI1	98	95.732	ENSETEG00000004756	MSI1	100	95.732	Echinops_telfairi
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	100.000	ENSEASG00005004736	MSI1	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	100.000	ENSECAG00000017526	MSI1	100	100.000	Equus_caballus
ENSFCAG00000011007	MSI1	94	81.232	ENSELUG00000023280	-	100	80.938	Esox_lucius
ENSFCAG00000011007	MSI1	94	80.387	ENSELUG00000023219	MSI1	92	80.387	Esox_lucius
ENSFCAG00000011007	MSI1	98	95.820	ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	Ficedula_albicollis
ENSFCAG00000011007	MSI1	98	99.695	ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	Fukomys_damarensis
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	84.530	ENSFHEG00000022446	MSI1	100	84.530	Fundulus_heteroclitus
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	83.791	ENSFHEG00000003560	-	100	83.791	Fundulus_heteroclitus
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	76.584	ENSGMOG00000017838	-	100	76.584	Gadus_morhua
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	82.597	ENSGMOG00000001006	MSI1	99	82.320	Gadus_morhua
ENSFCAG00000011007	MSI1	94	95.238	ENSGALG00000007227	MSI1	98	86.957	Gallus_gallus
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	65.205	ENSGAFG00000005860	-	100	65.205	Gambusia_affinis
ENSFCAG00000011007	MSI1	98	85.380	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	85.380	Gambusia_affinis
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	80.663	ENSGACG00000008674	-	100	80.663	Gasterosteus_aculeatus
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	83.425	ENSGACG00000012679	MSI1	100	83.425	Gasterosteus_aculeatus
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	95.580	ENSGAGG00000016037	MSI1	100	95.580	Gopherus_agassizii
ENSFCAG00000011007	MSI1	94	100.000	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	83.242	ENSHBUG00000021921	MSI1	100	83.242	Haplochromis_burtoni
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	83.978	ENSHBUG00000011841	-	100	83.978	Haplochromis_burtoni
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	99.724	ENSHGLG00000012782	MSI1	100	99.724	Heterocephalus_glaber_female
ENSFCAG00000011007	MSI1	98	99.695	ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	Heterocephalus_glaber_male
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	78.689	ENSHCOG00000012067	-	100	78.689	Hippocampus_comes
ENSFCAG00000011007	MSI1	98	80.938	ENSHCOG00000012019	MSI1	100	85.714	Hippocampus_comes
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	82.320	ENSIPUG00000001976	msi1	99	84.026	Ictalurus_punctatus
ENSFCAG00000011007	MSI1	94	100.000	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	100.000	ENSJJAG00000010463	Msi1	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	84.530	ENSJJAG00000010643	-	100	84.254	Jaculus_jaculus
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	83.702	ENSKMAG00000011251	MSI1	100	83.702	Kryptolebias_marmoratus
ENSFCAG00000011007	MSI1	98	83.578	ENSKMAG00000019877	-	100	88.509	Kryptolebias_marmoratus
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	83.242	ENSLBEG00000001375	-	100	83.242	Labrus_bergylta
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	84.254	ENSLBEG00000008789	MSI1	100	84.254	Labrus_bergylta
ENSFCAG00000011007	MSI1	98	87.427	ENSLACG00000018287	MSI1	100	87.427	Latimeria_chalumnae
ENSFCAG00000011007	MSI1	50	70.000	ENSLOCG00000008618	zgc:110796	71	70.000	Lepisosteus_oculatus
ENSFCAG00000011007	MSI1	91	89.426	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	89.426	Loxodonta_africana
ENSFCAG00000011007	MSI1	98	100.000	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSFCAG00000011007	MSI1	97	98.291	ENSMMUG00000031527	MSI1	97	98.291	Macaca_mulatta
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	100.000	ENSMNEG00000040034	MSI1	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSFCAG00000011007	MSI1	98	100.000	ENSMLEG00000003921	MSI1	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSFCAG00000011007	MSI1	96	85.960	ENSMAMG00000018426	-	100	83.791	Mastacembelus_armatus
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	83.425	ENSMAMG00000002279	MSI1	100	83.425	Mastacembelus_armatus
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	83.242	ENSMZEG00005026892	MSI1	100	83.242	Maylandia_zebra
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	83.978	ENSMZEG00005000340	-	100	83.978	Maylandia_zebra
ENSFCAG00000011007	MSI1	64	98.817	ENSMGAG00000016518	-	100	98.817	Meleagris_gallopavo
ENSFCAG00000011007	MSI1	71	100.000	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	100.000	ENSMICG00000033181	MSI1	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	99.724	ENSMOCG00000002286	Msi1	100	99.724	Microtus_ochrogaster
ENSFCAG00000011007	MSI1	98	76.316	ENSMMOG00000010492	MSI1	98	79.464	Mola_mola
ENSFCAG00000011007	MSI1	98	81.571	ENSMMOG00000012265	-	97	86.538	Mola_mola
ENSFCAG00000011007	MSI1	91	67.771	ENSMODG00000003189	-	100	67.771	Monodelphis_domestica
ENSFCAG00000011007	MSI1	98	85.044	ENSMALG00000001426	-	100	86.646	Monopterus_albus
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	83.978	ENSMALG00000017889	MSI1	100	83.978	Monopterus_albus
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	99.448	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	100	99.490	Mus_caroli
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	99.448	ENSMUSG00000054256	Msi1	100	99.490	Mus_musculus
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	99.171	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	100	99.171	Mus_pahari
ENSFCAG00000011007	MSI1	100	99.448	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	100	99.490	Mus_spretus
ENSFCAG00000011007	MSI1	94	100.000	ENSMPUG00000003168	MSI1	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSFCAG00000011007	MSI1	94	90.179	ENSMLUG00000010313	MSI1	100	90.179	Myotis_lucifugus
ENSFCAG00000011007	MSI1	98	93.855	ENSNGAG00000014508	Msi1	97	93.855	Nannospalax_galili
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