EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFDAG00000013726 (Gene tree)
Gene ID: 104863292
Gene Symbol: POLR1A
Alias: DKFZP586M0122|FLJ21915|RPA1|RPO1-4
Full Name: RNA polymerase I subunit A
Gene Type: protein_coding
Species: Fukomys_damarensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 81817 bases
Position: chrKN122139.1:1352282-1434098
Accession: 104863292
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFDAP00000004492	RNA_pol_Rpb1_5	PF04998.17	7.4e-104	1	1
ENSFDAP00000004492	RNA_pol_Rpb1_4	PF05000.17	1.6e-24	1	1
ENSFDAP00000004492	RNA_pol_Rpb1_2	PF00623.20	1.3e-69	1	1
ENSFDAP00000004492	RNA_pol_Rpb1_3	PF04983.18	9.5e-37	1	1
ENSFDAP00000004492	RNA_pol_Rpb1_1	PF04997.12	1.5e-22	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFDAT00000018024	POLR1A-201	6214	XM_010625676	ENSFDAP00000004492	1713 (aa)	XP_010623978	A0A091DKK2

Gene Model

Click here to download ENSFDAG00000013726's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSFDAG00000013726's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSFDAG00000013726	POLR1A	63	32.128	ENSFDAG00000007813	POLR3A	70	32.128
ENSFDAG00000013726	POLR1A	69	33.636	ENSFDAG00000008287	-	51	38.806

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	88.095	ENSG00000068654	POLR1A	100	88.560	Homo_sapiens
ENSFDAG00000013726	POLR1A	69	67.227	ENSAPOG00000017945	polr1a	99	67.227	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	88.960	ENSAMEG00000005807	POLR1A	100	91.701	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	63.605	ENSACIG00000022147	polr1a	100	62.892	Amphilophus_citrinellus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	66.009	ENSAOCG00000017336	polr1a	100	68.198	Amphiprion_ocellaris
ENSFDAG00000013726	POLR1A	94	74.306	ENSAPEG00000016105	polr1a	97	74.306	Amphiprion_percula
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	66.280	ENSATEG00000016773	polr1a	100	65.993	Anabas_testudineus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	86	71.486	ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	71.992	Anas_platyrhynchos
ENSFDAG00000013726	POLR1A	99	68.235	ENSACAG00000012141	POLR1A	99	67.550	Anolis_carolinensis
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	87.972	ENSANAG00000033927	POLR1A	100	88.263	Aotus_nancymaae
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	62.225	ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.645	Astatotilapia_calliptera
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	87.101	ENSBTAG00000006481	POLR1A	100	87.856	Bos_taurus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	99	38.470	WBGene00012999	rpoa-1	98	38.453	Caenorhabditis_elegans
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	87.224	ENSCJAG00000019547	POLR1A	100	88.037	Callithrix_jacchus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	89.360	ENSCAFG00000007613	POLR1A	100	89.419	Canis_familiaris
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	89.379	ENSCAFG00020014752	POLR1A	100	89.437	Canis_lupus_dingo
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	87.078	ENSCHIG00000018204	POLR1A	100	87.311	Capra_hircus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	87.151	ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	87.151	Carlito_syrichta
ENSFDAG00000013726	POLR1A	97	88.390	ENSCAPG00000010132	POLR1A	100	88.309	Cavia_aperea
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	93.174	ENSCPOG00000012350	POLR1A	100	93.291	Cavia_porcellus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	87.689	ENSCCAG00000019839	POLR1A	100	88.502	Cebus_capucinus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	88.618	ENSCATG00000029786	POLR1A	100	89.082	Cercocebus_atys
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	94.474	ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	94.764	Chinchilla_lanigera
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	88.269	ENSCSAG00000016251	POLR1A	100	89.024	Chlorocebus_sabaeus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	99	74.316	ENSCPBG00000001115	POLR1A	99	74.126	Chrysemys_picta_bellii
ENSFDAG00000013726	POLR1A	99	46.285	ENSCSAVG00000007184	-	91	54.839	Ciona_savignyi
