EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFCAG00000037571 (Gene tree)
Gene ID: 111562239
Gene Symbol: SRPRB
Alias: APMCF1|SR-beta
Full Name: SRP receptor subunit beta
Gene Type: protein_coding
Species: Felis_catus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 28480 bases
Position: chrC2:131268559-131297038
Accession: 111562239
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFCAP00000028963	MMR_HSR1	PF01926.23	2.3e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFCAT00000049507	SRPRB-201	891	XM_023260185	ENSFCAP00000028963	296 (aa)	XP_023115953	A0A2I2U915

Gene Model

Click here to download ENSFCAG00000037571's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
fca03060	Protein export	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSFCAG00000037571's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	91.513	ENSG00000144867	SRPRB	99	95.597	Homo_sapiens
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	90.406	ENSANAG00000028236	SRPRB	100	90.406	Aotus_nancymaae
ENSFCAG00000037571	SRPRB	100	91.892	ENSBTAG00000044075	SRPRB	100	91.892	Bos_taurus
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	90.406	ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	90.406	Callithrix_jacchus
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	95.203	ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	95.203	Canis_lupus_dingo
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	93.358	ENSCHIG00000019717	SRPRB	100	93.358	Capra_hircus
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	90.037	ENSTSYG00000031948	SRPRB	100	90.037	Carlito_syrichta
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	80.812	ENSCPOG00000030107	SRPRB	100	80.812	Cavia_porcellus
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	88.192	ENSCCAG00000033027	SRPRB	100	88.192	Cebus_capucinus
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	91.882	ENSCATG00000033438	SRPRB	100	91.882	Cercocebus_atys
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	88.192	ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	88.192	Chinchilla_lanigera
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	91.882	ENSCSAG00000010699	SRPRB	100	91.882	Chlorocebus_sabaeus
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	83.026	ENSCHOG00000011792	SRPRB	100	83.026	Choloepus_hoffmanni
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	75.277	ENSCANG00000043327	SRPRB	100	75.277	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	89.299	ENSCGRG00001018121	Srprb	100	89.299	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFCAG00000037571	SRPRB	86	91.016	ENSCGRG00000014367	Srprb	98	91.016	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	88.930	ENSDNOG00000032146	SRPRB	100	88.930	Dasypus_novemcinctus
ENSFCAG00000037571	SRPRB	78	86.207	ENSDORG00000000764	Srprb	85	88.584	Dipodomys_ordii
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	95.572	ENSEASG00005003967	SRPRB	100	95.572	Equus_asinus_asinus
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	95.572	ENSECAG00000036666	SRPRB	100	95.572	Equus_caballus
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	88.192	ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	88.192	Fukomys_damarensis
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	92.251	ENSGGOG00000027849	SRPRB	100	92.251	Gorilla_gorilla
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	88.930	ENSHGLG00000016818	SRPRB	100	88.930	Heterocephalus_glaber_female
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	88.930	ENSHGLG00100018893	SRPRB	100	88.930	Heterocephalus_glaber_male
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	84.871	ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	84.871	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	91.882	ENSMFAG00000039758	SRPRB	100	91.882	Macaca_fascicularis
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	91.882	ENSMMUG00000008918	SRPRB	100	91.882	Macaca_mulatta
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	91.882	ENSMNEG00000032832	SRPRB	100	91.882	Macaca_nemestrina
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	91.882	ENSMLEG00000035589	SRPRB	100	91.882	Mandrillus_leucophaeus
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	89.668	ENSMAUG00000021695	Srprb	100	89.668	Mesocricetus_auratus
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	91.513	ENSMICG00000048959	SRPRB	100	91.513	Microcebus_murinus
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	83.764	ENSMODG00000018493	SRPRB	100	83.764	Monodelphis_domestica
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	90.037	MGP_CAROLIEiJ_G0032586	Srprb	100	90.037	Mus_caroli
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	89.668	ENSMUSG00000032553	Srprb	100	89.668	Mus_musculus
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	90.406	MGP_PahariEiJ_G0015454	Srprb	100	90.406	Mus_pahari
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	89.668	MGP_SPRETEiJ_G0033731	Srprb	100	89.668	Mus_spretus
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	94.465	ENSMPUG00000009687	SRPRB	100	94.465	Mustela_putorius_furo
ENSFCAG00000037571	SRPRB	96	87.368	ENSNGAG00000024311	-	100	88.930	Nannospalax_galili
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	91.144	ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	91.144	Nomascus_leucogenys
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	87.823	ENSODEG00000018092	SRPRB	100	87.823	Octodon_degus
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	92.620	ENSOCUG00000007623	SRPRB	100	92.620	Oryctolagus_cuniculus
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	90.406	ENSOGAG00000005243	SRPRB	100	90.406	Otolemur_garnettii
ENSFCAG00000037571	SRPRB	78	90.435	ENSOARG00000008412	SRPRB	92	93.607	Ovis_aries
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	91.513	ENSPPAG00000023940	SRPRB	100	91.513	Pan_paniscus
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	100.000	ENSPPRG00000023305	SRPRB	100	100.000	Panthera_pardus
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	99.262	ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	99.262	Panthera_tigris_altaica
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	91.513	ENSPTRG00000015413	SRPRB	100	91.513	Pan_troglodytes
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	91.513	ENSPANG00000023015	SRPRB	100	91.513	Papio_anubis
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	90.406	ENSPEMG00000017954	Srprb	100	90.406	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	91.144	ENSPPYG00000014115	SRPRB	100	91.144	Pongo_abelii
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	81.919	ENSPCAG00000013823	SRPRB	100	81.919	Procavia_capensis
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	94.834	ENSPVAG00000011319	SRPRB	100	94.834	Pteropus_vampyrus
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	91.882	ENSRBIG00000027819	SRPRB	100	91.882	Rhinopithecus_bieti
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	91.882	ENSRROG00000030536	SRPRB	100	91.882	Rhinopithecus_roxellana
ENSFCAG00000037571	SRPRB	68	88.060	ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	88.060	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	92.620	ENSSARG00000012943	SRPRB	100	92.620	Sorex_araneus
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	93.727	ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	93.727	Sus_scrofa
ENSFCAG00000037571	SRPRB	85	90.909	ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	89.219	Tupaia_belangeri
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	86.716	ENSTTRG00000007802	SRPRB	100	86.716	Tursiops_truncatus
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	95.941	ENSUAMG00000018135	SRPRB	100	95.941	Ursus_americanus
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	95.572	ENSUMAG00000015817	SRPRB	100	95.572	Ursus_maritimus
ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	94.465	ENSVVUG00000005707	SRPRB	100	94.465	Vulpes_vulpes