EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFDAG00000011250 (Gene tree)
Gene ID: 104849804
Gene Symbol: FTSJ1
Alias: CDLIV|JM23|MRX44|MRX9|SPB1|TRM7|TRMT7
Full Name: FtsJ RNA methyltransferase homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Fukomys_damarensis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 17404 bases
Position: chrKN123977.1:1861140-1878543
Accession: 104849804
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFDAP00000001200	FtsJ	PF01728.19	3.7e-69	1	1
ENSFDAP00000001209	FtsJ	PF01728.19	3.7e-69	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFDAT00000015214	FTSJ1-201	5284	XM_010606387	ENSFDAP00000001200	326 (aa)	XP_010604689	-
ENSFDAT00000015222	FTSJ1-202	1947	XM_010606386	ENSFDAP00000001209	328 (aa)	XP_010604688	-

Gene Model

Click here to download ENSFDAG00000011250's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSFDAG00000011250's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	59	33.838	ENSFDAG00000004774	MRM2	80	33.838

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	89.877	ENSG00000068438	FTSJ1	99	89.877	Homo_sapiens
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	90	76.254	ENSAPOG00000018541	ftsj1	95	76.254	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	91.515	ENSAMEG00000012735	FTSJ1	99	91.515	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	90	75.254	ENSACIG00000001541	ftsj1	95	75.254	Amphilophus_citrinellus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	90	74.754	ENSAOCG00000009380	ftsj1	95	74.754	Amphiprion_ocellaris
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	90	75.082	ENSAPEG00000020434	ftsj1	95	75.082	Amphiprion_percula
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	90	74.671	ENSATEG00000008408	ftsj1	95	74.671	Anabas_testudineus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	79	74.525	ENSACAG00000016605	FTSJ1	88	74.525	Anolis_carolinensis
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	90.854	ENSANAG00000030571	-	99	90.854	Aotus_nancymaae
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	97	87.697	ENSANAG00000035537	-	95	89.931	Aotus_nancymaae
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	90	74.098	ENSACLG00000014226	ftsj1	95	74.098	Astatotilapia_calliptera
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	88	77.397	ENSAMXG00000037663	ftsj1	91	77.397	Astyanax_mexicanus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	99	77.160	ENSBTAG00000046593	-	99	77.160	Bos_taurus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	83.537	ENSBTAG00000031829	FTSJ1	99	83.537	Bos_taurus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	88	55.369	WBGene00011281	R74.7	88	55.369	Caenorhabditis_elegans
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	90.854	ENSCJAG00000002256	FTSJ1	99	90.854	Callithrix_jacchus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	91.463	ENSCAFG00000015339	FTSJ1	99	91.463	Canis_familiaris
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	91.463	ENSCAFG00020021351	FTSJ1	99	91.463	Canis_lupus_dingo
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	76.524	ENSCHIG00000021392	-	99	76.524	Capra_hircus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	89.939	ENSCHIG00000000441	-	99	89.939	Capra_hircus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	99	77.607	ENSCHIG00000017370	-	99	77.607	Capra_hircus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	91.768	ENSTSYG00000029207	FTSJ1	99	91.768	Carlito_syrichta
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	91	79.667	ENSCAPG00000011705	FTSJ1	97	79.667	Cavia_aperea
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	92.683	ENSCPOG00000030576	FTSJ1	100	92.683	Cavia_porcellus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	90.854	ENSCCAG00000027731	FTSJ1	99	90.854	Cebus_capucinus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	90.854	ENSCATG00000013045	FTSJ1	99	90.854	Cercocebus_atys
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	99	92.661	ENSCLAG00000011582	FTSJ1	99	92.661	Chinchilla_lanigera
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	91.159	ENSCSAG00000013278	FTSJ1	99	91.159	Chlorocebus_sabaeus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	88	70.508	ENSCING00000008473	-	92	70.508	Ciona_intestinalis
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	88	68.543	ENSCSAVG00000010259	-	96	68.543	Ciona_savignyi