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	85.665	ENSCANG00000031785	POLR1A	100	85.897	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	84.410	ENSCGRG00001006651	Polr1a	100	84.410	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFDAG00000013726	POLR1A	60	88.402	ENSCGRG00000010834	Polr1a	100	88.402	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	62.573	ENSCSEG00000020190	polr1a	100	62.245	Cynoglossus_semilaevis
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	63.947	ENSCVAG00000020941	polr1a	100	63.847	Cyprinodon_variegatus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	66.608	ENSDARG00000098375	polr1a	100	66.492	Danio_rerio
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	81.823	ENSDNOG00000010829	POLR1A	100	81.823	Dasypus_novemcinctus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	88.915	ENSDORG00000008298	Polr1a	100	89.031	Dipodomys_ordii
ENSFDAG00000013726	POLR1A	72	96.875	ENSETEG00000000412	-	72	96.875	Echinops_telfairi
ENSFDAG00000013726	POLR1A	89	47.338	ENSEBUG00000005667	-	99	47.213	Eptatretus_burgeri
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	89.373	ENSEASG00005001625	POLR1A	100	90.186	Equus_asinus_asinus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	89.315	ENSECAG00000036306	-	100	91.909	Equus_caballus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	89.315	ENSECAG00000030510	-	100	91.909	Equus_caballus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	89.315	ENSECAG00000010092	POLR1A	100	91.909	Equus_caballus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	85	94.681	ENSEEUG00000000676	POLR1A	85	94.444	Erinaceus_europaeus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	66.185	ENSELUG00000012769	polr1a	99	67.036	Esox_lucius
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	88.553	ENSFCAG00000008966	POLR1A	100	88.727	Felis_catus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	99	70.512	ENSFALG00000010082	POLR1A	99	70.682	Ficedula_albicollis
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	62.288	ENSFHEG00000005996	polr1a	100	61.860	Fundulus_heteroclitus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	59.475	ENSGMOG00000002230	polr1a	100	59.661	Gadus_morhua
ENSFDAG00000013726	POLR1A	90	69.117	ENSGALG00000038160	-	99	69.003	Gallus_gallus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	64.282	ENSGAFG00000015266	polr1a	100	64.049	Gambusia_affinis
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	65.052	ENSGACG00000018791	polr1a	100	64.974	Gasterosteus_aculeatus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	89	75.228	ENSGAGG00000004984	-	95	80.789	Gopherus_agassizii
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	88.153	ENSGGOG00000001788	POLR1A	100	88.618	Gorilla_gorilla
ENSFDAG00000013726	POLR1A	90	64.206	ENSHBUG00000020021	polr1a	98	64.405	Haplochromis_burtoni
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	94.749	ENSHGLG00000006334	POLR1A	100	94.866	Heterocephalus_glaber_female
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	94.474	ENSHGLG00100006614	POLR1A	100	94.590	Heterocephalus_glaber_male
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	62.029	ENSHCOG00000003345	polr1a	100	61.756	Hippocampus_comes
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	65.932	ENSIPUG00000013174	polr1a	100	65.107	Ictalurus_punctatus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	87.631	ENSSTOG00000012580	POLR1A	100	87.930	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	89.685	ENSJJAG00000013113	Polr1a	100	89.510	Jaculus_jaculus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	65.385	ENSKMAG00000007399	polr1a	100	65.114	Kryptolebias_marmoratus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	94	68.239	ENSLBEG00000015401	polr1a	99	67.715	Labrus_bergylta
ENSFDAG00000013726	POLR1A	53	76.170	ENSLACG00000003218	polr1a	100	76.170	Latimeria_chalumnae
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	70.517	ENSLOCG00000010881	polr1a	100	70.708	Lepisosteus_oculatus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	87.812	ENSLAFG00000014948	POLR1A	100	87.928	Loxodonta_africana
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	88.386	ENSMFAG00000046097	POLR1A	100	89.141	Macaca_fascicularis
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	88.269	ENSMMUG00000015815	POLR1A	100	89.024	Macaca_mulatta
