EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFDAG00000009438 (Gene tree)
Gene ID: 104852349
Gene Symbol: SKIV2L
Alias: 170A|DDX13|HLP|SKI2W|SKIV2|SKIV2L1
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Fukomys_damarensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8846 bases
Position: chrKN124473.1:389061-397906
Accession: 104852349
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFDAP00000019014	rRNA_proc-arch	PF13234.6	2.9e-39	1	1
ENSFDAP00000019014	DEAD	PF00270.29	1.2e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFDAT00000013107	SKIV2L-201	3693	XM_010609934	ENSFDAP00000019014	1230 (aa)	XP_010608236	-

Gene Model

Click here to download ENSFDAG00000009438's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSFDAG00000009438's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	76	35.959	ENSFDAG00000011199	MTREX	88	35.959

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.056	ENSG00000204351	SKIV2L	100	89.816	Homo_sapiens
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	60.111	ENSAPOG00000008257	skiv2l	99	60.289	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.449	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	90.209	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	59.054	ENSACIG00000016719	skiv2l	99	59.003	Amphilophus_citrinellus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	60.207	ENSAOCG00000017352	skiv2l	99	60.129	Amphiprion_ocellaris
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	60.048	ENSAPEG00000001055	skiv2l	99	59.968	Amphiprion_percula
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	59.603	ENSATEG00000007601	skiv2l	99	59.583	Anabas_testudineus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	64.314	ENSACAG00000011746	SKIV2L	98	64.565	Anolis_carolinensis
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.698	ENSANAG00000037992	SKIV2L	100	90.457	Aotus_nancymaae
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	60.428	ENSACLG00000006886	skiv2l	99	60.370	Astatotilapia_calliptera
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	98	58.280	ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	58.280	Astyanax_mexicanus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.217	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	100	90.136	Bos_taurus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	96	38.768	WBGene00008502	skih-2	78	43.548	Caenorhabditis_elegans
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.537	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	90.217	Callithrix_jacchus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	98	89.967	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	100	89.495	Canis_familiaris
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	98	89.967	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	100	89.495	Canis_lupus_dingo
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.136	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	100	90.217	Capra_hircus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.217	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	100	89.896	Carlito_syrichta
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.931	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	100	90.530	Cavia_porcellus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.457	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	100	90.136	Cebus_capucinus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	89.735	ENSCATG00000036901	SKIV2L	100	89.735	Cercocebus_atys
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.457	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	90.537	Chinchilla_lanigera
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.217	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	100	89.896	Chlorocebus_sabaeus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	87	65.031	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	95	65.193	Chrysemys_picta_bellii
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	93	50.382	ENSCING00000005576	-	99	50.256	Ciona_intestinalis
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	90.128	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	90.128	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.858	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	100	90.698	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	60.287	ENSCSEG00000011326	skiv2l	98	60.242	Cynoglossus_semilaevis
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	60.176	ENSCVAG00000003072	skiv2l	95	65.249	Cyprinodon_variegatus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	59.177	ENSDARG00000062206	skiv2l	99	59.182	Danio_rerio
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	93	93.086	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	94	93.214	Dasypus_novemcinctus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	93	43.347	FBgn0039117	tst	97	43.013	Drosophila_melanogaster
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	72	88.046	ENSETEG00000009522	SKIV2L	72	90.278	Echinops_telfairi
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	89	55.662	ENSEBUG00000013680	-	95	57.648	Eptatretus_burgeri
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	93	90.361	ENSEASG00005015534	SKIV2L	99	90.448	Equus_asinus_asinus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	95	90.093	ENSECAG00000021823	SKIV2L	96	90.178	Equus_caballus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	54	97.233	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	57	97.233	Erinaceus_europaeus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	59.163	ENSELUG00000000181	skiv2l	94	65.768	Esox_lucius
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.136	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	100	90.217	Felis_catus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	60.126	ENSFHEG00000008853	skiv2l	94	65.567	Fundulus_heteroclitus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	57.907	ENSGMOG00000005926	skiv2l	98	57.908	Gadus_morhua
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	77	60.187	ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	60.393	Gallus_gallus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	60.174	ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	59.952	Gambusia_affinis
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	59.159	ENSGACG00000002927	skiv2l	98	59.182	Gasterosteus_aculeatus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.056	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	100	89.816	Gorilla_gorilla
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	60.270	ENSHBUG00000000726	skiv2l	99	60.209	Haplochromis_burtoni
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	91.673	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	100	91.593	Heterocephalus_glaber_female
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.607	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	100	90.519	Heterocephalus_glaber_male
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	98	58.828	ENSHCOG00000007191	skiv2l	96	65.560	Hippocampus_comes
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	58.958	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	58.974	Ictalurus_punctatus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.778	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	90.537	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	70	59.569	ENSLACG00000002986	-	73	58.690	Latimeria_chalumnae
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	89.103	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	88.773	Loxodonta_africana
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.056	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	100	90.056	Macaca_fascicularis
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.136	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	100	89.896	Macaca_mulatta
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	89.976	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	89.976	Macaca_nemestrina
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	89.816	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	100	89.816	Mandrillus_leucophaeus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	59.905	ENSMAMG00000002927	skiv2l	95	65.768	Mastacembelus_armatus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	60.270	ENSMZEG00005026415	skiv2l	99	60.209	Maylandia_zebra
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	71	51.572	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	72	75.102	Meleagris_gallopavo
