EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFDAG00000014232 (Gene tree)
Gene ID: 104848401
Gene Symbol: SBNO1
Alias: FLJ10701|FLJ10833|MOP3|Sno
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Fukomys_damarensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 46974 bases
Position: chrKN123762.1:8524900-8571873
Accession: 104848401
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFDAP00000005120	ResIII	PF04851.15	6.5e-08	1	1
ENSFDAP00000005121	ResIII	PF04851.15	7.3e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFDAT00000018600	SBNO1-201	3801	-	ENSFDAP00000005120	1266 (aa)	-	-
ENSFDAT00000018604	SBNO1-202	4143	XM_010604318	ENSFDAP00000005121	1380 (aa)	XP_010602620	-

Gene Model

Click here to download ENSFDAG00000014232's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSFDAG00000014232's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSFDAG00000014232	SBNO1	80	68.090	ENSFDAG00000015186	SBNO2	75	67.937

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.471	ENSG00000139697	SBNO1	99	95.471	Homo_sapiens
ENSFDAG00000014232	SBNO1	82	79.553	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	79.897	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.699	ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	95.699	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	79.541	ENSACIG00000008088	sbno1	94	80.071	Amphilophus_citrinellus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	80.072	ENSAOCG00000014859	sbno1	94	80.616	Amphiprion_ocellaris
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	80.072	ENSAPEG00000006069	sbno1	94	80.616	Amphiprion_percula
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	81.769	ENSATEG00000006667	sbno1	95	81.917	Anabas_testudineus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	90.761	ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	90.302	Anas_platyrhynchos
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	85.989	ENSACAG00000015441	SBNO1	84	90.200	Anolis_carolinensis
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.771	ENSANAG00000029958	-	99	95.771	Aotus_nancymaae
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	73.338	ENSACLG00000024913	sbno1	100	73.481	Astatotilapia_calliptera
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	83.813	ENSAMXG00000019473	sbno1	100	79.202	Astyanax_mexicanus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	100	95.908	ENSBTAG00000020505	SBNO1	100	95.908	Bos_taurus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.259	ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	95.259	Callithrix_jacchus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.768	ENSCAFG00000007503	SBNO1	99	95.768	Canis_familiaris
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.043	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	95.043	Canis_lupus_dingo
ENSFDAG00000014232	SBNO1	100	95.833	ENSCHIG00000008382	SBNO1	100	95.833	Capra_hircus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.833	ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	95.833	Carlito_syrichta
ENSFDAG00000014232	SBNO1	97	96.290	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	96.692	Cavia_aperea
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	96.619	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	96.619	Cavia_porcellus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	94.005	ENSCCAG00000035316	SBNO1	99	90.883	Cebus_capucinus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	93.727	ENSCATG00000008239	SBNO1	99	95.609	Cercocebus_atys
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	96.693	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	96.693	Chinchilla_lanigera
ENSFDAG00000014232	SBNO1	83	96.543	ENSCSAG00000002064	SBNO1	99	96.543	Chlorocebus_sabaeus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	96	93.359	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	93.359	Choloepus_hoffmanni
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	90.445	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	90.302	Chrysemys_picta_bellii
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	90.857	ENSCANG00000042688	-	99	90.785	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	100	94.616	ENSCGRG00001017470	Sbno1	100	94.757	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFDAG00000014232	SBNO1	100	94.616	ENSCGRG00000004756	Sbno1	100	94.757	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	80.072	ENSCSEG00000011919	sbno1	95	80.616	Cynoglossus_semilaevis
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	80.251	ENSCVAG00000007038	sbno1	95	80.797	Cyprinodon_variegatus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	83.485	ENSDARG00000099080	sbno1	94	83.759	Danio_rerio
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.286	ENSDNOG00000017147	SBNO1	98	96.814	Dasypus_novemcinctus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	94.296	ENSDORG00000015261	Sbno1	94	95.109	Dipodomys_ordii
ENSFDAG00000014232	SBNO1	90	99.275	ENSETEG00000005620	SBNO1	91	90.444	Echinops_telfairi
ENSFDAG00000014232	SBNO1	75	63.265	ENSEBUG00000013823	sbno1	85	86.802	Eptatretus_burgeri
ENSFDAG00000014232	SBNO1	54	95.906	ENSEASG00005012595	-	91	97.459	Equus_asinus_asinus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	96.193	ENSECAG00000006127	SBNO1	99	96.442	Equus_caballus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	83	99.454	ENSEEUG00000003793	SBNO1	83	99.454	Erinaceus_europaeus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	82.709	ENSELUG00000002886	sbno1	95	83.877	Esox_lucius