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	88.386	ENSMNEG00000043313	POLR1A	100	89.141	Macaca_nemestrina
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	87.747	ENSMLEG00000042428	POLR1A	100	88.502	Mandrillus_leucophaeus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	66.123	ENSMAMG00000016565	polr1a	100	65.529	Mastacembelus_armatus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	65.875	ENSMZEG00005004915	polr1a	100	65.295	Maylandia_zebra
ENSFDAG00000013726	POLR1A	99	68.990	ENSMGAG00000013111	POLR1A	99	68.994	Meleagris_gallopavo
ENSFDAG00000013726	POLR1A	92	89.079	ENSMAUG00000008497	Polr1a	100	89.270	Mesocricetus_auratus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	88.689	ENSMICG00000000757	POLR1A	100	88.805	Microcebus_murinus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	89.057	ENSMOCG00000000122	Polr1a	100	88.882	Microtus_ochrogaster
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	65.248	ENSMMOG00000010216	polr1a	100	65.035	Mola_mola
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	74.236	ENSMODG00000009335	POLR1A	100	74.134	Monodelphis_domestica
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	65.369	ENSMALG00000013363	polr1a	100	65.147	Monopterus_albus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	87.035	MGP_CAROLIEiJ_G0028494	Polr1a	100	86.977	Mus_caroli
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	87.326	ENSMUSG00000049553	Polr1a	100	87.267	Mus_musculus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	88.191	MGP_PahariEiJ_G0022230	Polr1a	100	88.074	Mus_pahari
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	85.763	MGP_SPRETEiJ_G0029499	Polr1a	100	86.294	Mus_spretus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	89.192	ENSMPUG00000009135	POLR1A	100	89.076	Mustela_putorius_furo
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	87.269	ENSMLUG00000015723	POLR1A	100	87.442	Myotis_lucifugus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	88.837	ENSNGAG00000017907	Polr1a	100	89.070	Nannospalax_galili
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	65.872	ENSNBRG00000000519	polr1a	100	65.411	Neolamprologus_brichardi
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	86.358	ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	86.821	Nomascus_leucogenys
ENSFDAG00000013726	POLR1A	75	92.913	ENSMEUG00000011665	-	75	92.913	Notamacropus_eugenii
ENSFDAG00000013726	POLR1A	99	83.058	ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	83.058	Ochotona_princeps
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	93.816	ENSODEG00000003542	POLR1A	100	94.107	Octodon_degus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	65.531	ENSONIG00000015895	polr1a	100	65.547	Oreochromis_niloticus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	89.796	ENSOCUG00000010138	POLR1A	100	90.321	Oryctolagus_cuniculus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	64.962	ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.381	Oryzias_latipes
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	63.610	ENSORLG00020020726	polr1a	99	62.912	Oryzias_latipes_hni
ENSFDAG00000013726	POLR1A	95	76.596	ENSORLG00015016071	polr1a	98	76.667	Oryzias_latipes_hsok
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	88.086	ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	88.201	Otolemur_garnettii
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	86.974	ENSOARG00000020601	POLR1A	100	87.949	Ovis_aries
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	87.921	ENSPPAG00000042450	POLR1A	100	88.386	Pan_paniscus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	88.669	ENSPPRG00000006702	POLR1A	100	88.844	Panthera_pardus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	88.188	ENSPTIG00000018783	POLR1A	100	88.361	Panthera_tigris_altaica
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	87.863	ENSPTRG00000012147	POLR1A	100	88.328	Pan_troglodytes
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	88.502	ENSPANG00000025908	POLR1A	100	88.966	Papio_anubis
ENSFDAG00000013726	POLR1A	94	75.000	ENSPKIG00000005468	polr1a	99	75.000	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFDAG00000013726	POLR1A	63	71.376	ENSPSIG00000009321	-	99	70.577	Pelodiscus_sinensis
