EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFDAG00000013345 (Gene tree)
Gene ID: 104871424
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Fukomys_damarensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 80088 bases
Position: chrKN122864.1:8911052-8991139
Accession: 104871424
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFDAP00000004036	IBN_N	PF03810.19	5.5e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFDAT00000029008	TNPO1-201	6776	XM_010637334	ENSFDAP00000004036	898 (aa)	XP_010635636	UPI00053FE42B

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	84.893	ENSFDAG00000021543	TNPO2	99	84.893

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.666	ENSG00000083312	TNPO1	100	99.666	Homo_sapiens
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	93.483	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.483	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	98.670	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.670	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFDAG00000013345	TNPO1	86	92.506	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.506	Amphilophus_citrinellus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	93.596	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	93.596	Amphiprion_ocellaris
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	93.596	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.596	Amphiprion_percula
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	93.146	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.146	Anabas_testudineus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	98	92.559	ENSAPLG00000009619	-	97	93.563	Anas_platyrhynchos
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	96.404	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.404	Anolis_carolinensis
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	88.085	ENSANAG00000025351	-	100	88.085	Aotus_nancymaae
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.220	ENSANAG00000022453	-	100	99.220	Aotus_nancymaae
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	64.151	ENSANAG00000027118	-	99	63.929	Aotus_nancymaae
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	91.236	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.236	Astatotilapia_calliptera
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.377	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.040	Astyanax_mexicanus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.443	ENSBTAG00000007979	TNPO1	100	99.443	Bos_taurus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.332	ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.332	Callithrix_jacchus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	95	99.417	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.417	Canis_familiaris
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	96.517	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.517	Canis_lupus_dingo
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.332	ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.332	Capra_hircus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	95.367	ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.625	Carlito_syrichta
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.220	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.220	Cebus_capucinus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.666	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	99.666	Cercocebus_atys
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.889	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.889	Chinchilla_lanigera
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.555	ENSCSAG00000015616	TNPO1	100	99.555	Chlorocebus_sabaeus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	94	86.777	ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	86.777	Choloepus_hoffmanni
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	97.419	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.419	Chrysemys_picta_bellii
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	75.196	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.196	Ciona_savignyi
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.666	ENSCANG00000004353	TNPO1	100	99.666	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.332	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.332	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFDAG00000013345	TNPO1	95	99.298	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	99.298	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	91.910	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	91.910	Cynoglossus_semilaevis
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.921	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	92.921	Cyprinodon_variegatus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.256	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	91.919	Danio_rerio
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	93.304	ENSDNOG00000006647	TNPO1	100	93.304	Dasypus_novemcinctus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	92	99.398	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.397	Dipodomys_ordii
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	57.675	FBgn0035693	CG8219	99	57.223	Drosophila_melanogaster
ENSFDAG00000013345	TNPO1	86	98.876	ENSETEG00000017805	TNPO1	90	98.876	Echinops_telfairi
ENSFDAG00000013345	TNPO1	94	84.762	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.881	Eptatretus_burgeri
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.666	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	99.666	Equus_asinus_asinus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.443	ENSECAG00000024424	TNPO1	100	99.443	Equus_caballus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	86.275	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	85.839	Esox_lucius
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.666	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	99.666	Felis_catus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	97.079	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.079	Ficedula_albicollis
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	93.266	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.266	Fundulus_heteroclitus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	89.521	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.521	Gadus_morhua
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	96.214	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.629	Gallus_gallus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.040	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.040	Gambusia_affinis
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.617	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.617	Gasterosteus_aculeatus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	97.191	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.191	Gopherus_agassizii
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	82.905	ENSGGOG00000022535	-	99	82.905	Gorilla_gorilla
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.666	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	99.666	Gorilla_gorilla
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.809	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	92.809	Haplochromis_burtoni
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.666	ENSHGLG00000000970	-	100	99.666	Heterocephalus_glaber_female
ENSFDAG00000013345	TNPO1	95	99.533	ENSHGLG00100017090	-	99	99.533	Heterocephalus_glaber_male
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	75.835	ENSHGLG00100000963	-	100	75.278	Heterocephalus_glaber_male
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	99.329	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.329	Jaculus_jaculus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	93.258	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.258	Kryptolebias_marmoratus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	90	89.766	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	89.766	Labrus_bergylta