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.056	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	90.144	Mesocricetus_auratus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.297	ENSMICG00000046331	SKIV2L	100	90.056	Microcebus_murinus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	88.933	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	89.094	Microtus_ochrogaster
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	59.984	ENSMMOG00000014547	skiv2l	96	65.874	Mola_mola
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	83.440	ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	83.520	Monodelphis_domestica
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	58.842	ENSMALG00000010535	skiv2l	98	58.795	Monopterus_albus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.297	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	100	89.976	Mus_caroli
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.297	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	100	90.056	Mus_musculus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.297	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	100	90.056	Mus_pahari
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	89.896	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	100	89.655	Mus_spretus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.297	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	100	90.056	Mustela_putorius_furo
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	88.853	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	100	88.532	Myotis_lucifugus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	59.665	ENSNBRG00000018650	skiv2l	98	59.564	Neolamprologus_brichardi
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	98	87.186	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	86.942	Nomascus_leucogenys
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	79	89.381	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	89.381	Notamacropus_eugenii
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	89.655	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	89.415	Ochotona_princeps
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	89.655	ENSODEG00000017516	SKIV2L	100	89.655	Octodon_degus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	60.956	ENSONIG00000013500	skiv2l	99	60.936	Oreochromis_niloticus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.377	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	100	90.457	Oryctolagus_cuniculus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	60.412	ENSORLG00000002021	skiv2l	99	60.370	Oryzias_latipes
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	60.253	ENSORLG00020009462	skiv2l	96	63.646	Oryzias_latipes_hni
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	60.174	ENSORLG00015016750	skiv2l	99	60.129	Oryzias_latipes_hsok
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	60.890	ENSOMEG00000008531	skiv2l	99	60.677	Oryzias_melastigma
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.537	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	100	90.136	Otolemur_garnettii
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	86.144	ENSOARG00000002411	-	100	85.827	Ovis_aries
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	98	89.231	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	99	88.988	Pan_paniscus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.297	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	100	90.377	Panthera_pardus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.056	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	89.816	Panthera_tigris_altaica
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.136	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	100	89.896	Pan_troglodytes
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	98	88.898	ENSPANG00000011501	SKIV2L	99	88.655	Papio_anubis
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	59.289	ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	58.917	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	59.197	ENSPMGG00000019707	skiv2l	98	59.187	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.377	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	100	90.377	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	83.373	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	100	83.453	Phascolarctos_cinereus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	60.143	ENSPFOG00000002424	skiv2l	99	59.855	Poecilia_formosa
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	60.270	ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	59.984	Poecilia_latipinna
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	59.937	ENSPMEG00000006997	skiv2l	99	59.711	Poecilia_mexicana
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	59.003	ENSPREG00000002277	skiv2l	96	65.249	Poecilia_reticulata
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	89.495	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	89.254	Pongo_abelii
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	77	92.105	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	77	92.105	Procavia_capensis
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	91.179	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	100	90.938	Propithecus_coquereli
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	88.702	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	100	88.372	Pteropus_vampyrus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	58.635	ENSPNYG00000017853	skiv2l	97	65.596	Pundamilia_nyererei
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	98	59.680	ENSPNAG00000011823	skiv2l	99	59.631	Pygocentrus_nattereri
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.385	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	100	90.056	Rattus_norvegicus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	98	87.702	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	87.460	Rhinopithecus_bieti
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	89.976	ENSRROG00000036429	SKIV2L	100	89.976	Rhinopithecus_roxellana
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	93	37.141	YLR398C	-	93	37.061	Saccharomyces_cerevisiae
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.377	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	90.056	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	83.360	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	82.320	Sarcophilus_harrisii
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	59.937	ENSSFOG00015016930	skiv2l	96	66.321	Scleropages_formosus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	59.697	ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	59.503	Scophthalmus_maximus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	60.143	ENSSDUG00000019977	skiv2l	95	66.183	Seriola_dumerili
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	58.989	ENSSLDG00000024382	skiv2l	95	65.664	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	61.712	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	98	60.330	Sphenodon_punctatus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	94	59.683	ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	59.695	Stegastes_partitus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.377	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	90.457	Sus_scrofa
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	58.473	ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	58.690	Tetraodon_nigroviridis
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	94	89.571	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	89.571	Tupaia_belangeri
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	85.806	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	85.886	Tursiops_truncatus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.537	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	90.297	Ursus_americanus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	93	90.361	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	99	90.103	Ursus_maritimus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	98	90.065	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	98	89.821	Vulpes_vulpes
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	57.677	ENSXETG00000010932	skiv2l	100	57.677	Xenopus_tropicalis
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	60.256	ENSXCOG00000019517	skiv2l	96	60.081	Xiphophorus_couchianus
ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	59.826	ENSXMAG00000014079	skiv2l	99	59.679	Xiphophorus_maculatus