ENSFDAG00000013726	POLR1A	55	67.876	ENSPMGG00000009718	polr1a	95	67.876	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	89.128	ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	89.186	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFDAG00000013726	POLR1A	95	79.230	ENSPCIG00000004222	POLR1A	99	79.352	Phascolarctos_cinereus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	64.282	ENSPFOG00000005025	polr1a	100	63.805	Poecilia_formosa
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	64.377	ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.033	Poecilia_latipinna
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	62.849	ENSPMEG00000006463	polr1a	100	62.493	Poecilia_mexicana
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	64.381	ENSPREG00000002389	polr1a	100	63.789	Poecilia_reticulata
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	87.805	ENSPPYG00000012217	POLR1A	100	88.269	Pongo_abelii
ENSFDAG00000013726	POLR1A	92	96.000	ENSPCAG00000011582	POLR1A	92	96.000	Procavia_capensis
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	89.089	ENSPCOG00000026987	POLR1A	100	89.263	Propithecus_coquereli
ENSFDAG00000013726	POLR1A	95	88.686	ENSPVAG00000012674	POLR1A	95	88.070	Pteropus_vampyrus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	65.165	ENSPNYG00000000026	polr1a	100	65.295	Pundamilia_nyererei
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	66.957	ENSPNAG00000019223	polr1a	99	68.651	Pygocentrus_nattereri
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	88.714	ENSRNOG00000009545	Polr1a	100	88.889	Rattus_norvegicus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	87.805	ENSRBIG00000028335	POLR1A	100	88.560	Rhinopithecus_bieti
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	87.747	ENSRROG00000031473	POLR1A	100	88.502	Rhinopithecus_roxellana
ENSFDAG00000013726	POLR1A	99	37.177	YOR341W	RPA190	99	36.866	Saccharomyces_cerevisiae
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	87.456	ENSSBOG00000030262	POLR1A	100	88.269	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	73.518	ENSSHAG00000014739	POLR1A	100	73.518	Sarcophilus_harrisii
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	67.733	ENSSFOG00015019716	polr1a	100	67.572	Scleropages_formosus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	65.591	ENSSMAG00000014342	polr1a	100	65.240	Scophthalmus_maximus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	66.705	ENSSDUG00000014631	polr1a	100	66.340	Seriola_dumerili
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	64.904	ENSSLDG00000024095	polr1a	100	64.434	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFDAG00000013726	POLR1A	73	97.872	ENSSARG00000003136	-	76	97.872	Sorex_araneus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	95	77.949	ENSSPUG00000004215	POLR1A	98	77.949	Sphenodon_punctatus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	64	71.315	ENSSPAG00000016341	polr1a	94	71.315	Stegastes_partitus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	83	89.909	ENSSSCG00000008226	POLR1A	99	89.881	Sus_scrofa
ENSFDAG00000013726	POLR1A	99	70.272	ENSTGUG00000010704	POLR1A	100	70.272	Taeniopygia_guttata
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	63.370	ENSTRUG00000002210	polr1a	99	64.576	Takifugu_rubripes
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	59.839	ENSTNIG00000010116	polr1a	100	59.678	Tetraodon_nigroviridis
ENSFDAG00000013726	POLR1A	74	95.133	ENSTBEG00000008646	POLR1A	74	95.133	Tupaia_belangeri
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	84.204	ENSTTRG00000008597	POLR1A	100	84.486	Tursiops_truncatus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	69	88.494	ENSUAMG00000012158	-	94	88.409	Ursus_americanus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	88.495	ENSUMAG00000006700	POLR1A	100	88.437	Ursus_maritimus
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	89.128	ENSVVUG00000001245	POLR1A	100	89.186	Vulpes_vulpes
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	67.731	ENSXETG00000001952	polr1a	100	68.838	Xenopus_tropicalis
ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	64.477	ENSXMAG00000004032	polr1a	100	64.672	Xiphophorus_maculatus