EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFDAG00000013143 (Gene tree)
Gene ID: 104875425
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Fukomys_damarensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 40384 bases
Position: chrKN123381.1:422252-462635
Accession: 104875425
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFDAP00000003770	GTP_EFTU	PF00009.27	2.5e-45	1	1
ENSFDAP00000003770	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	8e-13	1	1
ENSFDAP00000003770	EFG_IV	PF03764.18	1.9e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFDAT00000017403	EFTUD2-201	5770	XM_010642929	ENSFDAP00000003770	972 (aa)	XP_010641231	UPI00053F922E

Gene Model

Click here to download ENSFDAG00000013143's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSFDAG00000013143's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	51	32.639	ENSFDAG00000016559	GFM1	58	32.639
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	84	34.507	ENSFDAG00000009023	EFL1	84	34.507
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	87	38.832	ENSFDAG00000010465	EEF2	99	38.832

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.280	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	92.181	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	92.078	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.383	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	99.383	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	88.683	ENSACIG00000009096	eftud2	100	88.580	Amphilophus_citrinellus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	87	88.235	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.235	Amphiprion_ocellaris
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	92.284	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	92.181	Amphiprion_percula
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	92.593	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.490	Anabas_testudineus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	99	94.130	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	94.130	Anas_platyrhynchos
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	97.222	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.222	Anolis_carolinensis
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.177	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.177	Aotus_nancymaae
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	92.181	ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	Astatotilapia_calliptera
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	91.402	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.402	Astyanax_mexicanus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.486	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	99.486	Bos_taurus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	99	70.351	WBGene00001166	eftu-2	99	69.731	Caenorhabditis_elegans
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.177	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.177	Callithrix_jacchus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.383	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	99.383	Canis_familiaris
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.383	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.383	Canis_lupus_dingo
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.486	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	Capra_hircus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	98.971	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	98.971	Carlito_syrichta
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.177	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	99.177	Cavia_aperea
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.177	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.177	Cavia_porcellus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.177	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	99.177	Cebus_capucinus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.177	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.177	Cercocebus_atys
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.074	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	99.074	Chinchilla_lanigera
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.177	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.177	Chlorocebus_sabaeus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	91	86.712	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.712	Choloepus_hoffmanni
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	98.457	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.457	Chrysemys_picta_bellii
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	78.051	ENSCING00000009372	-	100	77.653	Ciona_intestinalis
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	99	78.049	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.599	Ciona_savignyi
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.177	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	99.177	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.486	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.486	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	99.486	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	91.564	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.461	Cynoglossus_semilaevis
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	92.387	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.284	Cyprinodon_variegatus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	90.853	ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.889	Danio_rerio
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	98.560	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	98.560	Dasypus_novemcinctus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.383	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.383	Dipodomys_ordii
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	75.051	FBgn0039566	CG4849	100	74.769	Drosophila_melanogaster
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	92	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	74	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	87.065	Eptatretus_burgeri
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.383	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	99.383	Equus_asinus_asinus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.280	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	99.280	Equus_caballus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	91.049	ENSELUG00000017169	eftud2	100	91.255	Esox_lucius
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.280	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.280	Felis_catus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	97.840	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.840	Ficedula_albicollis
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	92.490	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	92.387	Fundulus_heteroclitus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	90.947	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.667	Gadus_morhua
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	97.737	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.491	Gallus_gallus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	92.490	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	92.387	Gambusia_affinis
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	91.667	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.358	Gasterosteus_aculeatus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.177	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	99.177	Gorilla_gorilla
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	92.078	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	Haplochromis_burtoni
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.588	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	99.588	Heterocephalus_glaber_female
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.588	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	99.588	Heterocephalus_glaber_male
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	91.049	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.161	Hippocampus_comes
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	91.461	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	Ictalurus_punctatus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	93.313	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.313	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	96	99.573	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.573	Jaculus_jaculus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	91.872	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.564	Kryptolebias_marmoratus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	95	91.694	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.824	Labrus_bergylta
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	94.033	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.553	Latimeria_chalumnae
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	92.181	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	92.798	Lepisosteus_oculatus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.074	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.074	Loxodonta_africana
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.177	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	99.177	Macaca_fascicularis
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.177	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.177	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	99.177	Macaca_nemestrina
