EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFDAG00000010243 (Gene tree)
Gene ID: 104857434
Gene Symbol: EEFSEC
Alias: EFSEC|SELB|eEFSec
Full Name: eukaryotic elongation factor%2C selenocysteine-tRNA specific
Gene Type: protein_coding
Species: Fukomys_damarensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 146098 bases
Position: chrKN120539.1:790850-936947
Accession: 104857434
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFDAP00000017911	GTP_EFTU	PF00009.27	5.5e-08	1	1
ENSFDAP00000017931	GTP_EFTU	PF00009.27	7.6e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFDAT00000014020	EEFSEC-201	726	-	ENSFDAP00000017931	242 (aa)	-	-
ENSFDAT00000014032	EEFSEC-202	2400	XM_010617315	ENSFDAP00000017911	490 (aa)	XP_010615617	-

Gene Model

Click here to download ENSFDAG00000010243's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSFDAG00000010243's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	94.079	ENSG00000132394	EEFSEC	82	89.796	Homo_sapiens
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	61.350	ENSAPOG00000015931	eefsec	83	60.558	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	94.737	ENSAMEG00000015165	EEFSEC	99	82.927	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	87	70.142	ENSACIG00000022407	eefsec	74	63.483	Amphilophus_citrinellus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	61.759	ENSAOCG00000008603	eefsec	83	60.956	Amphiprion_ocellaris
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	88	71.875	ENSAPEG00000017090	eefsec	83	60.757	Amphiprion_percula
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	59.681	ENSATEG00000002753	eefsec	83	59.761	Anabas_testudineus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	85	85.430	ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	79.582	Anas_platyrhynchos
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	62	82.000	ENSACAG00000028177	-	99	82.692	Anolis_carolinensis
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	93.421	ENSANAG00000032691	EEFSEC	82	88.980	Aotus_nancymaae
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	60.080	ENSACLG00000024565	eefsec	83	60.878	Astatotilapia_calliptera
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	70.000	ENSAMXG00000002260	eefsec	82	61.446	Astyanax_mexicanus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	89.669	ENSBTAG00000030962	EEFSEC	83	86.122	Bos_taurus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	81	46.809	WBGene00008133	efsc-1	75	30.345	Caenorhabditis_elegans
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	93.421	ENSCJAG00000005387	EEFSEC	82	89.184	Callithrix_jacchus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	94.079	ENSCAFG00000004135	EEFSEC	66	89.592	Canis_familiaris
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	94.079	ENSCAFG00020004811	EEFSEC	82	89.592	Canis_lupus_dingo
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	88.816	ENSCHIG00000021838	EEFSEC	85	86.735	Capra_hircus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	94.079	ENSTSYG00000012922	EEFSEC	82	90.612	Carlito_syrichta
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	94.624	ENSCAPG00000000084	EEFSEC	98	86.735	Cavia_aperea
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	94.624	ENSCPOG00000024352	EEFSEC	84	92.653	Cavia_porcellus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	93.421	ENSCCAG00000031336	EEFSEC	82	89.388	Cebus_capucinus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	94.079	ENSCATG00000019414	EEFSEC	100	89.463	Cercocebus_atys
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	95.699	ENSCLAG00000006973	EEFSEC	84	92.653	Chinchilla_lanigera
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	93.421	ENSCSAG00000008599	EEFSEC	82	89.592	Chlorocebus_sabaeus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	98	84.667	ENSCPBG00000014356	EEFSEC	71	77.986	Chrysemys_picta_bellii
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	51.633	ENSCSAVG00000002208	-	88	51.837	Ciona_savignyi
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	92.763	ENSCANG00000031492	EEFSEC	82	88.980	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	94.737	ENSCGRG00001018089	Eefsec	84	86.762	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	94.737	ENSCGRG00000010063	Eefsec	84	86.762	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	84	75.926	ENSCSEG00000003008	eefsec	82	60.198	Cynoglossus_semilaevis
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	61.818	ENSCVAG00000005381	eefsec	82	61.569	Cyprinodon_variegatus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	62.048	ENSDARG00000004696	eefsec	83	62.450	Danio_rerio
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	82.245	ENSDNOG00000008925	EEFSEC	83	83.096	Dasypus_novemcinctus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	71.020	ENSDORG00000000264	Eefsec	99	84.536	Dipodomys_ordii
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	89	40.690	FBgn0034627	eEFSec	78	40.690	Drosophila_melanogaster
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	75.869	ENSETEG00000007406	EEFSEC	82	75.869	Echinops_telfairi
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	70	54.942	ENSEBUG00000015029	eefsec	68	53.740	Eptatretus_burgeri
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	94.737	ENSEASG00005006786	EEFSEC	82	90.408	Equus_asinus_asinus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	94.737	ENSECAG00000016565	EEFSEC	82	90.816	Equus_caballus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	58.635	ENSELUG00000016632	eefsec	82	58.635	Esox_lucius
