EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFDAG00000016229 (Gene tree)
Gene ID: 104865227
Gene Symbol: SRPRA
Alias: SR-alpha|SRP-alpha|SRPR|Sralpha
Full Name: SRP receptor subunit alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Fukomys_damarensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 31432 bases
Position: chrKN122286.1:1917367-1948798
Accession: 104865227
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFDAP00000007823	SRP54	PF00448.22	1.3e-47	1	1
ENSFDAP00000007815	SRP54	PF00448.22	5.5e-20	1	1
ENSFDAP00000007823	SRP54_N	PF02881.19	6e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFDAT00000020996	SRPRA-202	468	-	ENSFDAP00000007815	155 (aa)	-	-
ENSFDAT00000020988	SRPRA-201	2714	XM_010628649	ENSFDAP00000007823	637 (aa)	XP_010626951	A0A091DGV5

Gene Model

Click here to download ENSFDAG00000016229's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSFDAG00000016229's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	98.589	ENSG00000182934	SRPRA	100	98.589	Homo_sapiens
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.916	ENSAPOG00000017588	srpra	100	68.397	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	96.708	ENSAMEG00000000117	SRPRA	100	96.708	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFDAG00000016229	SRPRA	85	88.636	ENSACIG00000021588	srpra	100	66.159	Amphilophus_citrinellus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.916	ENSAOCG00000018884	srpra	100	68.550	Amphiprion_ocellaris
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.916	ENSAPEG00000022286	srpra	100	65.258	Amphiprion_percula
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	82.517	ENSATEG00000023578	srpra	93	86.420	Anabas_testudineus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	88.112	ENSAPLG00000016079	SRPRA	100	78.454	Anas_platyrhynchos
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	87.413	ENSACAG00000000108	SRPRA	100	77.231	Anolis_carolinensis
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	98.119	ENSANAG00000020346	SRPRA	100	98.119	Aotus_nancymaae
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.916	ENSACLG00000000518	srpra	100	67.835	Astatotilapia_calliptera
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.916	ENSAMXG00000009975	srpra	100	64.697	Astyanax_mexicanus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	97.340	ENSBTAG00000014105	SRPRA	100	97.340	Bos_taurus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	68.056	WBGene00009521	F38A1.8	99	47.866	Caenorhabditis_elegans
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	98.119	ENSCJAG00000008752	SRPRA	100	98.119	Callithrix_jacchus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	94.357	ENSCAFG00000010474	SRPRA	100	94.357	Canis_familiaris
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	96.395	ENSCAFG00020010608	SRPRA	100	96.395	Canis_lupus_dingo
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	96.401	ENSCHIG00000012423	SRPRA	100	96.401	Capra_hircus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	85	99.242	ENSTSYG00000005187	SRPRA	100	98.125	Carlito_syrichta
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	93.007	ENSCAPG00000007098	SRPRA	91	98.496	Cavia_aperea
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	98.116	ENSCPOG00000014976	SRPRA	100	98.116	Cavia_porcellus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	97.962	ENSCCAG00000025602	SRPRA	100	97.962	Cebus_capucinus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	98.589	ENSCATG00000039354	SRPRA	100	98.589	Cercocebus_atys
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	99.058	ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	99.058	Chinchilla_lanigera
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	98.589	ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	98.589	Chlorocebus_sabaeus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	85	98.485	ENSCHOG00000010015	-	73	98.980	Choloepus_hoffmanni
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	88.811	ENSCPBG00000011128	SRPRA	100	78.341	Chrysemys_picta_bellii
ENSFDAG00000016229	SRPRA	85	81.061	ENSCING00000008954	-	100	58.282	Ciona_intestinalis
ENSFDAG00000016229	SRPRA	85	80.303	ENSCSAVG00000005602	-	100	58.779	Ciona_savignyi
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	97.492	ENSCANG00000032337	SRPRA	100	97.492	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	97.488	ENSCGRG00001017670	Srpr	100	97.488	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	97.488	ENSCGRG00000009892	Srpr	100	97.488	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	82.517	ENSCSEG00000002374	srpra	100	68.237	Cynoglossus_semilaevis
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.217	ENSCVAG00000019881	srpra	100	67.466	Cyprinodon_variegatus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	85.315	ENSDARG00000061124	srpra	100	66.768	Danio_rerio
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	95.504	ENSDNOG00000010821	SRPRA	100	95.504	Dasypus_novemcinctus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	98.273	ENSDORG00000016719	Srpr	100	98.273	Dipodomys_ordii
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	74.126	FBgn0010391	Gtp-bp	100	52.006	Drosophila_melanogaster
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	92.835	ENSETEG00000013956	SRPRA	100	92.835	Echinops_telfairi
ENSFDAG00000016229	SRPRA	85	86.364	ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.916	Eptatretus_burgeri
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	95.618	ENSEASG00005022980	SRPRA	100	95.305	Equus_asinus_asinus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	95.775	ENSECAG00000014692	SRPRA	100	95.462	Equus_caballus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	86.916	ENSEEUG00000007920	SRPRA	100	86.137	Erinaceus_europaeus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	82.517	ENSELUG00000017643	srpra	100	68.913	Esox_lucius
