EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFDAG00000008617 (Gene tree)
Gene ID: 104875155
Gene Symbol: HTATSF1
Alias: TAT-SF1
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Fukomys_damarensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 14509 bases
Position: chrKN120972.1:701265-715773
Accession: 104875155
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFDAP00000020187	RRM_1	PF00076.22	1.5e-17	1	2
ENSFDAP00000020187	RRM_1	PF00076.22	1.5e-17	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFDAT00000012122	HTATSF1-201	2983	XM_010642565	ENSFDAP00000020187	756 (aa)	XP_010640867	UPI00053F7760

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	75.462	ENSG00000102241	HTATSF1	100	86.066	Homo_sapiens
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	54	61.374	ENSAPOG00000009823	htatsf1	92	60.664	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	75.163	ENSAMEG00000002921	HTATSF1	99	73.924	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	50	61.675	ENSAOCG00000020994	htatsf1	92	58.605	Amphiprion_ocellaris
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	50	61.675	ENSAPEG00000016432	htatsf1	91	59.338	Amphiprion_percula
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	54	57.471	ENSATEG00000008903	htatsf1	95	57.968	Anabas_testudineus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	93	72.549	ENSANAG00000025458	-	99	71.509	Aotus_nancymaae
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	95	64.472	ENSANAG00000027986	-	96	63.674	Aotus_nancymaae
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	54	58.525	ENSACLG00000008096	htatsf1	95	58.050	Astatotilapia_calliptera
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	71.708	ENSBTAG00000054942	HTATSF1	99	71.073	Bos_taurus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	100	66.798	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	99	67.507	Bos_taurus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	71.708	ENSBTAG00000055212	HTATSF1	99	71.073	Bos_taurus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	75.591	ENSCJAG00000003676	HTATSF1	99	73.844	Callithrix_jacchus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	74.737	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	99	73.747	Canis_familiaris
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	74.416	ENSCAFG00020024635	HTATSF1	99	73.438	Canis_lupus_dingo
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	72.368	ENSCHIG00000000312	HTATSF1	99	71.731	Capra_hircus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	76.316	ENSTSYG00000028876	HTATSF1	99	76.253	Carlito_syrichta
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	75.427	ENSCCAG00000022701	-	99	73.810	Cebus_capucinus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	71.014	ENSCCAG00000025329	-	99	70.596	Cebus_capucinus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	76.058	ENSCATG00000029963	HTATSF1	99	76.058	Cercocebus_atys
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	78.010	ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	77.778	Chinchilla_lanigera
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	76.190	ENSCSAG00000007505	HTATSF1	99	76.190	Chlorocebus_sabaeus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	50	68.229	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	85	70.857	Chrysemys_picta_bellii
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	75.926	ENSCANG00000028495	HTATSF1	99	75.926	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	82	76.358	ENSCGRG00001021602	Htatsf1	99	71.576	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	73	69.449	ENSCGRG00000002085	Htatsf1	99	65.211	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	70.619	ENSDNOG00000002254	HTATSF1	99	72.549	Dasypus_novemcinctus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	67	47.266	ENSETEG00000006377	-	68	47.563	Echinops_telfairi
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	70.876	ENSEASG00005003440	HTATSF1	100	73.282	Equus_asinus_asinus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	71.447	ENSECAG00000009156	HTATSF1	100	73.874	Equus_caballus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	60.417	ENSEEUG00000010668	HTATSF1	99	60.156	Erinaceus_europaeus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	100	73.828	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	99	73.615	Felis_catus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	54	60.656	ENSFHEG00000020286	htatsf1	95	60.656	Fundulus_heteroclitus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	54	60.890	ENSGAFG00000003041	htatsf1	95	59.681	Gambusia_affinis
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	54	59.811	ENSGACG00000020459	htatsf1	96	58.391	Gasterosteus_aculeatus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	75.594	ENSGGOG00000026072	HTATSF1	99	75.529	Gorilla_gorilla
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	54	58.525	ENSHBUG00000004392	htatsf1	95	58.050	Haplochromis_burtoni
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	98	84.379	ENSHGLG00000005328	HTATSF1	99	84.218	Heterocephalus_glaber_female
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	50	60.453	ENSHCOG00000009056	htatsf1	95	58.670	Hippocampus_comes
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	77.690	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	79.255	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	55	59.132	ENSKMAG00000007622	htatsf1	95	59.453	Kryptolebias_marmoratus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	51	62.438	ENSLBEG00000001154	htatsf1	97	58.969	Labrus_bergylta
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	64.940	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	90	70.747	Loxodonta_africana
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	75.926	ENSMFAG00000044705	HTATSF1	99	75.926	Macaca_fascicularis
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	75.926	ENSMMUG00000006450	HTATSF1	99	75.926	Macaca_mulatta
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	71.391	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	99	69.854	Macaca_nemestrina
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	76.190	ENSMLEG00000035511	HTATSF1	99	76.190	Mandrillus_leucophaeus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	50	64.122	ENSMAMG00000021225	htatsf1	87	64.122	Mastacembelus_armatus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	54	58.525	ENSMZEG00005000485	htatsf1	95	58.050	Maylandia_zebra
