EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFDAG00000008310 (Gene tree)
Gene ID: 104868704
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Fukomys_damarensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6892 bases
Position: chrKN120745.1:3605109-3612000
Accession: 104868704
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFDAP00000020613	SYF2	PF08231.12	8.9e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFDAT00000011719	SYF2-201	732	XM_010633615	ENSFDAP00000020613	243 (aa)	XP_010631917	-

Gene Model

Click here to download ENSFDAG00000008310's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSFDAG00000008310's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.416	ENSG00000117614	SYF2	100	93.416	Homo_sapiens
ENSFDAG00000008310	SYF2	90	84.475	ENSAPOG00000001174	syf2	100	79.012	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFDAG00000008310	SYF2	80	95.897	ENSAMEG00000010134	-	100	95.897	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFDAG00000008310	SYF2	99	90.909	ENSAMEG00000010115	-	99	90.909	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFDAG00000008310	SYF2	90	81.735	ENSACIG00000023688	syf2	89	80.631	Amphilophus_citrinellus
ENSFDAG00000008310	SYF2	90	84.932	ENSAOCG00000022046	syf2	93	84.932	Amphiprion_ocellaris
ENSFDAG00000008310	SYF2	84	82.439	ENSAOCG00000010912	syf2	64	82.439	Amphiprion_ocellaris
ENSFDAG00000008310	SYF2	96	78.279	ENSAPEG00000018858	syf2	94	78.279	Amphiprion_percula
ENSFDAG00000008310	SYF2	89	82.949	ENSATEG00000007745	syf2	92	83.028	Anabas_testudineus
ENSFDAG00000008310	SYF2	82	89.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.000	Anas_platyrhynchos
ENSFDAG00000008310	SYF2	68	75.449	ENSACAG00000026777	-	94	75.796	Anolis_carolinensis
ENSFDAG00000008310	SYF2	84	85.294	ENSACAG00000013653	-	100	85.294	Anolis_carolinensis
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.416	ENSANAG00000032473	SYF2	100	93.416	Aotus_nancymaae
ENSFDAG00000008310	SYF2	90	81.279	ENSACLG00000019916	syf2	99	77.021	Astatotilapia_calliptera
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	78.189	ENSAMXG00000004051	syf2	100	78.189	Astyanax_mexicanus
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.061	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.068	Bos_taurus
ENSFDAG00000008310	SYF2	86	51.429	WBGene00019402	syf-2	99	48.276	Caenorhabditis_elegans
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.827	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	93.827	Callithrix_jacchus
ENSFDAG00000008310	SYF2	96	85.043	ENSCAFG00000030331	-	99	85.043	Canis_familiaris
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	91.463	ENSCAFG00000012895	-	100	91.870	Canis_familiaris
ENSFDAG00000008310	SYF2	74	87.363	ENSCAFG00020021094	-	83	95.513	Canis_lupus_dingo
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	91.463	ENSCAFG00020021091	-	100	91.870	Canis_lupus_dingo
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.593	ENSCHIG00000020874	SYF2	99	94.538	Capra_hircus
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.593	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	92.593	Carlito_syrichta
ENSFDAG00000008310	SYF2	81	97.475	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.475	Cavia_aperea
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	95.082	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	95.082	Cavia_porcellus
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.827	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	93.827	Cebus_capucinus
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.593	ENSCATG00000026917	SYF2	100	92.593	Cercocebus_atys
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	96.311	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	96.311	Chinchilla_lanigera
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.593	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	92.593	Chlorocebus_sabaeus
ENSFDAG00000008310	SYF2	72	77.011	ENSCHOG00000005273	-	96	77.011	Choloepus_hoffmanni
ENSFDAG00000008310	SYF2	92	88.393	ENSCPBG00000025073	SYF2	92	87.336	Chrysemys_picta_bellii
ENSFDAG00000008310	SYF2	87	53.052	ENSCING00000003017	-	89	52.582	Ciona_intestinalis
ENSFDAG00000008310	SYF2	87	50.704	ENSCSAVG00000006627	-	97	50.704	Ciona_savignyi