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	93.421	ENSFCAG00000006153	EEFSEC	82	90.000	Felis_catus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	98	86.093	ENSFALG00000007901	EEFSEC	99	74.233	Ficedula_albicollis
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	61.895	ENSFHEG00000007155	eefsec	82	61.847	Fundulus_heteroclitus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	59.509	ENSGMOG00000007705	eefsec	82	60.489	Gadus_morhua
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	98	85.333	ENSGALG00000038684	EEFSEC	83	75.256	Gallus_gallus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	67.333	ENSGAFG00000021692	eefsec	83	62.222	Gambusia_affinis
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	61.866	ENSGACG00000000793	eefsec	84	60.800	Gasterosteus_aculeatus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	98	84.667	ENSGAGG00000002059	EEFSEC	82	73.824	Gopherus_agassizii
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	94.737	ENSGGOG00000001445	EEFSEC	94	89.796	Gorilla_gorilla
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	61.554	ENSHBUG00000008917	eefsec	83	61.078	Haplochromis_burtoni
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	96.694	ENSHGLG00000000094	EEFSEC	100	96.053	Heterocephalus_glaber_female
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	96.053	ENSHGLG00100011393	EEFSEC	81	94.490	Heterocephalus_glaber_male
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	61.914	ENSHCOG00000004193	eefsec	83	61.992	Hippocampus_comes
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	61.290	ENSIPUG00000017291	eefsec	80	65.207	Ictalurus_punctatus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	91.447	ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	89.583	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	90.496	ENSJJAG00000020703	-	100	94.737	Jaculus_jaculus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	62.222	ENSKMAG00000019907	eefsec	83	62.298	Kryptolebias_marmoratus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	60.362	ENSLBEG00000017908	eefsec	82	60.643	Labrus_bergylta
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	80.000	ENSLACG00000013137	EEFSEC	92	68.303	Latimeria_chalumnae
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	93	72.667	ENSLOCG00000014535	eefsec	82	63.692	Lepisosteus_oculatus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	83.707	ENSLAFG00000001997	EEFSEC	84	84.114	Loxodonta_africana
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	94.079	ENSMFAG00000042128	EEFSEC	82	90.000	Macaca_fascicularis
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	93.421	ENSMMUG00000018663	EEFSEC	100	89.669	Macaca_mulatta
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	94.079	ENSMNEG00000028574	EEFSEC	82	89.796	Macaca_nemestrina
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	94.079	ENSMLEG00000041771	EEFSEC	92	89.796	Mandrillus_leucophaeus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	68.000	ENSMAMG00000023964	eefsec	83	60.040	Mastacembelus_armatus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	88	68.075	ENSMZEG00005009380	eefsec	72	62.921	Maylandia_zebra
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	79	75.959	ENSMGAG00000007243	EEFSEC	99	75.959	Meleagris_gallopavo
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	90	93.421	ENSMAUG00000011197	Eefsec	82	85.811	Mesocricetus_auratus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	94.737	ENSMOCG00000017748	Eefsec	84	87.780	Microtus_ochrogaster
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	96	66.524	ENSMMOG00000021820	eefsec	73	63.483	Mola_mola
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	97	82.751	ENSMODG00000008034	EEFSEC	75	82.751	Monodelphis_domestica
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	97	60.612	ENSMALG00000016211	eefsec	81	63.182	Monopterus_albus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	95.395	MGP_CAROLIEiJ_G0028627	Eefsec	100	96.053	Mus_caroli
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	95.395	ENSMUSG00000033216	Eefsec	100	96.053	Mus_musculus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	95.395	MGP_PahariEiJ_G0022366	Eefsec	100	96.053	Mus_pahari
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	95.395	MGP_SPRETEiJ_G0029640	Eefsec	100	96.053	Mus_spretus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	94.079	ENSMPUG00000017340	EEFSEC	79	89.549	Mustela_putorius_furo
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	94.079	ENSMLUG00000004261	EEFSEC	99	86.939	Myotis_lucifugus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	91.736	ENSNGAG00000023278	-	100	94.079	Nannospalax_galili
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	60.279	ENSNBRG00000002387	eefsec	83	61.155	Neolamprologus_brichardi
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	93.421	ENSNLEG00000014303	EEFSEC	82	89.388	Nomascus_leucogenys
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	98	91.447	ENSMEUG00000005747	EEFSEC	100	78.163	Notamacropus_eugenii
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	93.421	ENSOPRG00000011276	EEFSEC	83	89.366	Ochotona_princeps
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	92.763	ENSODEG00000002928	EEFSEC	90	92.041	Octodon_degus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	88	70.312	ENSONIG00000019038	eefsec	100	60.282	Oreochromis_niloticus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	85.526	ENSOANG00000009108	EEFSEC	99	75.983	Ornithorhynchus_anatinus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	94.737	ENSOCUG00000016517	EEFSEC	83	89.388	Oryctolagus_cuniculus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	61.336	ENSORLG00000001377	eefsec	82	61.336	Oryzias_latipes