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	90.798	ENSCANG00000033841	FTSJ1	99	90.798	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	86.585	ENSCGRG00001023654	Ftsj1	100	86.585	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	86.544	ENSCGRG00000007253	Ftsj1	99	86.544	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	88	61.168	ENSCSEG00000018843	ftsj1	90	61.433	Cynoglossus_semilaevis
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	88	73.913	ENSCVAG00000009618	ftsj1	95	73.913	Cyprinodon_variegatus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	92	73.529	ENSDARG00000057089	ftsj1	100	87.500	Danio_rerio
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	85.152	ENSDNOG00000047923	-	99	85.152	Dasypus_novemcinctus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	96	59.236	ENSDNOG00000044320	-	99	59.236	Dasypus_novemcinctus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	98	87.188	ENSDORG00000000074	Ftsj1	100	87.188	Dipodomys_ordii
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	84	51.761	FBgn0038861	CG7009	87	51.761	Drosophila_melanogaster
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	80	52.203	FBgn0038471	CG5220	98	52.203	Drosophila_melanogaster
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	67	76.037	ENSETEG00000014092	-	65	76.037	Echinops_telfairi
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	95	62.058	ENSETEG00000018343	-	99	61.981	Echinops_telfairi
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	67	73.756	ENSEBUG00000005843	ftsj1	69	73.756	Eptatretus_burgeri
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	61	89.000	ENSEASG00005008272	FTSJ1	70	89.000	Equus_asinus_asinus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	90.549	ENSECAG00000019260	FTSJ1	99	90.549	Equus_caballus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	89	92.491	ENSEEUG00000001469	FTSJ1	100	92.491	Erinaceus_europaeus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	89	75.667	ENSELUG00000011483	ftsj1	90	75.667	Esox_lucius
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	91.159	ENSFCAG00000026453	FTSJ1	99	91.159	Felis_catus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	89	75.497	ENSFHEG00000008464	ftsj1	94	75.497	Fundulus_heteroclitus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	88	76.689	ENSGMOG00000004562	ftsj1	99	76.689	Gadus_morhua
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	65	73.832	ENSGAFG00000002036	ftsj1	94	73.832	Gambusia_affinis
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	92	74.026	ENSGACG00000008843	ftsj1	95	74.026	Gasterosteus_aculeatus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	89.329	ENSGGOG00000028552	FTSJ1	99	89.329	Gorilla_gorilla
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	90	74.098	ENSHBUG00000015883	ftsj1	95	74.098	Haplochromis_burtoni
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	94.512	ENSHGLG00000003132	FTSJ1	100	94.512	Heterocephalus_glaber_female
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	94.512	ENSHGLG00100014682	FTSJ1	100	94.512	Heterocephalus_glaber_male
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	89	75.920	ENSHCOG00000010145	ftsj1	95	75.920	Hippocampus_comes
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	89	75.932	ENSIPUG00000005052	FTSJ1	92	75.932	Ictalurus_punctatus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	99	91.104	ENSSTOG00000027717	FTSJ1	99	91.104	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	99	87.234	ENSJJAG00000014517	-	100	87.234	Jaculus_jaculus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	97	84.858	ENSJJAG00000011596	-	98	85.852	Jaculus_jaculus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	88	76.792	ENSKMAG00000000645	ftsj1	92	76.792	Kryptolebias_marmoratus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	89	75.497	ENSLBEG00000005293	ftsj1	84	75.497	Labrus_bergylta
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	76	84.848	ENSLACG00000009913	FTSJ1	82	84.848	Latimeria_chalumnae
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	88	76.451	ENSLOCG00000015688	ftsj1	87	76.451	Lepisosteus_oculatus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	99	85.627	ENSLAFG00000032618	FTSJ1	100	85.627	Loxodonta_africana
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	90.854	ENSMFAG00000003467	FTSJ1	99	90.854	Macaca_fascicularis
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	90.854	ENSMMUG00000018894	FTSJ1	99	90.854	Macaca_mulatta
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	90.549	ENSMNEG00000044348	FTSJ1	99	90.549	Macaca_nemestrina