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	80.247	ENSCANG00000037322	SYF2	100	80.247	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	90.947	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.947	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFDAG00000008310	SYF2	81	95.408	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	94.975	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFDAG00000008310	SYF2	90	78.440	ENSCSEG00000000117	syf2	99	73.840	Cynoglossus_semilaevis
ENSFDAG00000008310	SYF2	90	81.735	ENSCVAG00000019543	syf2	100	76.543	Cyprinodon_variegatus
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	77.778	ENSDARG00000004706	syf2	100	77.778	Danio_rerio
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	91.837	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	91.837	Dasypus_novemcinctus
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	91.393	ENSDORG00000001274	Syf2	100	91.393	Dipodomys_ordii
ENSFDAG00000008310	SYF2	90	56.818	FBgn0033556	CG12343	97	56.818	Drosophila_melanogaster
ENSFDAG00000008310	SYF2	94	76.856	ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.856	Echinops_telfairi
ENSFDAG00000008310	SYF2	81	60.406	ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	Eptatretus_burgeri
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	81.893	ENSEASG00005004232	-	100	81.893	Equus_asinus_asinus
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.653	ENSEASG00005004224	-	100	92.653	Equus_asinus_asinus
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.061	ENSECAG00000012023	-	100	93.061	Equus_caballus
ENSFDAG00000008310	SYF2	97	94.068	ENSECAG00000010440	-	99	94.068	Equus_caballus
ENSFDAG00000008310	SYF2	75	79.235	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	79.235	Erinaceus_europaeus
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	79.508	ENSELUG00000003465	syf2	99	79.508	Esox_lucius
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.276	ENSFCAG00000043095	-	100	92.276	Felis_catus
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.653	ENSFCAG00000010324	-	85	92.653	Felis_catus
ENSFDAG00000008310	SYF2	84	85.784	ENSFALG00000000460	SYF2	96	79.079	Ficedula_albicollis
ENSFDAG00000008310	SYF2	90	67.273	ENSFHEG00000007238	syf2	97	67.273	Fundulus_heteroclitus
ENSFDAG00000008310	SYF2	90	83.028	ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.186	Gadus_morhua
ENSFDAG00000008310	SYF2	92	88.393	ENSGALG00000013639	SYF2	100	81.349	Gallus_gallus
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	74.486	ENSGAFG00000019435	syf2	97	74.486	Gambusia_affinis
ENSFDAG00000008310	SYF2	88	83.256	ENSGACG00000007305	syf2	99	77.500	Gasterosteus_aculeatus
ENSFDAG00000008310	SYF2	92	88.839	ENSGAGG00000010670	SYF2	92	87.773	Gopherus_agassizii
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.827	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	93.827	Gorilla_gorilla
ENSFDAG00000008310	SYF2	96	77.778	ENSHBUG00000020477	syf2	99	77.778	Haplochromis_burtoni
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	95.902	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	95.902	Heterocephalus_glaber_female
ENSFDAG00000008310	SYF2	93	83.700	ENSHGLG00000004304	-	100	79.424	Heterocephalus_glaber_female
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	95.902	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	95.902	Heterocephalus_glaber_male
ENSFDAG00000008310	SYF2	97	77.500	ENSHCOG00000012904	syf2	78	77.500	Hippocampus_comes
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	78.189	ENSIPUG00000019859	syf2	100	78.189	Ictalurus_punctatus
ENSFDAG00000008310	SYF2	60	96.575	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFDAG00000008310	SYF2	82	96.985	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	Jaculus_jaculus
ENSFDAG00000008310	SYF2	99	76.349	ENSKMAG00000013856	syf2	97	76.349	Kryptolebias_marmoratus
ENSFDAG00000008310	SYF2	90	83.105	ENSLBEG00000014425	syf2	100	76.955	Labrus_bergylta
ENSFDAG00000008310	SYF2	90	85.780	ENSLACG00000012064	SYF2	92	85.780	Latimeria_chalumnae
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	80.658	ENSLOCG00000002728	syf2	95	80.658	Lepisosteus_oculatus
ENSFDAG00000008310	SYF2	75	64.674	ENSLAFG00000030814	-	100	64.674	Loxodonta_africana
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.245	ENSLAFG00000023150	-	100	92.245	Loxodonta_africana
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.004	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	93.004	Macaca_fascicularis
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.416	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	93.416	Macaca_mulatta