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	61.336	ENSORLG00020000729	eefsec	82	61.336	Oryzias_latipes_hni
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	61.336	ENSORLG00015001986	eefsec	82	61.336	Oryzias_latipes_hsok
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	60.931	ENSOMEG00000010071	eefsec	88	61.336	Oryzias_melastigma
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	84	96.053	ENSOGAG00000014084	EEFSEC	96	91.822	Otolemur_garnettii
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	77	86.667	ENSOARG00000004600	EEFSEC	99	86.667	Ovis_aries
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	94.079	ENSPPAG00000030936	EEFSEC	82	89.796	Pan_paniscus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	93.421	ENSPPRG00000002846	EEFSEC	82	90.000	Panthera_pardus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	93.421	ENSPTIG00000013855	EEFSEC	88	90.000	Panthera_tigris_altaica
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	94.079	ENSPTRG00000015353	EEFSEC	82	89.592	Pan_troglodytes
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	94.079	ENSPANG00000017041	EEFSEC	82	89.388	Papio_anubis
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	98	72.667	ENSPKIG00000005220	eefsec	82	61.829	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	83	86.000	ENSPSIG00000015135	EEFSEC	80	78.220	Pelodiscus_sinensis
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	61.134	ENSPMGG00000020300	eefsec	83	61.212	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	93.421	ENSPEMG00000013677	Eefsec	84	86.558	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	87	72.667	ENSPMAG00000006779	eefsec	81	63.387	Petromyzon_marinus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	92.763	ENSPCIG00000020494	EEFSEC	100	79.381	Phascolarctos_cinereus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	88	73.438	ENSPFOG00000003748	eefsec	82	61.741	Poecilia_formosa
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	84	77.778	ENSPLAG00000018012	eefsec	82	61.741	Poecilia_latipinna
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	88	73.438	ENSPMEG00000001202	eefsec	82	61.741	Poecilia_mexicana
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	68.000	ENSPREG00000012235	eefsec	83	61.538	Poecilia_reticulata
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	93.421	ENSPPYG00000013436	EEFSEC	82	89.388	Pongo_abelii
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	84	78.935	ENSPCAG00000005883	EEFSEC	78	78.935	Procavia_capensis
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	87.500	ENSPCOG00000023432	EEFSEC	83	81.429	Propithecus_coquereli
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	60.279	ENSPNYG00000005726	eefsec	83	61.078	Pundamilia_nyererei
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	70.000	ENSPNAG00000016724	eefsec	83	61.323	Pygocentrus_nattereri
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	95.395	ENSRNOG00000012954	Eefsec	84	87.984	Rattus_norvegicus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	93.421	ENSRBIG00000032635	EEFSEC	82	89.388	Rhinopithecus_bieti
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	62	94.667	ENSRROG00000030260	-	55	91.463	Rhinopithecus_roxellana
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	93.421	ENSSBOG00000031478	EEFSEC	100	89.669	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	91.447	ENSSHAG00000014760	EEFSEC	100	79.794	Sarcophilus_harrisii
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	71.333	ENSSFOG00015021109	eefsec	82	61.404	Scleropages_formosus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	60.159	ENSSMAG00000001454	eefsec	83	60.437	Scophthalmus_maximus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	60.159	ENSSDUG00000007924	eefsec	83	60.239	Seriola_dumerili
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	97	59.592	ENSSLDG00000024985	eefsec	82	59.674	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	88	84.106	ENSSPUG00000004191	EEFSEC	100	72.464	Sphenodon_punctatus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	88	71.875	ENSSPAG00000001320	eefsec	83	61.155	Stegastes_partitus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	92.473	ENSSSCG00000011619	EEFSEC	83	88.438	Sus_scrofa
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	98	87.333	ENSTGUG00000007895	EEFSEC	84	74.438	Taeniopygia_guttata
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	60.843	ENSTRUG00000010327	eefsec	82	60.922	Takifugu_rubripes
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	88	73.438	ENSTNIG00000003225	eefsec	83	60.600	Tetraodon_nigroviridis
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	90.132	ENSTTRG00000000994	EEFSEC	83	86.327	Tursiops_truncatus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	94.737	ENSUAMG00000017283	EEFSEC	82	90.408	Ursus_americanus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	85	94.079	ENSVVUG00000018372	EEFSEC	90	90.255	Vulpes_vulpes
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	77	74.933	ENSXETG00000002066	eefsec	80	74.933	Xenopus_tropicalis
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	61.538	ENSXCOG00000019916	eefsec	83	61.895	Xiphophorus_couchianus
ENSFDAG00000010243	EEFSEC	96	67.333	ENSXMAG00000001839	eefsec	83	61.895	Xiphophorus_maculatus