ENSFDAG00000013345	TNPO1	95	88.837	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	88.837	Latimeria_chalumnae
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	94.966	ENSLOCG00000011092	tnpo1	98	94.966	Lepisosteus_oculatus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	96	98.845	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.845	Loxodonta_africana
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.666	ENSMFAG00000003636	TNPO1	100	99.666	Macaca_fascicularis
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.555	ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.555	Macaca_mulatta
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.666	ENSMNEG00000044581	TNPO1	100	99.666	Macaca_nemestrina
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.666	ENSMLEG00000030740	TNPO1	100	99.666	Mandrillus_leucophaeus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	93.146	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.146	Mastacembelus_armatus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.584	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.584	Maylandia_zebra
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	99.219	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	95.633	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.633	Microcebus_murinus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	98.885	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	98.885	Microtus_ochrogaster
ENSFDAG00000013345	TNPO1	86	92.139	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.139	Mola_mola
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	97.447	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.447	Monodelphis_domestica
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.022	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.022	Monopterus_albus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.109	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	100.000	Mus_caroli
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.332	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	100.000	Mus_musculus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.220	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	Mus_pahari
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.109	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	100.000	Mus_spretus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.555	ENSMPUG00000014387	TNPO1	100	99.555	Mustela_putorius_furo
ENSFDAG00000013345	TNPO1	95	98.952	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.952	Myotis_lucifugus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.332	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.332	Nannospalax_galili
ENSFDAG00000013345	TNPO1	86	92.377	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.377	Neolamprologus_brichardi
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.666	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	99.666	Nomascus_leucogenys
ENSFDAG00000013345	TNPO1	91	92.966	ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.966	Ochotona_princeps
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.666	ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.666	Octodon_degus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	91.889	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	91.889	Oreochromis_niloticus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	91	97.805	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.805	Ornithorhynchus_anatinus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	95	92.874	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.874	Oryctolagus_cuniculus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	86	92.348	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.348	Oryzias_latipes
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.672	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.672	Oryzias_latipes_hni
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.785	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	92.785	Oryzias_latipes_hsok
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.672	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.672	Oryzias_melastigma
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.555	ENSOGAG00000000808	TNPO1	100	99.555	Otolemur_garnettii
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.443	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.443	Ovis_aries
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.666	ENSPPAG00000042518	TNPO1	100	99.666	Pan_paniscus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.666	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	99.666	Panthera_pardus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.666	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	99.666	Panthera_tigris_altaica
ENSFDAG00000013345	TNPO1	93	86.740	ENSPTRG00000047731	-	100	86.740	Pan_troglodytes
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.666	ENSPTRG00000016972	TNPO1	100	99.666	Pan_troglodytes
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.666	ENSPANG00000006074	TNPO1	100	99.666	Papio_anubis
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	90.225	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.225	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	96.659	ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.659	Pelodiscus_sinensis
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	90.123	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.236	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	95	99.298	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.298	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	97.978	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	97.978	Phascolarctos_cinereus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.833	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	92.833	Poecilia_formosa
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.833	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	92.833	Poecilia_latipinna
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	93.034	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.034	Poecilia_mexicana
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.937	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	92.937	Poecilia_reticulata
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.555	ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.555	Pongo_abelii
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.555	ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.555	Propithecus_coquereli
ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.332	ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.332	Pteropus_vampyrus
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.593	ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.593	Pundamilia_nyererei
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ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	99.101	ENSRNOG00000014999	Tnpo1	100	99.101	Rattus_norvegicus
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ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.666	ENSRROG00000035271	TNPO1	100	99.666	Rhinopithecus_roxellana
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ENSFDAG00000013345	TNPO1	95	93.107	ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.107	Scophthalmus_maximus
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ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	99.663	ENSVVUG00000007338	TNPO1	100	99.663	Vulpes_vulpes
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	94.045	ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.045	Xenopus_tropicalis
ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.705	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.705	Xiphophorus_maculatus