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	96.193	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	96.193	Felis_catus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	90.942	ENSFALG00000009273	SBNO1	99	90.302	Ficedula_albicollis
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	80.431	ENSFHEG00000007360	sbno1	95	80.978	Fundulus_heteroclitus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	94	77.082	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	77.786	Gadus_morhua
ENSFDAG00000014232	SBNO1	88	90.252	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	90.089	Gallus_gallus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	74.191	ENSGAFG00000003960	sbno1	95	81.159	Gambusia_affinis
ENSFDAG00000014232	SBNO1	96	80.177	ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.032	Gasterosteus_aculeatus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	89.898	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	89.585	Gopherus_agassizii
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.399	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	95.399	Gorilla_gorilla
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	69.281	ENSHBUG00000011910	sbno1	100	69.478	Haplochromis_burtoni
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	97.196	ENSHGLG00000014165	-	99	97.196	Heterocephalus_glaber_female
ENSFDAG00000014232	SBNO1	91	81.818	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	81.621	Hippocampus_comes
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	83.063	ENSIPUG00000015830	Sbno1	92	84.824	Ictalurus_punctatus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.830	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	95.830	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.820	ENSJJAG00000001741	Sbno1	99	96.310	Jaculus_jaculus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	79.438	ENSKMAG00000009696	sbno1	95	81.159	Kryptolebias_marmoratus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	82.226	ENSLBEG00000007623	sbno1	95	82.790	Labrus_bergylta
ENSFDAG00000014232	SBNO1	100	79.943	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	82.334	Latimeria_chalumnae
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	84.946	ENSLOCG00000005725	sbno1	98	80.127	Lepisosteus_oculatus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	94.899	ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	94.899	Loxodonta_africana
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.259	ENSMFAG00000031429	SBNO1	99	95.259	Macaca_fascicularis
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.327	ENSMMUG00000011496	SBNO1	99	95.327	Macaca_mulatta
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.290	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	95.290	Mandrillus_leucophaeus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	78.761	ENSMAMG00000005473	sbno1	95	82.246	Mastacembelus_armatus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	91.123	ENSMGAG00000003274	SBNO1	99	90.230	Meleagris_gallopavo
ENSFDAG00000014232	SBNO1	52	97.273	ENSMAUG00000004834	-	99	97.273	Mesocricetus_auratus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.067	ENSMICG00000006573	-	99	95.067	Microcebus_murinus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	100	94.601	ENSMOCG00000009390	Sbno1	100	94.836	Microtus_ochrogaster
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	81.588	ENSMMOG00000008691	sbno1	94	81.703	Mola_mola
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	92.601	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	92.601	Monodelphis_domestica
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	79.892	ENSMALG00000001056	sbno1	95	80.435	Monopterus_albus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.109	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	99	96.974	Mus_caroli
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.183	ENSMUSG00000038095	Sbno1	99	97.277	Mus_musculus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.111	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	99	96.974	Mus_pahari
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.109	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	99	97.277	Mus_spretus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	96.049	ENSMPUG00000001658	SBNO1	99	96.049	Mustela_putorius_furo
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.758	ENSMLUG00000017159	SBNO1	99	95.758	Myotis_lucifugus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.546	ENSNGAG00000012620	Sbno1	99	95.546	Nannospalax_galili
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	73.357	ENSNBRG00000019189	sbno1	100	73.500	Neolamprologus_brichardi
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	93.869	ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	92.391	Nomascus_leucogenys
ENSFDAG00000014232	SBNO1	60	95.699	ENSMEUG00000008768	-	86	95.699	Notamacropus_eugenii
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	93.490	ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	92.391	Ochotona_princeps
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	96.619	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	96.619	Octodon_degus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	74.103	ENSONIG00000015348	sbno1	95	80.797	Oreochromis_niloticus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	98	94.088	ENSOCUG00000002441	SBNO1	95	94.088	Oryctolagus_cuniculus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	74.278	ENSORLG00000001593	sbno1	100	74.489	Oryzias_latipes