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	91.411	ENSMLEG00000016789	FTSJ1	99	91.411	Mandrillus_leucophaeus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	90	76.080	ENSMAMG00000022841	ftsj1	91	76.080	Mastacembelus_armatus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	90	74.098	ENSMZEG00005022583	ftsj1	95	74.098	Maylandia_zebra
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	86.280	ENSMAUG00000015442	Ftsj1	100	86.280	Mesocricetus_auratus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	89	94.158	ENSMICG00000036228	-	98	94.158	Microcebus_murinus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	67	94.495	ENSMOCG00000000507	-	100	94.495	Microtus_ochrogaster
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	97	84.227	ENSMOCG00000021218	-	96	84.227	Microtus_ochrogaster
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	93	86.139	ENSMOCG00000020523	-	96	86.139	Microtus_ochrogaster
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	90	70.915	ENSMMOG00000018969	ftsj1	97	70.588	Mola_mola
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	88	79.585	ENSMODG00000011356	FTSJ1	98	79.585	Monodelphis_domestica
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	90	74.419	ENSMALG00000014209	ftsj1	97	73.770	Monopterus_albus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	99	84.923	MGP_CAROLIEiJ_G0032918	Ftsj1	100	84.923	Mus_caroli
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	99	84.923	ENSMUSG00000031171	Ftsj1	100	84.923	Mus_musculus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	84.663	MGP_PahariEiJ_G0031467	Ftsj1	100	84.709	Mus_pahari
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	99	84.615	MGP_SPRETEiJ_G0034067	Ftsj1	100	84.615	Mus_spretus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	92.683	ENSMPUG00000013493	FTSJ1	99	92.683	Mustela_putorius_furo
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	87.311	ENSMLUG00000003977	FTSJ1	99	87.311	Myotis_lucifugus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	88.110	ENSNGAG00000018629	-	100	88.110	Nannospalax_galili
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	83.232	ENSNGAG00000016847	-	99	83.232	Nannospalax_galili
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	90	66.766	ENSNBRG00000012481	ftsj1	96	66.766	Neolamprologus_brichardi
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	84.451	ENSNLEG00000007816	FTSJ1	99	84.451	Nomascus_leucogenys
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	92.988	ENSODEG00000009855	FTSJ1	100	92.988	Octodon_degus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	90	73.616	ENSONIG00000003966	ftsj1	98	73.616	Oreochromis_niloticus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	79	43.243	ENSOANG00000013572	-	89	43.243	Ornithorhynchus_anatinus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	90.244	ENSOCUG00000008009	-	99	90.244	Oryctolagus_cuniculus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	99	85.494	ENSOCUG00000024620	-	99	85.494	Oryctolagus_cuniculus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	99	86.728	ENSOCUG00000023277	-	99	86.728	Oryctolagus_cuniculus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	88	75.000	ENSORLG00000028355	ftsj1	94	75.000	Oryzias_latipes
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	88	75.342	ENSORLG00020007897	ftsj1	94	75.342	Oryzias_latipes_hni
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	88	74.315	ENSOMEG00000018497	ftsj1	86	74.315	Oryzias_melastigma
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	98	88.580	ENSOGAG00000032641	-	100	88.580	Otolemur_garnettii
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	78.248	ENSOGAG00000016174	-	99	78.248	Otolemur_garnettii
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	89.939	ENSOARG00000012432	-	99	89.939	Ovis_aries
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	75.610	ENSOARG00000012099	-	99	75.610	Ovis_aries
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	89.877	ENSPPAG00000028540	FTSJ1	99	89.877	Pan_paniscus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	90.854	ENSPPRG00000000249	FTSJ1	99	90.854	Panthera_pardus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	90.549	ENSPTIG00000017680	FTSJ1	99	90.549	Panthera_tigris_altaica
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	89.877	ENSPTRG00000049433	FTSJ1	99	89.877	Pan_troglodytes
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	90.549	ENSPANG00000010102	FTSJ1	99	90.549	Papio_anubis