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.177	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	99.177	Mandrillus_leucophaeus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	92.387	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.284	Mastacembelus_armatus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	92.181	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	92.078	Maylandia_zebra
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	97.741	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.741	Meleagris_gallopavo
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.486	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	99.486	Mesocricetus_auratus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.177	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	99.177	Microcebus_murinus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	92	81.685	ENSMOCG00000017653	-	90	81.685	Microtus_ochrogaster
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.588	ENSMOCG00000009039	-	100	99.588	Microtus_ochrogaster
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	87	94.000	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	94.000	Mola_mola
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.074	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.074	Monodelphis_domestica
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	87	92.235	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.235	Monopterus_albus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.486	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	99.486	Mus_caroli
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.486	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	99.486	Mus_musculus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.486	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.486	Mus_pahari
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.486	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	99.486	Mus_spretus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	97	99.364	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	99.364	Mustela_putorius_furo
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.383	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	99.383	Myotis_lucifugus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.691	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.691	Nannospalax_galili
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	92.078	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	Neolamprologus_brichardi
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	97	97.343	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.343	Nomascus_leucogenys
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	95.370	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.370	Notamacropus_eugenii
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	91.152	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.152	Ochotona_princeps
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.074	ENSODEG00000018041	-	100	99.074	Octodon_degus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	93	79.885	ENSODEG00000003385	-	100	79.885	Octodon_degus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	92.181	ENSONIG00000000912	eftud2	100	92.078	Oreochromis_niloticus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.383	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.383	Oryctolagus_cuniculus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	91.461	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.461	Oryzias_latipes
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	91.564	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.564	Oryzias_latipes_hni
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	91.564	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.464	Oryzias_latipes_hsok
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	96.914	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	96.914	Otolemur_garnettii
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.486	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	99.486	Ovis_aries
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.280	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	99.280	Pan_paniscus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.383	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	99.383	Panthera_pardus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.383	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	99.383	Panthera_tigris_altaica
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.280	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.280	Pan_troglodytes
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.177	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	99.177	Papio_anubis
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	93	97.133	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	Pelodiscus_sinensis
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	84.156	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.774	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.691	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	99.691	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.074	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	99.074	Phascolarctos_cinereus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	92.490	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	92.387	Poecilia_formosa
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	92.490	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	92.387	Poecilia_latipinna
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	92.490	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	92.387	Poecilia_mexicana
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	97.737	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	97.737	Pongo_abelii
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	94.856	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	94.856	Procavia_capensis
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.074	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.074	Propithecus_coquereli
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	94.650	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.650	Pteropus_vampyrus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	92.078	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.975	Pundamilia_nyererei
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	91.872	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.181	Pygocentrus_nattereri
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.486	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.486	Rattus_norvegicus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.074	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	99.074	Rhinopithecus_bieti
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.074	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.074	Rhinopithecus_roxellana
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	97	33.992	YKL173W	SNU114	97	33.663	Saccharomyces_cerevisiae
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.177	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.177	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	97	99.147	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.147	Sarcophilus_harrisii
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	91.255	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.975	Scleropages_formosus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	91.770	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.667	Scophthalmus_maximus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	92.284	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	Seriola_dumerili
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	92.387	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	92.284	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	90.741	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.741	Sorex_araneus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	97.119	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.119	Sphenodon_punctatus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	92.387	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	92.284	Stegastes_partitus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.177	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.177	Sus_scrofa
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	84	97.080	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.080	Taeniopygia_guttata
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	91.358	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	Takifugu_rubripes
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	86.885	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.680	Tetraodon_nigroviridis
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	93.519	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.519	Tupaia_belangeri
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	90.741	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.741	Tursiops_truncatus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	98.255	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.255	Ursus_americanus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.383	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	99.383	Ursus_maritimus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.383	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	99.383	Vulpes_vulpes
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	96	95.085	ENSXETG00000003394	eftud2	98	95.974	Xenopus_tropicalis
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	81	93.622	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.622	Xiphophorus_couchianus
ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	92.490	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.387	Xiphophorus_maculatus