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	71.317	ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	70.735	Mesocricetus_auratus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	75.000	ENSMICG00000009348	HTATSF1	99	74.570	Microcebus_murinus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	70.337	ENSMOCG00000023007	-	99	69.908	Microtus_ochrogaster
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	69.507	ENSMOCG00000022370	-	95	67.333	Microtus_ochrogaster
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	52	60.145	ENSMMOG00000011013	htatsf1	90	60.145	Mola_mola
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	50	71.018	ENSMODG00000014087	-	84	71.018	Monodelphis_domestica
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	54	58.295	ENSMALG00000019977	htatsf1	95	58.295	Monopterus_albus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	100	72.099	MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	71.995	Mus_caroli
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	98	71.979	ENSMUSG00000067873	Htatsf1	99	71.542	Mus_musculus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	98	71.979	MGP_SPRETEiJ_G0034249	Htatsf1	99	71.542	Mus_spretus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	73.214	ENSMPUG00000001901	HTATSF1	99	72.036	Mustela_putorius_furo
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	67.328	ENSMLUG00000009234	-	98	67.109	Myotis_lucifugus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	68.449	ENSMLUG00000028418	-	99	67.755	Myotis_lucifugus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	98	73.190	ENSNGAG00000017831	Htatsf1	98	72.872	Nannospalax_galili
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	74.142	ENSNLEG00000002746	HTATSF1	99	74.074	Nomascus_leucogenys
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	54	59.677	ENSONIG00000008638	htatsf1	95	59.184	Oreochromis_niloticus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	75.195	ENSOCUG00000012570	HTATSF1	99	74.570	Oryctolagus_cuniculus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	53	58.565	ENSOMEG00000007564	htatsf1	95	57.883	Oryzias_melastigma
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	98	72.510	ENSOGAG00000005565	HTATSF1	99	72.069	Otolemur_garnettii
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	68.823	ENSOARG00000000481	-	99	68.497	Ovis_aries
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	71.521	ENSOARG00000011215	-	99	70.888	Ovis_aries
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	75.462	ENSPPAG00000024268	HTATSF1	99	75.397	Pan_paniscus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	100	73.698	ENSPPRG00000014209	HTATSF1	99	73.483	Panthera_pardus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	93	72.791	ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	72.688	Panthera_tigris_altaica
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	75.462	ENSPTRG00000044591	HTATSF1	99	75.397	Pan_troglodytes
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	64.868	ENSPANG00000010946	HTATSF1	99	64.868	Papio_anubis
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	54	60.606	ENSPMGG00000006172	htatsf1	93	60.839	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	98	71.958	ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	70.696	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	52	64.975	ENSPCIG00000018896	-	88	64.975	Phascolarctos_cinereus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	54	62.295	ENSPFOG00000007871	htatsf1	93	61.048	Poecilia_formosa
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	54	61.827	ENSPLAG00000007532	htatsf1	97	60.592	Poecilia_latipinna
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	54	62.295	ENSPMEG00000000352	htatsf1	97	61.048	Poecilia_mexicana
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	56	60.364	ENSPREG00000007811	htatsf1	97	60.364	Poecilia_reticulata
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	83	78.469	ENSPPYG00000020765	HTATSF1	84	77.125	Pongo_abelii
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	98	60.729	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	99	58.530	Procavia_capensis
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	76.084	ENSPCOG00000021823	HTATSF1	99	75.232	Propithecus_coquereli
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	98	67.733	ENSPVAG00000010281	HTATSF1	89	68.631	Pteropus_vampyrus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	54	58.756	ENSPNYG00000016693	htatsf1	95	58.503	Pundamilia_nyererei
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	100	72.087	ENSRNOG00000027761	Htatsf1	99	71.466	Rattus_norvegicus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	66.005	ENSRBIG00000035486	HTATSF1	99	65.608	Rhinopithecus_bieti
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	75.926	ENSRROG00000021939	HTATSF1	99	75.926	Rhinopithecus_roxellana
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	71.316	ENSSBOG00000017914	-	99	69.669	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	75.000	ENSSBOG00000027186	-	99	74.603	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	51	68.653	ENSSHAG00000006440	-	99	68.653	Sarcophilus_harrisii
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	50	61.842	ENSSFOG00015012002	htatsf1	81	61.842	Scleropages_formosus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	54	59.112	ENSSLDG00000016880	htatsf1	93	58.469	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	61.346	ENSSARG00000005193	HTATSF1	97	60.241	Sorex_araneus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	52	64.865	ENSSPUG00000014767	HTATSF1	87	65.356	Sphenodon_punctatus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	54	59.101	ENSSPAG00000000732	htatsf1	89	61.687	Stegastes_partitus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	66.273	ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	65.670	Sus_scrofa
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	51	63.119	ENSTNIG00000016140	htatsf1	88	62.871	Tetraodon_nigroviridis
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	85	65.528	ENSTTRG00000002269	HTATSF1	96	64.976	Tursiops_truncatus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	75.489	ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	75.231	Ursus_americanus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	74.581	ENSUMAG00000010393	HTATSF1	99	74.316	Ursus_maritimus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	91	66.571	ENSVPAG00000004569	HTATSF1	99	65.612	Vicugna_pacos
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	74.156	ENSVVUG00000024802	HTATSF1	99	73.177	Vulpes_vulpes
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	54	63.680	ENSXCOG00000006912	htatsf1	97	62.559	Xiphophorus_couchianus
ENSFDAG00000008617	HTATSF1	56	62.238	ENSXMAG00000000490	htatsf1	97	62.238	Xiphophorus_maculatus