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	96.714	ENSFCAG00000011274	-	100	96.714	Felis_catus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	80	95.499	ENSFCAG00000030894	-	99	95.108	Felis_catus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	88.112	ENSFALG00000005048	SRPRA	99	75.156	Ficedula_albicollis
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.217	ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.020	Fundulus_heteroclitus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.217	ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.682	Gadus_morhua
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	88.112	ENSGALG00000030759	SRPRA	100	78.704	Gallus_gallus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.217	ENSGAFG00000000453	srpra	100	66.517	Gambusia_affinis
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.217	ENSGACG00000006550	srpra	100	67.132	Gasterosteus_aculeatus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	88.112	ENSGAGG00000021157	SRPRA	100	78.802	Gopherus_agassizii
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	98.433	ENSGGOG00000012962	SRPRA	100	98.433	Gorilla_gorilla
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.217	ENSHBUG00000000119	srpra	100	67.683	Haplochromis_burtoni
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	98.273	ENSHGLG00000001597	SRPR	100	98.273	Heterocephalus_glaber_female
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	98.273	ENSHGLG00100006449	SRPR	100	98.273	Heterocephalus_glaber_male
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	85.315	ENSHCOG00000010749	srpra	100	67.910	Hippocampus_comes
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	82.517	ENSIPUG00000000867	srpra	99	64.065	Ictalurus_punctatus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	98.276	ENSSTOG00000009897	SRPRA	100	98.276	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	97.174	ENSJJAG00000020272	Srpr	100	97.174	Jaculus_jaculus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	84.615	ENSKMAG00000002280	srpra	100	67.359	Kryptolebias_marmoratus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.217	ENSLBEG00000009608	srpra	100	68.237	Labrus_bergylta
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	81.119	ENSLACG00000017781	SRPRA	100	70.388	Latimeria_chalumnae
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	84.028	ENSLOCG00000002733	srpra	100	66.417	Lepisosteus_oculatus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	95.149	ENSLAFG00000010252	SRPRA	100	95.149	Loxodonta_africana
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	98.746	ENSMFAG00000032606	SRPRA	100	98.746	Macaca_fascicularis
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	98.746	ENSMMUG00000007938	SRPRA	100	98.746	Macaca_mulatta
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	98.589	ENSMNEG00000030709	SRPRA	100	98.589	Macaca_nemestrina
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	98.589	ENSMLEG00000043404	SRPRA	100	98.589	Mandrillus_leucophaeus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	82.517	ENSMAMG00000000473	srpra	100	66.970	Mastacembelus_armatus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.916	ENSMZEG00005013432	srpra	100	67.835	Maylandia_zebra
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	87.413	ENSMGAG00000000732	SRPRA	100	78.512	Meleagris_gallopavo
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	97.802	ENSMAUG00000015648	Srpr	100	97.802	Mesocricetus_auratus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	97.492	ENSMICG00000015981	SRPRA	100	97.492	Microcebus_murinus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	97.802	ENSMOCG00000008311	Srpr	100	97.802	Microtus_ochrogaster
ENSFDAG00000016229	SRPRA	85	88.636	ENSMMOG00000005019	srpra	100	67.652	Mola_mola
ENSFDAG00000016229	SRPRA	79	86.066	ENSMODG00000029422	-	100	88.889	Monodelphis_domestica
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	89.984	ENSMODG00000004576	-	100	89.498	Monodelphis_domestica
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.217	ENSMALG00000011343	srpra	100	68.237	Monopterus_albus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	97.488	MGP_CAROLIEiJ_G0031951	Srpr	100	97.488	Mus_caroli
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	97.488	ENSMUSG00000032042	Srpr	100	97.488	Mus_musculus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	97.645	MGP_PahariEiJ_G0014816	Srpr	100	97.645	Mus_pahari
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	92.825	MGP_SPRETEiJ_G0033075	Srpr	100	92.825	Mus_spretus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	96.552	ENSMPUG00000006626	SRPRA	100	96.552	Mustela_putorius_furo
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	95.141	ENSMLUG00000017334	SRPRA	100	95.141	Myotis_lucifugus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	97.331	ENSNGAG00000015686	Srpr	100	97.331	Nannospalax_galili
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.916	ENSNBRG00000017311	srpra	100	68.043	Neolamprologus_brichardi
ENSFDAG00000016229	SRPRA	95	98.849	ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	98.849	Nomascus_leucogenys
ENSFDAG00000016229	SRPRA	94	90.500	ENSMEUG00000004956	SRPRA	100	90.167	Notamacropus_eugenii
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	90.297	ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	90.297	Ochotona_princeps
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	97.331	ENSODEG00000004730	SRPRA	100	97.331	Octodon_degus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.217	ENSONIG00000005324	srpra	100	67.835	Oreochromis_niloticus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	98.276	ENSOCUG00000017057	SRPRA	100	98.276	Oryctolagus_cuniculus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.916	ENSORLG00000014676	srpra	100	68.510	Oryzias_latipes