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.004	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	93.004	Macaca_nemestrina
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.593	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	92.593	Mandrillus_leucophaeus
ENSFDAG00000008310	SYF2	89	81.567	ENSMAMG00000010403	syf2	98	75.720	Mastacembelus_armatus
ENSFDAG00000008310	SYF2	94	78.541	ENSMZEG00005006429	syf2	98	78.541	Maylandia_zebra
ENSFDAG00000008310	SYF2	82	89.447	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.447	Meleagris_gallopavo
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.181	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	92.181	Mesocricetus_auratus
ENSFDAG00000008310	SYF2	82	96.985	ENSMICG00000016191	SYF2	100	96.985	Microcebus_murinus
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.004	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	93.004	Microtus_ochrogaster
ENSFDAG00000008310	SYF2	90	79.909	ENSMMOG00000002396	syf2	92	79.909	Mola_mola
ENSFDAG00000008310	SYF2	93	87.665	ENSMODG00000013951	-	99	87.665	Monodelphis_domestica
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	76.639	ENSMALG00000010706	syf2	100	77.049	Monopterus_albus
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	91.358	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	91.358	Mus_caroli
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	91.358	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	91.358	Mus_musculus
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	91.358	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	91.358	Mus_pahari
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	91.358	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	91.358	Mus_spretus
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	91.463	ENSMPUG00000015801	-	100	91.463	Mustela_putorius_furo
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	91.870	ENSMPUG00000015802	-	100	91.870	Mustela_putorius_furo
ENSFDAG00000008310	SYF2	94	94.323	ENSMLUG00000001885	SYF2	94	94.323	Myotis_lucifugus
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.683	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.683	Nannospalax_galili
ENSFDAG00000008310	SYF2	95	71.610	ENSNBRG00000010720	syf2	99	71.610	Neolamprologus_brichardi
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.827	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	93.827	Nomascus_leucogenys
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	91.358	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.358	Ochotona_princeps
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	84.836	ENSODEG00000014338	-	99	85.957	Octodon_degus
ENSFDAG00000008310	SYF2	97	95.745	ENSODEG00000017664	-	99	95.745	Octodon_degus
ENSFDAG00000008310	SYF2	90	81.279	ENSONIG00000008213	syf2	99	77.021	Oreochromis_niloticus
ENSFDAG00000008310	SYF2	83	90.099	ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	Ornithorhynchus_anatinus
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	94.262	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.262	Oryctolagus_cuniculus
ENSFDAG00000008310	SYF2	95	80.000	ENSORLG00000028820	syf2	99	80.000	Oryzias_latipes
ENSFDAG00000008310	SYF2	99	77.593	ENSORLG00020018333	syf2	99	77.593	Oryzias_latipes_hni
ENSFDAG00000008310	SYF2	99	77.178	ENSORLG00015014665	syf2	99	77.178	Oryzias_latipes_hsok
ENSFDAG00000008310	SYF2	91	82.883	ENSOMEG00000013911	syf2	93	82.883	Oryzias_melastigma
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.852	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	93.852	Otolemur_garnettii
ENSFDAG00000008310	SYF2	80	67.692	ENSOARG00000006269	-	100	67.692	Ovis_aries
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.308	ENSOARG00000006348	-	100	92.308	Ovis_aries
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.827	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	93.827	Pan_paniscus
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.276	ENSPPRG00000001651	-	100	92.276	Panthera_pardus
ENSFDAG00000008310	SYF2	99	92.623	ENSPPRG00000001638	-	99	92.623	Panthera_pardus
ENSFDAG00000008310	SYF2	89	98.148	ENSPTIG00000005711	-	88	91.322	Panthera_tigris_altaica
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.276	ENSPTIG00000007036	-	100	92.276	Panthera_tigris_altaica
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.827	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	93.827	Pan_troglodytes