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	74.366	ENSORLG00020015216	sbno1	100	74.366	Oryzias_latipes_hni
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	74.401	ENSORLG00015002726	sbno1	100	74.542	Oryzias_latipes_hsok
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	78.521	ENSOMEG00000019313	sbno1	94	80.328	Oryzias_melastigma
ENSFDAG00000014232	SBNO1	52	94.251	ENSOGAG00000010781	-	99	94.251	Otolemur_garnettii
ENSFDAG00000014232	SBNO1	100	95.624	ENSOARG00000004404	SBNO1	100	95.624	Ovis_aries
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.402	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	95.402	Pan_paniscus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	96.193	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	96.193	Panthera_pardus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.977	ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	95.977	Panthera_tigris_altaica
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.474	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	95.474	Pan_troglodytes
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.399	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	95.399	Papio_anubis
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	82.011	ENSPKIG00000001441	sbno1	100	79.286	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	89.921	ENSPSIG00000009572	-	99	89.979	Pelodiscus_sinensis
ENSFDAG00000014232	SBNO1	92	86.314	ENSPSIG00000009256	-	100	86.314	Pelodiscus_sinensis
ENSFDAG00000014232	SBNO1	100	94.616	ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	94.616	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	92.572	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	92.103	Phascolarctos_cinereus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	80.610	ENSPFOG00000005069	sbno1	95	81.159	Poecilia_formosa
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	80.610	ENSPLAG00000015015	sbno1	95	81.159	Poecilia_latipinna
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	80.610	ENSPMEG00000021212	sbno1	95	81.159	Poecilia_mexicana
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	80.251	ENSPREG00000017746	sbno1	95	80.797	Poecilia_reticulata
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.290	ENSPPYG00000005084	SBNO1	99	95.255	Pongo_abelii
ENSFDAG00000014232	SBNO1	88	91.221	ENSPCAG00000008634	SBNO1	88	91.298	Procavia_capensis
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	96.049	ENSPCOG00000024277	SBNO1	99	96.049	Propithecus_coquereli
ENSFDAG00000014232	SBNO1	92	95.229	ENSPVAG00000015304	SBNO1	87	95.229	Pteropus_vampyrus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	74.357	ENSPNYG00000004291	sbno1	95	80.797	Pundamilia_nyererei
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	78.165	ENSPNAG00000015622	sbno1	95	84.964	Pygocentrus_nattereri
ENSFDAG00000014232	SBNO1	100	94.903	ENSRNOG00000001064	Sbno1	99	95.109	Rattus_norvegicus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.402	ENSRROG00000034230	SBNO1	99	95.402	Rhinopithecus_roxellana
ENSFDAG00000014232	SBNO1	96	91.011	ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	91.011	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	82.616	ENSSFOG00015019025	sbno1	100	78.658	Scleropages_formosus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	74.406	ENSSMAG00000013640	sbno1	95	81.159	Scophthalmus_maximus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	82.065	ENSSDUG00000023480	sbno1	95	82.065	Seriola_dumerili
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	82.065	ENSSLDG00000007928	sbno1	95	82.065	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFDAG00000014232	SBNO1	89	95.513	ENSSARG00000002594	SBNO1	89	95.513	Sorex_araneus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	89.331	ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	87.428	Sphenodon_punctatus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	80.322	ENSSPAG00000016244	sbno1	95	80.978	Stegastes_partitus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	96.858	ENSSSCG00000009776	SBNO1	99	96.522	Sus_scrofa
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	91.123	ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	90.302	Taeniopygia_guttata
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	81.455	ENSTRUG00000018490	sbno1	95	81.569	Takifugu_rubripes
ENSFDAG00000014232	SBNO1	57	70.407	ENSTNIG00000013506	sbno1	99	70.307	Tetraodon_nigroviridis
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	96.049	ENSUAMG00000019671	SBNO1	99	96.049	Ursus_americanus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	96.049	ENSUMAG00000004002	SBNO1	99	96.049	Ursus_maritimus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	95	95.556	ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	95.556	Vicugna_pacos
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.977	ENSVVUG00000027807	SBNO1	99	95.977	Vulpes_vulpes
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	87.857	ENSXETG00000031930	SBNO1	94	88.727	Xenopus_tropicalis
ENSFDAG00000014232	SBNO1	86	79.795	ENSXCOG00000011607	sbno1	90	81.316	Xiphophorus_couchianus
ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	80.251	ENSXMAG00000002140	sbno1	95	80.797	Xiphophorus_maculatus