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	89	73.684	ENSPKIG00000019318	ftsj1	89	73.684	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	84	56.028	ENSPSIG00000007020	FTSJ1	93	57.197	Pelodiscus_sinensis
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	78.528	ENSPEMG00000013262	-	97	78.528	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	87.117	ENSPEMG00000015698	-	100	87.117	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	89	73.311	ENSPMAG00000006943	FTSJ1	99	73.311	Petromyzon_marinus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	94	75.325	ENSPCIG00000007236	FTSJ1	97	75.325	Phascolarctos_cinereus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	89	73.220	ENSPFOG00000017003	ftsj1	95	73.220	Poecilia_formosa
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	78	76.172	ENSPLAG00000016190	ftsj1	91	76.172	Poecilia_latipinna
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	94	70.645	ENSPMEG00000021719	ftsj1	99	70.645	Poecilia_mexicana
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	89	73.720	ENSPREG00000016616	ftsj1	95	73.720	Poecilia_reticulata
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	68	75.159	ENSPPYG00000020309	-	99	75.159	Pongo_abelii
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	57	92.405	ENSPCAG00000009437	-	65	92.405	Procavia_capensis
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	89	94.845	ENSPCOG00000022716	-	93	94.845	Propithecus_coquereli
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	89.877	ENSPCOG00000018822	-	99	89.877	Propithecus_coquereli
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	70	76.852	ENSPVAG00000015621	FTSJ1	69	76.852	Pteropus_vampyrus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	90	74.098	ENSPNYG00000011144	ftsj1	95	74.098	Pundamilia_nyererei
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	89	76.949	ENSPNAG00000016330	ftsj1	92	76.949	Pygocentrus_nattereri
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	84.663	ENSRNOG00000004776	Ftsj1	99	84.663	Rattus_norvegicus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	90.549	ENSRBIG00000027511	FTSJ1	99	90.549	Rhinopithecus_bieti
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	90.549	ENSRROG00000029757	FTSJ1	99	90.549	Rhinopithecus_roxellana
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	88	48.065	YBR061C	TRM7	100	47.923	Saccharomyces_cerevisiae
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	91.104	ENSSBOG00000028146	FTSJ1	99	91.104	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	93	75.649	ENSSHAG00000012607	FTSJ1	100	75.649	Sarcophilus_harrisii
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	91	73.397	ENSSFOG00015006275	ftsj1	91	73.397	Scleropages_formosus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	90	75.585	ENSSMAG00000001754	ftsj1	95	75.585	Scophthalmus_maximus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	90	74.915	ENSSDUG00000015226	ftsj1	95	74.915	Seriola_dumerili
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	90	76.014	ENSSLDG00000019859	ftsj1	95	76.014	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	85.410	ENSSARG00000007091	-	99	85.410	Sorex_araneus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	77	77.291	ENSSARG00000007246	-	100	77.291	Sorex_araneus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	90	74.754	ENSSPAG00000022047	ftsj1	95	74.754	Stegastes_partitus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	89.329	ENSSSCG00000025599	FTSJ1	99	89.329	Sus_scrofa
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	89	74.324	ENSTRUG00000016142	ftsj1	93	74.324	Takifugu_rubripes
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	90	73.737	ENSTNIG00000010402	ftsj1	96	73.737	Tetraodon_nigroviridis
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	88.110	ENSTTRG00000009027	FTSJ1	99	88.110	Tursiops_truncatus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	98	92.188	ENSUAMG00000013296	FTSJ1	95	92.188	Ursus_americanus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	83.929	ENSUMAG00000007966	FTSJ1	99	84.756	Ursus_maritimus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	54	85.227	ENSVPAG00000008296	-	99	85.227	Vicugna_pacos
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	100	91.463	ENSVVUG00000017640	FTSJ1	99	91.463	Vulpes_vulpes
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	96	66.250	ENSXCOG00000003344	ftsj1	90	70.068	Xiphophorus_couchianus
ENSFDAG00000011250	FTSJ1	89	74.061	ENSXMAG00000009372	ftsj1	96	74.061	Xiphophorus_maculatus