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.004	ENSPANG00000008139	SYF2	100	93.004	Papio_anubis
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	79.424	ENSPKIG00000008130	syf2	100	79.424	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFDAG00000008310	SYF2	99	83.402	ENSPSIG00000011816	SYF2	94	83.402	Pelodiscus_sinensis
ENSFDAG00000008310	SYF2	97	78.390	ENSPMGG00000008755	syf2	92	78.390	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.593	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	92.593	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFDAG00000008310	SYF2	93	92.000	ENSPCIG00000014235	SYF2	100	85.600	Phascolarctos_cinereus
ENSFDAG00000008310	SYF2	96	76.923	ENSPFOG00000004116	syf2	95	76.923	Poecilia_formosa
ENSFDAG00000008310	SYF2	97	76.695	ENSPLAG00000006691	syf2	100	76.695	Poecilia_latipinna
ENSFDAG00000008310	SYF2	99	73.029	ENSPMEG00000011684	syf2	99	72.727	Poecilia_mexicana
ENSFDAG00000008310	SYF2	89	81.019	ENSPREG00000003009	syf2	97	77.350	Poecilia_reticulata
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.827	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	93.827	Pongo_abelii
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	63.374	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	62.963	Propithecus_coquereli
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	79.592	ENSPVAG00000005841	SYF2	100	79.592	Pteropus_vampyrus
ENSFDAG00000008310	SYF2	90	81.279	ENSPNYG00000004979	syf2	99	77.021	Pundamilia_nyererei
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	80.247	ENSPNAG00000015570	syf2	100	80.247	Pygocentrus_nattereri
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	91.358	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	91.358	Rattus_norvegicus
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	90.535	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	90.535	Rhinopithecus_bieti
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.004	ENSRROG00000001347	SYF2	100	93.004	Rhinopithecus_roxellana
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.593	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	92.593	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFDAG00000008310	SYF2	84	93.689	ENSSHAG00000007152	-	100	93.689	Sarcophilus_harrisii
ENSFDAG00000008310	SYF2	93	92.000	ENSSHAG00000015630	-	100	85.542	Sarcophilus_harrisii
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	78.189	ENSSFOG00015023647	syf2	100	78.189	Scleropages_formosus
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	76.543	ENSSMAG00000009867	syf2	100	76.543	Scophthalmus_maximus
ENSFDAG00000008310	SYF2	90	83.028	ENSSDUG00000013072	syf2	100	77.778	Seriola_dumerili
ENSFDAG00000008310	SYF2	90	83.028	ENSSLDG00000012677	syf2	100	77.778	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	72.951	ENSSARG00000012889	SYF2	100	72.951	Sorex_araneus
ENSFDAG00000008310	SYF2	94	86.463	ENSSPUG00000005251	SYF2	91	86.463	Sphenodon_punctatus
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	77.366	ENSSPAG00000009626	syf2	100	77.366	Stegastes_partitus
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.469	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	93.469	Sus_scrofa
ENSFDAG00000008310	SYF2	61	58.940	ENSTGUG00000001126	SYF2	87	57.627	Taeniopygia_guttata
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	75.820	ENSTRUG00000001499	syf2	93	77.021	Takifugu_rubripes
ENSFDAG00000008310	SYF2	90	80.275	ENSTNIG00000016912	syf2	98	80.275	Tetraodon_nigroviridis
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	70.370	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.959	Tupaia_belangeri
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.623	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.443	Tursiops_truncatus
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	90.650	ENSUAMG00000002897	SYF2	100	90.650	Ursus_americanus
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	91.057	ENSUMAG00000013108	SYF2	100	91.057	Ursus_maritimus
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.623	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	92.623	Vicugna_pacos
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	91.463	ENSVVUG00000027175	-	100	91.870	Vulpes_vulpes
ENSFDAG00000008310	SYF2	100	88.306	ENSVVUG00000027181	-	100	88.710	Vulpes_vulpes
ENSFDAG00000008310	SYF2	97	81.702	ENSXETG00000022797	syf2	94	81.702	Xenopus_tropicalis
ENSFDAG00000008310	SYF2	88	80.930	ENSXMAG00000022698	syf2	92	79.817	Xiphophorus_maculatus