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.916	ENSORLG00020009240	srpra	100	68.510	Oryzias_latipes_hni
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.916	ENSORLG00015015405	srpra	100	68.664	Oryzias_latipes_hsok
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.916	ENSOMEG00000005872	srpra	100	68.356	Oryzias_melastigma
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	97.488	ENSOGAG00000008926	SRPRA	100	97.488	Otolemur_garnettii
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	92.668	ENSOARG00000012397	SRPRA	100	93.292	Ovis_aries
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	98.589	ENSPPAG00000030813	SRPRA	100	98.589	Pan_paniscus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	96.714	ENSPPRG00000001542	SRPRA	100	96.714	Panthera_pardus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	96.557	ENSPTIG00000006989	SRPRA	100	96.557	Panthera_tigris_altaica
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	98.589	ENSPTRG00000028360	SRPRA	100	98.589	Pan_troglodytes
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	98.746	ENSPANG00000010858	SRPRA	100	98.746	Papio_anubis
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	81.818	ENSPKIG00000016106	srpra	100	66.770	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	87.413	ENSPSIG00000012009	SRPRA	100	76.847	Pelodiscus_sinensis
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.217	ENSPMGG00000001393	srpra	100	68.098	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	97.959	ENSPEMG00000018279	Srpr	100	97.959	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	80.420	ENSPMAG00000009559	srpra	99	61.360	Petromyzon_marinus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	90.141	ENSPCIG00000010207	SRPRA	100	90.297	Phascolarctos_cinereus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.916	ENSPFOG00000003114	srpra	100	68.741	Poecilia_formosa
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.916	ENSPLAG00000007323	srpra	100	68.541	Poecilia_latipinna
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.916	ENSPMEG00000015658	srpra	100	68.741	Poecilia_mexicana
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.916	ENSPREG00000004937	srpra	100	68.701	Poecilia_reticulata
ENSFDAG00000016229	SRPRA	89	98.684	ENSPPYG00000004045	SRPRA	100	98.684	Pongo_abelii
ENSFDAG00000016229	SRPRA	64	99.225	ENSPCAG00000003801	-	64	99.225	Procavia_capensis
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	97.649	ENSPCOG00000025726	SRPRA	100	97.649	Propithecus_coquereli
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	96.395	ENSPVAG00000000993	SRPRA	100	96.395	Pteropus_vampyrus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.916	ENSPNYG00000012371	srpra	100	67.835	Pundamilia_nyererei
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.916	ENSPNAG00000013476	srpra	100	66.210	Pygocentrus_nattereri
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	97.959	ENSRNOG00000010543	Srpra	100	97.959	Rattus_norvegicus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	98.433	ENSRBIG00000008702	SRPRA	100	98.433	Rhinopithecus_bieti
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	98.279	ENSRROG00000029494	SRPRA	100	98.279	Rhinopithecus_roxellana
ENSFDAG00000016229	SRPRA	83	37.143	YDR292C	-	76	38.075	Saccharomyces_cerevisiae
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	98.119	ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	98.119	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFDAG00000016229	SRPRA	94	90.864	ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.532	Sarcophilus_harrisii
ENSFDAG00000016229	SRPRA	85	87.879	ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.044	Scleropages_formosus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	85	88.636	ENSSMAG00000002783	srpra	100	65.895	Scophthalmus_maximus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.217	ENSSDUG00000013920	srpra	100	66.510	Seriola_dumerili
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.217	ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.275	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFDAG00000016229	SRPRA	85	96.970	ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	Sorex_araneus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	76.852	ENSSPUG00000018221	SRPRA	100	77.006	Sphenodon_punctatus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	85	89.394	ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.786	Stegastes_partitus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	96.708	ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	96.708	Sus_scrofa
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	88.112	ENSTGUG00000000815	SRPRA	100	75.413	Taeniopygia_guttata
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.217	ENSTRUG00000006856	srpra	100	67.278	Takifugu_rubripes
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.916	ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.250	Tetraodon_nigroviridis
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	96.088	ENSTTRG00000001558	SRPRA	100	96.088	Tursiops_truncatus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	96.557	ENSUAMG00000005510	SRPRA	100	96.557	Ursus_americanus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	93.007	ENSUMAG00000002269	SRPRA	99	87.722	Ursus_maritimus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	69	99.225	ENSVPAG00000001077	SRPRA	75	99.225	Vicugna_pacos
ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	96.552	ENSVVUG00000020094	SRPRA	100	96.552	Vulpes_vulpes
ENSFDAG00000016229	SRPRA	85	88.636	ENSXETG00000003920	srpra	100	62.748	Xenopus_tropicalis
ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.916	ENSXCOG00000001286	srpra	100	70.872	Xiphophorus_couchianus
ENSFDAG00000016229	SRPRA	93	84.722	ENSXMAG00000028401	srpra	100	67.322	Xiphophorus_maculatus